| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | 2496079 = | 166 (0.880) | 8 (0.040) | 7/382 | NT | 5.6% | coding (1318/1695 nt) | oxc | oxalyl‑CoA decarboxylase |
| ? | NC_007779 | 2496245 = | 113 (0.630) | coding (1152/1695 nt) | oxc | oxalyl‑CoA decarboxylase | |||||
TAGTTAATGAAGGTGCAAATACCCTGGATAATGCACGAAATATTATTGATATGTATAAACCACGTCGTCGTCTGGATTGTGGTACCTGGGGTGTCATGGGCATCGGTATGGGCTATGCCATCGGTGCTAGCGTGACTTCTGGTTCTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/2496225‑2496079‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctggttctcGCGCAATACGTCGCGCACAGCACTTAATGCATTAAAGTAATTTAATGGTTGAGTATCTGTACTTAATTTTTCATGCATTTTTTGTGCATTTTGCTGCTTGTGGATATTTAAAATATCGCGCCATACCAGTGGAGTCGTAAATGTGTTTTGTTTCAGTTCTGCCAGCATACCTTGCATACTGGATGCAATATCACCAACGACTGGCACAGCAATGGGGCGGTTGCTGTCAATTTCCTGC > NC_007779/2496245‑2496482 TAGTTAATGAAGGTGCAAATACCCTGGATAATGCACGAAATATTATTGATATGTATAAACCACGTCGTCGTCTGGATTGTGGTACCTGGGGTGTCATGGGCATCGGTATGGGCTATGCCATCGGTGCTAGCGTGACTTCTGGTTCTCGCGCAATACGTCGCGCACAGCACTTAATGCATTAAAGTAATTTAATGGTTGAGTATCTGTACTTAATTTTTCATGCATTTTTTGTGCATTTT > 1:1375003/1‑239TAGTTAATGAAGGTGCAAATACCCTGGATAATGCACGAAATATTATTGATATGTATAAACCACGTCGTCGTCTGGATTGTGGTACCTGGGGTGTCATGGGCATCGGTATGGGCTATGCCATCGGTGCTAGCGTGACTTCTGGTTCTCGCGCAATACGTCGCGCACAGCACTTAATGCATTAAAGTAATTTAATGGTTGAGTATCTGTACTTAATTTTTCATGCATTTTTTGTGCATTTT > 1:883389/1‑239 ATGTATAAACCACGTCGTCGTCTGGATTGTGGTACCTGGGGTGTCATGGGCATCGGTATGGGCTATGCCATCGGTGCTAGCGTGACTTCTGGTTCTCGCGCAATACGTCGCGCACAGCACTTAATGCATTAAAGTAATTTAATGGTTGAGTATCTGTACTTAATTTTTCATGCATTTTTTGTGCATTTTGCTGCTTGTGGATATTTAAAATATCGCGCCATACCAGTGGAGTCGTAAAT > 1:2162597/1‑239 CACGTCGTCGTCTGGATTGTGGTACCTGGGGTGTCATGGGCATCGGTATGGGCTATGCCATCGGTGCTAGCGTGACTTCTGGTTCTCGCGCAATACGTCGCGCACAGCACTTAATGCATTAAAGTAATTTAATGGTTGAGTATCTGTACTTAATTTTTCATGCATTTTTTGTGCATTTTGCTGCTTGTGGATATTTAAAATATCGCGCCATACCAGTGGAGTCGTAAATGTGTTTTGTT < 2:883389/239‑1 CGTCTGGATTGTGGTACCTGGGGTGTCATGGGCATCGGTATGGGCTATGCCATCGGTGCTAGCGTGACTTCTGGTTCTCGCGCAATACGTCGCGCACAGCACTTAATGCATTAAAGTAATTTAATGGTTGAGTATCTGTACTTAATTTTTCATGCATTTTTTGTGCATTTTGCTGCTTGTGGATATTTAAAATATCGCGCCATACCAGTGGAGTCGTAAATGTGTTTTGTTTCAGTTC < 2:1375003/238‑1 GTCTGGATTGTGGTACCTGGGGTGTCATGGGCATCGGTATGGGCTATGCCATCGGTGCTAGCGTGACTTCTGGTTCTCGCGCAATACGTCGCGCACAGCACTTAATGCATTAAAGTAATTTAATGGTTGAGTATCTGTACTTAATTTTTCATGCATTTTTTGTGCATTTTGCTGCTTGTGGATATTTAAAATATCGCGCCATACCAGTGGAGTCGTAAATGTGTTTTGTTTCAGTTCTG < 2:2162597/239‑1 GTCATGGGCATCGGTATGGGCTATGCCATCGGTGCTAGCGTGACTTCTGGTTCTCGCGCAATACGTCGCGCACAGCACTTAATGCATTAAAGTAATTTAATGGTTGAGTATCTGTACTTAATTTTTCATGCATTTTTTGTGCATTTTGCTGCTTGTGGATATTTAAAATATCGCGCCATACCAGTGGA > 1:666354/1‑188 GTCATGGGCATCGGTATGGGCTATGCCATCGGTGCTAGCGTGACTTCTGGTTCTCGCGCAATACGTCGCGCACAGCACTTAATGCATTAAAGTAATTTAATGGTTGAGTATCTGTACTTAATTTTTCATGCATTTTTTGTGCATTTTGCTGCATGTGGATATTTAAAATATCGCGCCATACCAGTGGA < 2:666354/188‑1 CTGGTTCTCGCGCAATACGTCGCGCACAGCACTTAATGCATTAAAGTAATTTAATGGTTGAGTATCTGTACTTAATTTTTCATGCATTTTTTGTGCATTTTGCTGCTTGTGGATATTTAAAATATCGCGC < 1:1400917/130‑1 CTGGTTCTCGCGCAATACGTCGCGCACAGCACTTAATGCATTAAAGTAATTTAATGGTTGAGTATCTGTACTTAATTTTTCATGCATTTTTTGTGCATTTTGCTGCTTGTGGATATTTAAAATATCGCGC > 2:1400917/1‑130 TGGTTCTCGCGCAATACGTCGCGCACAGCACTTAATGCATTAAAGTAATTTAATGGTTGAGTATCTGTACTTAATTTTTCATGCATTTTTTGTGCATTTTGCTGCTTGTGGATATTTAAAATATCGCGCCATACCAGTGGAGTCGTAAATGTGTTTTGTTTCAGTTCTGCCAGCATACCTTGCATACTGGATGCAATATCACCAACGACTGGCACAGCAATGGGGCGGTTGCTGTCAAT > 2:754353/1‑239 GTTCTCGCGCAATACGTCGCGCACAGCACTTAATGCATTAAAGTAATTTAATGGTTGAGTATCTGTACTTAATTTTTCATGCATTTTTTGTGCCTTTTGCTGCTTGTGGATATTTAAAATATCGCGCCATACCAGTGGAGTCGT‑AATTTGTTTTGTTTCAGTTCTGACAGCCTACCTTGCATTCTGGATGGAAAATCACCAACTACTGGCCAAGCCATGGGGCGGTTGCTGTCAAATT > 1:427245/1‑238 GTTCTCGCGCAATACGTCGCGCACAGCACTTAATGCATTAAAGTAATTTAATGGTTGAGTATCTGTACTTAATTTTT > 1:137780/1‑77 GTTCTCGCGCAATACGTCGCGCACAGCACTTAATGCATTAAAGTAATTTAATGGTTGAGTATCTGTACTTAATTTTT < 2:137780/77‑1 CTCGCGCAATACGTCGCGCACAGCACTTAATGCATTAAAGTAATTTAATGGTTGAGTATCTGTACTTAATTTTTCATGCATTTTTTGTGCATTTTGCTGCTTGTGGATATTTAAAATATCGCGCCATACCAGTGGAGTCGTAAATGTGTTTTGTTTCAGTTC < 1:1433706/162‑1 CTCGCGCAATACGTCGCGCACAGCACTTAATGCATTAAAGTAATTTAATGGTTGAGTATCTGTACTTAATTTTTCATGCATTTTTTGTGCATTTTGCTGCTTGTGGATATTTAAAATATCGCGCCATACCAGTGGAGTCGTAAATGTGTTTTGTTTCAGTTC > 2:1433706/1‑162 TCGCGCAATACGTCGCGCACAGCACTTAATGCATTAAAGTAATTTAATGGTTGAGTATCTGTACTTAATTTTTCATGCATTTTTTGTGCATTTTGCTGCTTGTGGATATTTAAAATATCGCGCCATACCAGTGGAGTCGTAAATGTGTTTTGTTTCAGTTCTGCCAGCATACCTTGCATACTGGATGCAATATCACCAACGACTGGCACAGCAATGGGGCGGTTGCTGTCAATTTCCTG < 2:737744/239‑1 CGCGCAATACGTCGCGCACAGCACTTAATGCATTAAAGTAATTTAATGGTTGAGTATCTGTACTTAATTTTTCATGCATTTTTTGTGCATTTTGCTGCTTGTGGATATTTAAAATATCGCGCCATACCAGTGGAGTCGTAAATGTGTTTTGTTTCAGTTCTGCCAGCATACCTTGCATACTGGATGCAATATCACCAACGACTGGCACAGCAATGGGGCGGTTGCTGTCAATTTCCTGC > 1:978939/1‑239 CGCGCAATACGTCGCGCACAGCACTTAATGCATTAAAGTAATTTAATGGTTGAGTATCTGTACTTAATTTTTCATGCATTTTTTGTGCATTTTGCTGCTTGTGGATATTTAAAATATCGCGCCATACCAGTGGAGTCGTAAATGTGTTTTGTTTCAGTTCTGCCAGCATACCTTGCATACTGGA > 2:1319182/1‑184 CGCGCAATACGTCGCGCACAGCACTTAATGCATTAAAGTAATTTAATGGTTGAGTATCTGTACTTAATTTTTCATGCATTTTTTGTGCATTTTGCTGCTTGTGGATATTTAAAATATCGCGCCATACCAGTGGAGTCGTAAATGTGTTTTGTTTCAGTTCTGCCAGCATACCTTGCATACTGGA < 1:1319182/184‑1 TAGTTAATGAAGGTGCAAATACCCTGGATAATGCACGAAATATTATTGATATGTATAAACCACGTCGTCGTCTGGATTGTGGTACCTGGGGTGTCATGGGCATCGGTATGGGCTATGCCATCGGTGCTAGCGTGACTTCTGGTTCTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/2496225‑2496079‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctggttctcGCGCAATACGTCGCGCACAGCACTTAATGCATTAAAGTAATTTAATGGTTGAGTATCTGTACTTAATTTTTCATGCATTTTTTGTGCATTTTGCTGCTTGTGGATATTTAAAATATCGCGCCATACCAGTGGAGTCGTAAATGTGTTTTGTTTCAGTTCTGCCAGCATACCTTGCATACTGGATGCAATATCACCAACGACTGGCACAGCAATGGGGCGGTTGCTGTCAATTTCCTGC > NC_007779/2496245‑2496482 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |