| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 1425653 = | NA (NA) | 10 (0.210) | 6/146 | 4.5 | 10.1% | coding (211/267 nt) | ynaE | predicted DNA‑binding transcriptional regulator |
| ? | REL606 | 1426028 = | 92 (1.860) | intergenic (‑165/+763) | ynaE/ynaF | predicted DNA‑binding transcriptional regulator/stress‑induced protein, ATP‑binding protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGAGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTT > REL606/1425953‑1426103 | ggCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGAGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGt < 2:178446/76‑1 (MQ=32) aTGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGAGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAAt > 2:845106/1‑76 (MQ=34) aTGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGAGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAAt < 1:406010/76‑1 (MQ=34) aTGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGAGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAAt < 2:639376/76‑1 (MQ=34) aTGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGAGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAAt < 1:405994/76‑1 (MQ=34) tGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGAGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAAtg > 1:1149678/1‑76 (MQ=34) gACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGAGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAAtgt > 1:1438721/1‑76 (MQ=34) gACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGAGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAAtgt > 2:32120/1‑76 (MQ=34) tAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGAGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGtt < 1:1589377/76‑1 (MQ=34) tAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGAGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGtt > 1:1248545/1‑76 (MQ=34) tAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGAGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGtt > 2:601106/1‑76 (MQ=34) aaaaaTGCTGAATATGATAAGGAGAGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTta > 1:1291069/1‑76 (MQ=34) aaaaTGCTGAATATGATAAGGAGAGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTtat > 2:330313/1‑76 (MQ=34) aaaaTGCTGAATATGATAAGGAGAGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTtat < 1:259716/76‑1 (MQ=34) aaaaTGCTGAATATGATAAGGAGAGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTtat > 2:330300/1‑76 (MQ=34) aaaaTGCTGAATATGATAAGGAGAGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTtat < 1:1272262/76‑1 (MQ=34) aaaaTGCTGAATATGATAAGGAGAGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTtat < 1:1004342/76‑1 (MQ=34) aaTGCTGAATATGATAAGGAGAGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTtatat < 1:388378/76‑1 (MQ=34) aaTGCTGAATATGATAAGGAGAGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTtatat > 1:1462403/1‑76 (MQ=34) gCTGAATATGATAAGGAGAGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATg < 1:1064545/76‑1 (MQ=34) cTGAATATGATAAGGAGAGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGa < 2:1244326/76‑1 (MQ=34) cTGAATATGATAAGGAGAGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGa > 1:943898/1‑76 (MQ=34) gAATATGATAAGGAGAGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGata < 1:262577/76‑1 (MQ=34) aaTATGATAAGGAGAGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGatat > 2:1008770/1‑76 (MQ=34) atatGATAAGGAGAGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGAtata < 1:1201617/76‑1 (MQ=34) tatGATAAGGAGAGAAGTGATTATCAGTATGCTTTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAg < 1:524593/76‑1 (MQ=21) tatGATAAGGAGAGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAg < 1:1218505/76‑1 (MQ=34) atGATAAGGAGAGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGt < 1:732334/76‑1 (MQ=34) atGATAAGGAGAGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGt > 1:954766/1‑76 (MQ=34) tGATAAGGAGAGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGtt < 2:1047706/76‑1 (MQ=34) tGATAAGGAGAGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGtt > 2:1066688/1‑76 (MQ=34) gATAAGGAGAGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTg > 1:216608/1‑76 (MQ=34) aTAAGGAGAGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGa > 1:153600/1‑76 (MQ=34) aTAAGGAGAGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGa > 1:716789/1‑76 (MQ=34) tAAGGAGAGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATNTGATATAGTTGAc < 1:1079345/76‑1 (MQ=21) tAAGGAGAGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGan < 1:1352932/76‑2 (MQ=21) tAAGGAGAGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATAGAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGAc > 2:1452408/1‑76 (MQ=21) aaGGAGAGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACa > 1:723965/1‑76 (MQ=35) aGGAGAGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACaa < 2:863065/76‑1 (MQ=38) aGGAGAGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACaa < 1:548789/76‑1 (MQ=38) gagagaAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAAtt > 2:119826/1‑76 (MQ=39) gagaAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAAtttt < 1:369246/76‑1 (MQ=39) aaGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATCTAGATGACAATTTTTAt > 2:715379/1‑76 (MQ=255) aaGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTAt > 2:1452111/1‑76 (MQ=39) aaGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTAt > 2:463736/1‑76 (MQ=39) aGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATc > 2:420987/1‑76 (MQ=39) gTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCt > 1:1351595/1‑76 (MQ=39) tGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCtt > 1:1179673/1‑76 (MQ=39) gATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTg < 2:437201/76‑1 (MQ=39) aTTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTgg > 2:1485606/1‑76 (MQ=39) aTTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTgg > 2:1555964/1‑76 (MQ=39) aTTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTgg < 2:972244/76‑1 (MQ=39) ttATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTggg < 2:915823/76‑1 (MQ=39) ttATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTggg < 1:262522/76‑1 (MQ=39) tATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGgt > 2:961835/1‑76 (MQ=39) tATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGgt > 2:795669/1‑76 (MQ=39) tCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGgtgt < 2:37289/76‑1 (MQ=255) cAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGtt > 2:1375941/1‑76 (MQ=255) aGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTc > 1:1249234/1‑76 (MQ=255) gTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCt > 1:505138/1‑76 (MQ=255) tATGCTGTTCATATNGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCtt > 1:875187/1‑76 (MQ=255) tATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCtt > 1:401123/1‑76 (MQ=255) aTGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCTTa > 2:434706/1‑76 (MQ=255) aTGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCTTa < 2:644678/76‑1 (MQ=255) aTGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCTTa > 1:426833/1‑76 (MQ=255) aTGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCTTa < 2:208467/76‑1 (MQ=255) tGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCTTaa > 1:108603/1‑76 (MQ=255) gCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCTTaaa < 1:1413522/76‑1 (MQ=255) gCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGCGTTCTTaaa > 2:236775/1‑76 (MQ=255) cTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCTTAAAg > 2:1009157/1‑76 (MQ=255) tGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCTTAAAGt > 2:576638/1‑76 (MQ=255) gTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCTTAAAGtt < 2:840900/76‑1 (MQ=255) ttCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCTTAAAGTTc > 1:1148524/1‑76 (MQ=255) ttCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCTTAAAGTTc > 1:1068514/1‑76 (MQ=255) ttCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCTTAAAGTTc > 2:314677/1‑76 (MQ=255) ttCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCTTAAAGTTc > 2:148268/1‑76 (MQ=255) tCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCTTAAAGTTCg < 1:996255/76‑1 (MQ=255) cATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCTTAAAGTTCGt < 1:935230/76‑1 (MQ=255) ataGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGa < 1:324619/76‑1 (MQ=39) taGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGAt < 2:918179/76‑1 (MQ=39) gCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATaa < 1:68181/76‑1 (MQ=39) ccTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATaaa < 2:1288367/76‑1 (MQ=39) cGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACAt < 1:1422503/76‑1 (MQ=39) cGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACAt > 2:831577/1‑76 (MQ=39) cGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACAt > 2:831590/1‑76 (MQ=39) aaTTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTg < 2:207043/76‑1 (MQ=39) aTTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGt < 1:1523562/76‑1 (MQ=39) aTTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGt > 1:690223/1‑76 (MQ=39) ttAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAGCATTGTc < 1:1002737/76‑1 (MQ=255) tAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCg > 1:1177820/1‑76 (MQ=39) tAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCg < 1:149124/76‑1 (MQ=39) tAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCg > 2:961953/1‑76 (MQ=39) tAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGttt > 2:460961/1‑76 (MQ=34) tAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGttt > 1:409323/1‑76 (MQ=34) | GGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGAGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTT > REL606/1425953‑1426103 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |