Missing coverage evidence... | ||||||||||
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seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 583464 | 583640 | 177 | 19 [17] | [18] 20 | tfaX/appY | pseudogene, DLP12 prophage,Phage or Prophage Related/global transcriptional activator, DLP12 prophage |
ATTAAAATTTGCAAACTATAATTTTGTGTATAAAAATATAAATGCACATCATCCTGATTATGATTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGTTTGCTCCGTAGTTTTCATCTGTCAATCATTTGATTTAATTATAAACAGGAGAGTTATCTCGTTCAAAAAAAATTCA > NC_000913/583553‑583767 | attaAAATTTGCAAACTATAATTTTGTGTATAAAAATATAAATGCACATCATCCTGATTATGATTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAg < 1:974826/128‑1 (MQ=255) attaAAATTTGCAAACTATAATTTTGTGTATAAAAATATAAATGCACATCATCCTGATTATGATTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATGTTATGATAGGTGCAAg > 2:974826/1‑128 (MQ=255) tgtATAAAAATATAAATGCACATCATCCTGATTATGATTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGAt > 2:559472/1‑93 (MQ=255) tgtATAAAAATATAAATGCACATCATCCTGATTATGATTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGAt < 1:559472/93‑1 (MQ=255) aTTATGATTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGTTTGCTCCGTAGTTTTCATCTGTCAATCATTTGATTTAATTATAAACAGGAGAGTTa > 2:610749/1‑139 (MQ=255) ttATGATTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGTTTGCTCCGTAGTTTTCATCTGTCAATCATTTGATTTAATTATAAACAGGAGAGTTAt > 1:1290429/1‑139 (MQ=255) gATTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGAt > 2:1531832/1‑58 (MQ=255) gATTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGAt < 1:1531832/58‑1 (MQ=255) tgtATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGTTTGCTCCGTAGTTTTCATCTGTCAATCATTTGATTTAATTATAAACAg < 1:86917/121‑1 (MQ=255) tgtATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGTTTGCTCCGTAGTTTTCATCTGTCAATCATTTGATTTAATTATAAACAg > 2:86917/1‑121 (MQ=255) gtATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGTTTGCTCCGTAGTTTTCATCTGTCAATCATTTGATTTAATTATAAACAGGAGAGTTATCTCGTTCaaa > 1:1152157/1‑139 (MQ=255) tGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGTTTGCTCCGTAGTTTTCATCTGTCAATCATTTGATTTAATTATAAACAGGAGAGTTATCTCGTTCAAAAAAAATTCa < 2:1290429/139‑1 (MQ=255) gttgttATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGa > 1:192813/1‑51 (MQ=255) gttgttATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGa < 2:192813/51‑1 (MQ=255) gttgttATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGTTTGCTCCGTAGTTTTCATCTGTCAAt > 2:1651991/1‑87 (MQ=255) gttgttATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGTTTGCTCCGTAGTTTTCATCTGTCAAt < 1:1651991/87‑1 (MQ=255) gttgttATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGTTTGCTCCGTAGTTTTCATCTGTCAATCATTTGATTTAATTATAAACAg > 1:417985/1‑109 (MQ=255) gttgttATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGTTTGCTCCGTAGTTTTCATCTGTCAATCATTTGATTTAATTATAAACAg < 2:417985/109‑1 (MQ=255) gACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGTTTGCTCCGTAGTTTTCATCTGTCAATCATTTGATTTAATTATAAACAg > 1:786938/1‑99 (MQ=255) gACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGTTTGCTCCGTAGTTTTCATCTGTCAATCATTTGATTTAATTATAAACAg < 2:786938/99‑1 (MQ=255) | ATTAAAATTTGCAAACTATAATTTTGTGTATAAAAATATAAATGCACATCATCCTGATTATGATTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGTTTGCTCCGTAGTTTTCATCTGTCAATCATTTGATTTAATTATAAACAGGAGAGTTATCTCGTTCAAAAAAAATTCA > NC_000913/583553‑583767 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |