| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 3,931,183 | (G)7→10 | intergenic (‑90/‑133) | ravA ← / → kup | hexameric AAA+ MoxR family ATPase, putative molecular chaperone/potassium transporter |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3931176 | 4 (0.070) | 44 (0.710) +GGG |
35/188 | 0.4 | 91.6% | intergenic (‑83/‑140) | ravA/kup | hexameric AAA+ MoxR family ATPase, putative molecular chaperone/potassium transporter |
| ? | NC_000913 | 3931177 = | 4 (0.060) | intergenic (‑84/‑139) | ravA/kup | hexameric AAA+ MoxR family ATPase, putative molecular chaperone/potassium transporter | |||||
ACGAACTGCTCAGGCGGGAAATTCTTTCCGCTAATAAATGAGGGTGAGCCATAATGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTCAAA‑GG‑‑GGGGGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTAATCGTGCATACTGTGCGCTTTTTTGTGGGCCAAGGGACTAAGCACACATTTCATATTTCAACGAAAGACTA > NC_000913/3931042‑3931311 | gaactgctcaggcgggaaattctttccgctaataaatgagggtgagccataatgaagtggcgtcctttcgtcaaaagttctgcgtaaattgcgagtatagacgtttcttgctggtggctaaaatagtctcaaaggggg‑‑g > 1:747885‑M2/137‑139 (MQ=255) actgctcaggcgggaaattctttccgctaataaatgagggtgagccataatgaagtggcgtcctttcgtcaaaagttctgcgtaaattgcgagtatagacgtttcttgctggtggctaaaatagtctcaaaggggg‑‑ggg > 2:897018‑M2/135‑139 (MQ=255) tgctcaggcgggaaattctttccgctaataaatgagggtgagccataatgaagtggcgtcctttcgtcaaaagttctgcgtaaattgcgagtatagacgtttcttgctggtggctaaaatagtctcaaaggggg‑‑ggggt > 2:628625‑M2/133‑138 (MQ=255) cGGGAAATTCTTTCCGCTAATAAATGAGGGTGAGCCATAATGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTCAAAGGG‑‑GGGGGTATTTTTCtt < 1:897018/139‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |