New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | 2060160 = | 124 (0.660) | 4 (0.040) | 4/230 | NT | 5.3% | intergenic (+449/+4) | Y75_RS10415/Y75_RS10420 | YebC/PmpR family DNA‑binding transcriptional regulator/tRNA‑Asn |
? | NC_007779 | 2062068 = | 72 (0.670) | intergenic (+5/+33) | Y75_RS10430/cbl | tRNA‑Asn/HTH‑type transcriptional regulator Cbl |
Only 100 of 189 total aligned reads displayed.
TGGTGTCTGGATGGGAATGTTTGCCGACTGGGCTGTGCGGGCCGTGCTGTTTTACTGGCGAATGGTTACTGGACGTTGGCTATGGAAATACCCTCGACCCGAGCCGCAAAAGTGTGAAAAAAAGCCAGTTGTGTCGGAATAAACGACAAAATGCAGATTATTTCAGCAAACGATTTCAAATTTAAAAAACAGGCTTTGACATTGTGGGTGGGCATCGCTAATATTCGCCTCGTTCTCACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/2060481‑2060160 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑acgattcctctgtagttcagtcggtagaacggcggactgttaatccgtatgtcactggttcgagtccagtcagaggagccaaattCCTGAAAAGCCCGCTTTTATAGCGGGATTTTTGCTATATCTGATAATCAATTTCCTCTTCACTGCTTTCCATCACCTGCCGCTTGATATCCTCAACTGACAGTCCTGCATTACAAAGTTCCAGAAAGCGCCAGACATAGTTACGCTGAAGTTGTCCTCGCTTCAGTCCCAACCAGACAGTATTAGCATCAAAAAGATGCCGCGTATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTT > NC_007779/2062068‑2062303 TGGTGTCTGGATGGGAATGTTTGCCGCCGGGGCTGGGCGGGCCGTGCTGTTTTACGGGCGAATGGTTACTGGACGTTGGCTATGGAAATACCCTCGACCCGAGCCGCAAAAGTGTGAAAAAAAGCCAGTTGTGTCGGAATAAACGACAAAATGCAGATTATTTCAGCAAACGATTTCAAATTTAAAAAACAGGCTTTGACATTGTGGGTGGGCATCGCTAATATTCGCCTCGTTCTCAC < 2:213130/239‑1 GTCTGGATGGGAATGTTTGCCGACTGGGCTGTGCGGGCCGTGCTGTTTTACTGGCGAATGGTTACTGGACGTTGGCTATGGAAATACCCTCGACCCGAGCCGCAAAAGTGTGAAAAAAAGCCAGTTGTGTCGGAATAAACGACAAAATGCAGATTATTTCAGCAAACGATTTCAAATTTAAAAAACAGGCTTTGACATTGTGGGTGGGCATCGCTAATATTCGCCTCGTTCTCACGAT > 2:1693537/1‑238 CTGGATGGGAATGTTTGCCGACTGGGCTGTGCGGGCCGTGCTGTTTTACTGGCGAATGGTTACTGGACGTTGGCTATGGAAATACCCTCGACCCGAGCCGCAAAAGTGTGAAAAAAAGCCAGATGTGTCGGAATAAACGACAAAATGCAGATTAGTTCAGCAAAAGATTTCAAATTTAAAAAACAGGCTTTGACATTGTGGGTGGGCATCGCTAATTTTCGCCTCGTTCTCACGATTC > 2:2178253/1‑238 CTGGATGGGAATGTTTGCCGACTGGGCTGTGCGGGCCGTGCTGTTTTACTGGCGAATGGATACTGGAAGTTGGCTATGGAAATACCCTCGACCCGAGCCGCAAAAGTGTGAAAAAAAGCCAGTTGTGTCGGAATAAACGACAAAATGCAGATTATTTCAGCAAACGATTTCAAATTTAAAAAACAGGCTTTGACATTGTGGGTGGGCATCGCTAATATTCGCCTCGTTCTCACGATT > 1:1257555/1‑237 TGGATGGGAATGTTTGCCGACTGGGCTGTGCGGGCCGTGCTGTTTTACTGGCGAATGGTTACTGGACGTTGGCTATGGAAATACCCTCGACCCGAGCCGCAAAAGTGTGAAAAAAAGCCAGTTGTGTCGGAATAAACGACAAAATGCAGATTATTTCAGCAAACGATTTCAAATTTAAAAAACAGGCTTTGACATTGTGGGTGGGCATCGCTAATATTCGCCTCGTTCTCACGATTCCT < 2:2029899/239‑1 TGGGAATGTTTGCCGACTGGGCTGTGCGGGCCGTGCTGTTTTACTGGCGAATGGTTACTGGACGTTGGCTATGGAAATACCCTCGACCCGAGCCGCAAAAGTGTGAAAAAAAGCCAGTTGTGTCGGAATAAACGACAAAATGCAGATTATTTCAGCAAACGATTTCAAATTTAAAAAACAGGCTTTGACATTGTGGGTGGGCATCGCTAATATTCGCCTCGTTCTCACGATTCCTCTG < 1:1593872/238‑1 AATGTTTGCCGACTGGGCTGTGCGGGCCGTGCTGTTTTACTGGCGAATGGTTACTGGACGTTGGCTATGGAAATACCCTCGACCCGAGCCGCAAAAGTGTGAAAAAAAGCCAGTTGTGTCGGAATAAACGACAAAATGCAGATTATTTCAGCAAACGATTTCAAATTTAAAAAACAGGCTTTGACATTGTGGGTGGGCATCGCTAATATTCGCCTCGTTCTCACGATTCCTCTGTAGT > 1:497372/1‑238 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1:373235/1‑222 GAATGGTTACTGGACGTTGGCTATGGAAATACCCTCGACCCGAGCCGCAAAAGTGTGAAAAAAAGCCAGTTGTGTCGGAATAAACGACAAAATGCAGATTATTTCAGCAAACGATTTCAAATTTAAAAAACAGGCTTTGACATTGTGGGTGGGCATCGCTAATATTCGCCTCGTTCTCACGATTC < 1:615707/185‑1 GGTTACTGGACGTTGGCTATGGAAATACCCTCGACCCGAGCCGCAAAAGTGTGAAAAAAAGCCAGTTGTGTCGGAATAAACGACAAAATGCAGATTATTTCAGCAAACGATTTCAAATTTAAAAAACAGGCTTTGACATTGTGGGTGGGCATCGCTAATATTCGCCTCGTTCTCACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGT < 2:1575719/239‑1 GGTTACTGGACGTGGGCTATGGAAATACCCTCGACCCGAGCCGCAAAAGTGTGAAAAAAAGCCAGTTGTGTCGGAATAAACGACAAAATGCAGATTATTTCAGCAAACGATTTCAAATTTAAAAAACAGGCTTTGACATTGTGGGTGGGCATCGCTAATATTCGCCTCGTTCTCACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGT < 2:1848715/239‑1 GACGTTGGCTATGGAAATACCCTCGACCCGAGCCGCAAAAGTGTGAAAAAAAGCCAGTTGTGTCGGAATAAACGACAAAATGCAGATTATTTCAGCAAACGATTTCAAATTTAAAAAACAGGCTTTGACATTGTGGGTGGGCATCGCTAATATTCGCCTCGTTCTCACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGT < 1:755315/206‑1 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CTATGGAAATACCCTCGACCCGAGCCGCAAAAGTGTGAAAAAAAGCCAGTTGTGTCGGAATAAACGACAAAATGCAGATTATTTCAGCAAACGATTTCAAATTTAAAAAACAGGCTTTGACATTGTGGGTGGGCATCGCTAATATTCGCCTCGTTCTCACGATTCCTCGGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCAC < 1:1761589/213‑1 GGAAATACCCTCGACCCGAGCCGCAAAAGTGTGAAAAAAAGCCAGTTGTGTCGGAATAAACGACAAAATGCAGATTATTTCAGCAAACGATTTCAAATTTAAAAAACAGGCTTTGACATTGTGGGTGGGCATCGCTAATATTCGCCTCGTTCTCACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCG > 2:89828/1‑201 TACCCTCGACCCGAGCCGCAAAAGTGTGAAAAAAAGCCAGTTGTGTCGGAATAAACGACAAAATGCAGATTATTTCAGCAAACGATTTCAAATTTAAAAAACAGGCTTTGACATTGTGGGTGGGCATCGCTAATATTCGCCTCGTTCTCACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAA < 2:734764/178‑1 TACCCTCGACCCGAGCCGCAAAAGTGTGAAAAAAAGCCAGTTGTGTCGGAATAAACGACAAAATGCAGATTATTTCAGCAAACGATTTCAAATTTAAAAAACAGGCTTTGACATTGTGGGTGGGCATCGCTAATATTCGCCTCGTTCTCACGATTCCTCTGTAGTTCAGT > 2:41553/1‑170 CTCGACCCGAGCCGCAAAAGTGTGAAAAAAAGCCAGTTGTGTCGGAATAAACGACAAAATGCAGATTATTTCAGCAAACGATTTCAAATTTAAAAAACAGGCTTTGACATTGTGGGTGGGCATCGCTAATATTCGCCTCGTTCTCACGATTC > 1:218246/1‑152 ATAAACGACAAAATGCAGATTATTTCAGCAAACGATTTCAAATTTAAAAAACAGGCTTTGACATTGTGGGTGGGCATCGCTAATATTCGCCTCGTTCTCACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGT > 1:1814325/1‑164 ATAAACGACAAAATGCAGATTATTTCAGCAAACGATTTCAAATTTAAAAAACAGGCTTTGACATTGTGGGTGGGCATCGCTAATATTCGCCTCGTTCTCACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGT > 1:711089/1‑164 ATTATTTCAGCAAACGATTTCAAATTTAAAAAACAGGCTTTGACATTGTGGGTGGGCATCGCTAATATTCGCCTCGTTCTCACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCCTGAAAAGCCCGCTTTTATAGCGGGATTTTTGCTATATCTGATAATCAATTTCCTCTTCACTGCTTTCCATC > 1:1101471/1‑239 ATTATTTCAGCAAACGATTTCAAATTTAAAAAACAGGCTTTGACATTGTGGGTGGGCATCGCTAATATTCGCCTCGTTCTCACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCA > 2:2338/1‑135 ATTTCAGCAAACGATTTCAAATTTAAAAAACAGGCTTTGACATTGTGGGTGGGCATCGCTAATATTCGCCTCGTTCTCACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTC > 1:388047/1‑139 AAATTTAAAAAACAGGCTTTGACATTGTGGGTGGGCATCGCTAATATTCGCCTCGTTCTCACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCCTGAAAAGCCCGCTTTTATAGCGGGATTTTTGCTATATCTGATAATCAATTTCCTCTTCACTGCTTTCCATCACCTGCCGCTTGATATCCTCA < 2:1101471/239‑1 ATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGGGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCCTGAAAAGCCCGCTTTTATAGCGGGATTTTTGCTATATCTGATAATCAATTTCCTCTTCACTGCTTTCCATCACCTGCCGCTTGATATCCTCAACTGACAGTC < 2:473896/186‑1 TTCCTCTGTGGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCCTGAAAAGCCCGCTTTTATAGCGGGATTTTTGCTATATCTGATAATCAATTTCCTCTTCACTGCTTTCCATCACCTGCCGCTCGATATCCTCAACTGACAGTCCTGCATTACAAAGTTCCAGAAAGCGCCAGACATAGTTACGCTGAAGTTGTCCT < 1:1709152/238‑1 TTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCCTGAAAAGCCCGCTTTTATAGCGGGATTTTTGCTATATCTGATAATCAATTTCCTCTTCACTGCTTTCCATCACCTGCCGCTTGATATCCTCAACTGACAGTCCTGCATTACAAAGTTCCAGAAAGCGCCAGACCTAGTTACGCTGAAGTTGTCCTC > 2:1110549/1‑239 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |