| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_007779 | 4051194 = | 235 (1.250) | 17 (0.100) | 6/376 | NT | 7.9% | coding (807/846 nt) | ugpE | sn‑glycerol‑3‑phosphate ABC transporter permease UgpE |
| ? | NC_007779 | 4051992 = | 174 (0.990) | coding (758/1071 nt) | Y75_RS20030 | sn‑glycerol 3‑phosphate ABC transporter ATP binding protein UgpC | |||||
Only 100 of 275 total aligned reads displayed.
ACATCGTTTTTCCGCTCTCCAAAACTAATCTGGCGGCGCTGTTTGTGATCACCTTTATCTACGGCTGGAATCAGTATTTGTGGCCGTTGTTGATTATTACCGATGTGGATCTCGGCACCACCGTGGCAGGGATCAAAGGGATGATCGCTACAGGCGAAGGCACCACGGAATGGAACTCAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGCGTGCCTTCGTG‑‑‑‑‑CGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGAAATTACAGGCAGTAACCAAAAGCTGGGATGGTAAAACCCAGGTCATTAAACCGCTGACCCTTGATGTGGCGGATGGCGAATTTATCGTGATGGTCGGGCCGTCTGGCTGCGGGAAATCGACGCTGCTGCGCATGGTTGCCGGGCTGGAGCGGGTGACAGAAGGCGATATCTGGATCAACGAC > NC_007779/4050956‑4051429 | aCATCGTTTTTCCGCTCTCCAAAACTAATCTGGCGGCGCTGTTTGTGATCACCTTTATCTACGGCTGGAATCAGTATTTGTGGCCGTTGTTGATTATTACCGATGTGGATCTCGGCACCACCGTGGCAGGGATCAAAGGGATGATCGCTACAGGCGAAGGCACCACGGAATGGAACTCAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAg > 1:1205452/1‑239 (MQ=255) cATCGTTTTTCCGCTCTCCAAAACTAATCTGGCGGCGCTGTTTGTGATCACCTTTATCTACGGCTGGAATCAGTATTTGTGGCCGTTGTTGATTATTACCGATGTGGATCTCGGCACCACCGTGGCAGGGATCAAAGGGATGATCGCTACAGGCGAAGGCACCACGGAATGGAACTCAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGc < 1:935286/239‑1 (MQ=255) aTCGTTTTTCCGCTCTCCAAAACTAATCTGGCGGCGCTGTTTGTGATCACCTTTATCTCCGGCTGGAATCAGTATTTGTGGCCGTTGTTGATTATTACCGATGTGGATCTCGGCACCACCGTGGCAGGGATCAAAGGGATGATCGCTACAGGCGAAGGCACCACGGAATGGAACTCAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGCg > 1:1300630/1‑239 (MQ=255) cgggcgctcctgatgcgccagtcgcaccaccagcttctgctcgccccagcgtccgtgcgccaggttatctgcgccgaggatctccagcgtgtccatcaccatcggtacgccgccttctgcctgcgagcttagcgcaatatgttccgggcgaatgccgagagtcattttacgcccggcatactgacggtagccaccgtttagcggcagctcaataccgccgtccagttcgaaatGCGTGc > 2:750206‑M1/234‑239 (MQ=255) cgggcgctcctgatgcgccagtcgcaccaccagcttctgctcgccccagcgtccgtgcgccaggttatctgcgccgaggatctccagcgtgtccatcaccatcggtacgccgccttctgcctgcgagcttagcgcaatatgttccgggcgaatgccgagagtcattttacgcccggcatactgacggtagccaccgtttagcggcagctcaataccgccgtccagttcgaaatGCGTGc > 1:1143438‑M1/234‑239 (MQ=255) tttttCCGCTCTCCAAACCTAATCTGGCGGTGTTGTTTGTGATCACCTTTATCTACGGCTGGAATCAGTATTTGTGGGCGTTGTTGATTATTACCGATGTGGATCTCGGCACCACCGTGGGAGGGATCAAAGGGATGATCGCTACAGGGGAAGGCACCACGGAATGGAACTCAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGc < 1:987600/234‑1 (MQ=255) tctcCAAAACTAATCTGGCGGCGCTGTTTGTGATCACCTTTATCTACGGCTGGAATCAGTATTTGTGGCCGTTGTTGATTATTACCGATGTGGAGCTCGGCACCACCGTGGCAGGGATCTAAGGGATGATCGCTACAGGCGAAGGCACCACGGAATGGAACTCAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGCGTGCCTTCGTg‑‑‑‑‑cg < 1:1440743/238‑1 (MQ=255) ccAAAACTAATCTGGCGGCGCTGTTTGTGATCACCTTTATCTACGGCTGGAATCAGTATTTGTGGCCGTTGTTGATTATTACCGATGTGGATCTCGGCACCACCGTGGCAGGGATCAAAGGGATGATCGCTACAGGCGAAGGCACCACGGAATGGAACTCAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGCGTGCCTTCGTG‑‑‑‑‑CGCGGc < 1:1063960/239‑1 (MQ=255) ccagtcgcaccaccagcttctgctcgccccagcgtccgtgcgccaggttatctgcgccgaggatctccagcgtgtccatcaccatcggtacgccgccttctgcctgcgagcttagcgcaatatgttccgggcgaatgccgagagtcattttacgcccggcatactgacggtagccaccgtttagcggcagctcaataccgccgtccagttcgaaatGCg < 1:460198‑M1/3‑1 (MQ=255) ccagtcgcaccaccagcttctgctcgccccagcgtccgtgcgccaggttatctgcgccgaggatctccagcgtgtccatcaccatcggtacgccgccttctgcctgcgagcttagcgcaatatgttccgggcgaatgccgagagtcattttacgcccggcatactgacggtagccaccgtttagcggcagctcaataccgccgtccagttcgaaatGCg > 2:460198‑M1/217‑219 (MQ=255) tAATCTGGCGGCGCTGTTTGTGATCACCTTTATCTACGGCTGGAATCAGTATTTGTGGCCGTTGTTGATTATTACCGATGTGGATCTCGGCACCACCGTGGCAGGGATCAAAGGGATGATCGCTACAGGCGGAGGCACCACGGAATGGGACTCAGGGGTGGGGGCGATGGTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGGTTGGTTTAGGGATGCCGCGGGCCTTCGTG‑‑‑‑‑CGCGGCCTTGTCg > 2:895030/1‑239 (MQ=255) aTCTGGCGGCGCTGTTTGTGATCACCTTTATCTACGGCTGGAATCAGTATTTGTGGCCGTTGTTGATTATTACCGATGTGGATCTCGGCACCACCGTGGCAGGGATCAAAGGGATGATCGCTACAGGCGAAGGCACCACGGAATGGAACTCAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGCGTGCCTTCGTG‑‑‑‑‑CGCGGc < 2:529925/230‑1 (MQ=255) aTCTGGCGGCGCTGTTTGTGATCACCTTTATCTACGGCTGGAATCAGTATTTGTGGCCGTTGTTGATTATTACCGATGTGGAACTCGGCACCCACGTGGCAGGGATCCAAGGGATGATCGCTACCGGCGAAGGCCACACCGGATGGAACTCAGGGCTGGGGGCGGTTTTGGTTAAGCCTTTCCCCCCGGTGGTGATTGGTTTTGTGATTCAGCGGTGCTTCGTG‑‑‑‑‑CGCGGCCCGGGCGAt > 2:1232788/1‑239 (MQ=255) 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ggCACCACGGAATGGAACTCAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGCGTGCCTTCGTG‑‑‑‑‑CGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGAAATTACAGGCAGTAACCAAAAg > 2:138397/1‑156 (MQ=255) ggCACCACGGAATGGAACTCAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGCGTGCCTTCGTG‑‑‑‑‑CGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGAAATTACAGGCAGTAACCAAAAGCTGGGATGGTa > 1:15356/1‑167 (MQ=255) ggCACCACGGAATGGAACTCAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGCGTGCCTTCGTG‑‑‑‑‑CGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGAAATTACAGGCAGTAACCAAAAGCTGGGATGGTa < 2:15356/167‑1 (MQ=255) ggCACCACGGAATGGAACTCAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGCGTGCCTTCGTG‑‑‑‑‑CGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGAAATTACAGGCAGTAACCAAAAGCTGGGATGGTAAAACCCAGGTCATTAAACCGCTGACCCTTGATGTGGCGGATGGCGaa < 2:1892896/214‑1 (MQ=255) 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tggtggCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGCGTGCCTTCGTG‑‑‑‑‑CGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGAAATTACAGGCAGTAACCAAAAGCTGGGATGGTAAAACCCAGGTCATTAAACCGCTGACCCTTGATGTGGCGGATGGCGAATTTATCGTGATGGTCGGGCCGTCTGGCTGCGGGAAATCGACGCcgctgc > 1:17559/1‑238 (MQ=255) gCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGCGTGCCTTCGTG‑‑‑‑‑CGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGAAATTACAGGCCGTAACCAAAAGCTGGGATGGTAAAACCCAGGTCATTACACCGCTGACCCTTGATGTGGCGGCAGGCGAATTTATCTTGATGGTCTGGCCGTCTTGCTGCGGGGAATCGTCGCTTCTgcggctgg > 1:1087346/1‑234 (MQ=255) gCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGCGTGCCTTCGTG‑‑‑‑‑CGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGAAATTACAGGCAGTAACCAAAAGCTGGGATGGTAAAACCCAGGTCATTAAACCGCTGACCCTTGATGTGGCGGATgg < 1:1024184/180‑1 (MQ=255) gCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGCGTGCCTTCGTG‑‑‑‑‑CGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGAAATTACAGGCAGTAACCAAAAGCTGGGATGGTAAAACCCAGGTCATTAAACCGCTGACCCTTGATGTGGCGGATgg > 2:1024184/1‑180 (MQ=255) 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cAGCGTGCCTTCGTG‑‑‑‑‑CGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGAAATTACAGGCAGTAACCAAAAGCTggg < 2:251043/83‑1 (MQ=255) | ACATCGTTTTTCCGCTCTCCAAAACTAATCTGGCGGCGCTGTTTGTGATCACCTTTATCTACGGCTGGAATCAGTATTTGTGGCCGTTGTTGATTATTACCGATGTGGATCTCGGCACCACCGTGGCAGGGATCAAAGGGATGATCGCTACAGGCGAAGGCACCACGGAATGGAACTCAGTGATGGTGGCGATGTTGTTAACGCTTATCCCTCCGGTGGTGATTGTTTTAGTGATGCAGCGTGCCTTCGTG‑‑‑‑‑CGCGGCCTGGTCGATAGTGAGAAATAAGATGGCAGGACTGAAATTACAGGCAGTAACCAAAAGCTGGGATGGTAAAACCCAGGTCATTAAACCGCTGACCCTTGATGTGGCGGATGGCGAATTTATCGTGATGGTCGGGCCGTCTGGCTGCGGGAAATCGACGCTGCTGCGCATGGTTGCCGGGCTGGAGCGGGTGACAGAAGGCGATATCTGGATCAACGAC > NC_007779/4050956‑4051429 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |