| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 3022392 = | 102 (1.800) | 6 (0.120) | 4/136 | 5.3 | 5.5% | coding (293/1140 nt) | ECB_02821 | hypothetical protein |
| ? | REL606 | 3022865 = | 114 (2.220) | intergenic (‑181/+393) | ECB_02821/ECB_02822 | hypothetical protein/bifunctional Ribulose 5‑phosphate reductase/CDP‑ribitol pyrophosphorylase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
ATAGTCGTAGATTCTAATAATTGGTTTAACAGAGGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACTGTGCATTAAACAAATAAAATACAATCTTTCCCTTGATA > REL606/3022319‑3022466 | aTAGTCGTAGATTCTAATAATTGGTTTAACAGAGGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATa < 1:1601845/76‑1 (MQ=255) tAGTCGTAGATTCTAATAATTGGTTTAACAGAGGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATaa < 1:794127/76‑1 (MQ=255) aGTCGTAGATTCTAATAATTGGTTTAACAGAGGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAg > 2:812235/1‑76 (MQ=255) aGTCGTAGATTCTAATAACTGGTTTAACATTGGTATGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTCCAAAAACATGGATAAg < 1:1739858/76‑1 (MQ=255) gTCGTAGATTCTAATAATTGGTTTAACAGAGGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGa < 1:195732/76‑1 (MQ=255) tCGTAGATTCTAATAATTGGTTTAACAGAGGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGAt < 1:1375797/76‑1 (MQ=255) tCGTAGATTCTAATAATTGGTTTAACAGAGGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGAt > 1:131873/1‑76 (MQ=255) cGTAGATTCTAATAATTGGTTTAACAGAGGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGAtc > 2:1666667/1‑76 (MQ=255) cGTAGATTCTAATAATTGGTTTAACAGAGGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGAtc > 2:117110/1‑76 (MQ=255) cGTAGATTCTAATAATTGGTTTAACAGAGGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGAtc > 1:439310/1‑76 (MQ=255) cGTAGATTCTAATAATTGGTTTAACAGAGGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGAta > 1:763508/1‑75 (MQ=255) gTAGATTCTAATAATTGGTTTAACAGAGGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGAtct > 1:1709021/1‑76 (MQ=255) tAGATTCTAATAATTGGTTTAACAGAGGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACCAGGATAAGAtctc > 2:1203202/1‑76 (MQ=255) aGATTCTAATAATTGGTTTAACAGAGGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATctct < 2:6308/76‑1 (MQ=255) aGATTCTAATAATTGGTTTAACAGAGGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATctct < 2:1155170/76‑1 (MQ=255) aGATTCTAATAATTGGTTTAACAGAGGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATctct > 1:679126/1‑76 (MQ=255) gATTCTAATAATTGGTTTAACAGAGGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTa < 2:657081/76‑1 (MQ=255) tCTAATAATTGGTTTAACAGAGGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATCAGATCTCTATTg > 2:699877/1‑76 (MQ=255) tCTAATAATTGGTTTAACAGAGGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTg > 2:699862/1‑76 (MQ=255) tCTAATAATTGGTTTAACAGAGGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTg < 2:1208661/76‑1 (MQ=255) cTAATAATTGGTTTAACAGAGGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTgg > 1:1652220/1‑76 (MQ=255) cTAATAATTGGTTTAACAGAGGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTgg > 1:1740078/1‑76 (MQ=255) aataatTGGTTTAACAGAGGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATANGATCTCTATTGGCt < 1:998935/76‑1 (MQ=255) aataatTGGTTTAACAGAGGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCt > 2:1391087/1‑76 (MQ=255) aataatTGGTTTAACAGAGGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCt < 2:1410455/76‑1 (MQ=255) aataatTGGTTTAACAGAGGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCt < 1:1290179/76‑1 (MQ=255) ataatTGGTTTAACAGAGGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTa < 2:690012/76‑1 (MQ=255) taatTGGTTTAACAGAGGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTac > 2:1806257/1‑76 (MQ=255) taatTGGTTTAACAGAGGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTac > 2:1695543/1‑76 (MQ=255) taatTGGTTTAACAGAGGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTAAAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTac > 1:1620869/1‑76 (MQ=255) aatTGGTTTAACAGAGGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTacg < 1:628372/76‑1 (MQ=255) ttGGTTTAACAGAGGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTacgac < 1:1292350/76‑1 (MQ=255) tGGTTTAACAGAGGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTGTTGGCTacggca > 1:929622/1‑76 (MQ=255) tGGTTTAACAGAGGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTacgaca < 2:668438/76‑1 (MQ=255) tGGTTTAACAGAGGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTacgaca > 2:2750/1‑76 (MQ=255) ggTTTAACAGAGGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTacgacac < 2:352729/76‑1 (MQ=255) ggTTTAACAGAGGCTAGCTTATGACCCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTaccacac < 1:1036883/76‑1 (MQ=255) tttAACAGAGGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTacgacacga > 2:363361/1‑76 (MQ=255) tAACAGAGGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTAcgacacgaca > 1:465457/1‑76 (MQ=255) tAACAGAGGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTAcgacacgaca > 1:588993/1‑76 (MQ=255) tAACAGAGGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTAcgacacgaca > 1:177077/1‑76 (MQ=255) aCAGGGGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAAt < 1:1827733/76‑1 (MQ=255) aCAGAGGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAAt < 2:779978/76‑1 (MQ=255) agagGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTg > 2:183567/1‑76 (MQ=255) gagGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTgg > 1:810793/1‑76 (MQ=255) gagGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAAATgg > 1:694525/1‑76 (MQ=255) agGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGa < 1:642805/76‑1 (MQ=255) agGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGa > 1:75676/1‑76 (MQ=255) gCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACt < 1:891546/76‑1 (MQ=255) gCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACt < 1:891556/76‑1 (MQ=255) gCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACt < 2:598407/76‑1 (MQ=255) tttgCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAAATGGACtg > 2:1429793/4‑76 (MQ=255) cTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACtg > 1:1064265/1‑76 (MQ=255) cTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACtg < 1:1095749/76‑1 (MQ=255) cTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACtg < 1:854879/76‑1 (MQ=255) cTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACtg > 1:1064248/1‑76 (MQ=255) cTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACtg < 1:52554/76‑1 (MQ=255) tAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACtgt < 2:1603983/76‑1 (MQ=255) aGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACtgtg > 1:961293/1‑76 (MQ=255) cTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACTGTGCa < 1:1820713/76‑1 (MQ=255) cTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACTGTGCa > 1:1162366/1‑76 (MQ=255) tATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACTGTGCAtt > 1:87197/1‑76 (MQ=255) tATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACTGTGCAtt > 1:506814/1‑76 (MQ=255) tATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACTGTGCAtt > 1:646807/1‑76 (MQ=255) aTGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACTGTGCATTa < 1:1540075/76‑1 (MQ=255) aTGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACTGTGCATTa < 2:1549140/76‑1 (MQ=255) tGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACTGTGCATTaa < 2:1222798/76‑1 (MQ=255) gACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACTGTGCATTaaa < 1:711419/76‑1 (MQ=255) aCTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACTGTGCATTAAAc > 2:1717166/1‑76 (MQ=255) ctctCGCCGTAAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACTGTGCATTAAACa < 1:785072/76‑1 (MQ=255) ctcGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACTGTGCATTAAACaaa < 1:1550271/76‑1 (MQ=255) tcGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACTGTGCATTAAACaaat > 2:1295801/1‑76 (MQ=255) cGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACTGTGCATTAAACaaata < 1:651217/76‑1 (MQ=255) cGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACTGTGCATTAAACaaata < 1:1623639/76‑1 (MQ=255) cGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACTGTGCATTAAACaaata < 1:1623625/76‑1 (MQ=255) gCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACTGTGCATTAAACaaataa < 1:1332348/76‑1 (MQ=255) gCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACTGTGCATTAAACaaataa < 2:269548/76‑1 (MQ=255) ccGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACTGTGCATTAAACaaataaa < 2:340093/76‑1 (MQ=255) ccGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACTGTGCATTAAACaaataaa > 2:1159876/1‑76 (MQ=255) ccGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACTGTGCATTAAACaaataaa < 2:1065244/76‑1 (MQ=255) ngTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACTGTGCATTAAACaaataaaa > 1:247525/2‑76 (MQ=255) cGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACTGTGCATTAAACaaataaaa < 2:1637859/76‑1 (MQ=255) gTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACTGTGCATTAAACaaataaaat > 1:1051587/1‑76 (MQ=255) gaattACAAAAACGTGGGGAAGACCTCTATTGGCGACGACACGACCATTGGACTGTGCGTTAATCAAATAAAATAc < 2:1312352/73‑1 (MQ=255) gAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACTGTGCATTAAACAAATAAAATAc < 2:746899/76‑1 (MQ=255) aGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACTGTGCATTAAACAAATAAAATACa > 2:141372/1‑76 (MQ=255) gTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACTGTGCATTAAACAAATAAAATACat < 2:1019775/76‑2 (MQ=255) gTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACTGTGCATTAAACAAATAAAATACaa < 1:1575999/76‑1 (MQ=255) cAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACTGTGCATTAAACAAATAAAATACAATCtt > 1:825652/1‑76 (MQ=255) aaaagCATGGATAAGAACTCTATTGGCTACGACACGACAATGGGACTGTGCATTAAACAAATAAAATACAATCttt < 1:1794351/76‑1 (MQ=255) aaaaaCATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACTGTGCATTAAACAAATNAAATACAATCttt < 1:1229790/76‑1 (MQ=255) aaaaaCATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACTGTGCATTAAACAAATAAAATACAATCttt < 2:1352684/76‑1 (MQ=255) aaaaaCAAGGATAAAATCTCTATTGGCTACGACACGAGAATTGGACTGTGCATTAAACAAATAAAATACAATCttt < 1:1794370/76‑1 (MQ=255) cATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACTGTGCATTAAACAAATAAAATACAATCTTTCCCtt > 1:156752/1‑76 (MQ=255) aTGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACTGTGCATTAAACAAATAAAATACAATCTTTCCCTTg > 1:12937/1‑76 (MQ=255) aTGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACTGTGCATTAAACAAATAAAATACAATCTTTCCCTTg < 2:1275208/76‑1 (MQ=255) tGGATAAGATCTCTATTGGCTACGGCACGAAAATTTGACTGTGCATTAAACAAATAAAATACAATCTTTCCCTTgt > 1:298285/1‑75 (MQ=255) tGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACTGTGCATTAAACAAATAAAATACAATCTTTCCCTTGa < 2:763508/76‑1 (MQ=255) agaaTAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACTGTGCATTAAACAAATAAAATACAATCTTTCCCTTGa > 2:508546/4‑76 (MQ=255) agaaTAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACTGTGCATTAAACAAATAAAATACAATCTTTCCCTTGa > 2:508532/4‑76 (MQ=255) | ATAGTCGTAGATTCTAATAATTGGTTTAACAGAGGCTAGCTTATGACTCTCGCCGTGAGTTACAAAAACATGGATAAGATCTCTATTGGCTACGACACGACAATTGGACTGTGCATTAAACAAATAAAATACAATCTTTCCCTTGATA > REL606/3022319‑3022466 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |