| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | 2060160 = | 124 (0.660) | 4 (0.040) | 4/230 | NT | 5.3% | intergenic (+449/+4) | Y75_RS10415/Y75_RS10420 | YebC/PmpR family DNA‑binding transcriptional regulator/tRNA‑Asn |
| ? | NC_007779 | 2062068 = | 72 (0.670) | intergenic (+5/+33) | Y75_RS10430/cbl | tRNA‑Asn/HTH‑type transcriptional regulator Cbl | |||||
Only 100 of 238 total aligned reads displayed.
CCCGCATAAGGCATTTTTCTCTTTATCTTTGTACGGTACTTCATGGAACAGAGTTTTTGACCTTGCGAATCGTGATGTCTGTTGGGGAGGGACAATTTGCTCACTGAAGCGTGAGACTCGATTAAGCGCACGAAACACAGAAATCAAAAAACCCGGTCACTTTTTTACAAGGTAACCGGGTAAAAATAATTTTTATTTTTTAACTGTTTTGAGACTCATAGAGATGTCTCAAAACTAAAATTTGGCTCCTCTGACTGGACTCGAACCAGTGACATACGGATTAACAGTCCGCCGTTCTACCGACTGAACTACAGAGGAATCGTGAGAACGAGGCGAATATTAGCGATGCCCACCCACAATGTCAAAGCCTGTTTTTTAAATTTGAAATCGTTTGCTGAAATAATCTGCATTTTGTCGTTTATTCCGACACAACTGGCTTTTTTTCACACTTTTGCGGCTCGGGTCGAGGGTAT > NC_007779/2059922‑2060394 | cccGCATAAGGCATTTTTCTCTTTATCTTTGTACGGTACTTCATGGAACAGAGTTTTTGACCTTGCGAATCGTGATGTCTGTTGGGGAGGGACAATTTGCTCACTGAAGCGTGAGACTCGATTAAGCGCACGAAACACAGAAATCAAAAAACCCGGTCACTTTTTTACAAGGTAACCGGGTAAAAATAATTTTTATTTTTTAACTGTTTTGAGACTCATAGAGATGTCTCAAAACTaaa > 1:1013658/1‑239 (MQ=255) 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agagaatttaatccgcctggatacgcggcatctttttgatgctaatactgtctggttgggactgaagcgaggacaacttcagcgtaactatgtctggcgctttctggaactttgtaatgcaggactgtcagttgaggatatcaagcggcaggtgatggaaagcagtgaagaggaaattgattatcagatatagcaaaaatcccgctataaaagcgggcttttcaggAATTTGGctcctc > 1:1760526‑M1/227‑239 (MQ=255) atttaatccgcctggatacgcggcatctttttgatgctaatactgtctggttgggactgaagcgaggacaacttcagcgtaactatgtctggcgctttctggaactttgtaatgcaggactgtcagttgaggatatcaagcggcaggtgatggaaagcagtgaagaggaaattgattatcagatatagcaaaaatcccgctataaaagcgggcttttcaggAATTTGGCTCCTCTGAc > 2:1508649‑M1/222‑238 (MQ=255) ctTTATCTTTGTACGGTACTTCATGGAACAGAGTTTTTGACCTTGCGAATCGTGATGTCTGTTGGGGAGGGACAATTTGCTCACTGAAGCGTGAGACTCGATTAAGCGCACGAAACACAGAAATCAAAAAACCCGGTCACTTTTTTACAAGGTAACCGGGTAAAAATAATTTTTATTTTTTAACTGTTTTGAGACTCATAGAGATGTCTCAAAACTAAAATTTGGCTCCTCTGACTgg > 2:1908831/1‑238 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |