New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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Only 100 of 214 total aligned reads displayed.
CATTTAGATTGTCAATATCAGAATCATGGTAAATTGATGTTGGGAATATTCCCGAAGCGTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTATTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGTTAACGGAGCTGCCATGAATCTGCCTGTAAAAATCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCGCCATTGGCCTTATATTCATTCTTAATGGCGTGGTGGGGTTACTGGGATTTGAAGCAAAAGGTTGGCAGACCTATGCCGTCGGTCTGGTGACGTGGGTGATTAGTTTCTGGCTGGCGGGGTTGATTATTCGTCGTCGCGATGAAGAAACTGAAAACGCCCAATAAGAATATTATCGGGCG‑TTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGTTATCCGCAGCGTGACGCTCCAGCGCC > NC_007779/398627‑399101 | cATTTAGATTGTCAATATCAGAATCATGGTAAATTGATGTTGGGAATATTCCCGAAGCGTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTATTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGTTAACGGAGCTGCCATGAATCTGCCTGTAAAAATCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTc > 1:2137008/1‑238 (MQ=255) 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> 2:887583/1‑239 (MQ=255) gggAATATTCCCGAAGCGTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTATTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGTTAACGGAGCTGCCATGAATCTGCCTGTAAAAATCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCGCCATTGGCCTTatat > 2:1106009/1‑213 (MQ=255) tatTCCCGAAGCGTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTATTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGTTAACGGAGCTGCCATGAATCTGCCTGTAAAAATCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCGCCATTGGCCTTATATTCATTCTTAATGGCGTGGTGGGGTTACTggg > 1:131748/1‑239 (MQ=255) tCCCGAAGCGTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTATTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGTTAACGGAGCTGCCATGAATCTGCCTGTAAAAATCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCGCCATTGGCCTTATATTCATTCTTAATGGCGTGGTGGGGTTACTGGGAtt > 1:1067775/1‑239 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |