| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 3022392 = | 102 (1.800) | 6 (0.120) | 4/136 | 5.3 | 5.5% | coding (293/1140 nt) | ECB_02821 | hypothetical protein |
| ? | REL606 | 3022865 = | 114 (2.220) | intergenic (‑181/+393) | ECB_02821/ECB_02822 | hypothetical protein/bifunctional Ribulose 5‑phosphate reductase/CDP‑ribitol pyrophosphorylase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
CTTTAACAATTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAACCTAAATGAAATATAC > REL606/3022790‑3022940 | ntttAACAATTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTAtt > 1:1124416/2‑76 (MQ=255) tttAACAATTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTc > 1:1354979/1‑76 (MQ=255) ttAACAATTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCt < 1:508546/76‑1 (MQ=255) ttAACAATTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCt < 1:508532/76‑1 (MQ=255) ttAACAATTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCt > 1:1323501/1‑76 (MQ=255) ttAACAATTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCt > 1:1323515/1‑76 (MQ=255) aCAATTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTtaa < 2:1304101/76‑1 (MQ=255) aaTTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTtaata < 1:562433/76‑1 (MQ=255) aaTTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTtaata < 2:87289/76‑1 (MQ=255) aaTTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTtaata < 1:696055/76‑1 (MQ=255) aaTTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTtaata < 1:755544/76‑1 (MQ=255) aaTTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTtaata < 1:1293372/76‑1 (MQ=255) aaTTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTtaata > 1:1536458/1‑76 (MQ=255) aaTTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTtaata < 2:30118/76‑1 (MQ=255) aaTTATAAAAACAAAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTtaata < 1:1032492/76‑1 (MQ=255) aTTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTtaataa < 2:875021/76‑1 (MQ=255) aTTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAAGCTTATTCTtaataa < 1:986939/76‑1 (MQ=255) tataAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATaaaa > 1:1255903/1‑76 (MQ=255) tataAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATaaaa < 1:1649490/76‑1 (MQ=255) tataAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATaaaa < 2:1213792/76‑1 (MQ=255) ataAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATaaaaa < 1:534882/76‑1 (MQ=255) ataAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATaaaaa < 1:794764/76‑1 (MQ=255) ataAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATaaaaa > 2:31624/1‑76 (MQ=255) taAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATaaaaaa < 1:1686858/76‑1 (MQ=255) aaaCACAAACCAATCACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATgt < 2:1722856/76‑1 (MQ=255) aaaCACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATgt < 2:1070270/76‑1 (MQ=255) aaaCACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATgt < 1:93300/76‑1 (MQ=255) acacAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATgtag > 2:74607/1‑76 (MQ=255) cacaAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATgtagt > 2:1376676/1‑76 (MQ=255) cacaAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATgtagt < 1:24245/76‑1 (MQ=255) aaaCCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTaaa < 1:344115/76‑1 (MQ=255) aaCCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTaaaa < 1:578669/76‑1 (MQ=255) aaCCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTaaaa < 2:1459611/76‑1 (MQ=255) aCCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAAt < 1:1584835/76‑1 (MQ=255) aCCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAAt < 1:455325/76‑1 (MQ=255) ccAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATc < 2:790955/76‑1 (MQ=255) cAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCt > 2:2964/1‑76 (MQ=255) cAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCt > 2:169101/1‑76 (MQ=255) aaTAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCtt > 1:912072/1‑76 (MQ=255) aaTAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCtt > 2:1013101/1‑76 (MQ=255) aaTAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCtt > 2:549128/1‑76 (MQ=255) aaCTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTa > 2:1628221/1‑76 (MQ=255) aaCTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTa > 2:87792/1‑76 (MQ=255) aaCTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTa < 1:1329074/76‑1 (MQ=255) aaCTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTa > 1:1449763/1‑76 (MQ=255) aaCTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTa > 1:555348/1‑76 (MQ=255) aCTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTaa < 1:1298211/76‑1 (MQ=255) aCTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTaa > 2:68419/1‑76 (MQ=255) aCTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTaa < 1:626231/76‑1 (MQ=255) aCTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTaa < 1:846263/76‑1 (MQ=255) cTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTaaa > 2:1341111/1‑76 (MQ=255) tgttGGTGCGATTTATCTGGAGCTATGCTATTTAAAATCTTATTCTTGATAAAAAATGTTGTAAAATCTTGTaaaa < 1:1025690/74‑1 (MQ=255) tATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTaaaa > 2:558452/1‑76 (MQ=255) tATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTaaaa < 2:1520043/76‑1 (MQ=255) tATTGGTGAAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTaaaa < 1:528688/76‑1 (MQ=255) tGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAaaat > 1:610961/1‑76 (MQ=255) tGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAaaat > 2:1036528/1‑76 (MQ=255) ggTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAGaaatn < 1:75406/76‑2 (MQ=255) ggTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAaaata < 1:1395826/76‑1 (MQ=255) gTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAaaataa < 1:518092/76‑1 (MQ=255) gTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAaaataa < 1:1789923/76‑1 (MQ=255) gTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAaaataa > 1:1259118/1‑76 (MQ=255) gCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAaaataaan < 1:1625590/76‑2 (MQ=255) gCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAaaataaan < 1:1625570/76‑2 (MQ=255) gCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAaaataaan < 1:1625571/76‑2 (MQ=255) aaTTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAAttt < 2:359777/76‑1 (MQ=255) tATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATaa > 1:95095/1‑76 (MQ=255) tATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATaa > 1:27960/1‑76 (MQ=255) tATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATaa > 1:1517420/1‑76 (MQ=255) tCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATg < 2:746446/76‑1 (MQ=255) tCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATg < 1:1813094/76‑1 (MQ=255) cTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGc < 1:150961/76‑1 (MQ=255) tGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCt < 2:512648/76‑1 (MQ=255) ggAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCtt < 2:1004059/76‑1 (MQ=255) aGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTa < 2:721615/76‑1 (MQ=255) gCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTAt < 2:1431401/76‑1 (MQ=255) cAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATg > 2:1827894/1‑76 (MQ=255) aaTGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATgt < 1:952847/76‑2 (MQ=255) aTGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGa < 1:413464/76‑1 (MQ=255) gCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGaaa > 1:1503070/1‑76 (MQ=255) aTTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAAcc > 1:926050/1‑76 (MQ=255) aTTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAAcc > 2:242213/1‑76 (MQ=255) ttAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAACCTa > 1:374225/1‑76 (MQ=255) ttAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAACCTa < 1:1487168/76‑1 (MQ=255) ttAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAACCTa < 2:1155176/76‑1 (MQ=255) ttAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAACCTa > 2:859699/1‑76 (MQ=255) ttAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAACCTa < 1:758767/76‑1 (MQ=255) tAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAACCTaa < 1:1290259/76‑1 (MQ=255) tAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAACCTaa > 2:1359354/1‑76 (MQ=255) tAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAACCTaa > 2:1714742/1‑76 (MQ=255) aaagTCGTAGTCTTAATAAAAAATGGAGTAAAAACGTGTAAAAAATAAAGTTATAATGCTTTATGGAAAACCTatt < 2:59926/76‑3 (MQ=255) aaaaTCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAACCTaaa > 2:1583438/1‑76 (MQ=255) aaTCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAACCTAAATg < 1:1548684/76‑1 (MQ=255) aTCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGCAAAACCTAAATGa < 1:1219625/76‑1 (MQ=255) aTCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGCAAAACCTAAATGa < 1:1219604/76‑1 (MQ=255) tCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAACCTAAATGaa > 1:395833/1‑76 (MQ=255) ttATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAACCTAAATGAAat > 1:1453779/1‑76 (MQ=255) tATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAACCTAAATGAAata < 2:1093350/76‑1 (MQ=255) ttCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAACCTAAATGAAAtata > 2:1145602/1‑76 (MQ=255) tCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAACCTAAATGAAATATAc < 1:558452/76‑1 (MQ=255) | CTTTAACAATTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAACCTAAATGAAATATAC > REL606/3022790‑3022940 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |