New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
ATCGTTTCAATTTCCATCCCACTGAAACCAAAAGCACTATCACCTTCAATGGCGACAACCGGAGAACCAGAAGTCACGCTAGCACCGATGGCATAGCCCATACCGATGCCCATGACACCCCAGGTACCACAATCCAGACGACGACGTGGTTTATACATATCAATAATATTTCGTGCATTATCCAGGGTATTTGCACCTTCATTAACTAAATAAATATCCTGGTTCTCGCGCAATACGTCGCGCACAGCACTTAATGCATTAAAGTAATTTAATGGTTGAGTATCTGTACTTAATTTTTCATGCATTTTTTGTGCATTTTGCTGCTTGTGGATATTTAAAATATCGCGCCATACCAGTGGAGTCGTAAATGTGTTTTGTTTCAGTTCTGCCAGCATACCTTGCATACTGGATGCAATATCACCAACGACTGGCACAGCAATGGGGCGGTTGCTGTCAATTTCCTGC > NC_007779/2496018‑2496482 | ttCAATTTCCATCCCACTGAAACCAAAAGCACTATCACCTTCAATGGCGACAACCGGAGAACCAGAAGTCGCGCTAGCACCGATGGCATAGCCCATACCGATGGCCATGACACCCCAGGTACCACAAGCCAGACGACGACGTGGTTTATACATATCAATAATGTTTCGTGCATTATCCAGGGTATTTGCAGCTTCATGAACTAAATAAATATCCTGGTTCTCGCGCAATACGTCGCGca < 1:275122/239‑1 (MQ=255) 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tagttaatgaaggtgcaaataccctggataatgcacgaaatattattgatatgtataaaccacgtcgtcgtctggattgtggtacctggggtgtcatgggcatcggtatgggctatgccatcggtgctagcgtgacttctggttctcGCGCAATACGTCGCGCACAGCACTTAATGCATTAAAGTAATTTAATGGTTGAGTATCTGTACTTAATTTTTCATGCATTTTTTGTGCAtttt > 1:883389‑M2/148‑239 (MQ=255) cACCGATGGCATAGCCCATACCGATGCCCATGACACCCCAGGTACCACAATCCAGACGACGACGTGGTTTATACATATCAATAATATTTCGTGCATTATCCAGGGTATTTGCACCTTCATTAACTAAATAAATATCCTGGTTCTCGCGCAATACGTCGCGCACAGCACTTAATGCATTAAAGTAATTTAATGGTTGAGTATCTGTACTTAATTTTTCATGCATTTTTTGTGCAtttt > 1:350352/1‑237 (MQ=255) aTGGCATAGCCCATACCGATGCCCATGACACCCCAGGTACCACAATCCAGACGACGACGTGGTTTATACATATCAATAATATTTCGTGCATTATCCAGGGTATTTGCACCTTCATTAACTAAATAAATATCCTGGTTCTCGCGCAATACGTCGCGca < 2:146798/157‑1 (MQ=255) aTGGCATAGCCCATACCGATGCCCATGACACCCCAGGTACCACAATCCAGACGACGACGTGGTTTATACATATCAATAATATTTCGTGCATTATCCAGGGTATTTGCACCTTCATTAACTAAATAAATATCCTGGTTCTCGCGCAATACGTCGCGca > 1:146798/1‑157 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |