Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC | REL606 | 1,733,297 | (CGTATGAA)1→2 | coding (333/1413 nt) | pykF → | pyruvate kinase |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 1733288 = | 13 (0.230) | 57 (1.030) | 38/146 | 0.4 | 87.3% | coding (324/1413 nt) | pykF | pyruvate kinase |
? | REL606 | = 1733295 | 4 (0.070) | coding (331/1413 nt) | pykF | pyruvate kinase |
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
TTCTCTGAAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAA > REL606/1733213‑1733363 | ttCTCTGAAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTa > 1:433403/1‑76 (MQ=255) tgctctGAAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTa < 2:919120/74‑1 (MQ=255) gctggtcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaac < 2:1387649‑M1/3‑1 (MQ=255) gctggtcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaac < 1:123123‑M1/3‑1 (MQ=255) gctggtcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaac > 1:351332‑M1/74‑76 (MQ=255) gctggtcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaac < 1:185135‑M1/3‑1 (MQ=255) gctggtcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaac > 1:1821782‑M1/74‑76 (MQ=255) gctggtcagacctttaccttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaac > 2:1334097‑M1/74‑76 (MQ=255) tctGAAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACg > 2:1001149/1‑76 (MQ=255) ctGAAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGt > 1:813658/1‑76 (MQ=255) gAAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTAt > 1:48678/1‑76 (MQ=255) gAAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTAt > 2:1320022/1‑76 (MQ=255) tcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgtatg < 2:1024269‑M1/8‑1 (MQ=255) tcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgtatg < 1:723981‑M1/8‑1 (MQ=255) tcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgtatg > 1:150476‑M1/69‑76 (MQ=255) aaaGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATg > 1:903730/1‑76 (MQ=255) aaaGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATg > 2:1228821/1‑76 (MQ=255) 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tCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatg < 2:1024269‑M2/76‑9 (MQ=255) tCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatg > 1:150476‑M2/1‑68 (MQ=255) tactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCa < 2:1673082‑M1/17‑1 (MQ=255) tactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCa > 1:218228‑M1/60‑76 (MQ=255) cAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatga < 1:1307939‑M2/76‑10 (MQ=255) actttcaccattgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCac < 1:1697203‑M1/18‑1 (MQ=255) aGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCTAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaa < 1:94280‑M2/76‑11 (MQ=255) aCCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaagg > 2:507448‑M2/1‑64 (MQ=255) caccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTg < 2:1076178‑M1/23‑1 (MQ=255) ttACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttc < 1:2998‑M2/76‑17 (MQ=255) ttACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttc < 1:1310014‑M2/76‑17 (MQ=255) tACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttca > 1:218228‑M2/1‑59 (MQ=255) tACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttca < 2:1673082‑M2/76‑18 (MQ=255) ccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGAc < 2:826454‑M1/25‑1 (MQ=255) aCTTTCACCATTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcac < 1:1697203‑M2/76‑19 (MQ=255) caccacTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactg < 2:1076178‑M2/76‑24 (MQ=255) caccacTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactg < 2:1049567‑M2/76‑24 (MQ=255) ccacTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgac < 2:826454‑M2/76‑26 (MQ=255) aaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctgtctgt < 2:460683‑M1/33‑1 (MQ=255) aaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctgtctgt < 2:460664‑M1/33‑1 (MQ=255) aaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctgtctgt < 2:804197‑M1/33‑1 (MQ=255) aaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctgtctgt < 1:1043383‑M1/33‑1 (MQ=255) atctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTg > 2:1482569‑M1/42‑76 (MQ=255) tctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTgg < 2:994105‑M1/36‑1 (MQ=255) ctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGc < 2:1185041‑M1/37‑1 (MQ=255) tgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCa < 1:1458173‑M1/38‑1 (MQ=255) tgtgatctgcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGgcg > 2:200091‑M1/39‑75 (MQ=255) gttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCaa > 1:827961‑M1/38‑76 (MQ=255) gttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCaa > 1:1452506‑M1/38‑76 (MQ=255) aTAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtct < 2:864016‑M2/76‑32 (MQ=255) ttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAac < 2:810577‑M1/40‑1 (MQ=255) tAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctg > 2:256953‑M2/1‑44 (MQ=255) tatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAaca < 1:1337532‑M1/41‑1 (MQ=255) tatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacatatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAaca > 1:1731856‑M1/36‑76 (MQ=255) aaaTCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgt < 1:1043383‑M2/76‑34 (MQ=255) aaaTCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgt < 2:460683‑M2/76‑34 (MQ=255) tCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttgg < 2:994105‑M2/76‑37 (MQ=255) cTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggc < 2:1185041‑M2/76‑38 (MQ=255) tgtgATCTGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcg > 2:200091‑M2/1‑38 (MQ=255) tGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggca < 1:1458173‑M2/76‑39 (MQ=255) gTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaa > 1:827961‑M2/1‑37 (MQ=255) gTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaa < 2:1396340‑M2/76‑40 (MQ=255) caacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTAc < 2:1505932‑M1/47‑1 (MQ=255) ttATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaac < 2:810577‑M2/76‑41 (MQ=255) ttATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaac < 2:198399‑M2/76‑41 (MQ=255) 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gtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGAt > 2:614759‑M1/11‑76 (MQ=255) taacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATc < 2:1139772‑M1/67‑1 (MQ=255) aacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCg > 1:1088459‑M1/9‑76 (MQ=255) cgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTTTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGt > 1:836583‑M1/7‑76 (MQ=255) gtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGCCCTGTCTGTTGGCAACCCCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTa > 2:988796‑M1/6‑76 (MQ=255) gCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtct > 1:206265‑M2/1‑13 (MQ=255) cGGTAACGTATGaangtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctg < 1:1000316‑M2/76‑65 (MQ=255) gTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgat > 2:614759‑M2/1‑10 (MQ=255) gTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgat > 2:344172‑M2/1‑10 (MQ=255) tAACGTATGaacgtctgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatc < 1:983582‑M2/76‑68 (MQ=255) aacgtatgaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatcg > 1:1088459‑M2/1‑8 (MQ=255) | TTCTCTGAAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAA > REL606/1733213‑1733363 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |