Missing coverage evidence... | ||||||||||
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seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 583464 | 583640 | 177 | 19 [17] | [18] 20 | tfaX/appY | pseudogene, DLP12 prophage,Phage or Prophage Related/global transcriptional activator, DLP12 prophage |
TGACTTGATAAGAAATGCAAGTAAAAATGATACTCTTTTTATTTTAAATTCAAACGGTTGACATATATATAGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATAAAAAGCATAGTAAGCGTTGAAAAATGTAACTTTGAAATAAGTTAGAATAAAAAACAACATACATATAA > NC_000913/583350‑583529 | tgACTTGATAAGGAATGCAAGTAAAAATGATACTCTTTTTATTTTAAATTCAAACGGTTGACATATATATAGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATAAAAAg > 2:1535738/1‑117 (MQ=255) tgACTTGATAAGGAATGCAAGTAAAAATGATACTCTTTTTATTTTAAATTCAAACGGTTGACATATATATAGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATAAAAAg < 1:1535738/117‑1 (MQ=255) aCTCTTTTTATTTTAAATTCAAACGGTTGACATATATATAGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATAAAAAGCATAGTAAGCGTTGAAAAATGTAACTTTGAAATAAGTTAGAATAAAAaacaac < 1:1404315/139‑1 (MQ=255) tttttATTTTAAATTCAAACGGTTGACATATATATAGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATAAAAAGCATAGTAAGCGTTGAAAAATGTAACTTTGAAATAAGTTAGAATAAAAaac < 1:981238/132‑1 (MQ=255) ttattattttaGATTCAAACGGTTGACATATATATAGCAAGAGGTTTCAGGTCCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATAAAAAGCATAGTAAGCGTTGAAAAATGTAACTTTGAAATAAGTTAGAATAAAAaac > 2:981238/4‑132 (MQ=255) tttaAATTCAAACGGTTGACATATATATAGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATAAAAAGCATAGTAAGCGTTGAAAAATGTAACTTTGaaa < 1:866880/107‑1 (MQ=255) tttaAATTCAAACGGTTGACATATATATAGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATAAAAAGCATAGTAAGCGTTGAAAAATGTAACTTTGaaa > 2:866880/1‑107 (MQ=255) tatataGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATaaa < 1:61192/49‑1 (MQ=255) tatataGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATaaa > 2:61192/1‑49 (MQ=255) tataGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATAAAAAGCATAGTAAGCg < 1:813259/61‑1 (MQ=255) tataGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATAAAAAGCATAGTAAGCg < 1:1347097/61‑1 (MQ=255) tataGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATAAAAAGCATAGTAAGCg > 2:1347097/1‑61 (MQ=255) tataGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATAAAAAGCATAGTAAGCg > 2:813259/1‑61 (MQ=255) aGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATAAAAAGCATAGTAAGCGTTGAAAAATGTAACTTTg < 1:1601689/76‑1 (MQ=255) aGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATAAAAAGCATAGTAAGCGTTGAAAAATGTAACTTTg > 2:1601689/1‑76 (MQ=255) gagGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATAAAAAGCATAGTAAGCGTTGAAAAATGTAACTTTGAAATAAGTTAGAATAAAAaacaac < 2:1454955/95‑1 (MQ=255) gagGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATAAAAAGCATAGTAAGCGTTGAAAAATGTAACTTTGAAATAAGTTAGAATAAAAaacaac > 1:1454955/1‑95 (MQ=255) gagGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATAAAAAGCATAGTAAGCGTTGAAAAATGTAACTTTGAAATAAGTTAGAATAAAAAACAACATACATataa > 1:49145/1‑105 (MQ=255) gagGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATAAAAAGCATAGTAAGCGTTGAAAAATGTAACTTTGAAATAAGTTAGAATAAAAAACAACATACATataa < 2:49145/105‑1 (MQ=255) | TGACTTGATAAGAAATGCAAGTAAAAATGATACTCTTTTTATTTTAAATTCAAACGGTTGACATATATATAGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATAAAAAGCATAGTAAGCGTTGAAAAATGTAACTTTGAAATAAGTTAGAATAAAAAACAACATACATATAA > NC_000913/583350‑583529 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |