| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1286875 = | 44 (0.740) | 22 (0.530) | 19/146 | 0.9 | 47.6% | intergenic (+349/+191) | narI/rttR | nitrate reductase 1, gamma (cytochrome b(NR)) subunit/rtT sRNA, processed from tyrT transcript |
| ? | NC_000913 | = 1287230 | 18 (0.440) | noncoding (7/171 nt) | rttR | rtT sRNA, processed from tyrT transcript | |||||
CTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGC > NC_000913/1286751‑1287008 | cttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctgacgctcgagccgaaccttaatcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggaCTTTTGAAAGTGAtg > 1:131030‑M1/125‑139 (MQ=255) tgcggcaacgctctctcgctgacgctcgagccgaaccttaatcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggaCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGa > 1:578058‑M1/110‑139 (MQ=255) cggcaacgctctctcgctgacgctcgagccgaaccttaatcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggaCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAtt < 1:423162‑M1/32‑1 (MQ=255) ctcgctgacgctcgagccgaaccttaatcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggaCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTgc < 2:1120631‑M1/44‑1 (MQ=255) gacgctcgagccgaaccttaatcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggaCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCtt > 2:423162‑M1/90‑139 (MQ=255) acgctcgagccgaaccttaatcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggaCTTTTGAAAGTGATGGTGGTggggg > 1:1038456‑M1/89‑113 (MQ=255) acgctcgagccgaaccttaatcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggaCTTTTGAAAGTGATGGTGGTggggg < 2:1038456‑M1/25‑1 (MQ=255) gctcgagccgaaccttaatcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggaCTTTTGaa < 1:241392‑M1/8‑1 (MQ=255) gctcgagccgaaccttaatcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggaCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGc < 2:798461‑M1/53‑1 (MQ=255) gctcgagccgaacattaatcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggaCTTTTGaa > 2:241392‑M1/87‑94 (MQ=255) cgagccgaaccttaatcgaagcttatcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggaCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCt > 1:1386016‑M1/84‑139 (MQ=255) aaGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGAtggt > 1:753709/1‑82 (MQ=255) aaGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGAtggt < 2:753709/82‑1 (MQ=255) gCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTggggg > 1:39752/1‑88 (MQ=255) gCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTggggg < 2:39752/88‑1 (MQ=255) ctcATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCtt < 1:1165771/109‑1 (MQ=255) ctcATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCtt > 2:1165771/1‑109 (MQ=255) ttCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCg < 1:1200727/104‑1 (MQ=255) ttCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCg > 2:1200727/1‑104 (MQ=12) tCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGc > 2:474997/1‑139 (MQ=16) ccccGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGAtggtggtg > 1:829700/1‑71 (MQ=11) ccccGCATGGGCAGAATACTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAATTGAtggtggtg < 2:829700/71‑1 (MQ=11) gcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggaCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGt > 2:1152734‑M1/47‑108 (MQ=255) gcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggaCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGt < 1:1152734‑M1/62‑1 (MQ=255) ggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggaCTTTTGAAAGTGATGGTGGTggggg > 1:1201429‑M1/42‑66 (MQ=255) ggcagaatatctaattgcggatgcgttgggaagttcagggaCTTTTGAAAGTGATGGTGGTggggg < 2:1201429‑M1/25‑1 (MQ=255) ggCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTggggg > 2:387738/1‑66 (MQ=255) ggCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTggggg < 1:387738/66‑1 (MQ=255) gcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggaCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGcc < 1:887605‑M1/69‑1 (MQ=255) gcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggaCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGcc > 2:887605‑M1/41‑109 (MQ=255) gcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggaCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGc > 2:1391781‑M1/41‑115 (MQ=255) gcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggaCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGc < 1:1391781‑M1/75‑1 (MQ=255) gCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCgg > 1:608469/1‑114 (MQ=38) gCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCgg > 1:624849/1‑114 (MQ=255) gCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCgg < 2:608469/114‑1 (MQ=25) gCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCgg < 2:624849/114‑1 (MQ=25) gCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAg > 1:44738/1‑139 (MQ=255) cagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggaCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGc < 2:232914‑M1/100‑1 (MQ=255) gAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCg < 2:44738/139‑1 (MQ=255) atatttaattgcggattcgttgggaagttcagggaCtttt < 2:1013637‑M1/5‑1 (MQ=255) atatttaattgcggattcgttgggaagttcagggaCtttt > 1:1013637‑M1/36‑40 (MQ=255) ttGATTGCGGATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGAtg < 2:496850/46‑1 (MQ=255) ttGATTGCGGATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGAtg > 1:496850/1‑46 (MQ=255) ttGATTGCGGATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGctc < 2:494947/113‑1 (MQ=37) ttGATTGCGGATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGctc > 1:494947/1‑113 (MQ=37) tGATTGCGGATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCt > 2:129175/1‑125 (MQ=255) tGATTGCGGATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCt < 1:129175/125‑1 (MQ=255) tgcggattcgttgggaagttcagggaCTTTTGAAAGTGAtggtggt < 1:1267326‑M1/20‑1 (MQ=255) tgcggattcgttgggaagttcagggaCTTTTGAAAGTGAtggtggt > 2:1267326‑M1/27‑46 (MQ=255) tgcggattcgttgggaagttcagggaCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCg < 2:226617‑M1/64‑1 (MQ=255) tgcggattcgttgggaagttcagggaCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCg > 1:226617‑M1/27‑90 (MQ=255) tgcggattcgttgggaagttcagggaCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCg < 2:1392964‑M1/113‑1 (MQ=255) tGCGGATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACg < 2:1164809/105‑1 (MQ=25) tGCGGATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACg > 1:1164809/1‑105 (MQ=255) tGCGGATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCt < 1:236463/121‑1 (MQ=255) tGCGGATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCt > 2:236463/1‑121 (MQ=255) tGCGGATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAATCg > 2:1254667/1‑139 (MQ=255) tGCGGATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAATCg > 1:5986/1‑139 (MQ=255) gCGGATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGtt > 1:550723/1‑91 (MQ=255) gCGGATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGtt < 2:550723/91‑1 (MQ=255) cggattcgttgggaagttcagggaCTTTTGAAAGTGATGGTGGTggggg > 1:1026104‑M1/25‑49 (MQ=255) cggattcgttgggaagttcagggaCTTTTGAAAGTGATGGTGGTggggg < 2:1026104‑M1/25‑1 (MQ=255) cggattcgttgggaagttcagggaCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGaa < 2:1404481‑M1/115‑1 (MQ=255) cGGATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTaat > 1:165250/1‑133 (MQ=255) cGGATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTaat < 2:165250/135‑3 (MQ=255) cGGATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAATCGaa > 1:378938/1‑139 (MQ=255) cGGATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAATCGaa < 1:474997/139‑1 (MQ=255) ggattcgttgggaagttcagggaCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAg > 1:232914‑M1/24‑139 (MQ=255) ggATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAg > 2:816831/1‑139 (MQ=255) gattcgttgggaagttcagggaCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGa < 2:681410‑M1/30‑1 (MQ=255) gattcgttgggaagttcagggaCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGa > 1:681410‑M1/23‑52 (MQ=255) gattcgttgggaagttcagggaCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCg > 2:1062531‑M1/23‑86 (MQ=255) gattcgttgggaagttcagggaCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCg < 1:1062531‑M1/64‑1 (MQ=255) gATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACt < 1:641890/57‑1 (MQ=255) gATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACt > 2:641890/1‑57 (MQ=255) tGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATc < 1:816831/139‑1 (MQ=255) gggaagttcagggaCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCg < 2:1208562‑M1/102‑1 (MQ=255) gggaagttcagggaCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCg > 1:1208562‑M1/15‑116 (MQ=255) aaTTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTc < 1:1254667/139‑1 (MQ=255) cagggaCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCg < 2:1260260‑M1/133‑1 (MQ=255) agggaCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGc > 1:1392964‑M1/6‑139 (MQ=255) gggCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTtc < 2:96444/123‑1 (MQ=255) gggCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTtc > 1:96444/1‑123 (MQ=255) | CTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGC > NC_000913/1286751‑1287008 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |