| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1286708 = | 51 (0.740) | 20 (0.360) | 12/176 | 2.9 | 36.3% | intergenic (+182/+358) | narI/rttR | nitrate reductase 1, gamma (cytochrome b(NR)) subunit/rtT sRNA, processed from tyrT transcript |
| ? | NC_000913 | = 1287241 | 29 (0.520) | intergenic (‑5/+3) | rttR/tyrV | rtT sRNA, processed from tyrT transcript/tRNA‑Tyr | |||||
GGGCACGGTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCA > NC_000913/1286573‑1286837 | gggCACGGTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGAtg > 2:683655/1‑139 (MQ=255) cACGGTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGAtggtg > 1:520204/1‑139 (MQ=255) cGGTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGAtggtggt < 1:1235489/139‑1 (MQ=255) cgttgcctgcggcaacgctctctcgctgacgctcgagccgaaccttaatcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTggg > 2:76311‑M1/128‑139 (MQ=255) ttgcctgcggcaacgctctctcgctgacgctcgagccgaaccttaatcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTggggg > 2:330475‑M1/126‑139 (MQ=255) ttgcctgcggcaacgctctctcgctgacgctcgagccgaaccttaatcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTggggg > 2:407243‑M1/126‑139 (MQ=255) tGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGa < 2:659290/139‑1 (MQ=255) gcggcaacgctctctcgctgacgctcgagccgaaccttaatcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttacttgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGAt < 1:102925‑M1/20‑1 (MQ=255) gTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTa > 2:878907/1‑139 (MQ=255) caacgctctctcgctgacgctcgagccgaaccttaatcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACt < 1:199223‑M1/24‑1 (MQ=255) gATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAgcg > 1:398560/1‑139 (MQ=255) tttcgctgacgctcgagccgaacctaaatcgcagcttctcatccttccccgcatgtgcagaatatttcattgcggcttcgttgggaagttcacggacttttgaaaggGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTg < 1:1384377‑M1/32‑1 (MQ=255) gcgcTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTg > 2:485426/1‑139 (MQ=255) ctgacgctcgagccgaaccttaatcgaagcttctcatccttccccgcgtgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTggggg > 2:1001733‑M1/103‑116 (MQ=255) ctgacgctcgagccgaaccttaatcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTggggg < 1:1001733‑M1/14‑1 (MQ=255) acgctcgagccgaaccttaatcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTggggg < 1:961608‑M1/14‑1 (MQ=255) acgctcgagccgaaccttaatcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTggggg > 2:961608‑M1/100‑113 (MQ=255) tcgagccgaaccttaatcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttatttgcggattcgttgggaagttctgggacttttgaaagtGATGGTGGTggggg > 1:931620‑M1/96‑109 (MQ=255) tcgagccgaaccttaatcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTggggg < 1:693849‑M1/14‑1 (MQ=255) tcgagccgaaccttaatcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTggggg > 2:693849‑M1/96‑109 (MQ=255) tcgagccgaaccttaatcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTggggg < 2:931620‑M1/14‑1 (MQ=255) tcgagccgaaccttaatcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGccc < 2:853900‑M1/44‑1 (MQ=255) cTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGa < 2:840446/91‑1 (MQ=255) cTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGa > 1:840446/1‑91 (MQ=255) aCAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGT‑GGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCg < 2:563105/139‑1 (MQ=255) cAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCg < 1:878907/139‑1 (MQ=255) aatcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTc > 1:989888‑M1/82‑128 (MQ=255) aatcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTc < 2:989888‑M1/47‑1 (MQ=255) aggaTATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCt > 1:755891/1‑139 (MQ=255) ggaTATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTg > 1:1360416/1‑139 (MQ=255) aagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCgg < 1:671865‑M1/63‑1 (MQ=255) aagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCgg > 2:199223‑M1/77‑139 (MQ=255) atTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTgc < 2:1546876/108‑1 (MQ=255) atTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTgc > 1:1546876/1‑108 (MQ=255) tGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTggggg < 2:171005/87‑1 (MQ=255) tGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTggggg > 1:171005/1‑87 (MQ=255) tGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCaa < 2:365572/139‑1 (MQ=255) tGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCaa > 2:288992/1‑139 (MQ=255) gCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTggggg < 2:460129/82‑1 (MQ=255) gCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTggggg > 1:460129/1‑82 (MQ=255) gCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCTGCAACGctc > 2:1030154/1‑139 (MQ=255) ccGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGctctc > 2:581805/1‑139 (MQ=255) gTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCt < 1:856195/94‑1 (MQ=255) gTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCt > 2:856195/1‑94 (MQ=255) ggtgCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCt < 2:755891/139‑1 (MQ=255) atgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCt > 1:850878‑M1/56‑133 (MQ=255) atgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCt < 2:850878‑M1/78‑1 (MQ=255) atgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCt < 1:636323‑M1/84‑1 (MQ=255) gtgCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGctc < 1:974026/125‑1 (MQ=255) gtgCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGATCGTTGCCTGCGGCAACGctc > 2:974026/1‑125 (MQ=255) tgCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG‑‑AGGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTcg > 2:1493149/1‑138 (MQ=255) gcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTAGTCAGCGACGCTTGTTTCGCTCTTCTGCTCCTTGCCAGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCgctcgag < 1:1363579‑M1/88‑4 (MQ=255) aTCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTAAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAgcc > 2:987750/1‑137 (MQ=255) aTCGGGCAAAATTAGCTAGGAGTAACAGGGTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTcgagcc < 2:1087388/139‑6 (MQ=255) cAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTgc < 2:1053134/76‑1 (MQ=255) cAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTgc > 1:1053134/1‑76 (MQ=255) taattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGAtggtggt < 2:1358435‑M1/9‑1 (MQ=255) taattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGAtggtggt > 1:1358435‑M1/42‑50 (MQ=255) taattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTggggg < 2:352039‑M1/14‑1 (MQ=255) taattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTggggg > 1:352039‑M1/42‑55 (MQ=255) taattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTggggg > 1:534516‑M1/42‑55 (MQ=255) taattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTggggg < 2:534516‑M1/14‑1 (MQ=255) taattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACctta < 2:932233‑M1/98‑2 (MQ=255) tgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTggggg > 2:343088‑M1/38‑51 (MQ=255) tgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTggggg < 1:343088‑M1/14‑1 (MQ=255) gcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCcgaaccttaatcga > 2:636323‑M1/37‑133 (MQ=255) gCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCttaatcgaa < 1:1030154/139‑8 (MQ=17) gCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGaa < 2:398560/139‑1 (MQ=255) cggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGaa < 2:18997‑M1/104‑1 (MQ=255) cggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCACCGCTGCGCGCATCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGaa < 2:233116‑M1/104‑1 (MQ=255) gattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTGGGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTTCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAAc > 2:1287132‑M1/34‑129 (MQ=255) gattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTGGGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGTTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAAc < 1:1287132‑M1/96‑1 (MQ=255) gattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTggcgctcgagccg > 2:1517910‑M1/34‑118 (MQ=255) gattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTggcgctcgagccg < 1:1517910‑M1/91‑7 (MQ=255) gAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTtc > 1:1337492/1‑139 (MQ=17) aGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTtct > 2:1568969/1‑139 (MQ=14) tAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCa < 2:555006/139‑1 (MQ=14) tAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCa < 1:288992/139‑1 (MQ=14) aCAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATc > 1:1370808/1‑139 (MQ=14) gTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG‑‑AGGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTc < 1:1493149/139‑1 (MQ=14) tttGATTATTTCAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCt < 2:898354/126‑1 (MQ=14) tttGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCt > 1:898354/1‑126 (MQ=14) tttGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTccc > 2:166577/1‑139 (MQ=14) tttGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTccc > 1:1250198/1‑139 (MQ=255) tttGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTccc > 2:58454/1‑139 (MQ=255) tttGATTATTTAAGGAAGCGATGGCGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCa < 2:519775/131‑1 (MQ=14) tttGATTATTTAAGGAAGCGATGGCGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCa > 1:519775/1‑131 (MQ=14) tcagggacttttgaaagtGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCaa > 2:1216900‑M1/19‑84 (MQ=255) cagggacttttgaaagtGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGAtt < 2:1002977‑M1/21‑1 (MQ=255) cagggacttttgaaagtGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGAtt > 1:1002977‑M1/18‑38 (MQ=255) gATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGc < 2:1337492/139‑1 (MQ=11) attattTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGca < 2:520204/139‑2 (MQ=11) tAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCa < 1:58454/139‑1 (MQ=255) | GGGCACGGTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG‑‑AAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCA > NC_000913/1286573‑1286837 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |