| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | REL606 | 1,733,297 | (CGTATGAA)1→2 | coding (333/1413 nt) | pykF → | pyruvate kinase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 1733288 = | 13 (0.230) | 57 (1.030) | 38/146 | 0.4 | 87.3% | coding (324/1413 nt) | pykF | pyruvate kinase |
| ? | REL606 | = 1733295 | 4 (0.070) | coding (331/1413 nt) | pykF | pyruvate kinase | |||||
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
AAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCG > REL606/1733220‑1733370 | tcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgtatg < 1:723981‑M1/8‑1 (MQ=255)tcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgtatg < 2:1024269‑M1/8‑1 (MQ=255)aaaGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATg > 2:962266/1‑76 (MQ=255)aaaGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATg > 1:903730/1‑76 (MQ=255)aaaGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATg > 2:1228821/1‑76 (MQ=255) cagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgtatga < 1:1307939‑M1/9‑1 (MQ=255) aaGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGa < 1:1524263‑M2/76‑2 (MQ=255) agacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagctaaatggttgcggtaacgtatgaacgtatgaa < 1:94280‑M1/10‑1 (MQ=255) gCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaac > 1:351332‑M2/1‑73 (MQ=255) gCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaac > 1:1821782‑M2/1‑73 (MQ=255) gCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaac < 1:185135‑M2/76‑4 (MQ=255) gCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaac < 2:1387649‑M2/76‑4 (MQ=255) gCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaac < 1:123123‑M2/76‑4 (MQ=255) gCTGGTCAGACCTTTACCTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaac > 2:1334097‑M2/1‑73 (MQ=255) acctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAgg > 2:507448‑M1/65‑76 (MQ=255) ttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTc < 1:1310014‑M1/16‑1 (MQ=255) tCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatg < 2:1024269‑M2/76‑9 (MQ=255) tCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatg > 1:150476‑M2/1‑68 (MQ=255) tCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatg < 1:723981‑M2/76‑9 (MQ=255) tactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCa > 1:218228‑M1/60‑76 (MQ=255) cAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatga < 1:1307939‑M2/76‑10 (MQ=255) actttcaccattgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCac < 1:1697203‑M1/18‑1 (MQ=255) aGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCTAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaa < 1:94280‑M2/76‑11 (MQ=255) aCCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaagg > 2:507448‑M2/1‑64 (MQ=255) caccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTg < 2:1076178‑M1/23‑1 (MQ=255) caccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTg < 2:1049567‑M1/23‑1 (MQ=255) ttACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttc < 1:2998‑M2/76‑17 (MQ=255) tACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttca < 2:1673082‑M2/76‑18 (MQ=255) tACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttca > 1:218228‑M2/1‑59 (MQ=255) ccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGAc < 2:826454‑M1/25‑1 (MQ=255) aCTTTCACCATTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcac < 1:1697203‑M2/76‑19 (MQ=255) caccacTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactg < 2:1076178‑M2/76‑24 (MQ=255) caccacTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactg < 2:1049567‑M2/76‑24 (MQ=255) ataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctgtct < 2:864016‑M1/31‑1 (MQ=255) taaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctgtctg > 2:256953‑M1/45‑76 (MQ=255) ccacTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgac < 2:826454‑M2/76‑26 (MQ=255) aaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctgtctgt < 1:1043383‑M1/33‑1 (MQ=255) aaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctgtctgt < 2:460664‑M1/33‑1 (MQ=255) aaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctgtctgt < 2:460683‑M1/33‑1 (MQ=255) atctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTg > 2:1482569‑M1/42‑76 (MQ=255) tctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTgg < 2:994105‑M1/36‑1 (MQ=255) ctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGc < 2:1185041‑M1/37‑1 (MQ=255) tgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCa < 1:1458173‑M1/38‑1 (MQ=255) tgtgatctgcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGgcg > 2:200091‑M1/39‑75 (MQ=255) gttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCaa > 1:827961‑M1/38‑76 (MQ=255) gttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCaa > 1:1452506‑M1/38‑76 (MQ=255) gttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCaa < 2:1396340‑M1/39‑1 (MQ=255) ttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAac < 2:198399‑M1/40‑1 (MQ=255) ttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAac < 2:810577‑M1/40‑1 (MQ=255) tatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAaca > 2:514430‑M1/36‑76 (MQ=255) tatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAaca < 1:1337532‑M1/41‑1 (MQ=255) tatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacatatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAaca > 1:1731856‑M1/36‑76 (MQ=255) aaaTCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgt < 2:804197‑M2/76‑34 (MQ=255) aaaTCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgt < 2:460664‑M2/76‑34 (MQ=255) aTCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttg > 2:1482569‑M2/1‑41 (MQ=255) cTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggc < 2:1185041‑M2/76‑38 (MQ=255) tgtgATCTGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcg > 2:200091‑M2/1‑38 (MQ=255) tGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggca < 1:1458173‑M2/76‑39 (MQ=255) gTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaa > 1:1452506‑M2/1‑37 (MQ=255) caacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTAc < 2:1505932‑M1/47‑1 (MQ=255) ttATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaac < 2:198399‑M2/76‑41 (MQ=255) ttATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaac < 2:810577‑M2/76‑41 (MQ=255) aacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACt < 2:1444139‑M1/48‑1 (MQ=255) tATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaaca < 1:1337532‑M2/76‑42 (MQ=255) tATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaaca > 2:514430‑M2/1‑35 (MQ=255) cagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTgg < 2:894071‑M1/50‑1 (MQ=255) cgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTg > 1:1002901‑M1/24‑76 (MQ=255) cAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtac < 2:1505932‑M2/76‑48 (MQ=255) aatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACg > 1:456868‑M1/21‑76 (MQ=255) aatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACg > 1:503165‑M1/21‑76 (MQ=255) aaCAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtact < 2:1444139‑M2/76‑49 (MQ=255) atcgttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGa < 1:678977‑M1/57‑1 (MQ=255) aCAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactg > 1:553030‑M2/1‑27 (MQ=255) cAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactgg < 2:894071‑M2/76‑51 (MQ=255) cGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttg > 1:1002901‑M2/1‑23 (MQ=255) gcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCt > 1:206265‑M1/14‑76 (MQ=255) cggtaacgtatgAANGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTg < 1:1000316‑M1/64‑1 (MQ=255) aaTGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacg > 1:503165‑M2/1‑20 (MQ=255) aaTGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacg > 1:456868‑M2/1‑20 (MQ=255) aTCGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacga < 1:678977‑M2/76‑58 (MQ=255) 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gTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgat > 2:614759‑M2/1‑10 (MQ=255) gTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgat > 2:344172‑M2/1‑10 (MQ=255) gAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTAtggt > 1:1024269‑M1/2‑75 (MQ=255) aacgtatgaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatcg > 1:1088459‑M2/1‑8 (MQ=255) cgtatgaacgtatgaaggtttcactactgacctgtttgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatcggt > 1:836583‑M2/1‑6 (MQ=255) gtatgaacgtatgaaggtttcactactgccctgtctgttggcaaccccgtactggttgacgatggtctgatcggta > 2:988796‑M2/1‑5 (MQ=255) gTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGtt < 2:425162/76‑1 (MQ=255) gTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGtt < 1:205968/76‑1 (MQ=255) tATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTa < 1:1602395/76‑1 (MQ=255) tGAAGGTTTCACTAGTGACGTGTCTGTTGGCAACCCCGTACTAGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTAcc < 2:291701/76‑1 (MQ=255) gaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatcggtatggt > 1:1024269‑M2/1‑1 (MQ=255) | AAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCG > REL606/1733220‑1733370 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |