| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_007779 | = 4001888 | 175 (1.040) | 3 (0.020) | 3/418 | NT | 1.8% | coding (886/1500 nt) | pitA | inorganic phosphate transporter PitA |
| ? | NC_007779 | = 4002033 | 155 (0.960) | coding (741/1500 nt) | pitA | inorganic phosphate transporter PitA | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 199 total aligned reads displayed.
GTCGGACTTCAGTTTCTTCAACAGGCGCTGATCGTCAGCACTCACGCCAGGCATCTTCACCACTTTGTCGATAGTGTCAGAAACGCACAGCATAATGCGGCGCATCTGGCTACGTTGATCAAGCGACAGCTTGTCGTAGCTTTCCACATCGGTGGTCAACATACCTTTCAGGCGGTTGAGCGCGTTAATGGTATTCGACGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTGATCAGCACCGGTAGCCTGTTTGAGCAGCGCAGGATGCTGCTCAAAGTAAGCTTCGACGTTGTTGATGGCATCACGGGTACGGGTGATTTCGTAGCCAGTGGCATTCATGTTCACCACGAAGCCTGCTGGCGCGACGCCAATCAATACCAACATAACCAGACCAATGCCTTTCTGACCATCGTTCGCGCCGTGCGAAAACGCCACGCCGATAGCGGA > NC_007779/4001652‑4002125 | gTCGGACTTCAGTTTCTTCAACAGGCGCTGATCGTCAGCACTCACGCCAGGCATCTTCACCACTTTGTCGATAGTGTCAGAAACGCACAGCATAATGCGGCGCATCTGGCTACGTTGATCAAGCGACAGCTTGTCGTAGCTTTCCACATCGGTGGTCAACATACCTTTCAGGCGGTTGAGCGCGTTAATGGTATTCGACGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCt > 1:808659/1‑238 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ttcttcAACAGGCGCTGATCGTCAGCACTCACGCCAGGCATCTTCACCACTTTGTCGATAGTGTCAGAAACGCACAGCATAATGCGGCGCATCTGGCTACGTTGATCAAGCGACAGCTTGTCGTAGCTTTCCACATCGGTGGTCAACATACCTTTCAGGCGGTTGAGCGCGTTAATGGTATTCGACGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGt < 1:1095640/237‑1 (MQ=255) ttcttcAACAGGCGCTGATCGTCAGCACTCACGCCAGGCATCTTCACCACTTTGTCGATAGTGTCAGAAACGCACAGCATAATGCGGCGCATCTGGCTACGTTGATCAAGCGACAGCTTGTCGTAGCTTTCCACATCGGTGGTCAACATACCTTTCAGGCGGTTGAGCGCGTTAATGGTATTCGACGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGt < 1:33653/237‑1 (MQ=255) ttcttcAACAGGCGCTGATCGTCAGCACTCACGCCAGGCATCTTCACCACTTTGTCGATAGTGTCAGAAACGCACAGCATAATGCGGCGCATCTGGCTACGTTGATCAAGCGACAGCTTGTCGTAGCTTTCCACATCGGTGGTCAACATACCTTTCAGGCGGTTGAGCGCGTTAATGGTATTCGACGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGt < 2:1936719/237‑1 (MQ=255) ttcatcAACAGGCGCTGATCGTCAGCACTCACGACAGGCATCTTCACCACTTTGTCGATAGTGTCAGAAACGCACAGCATAATGCGGCGCATCTGGCTACGTTGATCAAGCGACTGCTTGTCGTAGCTTTCCACATCGGTGGTCAACCTACCTTTCAGGCGGGTGAGCGCGTTAATGGTATTCGACGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTGCCGGGGCCGGt < 2:524545/237‑1 (MQ=255) gcgcTGATCGTCAGCACTCACGCCAGGCATCTTCACCACTTTGTCGATAGTGTCAGAAACGCACAGCATAATGCGGCGCATCTGGCTACGTTGATCAAGCGACAGCTTGTCGTAGCTTTCCACATCGGTGGTCAACATACCTTTCAGGCGGTTGAGCGCGTTAATGGTATTCGACGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTGATCa > 2:870703/1‑238 (MQ=255) tCGTCAGCACTCACGCCAGGCATCTTCACCACTTTGTCGATAGTGTCAGAAACGCACAGCATAATGCGGCGCATCTGGCTACGTTGATCAAGCGACAGCTTGTCGTAGCTTTCCACATCGGTGGTCAACATACCTTTCAGGCGGTTGAGCGCGTTAATGGTATTCGACGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTGATCAGCACCgg < 2:44307/238‑1 (MQ=255) 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cTTGTCGTAGCTTTCCACATCGGTGGTCAACATACCTTTCAGGCGGTTGAGCGCGTTAATGGTATTCGACGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTGATCAGCACCGGTAGCCTGTTTGAGCAGCGCAGGATGCTGCTCAAAGTAAGCTTCGACGTTGTTGAAGGCATCACGGGCACGGGTGAATTCGTAACCAGTGGCCTTCATGt > 2:1414084/1‑239 (MQ=255) gTCGTAGCTTTCCACATCGGTGGTCAACATACCTTTCAGGCGGTTGAGCGCGTTAATGGTATTCGACGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTGATCAGCACCGGTAGCCTGTTTGAGCAGCGCAGGATGCTGCTCAAAGTAAGCTTCGACGTTGTTGATGGCATCACGGGTACGGGTGATTTCGTAGCCAGTGGCATTCATGTTc > 1:1230501/1‑238 (MQ=255) gTCGTAGCTTTCCACATCGGTGGTCAACATACCTTTCAGGCGGTTGAGCGCGTTAATGGTATTCGACGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTGATCAGCACCGGTAGCCTGTTTGAGCAGCGCAGGATGCTGCTCAAAGTAAGCTTCGACGTTGTTGATGGCATCACGGGTACGGGTGATTTCGTAGCCAGTGGCATTCATGTTc > 1:1017083/1‑238 (MQ=255) 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ggtggtCAACATACCTTTCAGGCGGTTGAGCGCGTTAATGGTATTCGACGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTGATCAGCACCGGTAGCCTGTTTGAGCAGCGCAGGATGCTGCTCAAAGTAAGCTTCGACGTTGTTGATGGCATCACGGGTACGGGTGATTTCGTAGCCAGTGGCATTCATGTTCACCACGAAGCCTgctggcg > 1:1233195‑M2/1‑232 (MQ=255) ggtggtCAACATACCTTTCAGGCGGTTGAGCGCGTTAATGGTATTCGACGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTGATCAGCACCGGTAGCCTGTTTGAGCAGCGCAGGATGCTGCTCAAAGTAAGCTTCGACGTTGTTGATGGCATCACGGGTACGGGTGATTTCGTAGCCAGTGGCATTCATGTTCACCACGAAGCCTgctggcg > 1:1848694‑M2/1‑232 (MQ=255) tggtCAACATACCTTTCAGGCGGTTGAGCGCGTTAATGGTATTCGACGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTGATCAGCACCGGTAGCCTGTTTGAGCAGCGCAGGATGCTGCTCAAAGTAAGCTTCGACGTTGTTGATGGCATCACGGGTACGGGTGATTTCGTAGCCAGTGGCATTCATGTTCACCACGAAGCCTGCTGGcgcg > 1:1402040/1‑239 (MQ=255) 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ttttAGGTGGTTGGGCGCGTTAATGGGTTTCGACGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTGGTCAGCACCGGTAGCCTGTTTGAGCAGCGCAGGATGCTGCTCAAAGTAAGCTTCGACGTTGTTGATTGCATCACGGGTACGGGTGATTTCGTAGCCAGTGGCATTCATGTTCACCACGAAGCCTGCTGGCGCGACGCCAATCAATa < 2:1052809/239‑1 (MQ=255) tttCAGGCGGTTGAGCGCGTTAATGGTATTCGACGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTGATCAGCACCGGTAGCCTGTTTGAGCAGCGCAGGATGCTGCTCAAAGTAAGCTTCGACGTTGTTGATGGCATCACGGGTACGGGTGATTTCGTAGCCAGTGGCATTCATGTTCACCACGAAGCCTGCTGGCGCGACGCCAATCAATa < 2:803614/239‑1 (MQ=255) aGGCGGTTGAGCGCGTTAATGGTATTCGACGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTGATCAGCACCGGTAGCCTGTTTGAGCAGCGCAGGATGCTGCTCAAAGTAAGCTTCGACGTTGTTGATGGCATCACGGGTACGGGTGATTTCGTAGCCAGTGGCATTCATGTTCACCACGAAGCCTGCTGGCGCGACGCCAATCAATACCa > 1:624606/1‑238 (MQ=255) 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1:1938218/1‑197 (MQ=255) cAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTGATCAGCACCGGTAGCCTGTTTGAGCAGCGCAGGATGCTGCTCAAAGTAAGCTTCGACGTTGTTGATGGCATCACGGGTACGGGTGATTTCGTAGCCAGTGGCATTCATGTTCACCACGAAGCCTGCTGGCGCGACGCCAATCAATACCAACATAACCAGACCAATGCCTTTCTGACCATCGTTCGCGCCGTGCGAAAac > 1:931480/1‑239 (MQ=255) gggttggcgcCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTGATCAGAACCGGTGGCTTGTTTGAGCAGCGCAGGATGGTGCTCAAAGTAAGTTTCGACGTGGTGGATGGCATCACGGGGACGGGTGATTTCGTAGCCAGTGGCATTCATGTTCACCACGAAGCCTGCTGGCGCGACGCCAATCAATACCAACATAACCAGACCAATGCCTTTCTGACCATCGTTCGCGCCGTGCGAAAacgccac < 2:1940687/233‑1 (MQ=255) cgttgcgCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTGATCAGCACCGGTAGCCTGTTTGAGCAGCGCAGGATGCTGCTCAAAGTAAGCTTCGACGTTGTTGATGGCATCACGGGTACGGGTGATTTCGTAGCCAGTGGCATTCATGTTCACCACGAAGCCTGCTGGCGCGACGCCAATCAATACCAACATAACCAGACCAATGCCTTTCTGACCATCGTTCGCGCCGTGCGAAAacgccacg > 2:180925/1‑238 (MQ=255) 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gcCAGCaggcttcgtggtaaacatgaatgccgctggctactaaatcacccgtacccgtgatgccttcaaaaacgtcgaagcttactttgagcagcatcctgcgctgctcaaacaggctaccggtgctgatcagttagtaccggctccggaagctggcgcaacgcaacctgcggagttccactgccatccgtcgaataccattaacgcgctcaaccgcctgaaaggtatgttgaccaccg < 2:41784‑M1/239‑234 (MQ=255) gcCAGCTTCCGGGGCCGGTACTAACTGATCAGCACCGGTAGCCTGTTTGAGCAGCGCAGGATGCTGCTCAAAGTAAGCTTCGACGTTGTTGATGGCATCACGGGTACGGGTGATTTCGTAGCCAGTGGCATTCATGTTCACCACGAAGCCTGCTGGCGCGACGCCAATCAATACCAACATAACCAGACCAATGCCTTTCTGACCATCGTTCGCGCCGTGCGAAAACGCCACGCCGATAg < 1:995180/239‑1 (MQ=255) cagcaggcttcgtggtgaacatgaatgccactggctacgaaatcacccgtacccgtgatgccatcaacaacgtcgaagcttactttgagcagcatcctgcgctgctcaaacaggctaccggtgctgatcagttagtaccggctccggaagctggcgcaacgcaacctgcggagttccactgccatccgtcgaataccattaacgcgctcaaccgcctgaaaggtatgttgaccaccgat < 2:1543478‑M1/239‑236 (MQ=255) | GTCGGACTTCAGTTTCTTCAACAGGCGCTGATCGTCAGCACTCACGCCAGGCATCTTCACCACTTTGTCGATAGTGTCAGAAACGCACAGCATAATGCGGCGCATCTGGCTACGTTGATCAAGCGACAGCTTGTCGTAGCTTTCCACATCGGTGGTCAACATACCTTTCAGGCGGTTGAGCGCGTTAATGGTATTCGACGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTGATCAGCACCGGTAGCCTGTTTGAGCAGCGCAGGATGCTGCTCAAAGTAAGCTTCGACGTTGTTGATGGCATCACGGGTACGGGTGATTTCGTAGCCAGTGGCATTCATGTTCACCACGAAGCCTGCTGGCGCGACGCCAATCAATACCAACATAACCAGACCAATGCCTTTCTGACCATCGTTCGCGCCGTGCGAAAACGCCACGCCGATAGCGGA > NC_007779/4001652‑4002125 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |