| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 198 total aligned reads displayed.
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tGCGCGTTAGCCCGCCCTGCGTGGTACGGACGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAA‑TGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACGG‑CAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATgc < 1:1811362/181‑1 (MQ=31) tGCGCGTTAGCCCGCCCTGCGTGGTACGGACGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAA‑TGACGGCGGTCAGGGCACCGGCGCTGTTGTATTCATACCGCGGTTCATGGGCCTGCGTGTCTTTCACGG‑CAATTACATGTCCACGGCTGGCGTTTGCGGGGGACTGGCTCCTCCCTTCCTCCCTGCGCCCCC‑CCGTCATCGGCCCCAGGCggta > 2:418342/1‑237 (MQ=11) tGCGCGTTAGCCCGCCCTGCGTGGTACGGACGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAA‑TGACGGCGGTCAGGGCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACGG‑CAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACCCAGCCCTTCCTCGCCGTGCCCCG‑CCCGCATCTGCCCGAAGCgggca > 2:1122212/1‑239 (MQ=255) cgcgTTAGCCCGCCCTGCGTGGTACGGACGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAA‑TGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCCTACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACGG‑CAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATgcg > 2:940865/1‑180 (MQ=14) 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cgTTAGCCCGCCCTGCGTGGTACGGACGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAA‑TGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGACCTGCGTGCCTTTCACGG‑CAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGCGCACCG‑CCGTCCTCTGCCCGAACCcgtcatgg > 1:376650/1‑238 (MQ=9) cgTTAGCCCGCCCTGCGTGGTACGGACGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAA‑TGACGGCGGTCAGGGCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACGG‑CAATTTACTGTCCACGGCCGTCGTATGCGCGGTACTGACCCAGCCCTTCCCTGCGGGGCACCC‑CCGTCATCCGCCCCAAgggggccgggt > 2:1282954/1‑232 (MQ=11) cgTTAGCCCGCCCTGCGTGGTACGGACGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAA‑TGACGGCGGT > 2:1836056‑M1/1‑90 (MQ=255) gTTAGCCCGCCCTGCGTGGTACGGACGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAA‑TGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACGG‑CAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCG‑CCGTCATCTGCCCGAAGCggtcatggt < 1:1259487/238‑1 (MQ=31) 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2:1888150‑M2/158‑2 (MQ=255) tttCTGCTGCCGTCCGGGGCAA‑TGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACGG‑CAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCa < 1:475247‑M2/151‑2 (MQ=255) tggggcAAGTGAGGGGGGGgcaccgggaggaagggctgagtcagtaccgcgcatacgacagccgtggacagttaattgccgtgaaagacccgcagggccatgaaacgcggtatgaatacaacatcgccggtgacctgaccgccgtcattgccccggacggcagcagaaacgggacacagtacgatgcgtggggaaaggccgtccgtaccacgcagggcgggctaacgcgcagtatggaa < 2:1526794‑M1/238‑221 (MQ=255) attgccggcggggccccgcgaggaagggctgagtcagtaccgcgcatccgacagccgtggacagttaattgccgtgaaagacacgcagggccatgaaacgcggtatgaatacaacacggccggtgacctgaccgccgtcattgccccggacggcagcagaaacgggacacagtacgatgcgtggggaaaggccgtccgtaccacgcagggcgggctaacgcgcagtatggaatacgatg < 2:162383‑M1/234‑228 (MQ=255) tgcaccgcgaggcagggctgagtcagtaccgcgcatacgacagccgtggacagttaattgccgtgaaagacacgcagggccatgaaacgcggtatgaatacaacatcgacggtgacctgaccgccgtcattgccccggacggcagcagaaacgggacacagtacga > 1:2138675‑M1/1‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) | CAGGTCGTGGTGATAACGCTGTGTGCGGCCGTCAAAGCCGGTTTCCTGTATCAGCCGGTCAAGTACATCGTAACGGAAGGTGGTGTGGCTGCCGTTTTCACTGGTCAGGCGGATGACCCGTCCGGCAGCATCGTATTCCATACTGCGCGTTAGCCCGCCCTGCGTGGTACGGACGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAA‑TGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACGG‑CAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCG‑CCGTCATCTGCCCGAAGCGGTCATGGTCATAACGGGTTACATAACCGGAACAGTCGGTGAAGCTCAGCAACTGACCGTAACGGCTCCACGTCATGGTTTTCCG > NC_007779/3876190‑3876651 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |