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Missing coverage evidence... | ||||||||||
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New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 204 total aligned reads displayed.
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1:404988/150‑1 CTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAAACAAGTAAATAAACGAGAGATGACCTTTGCAAAAGGCAAAATTAAGATATAGCAAACAAATAGATCACAT > 2:1360145/1‑124 TGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAAACAAGTAAATAAACGAGAGATGACCTTTGCAAAAGGCAAAATTAAGATATAGCAAACAAATAGATCACATTGAATCTAATCGGTTTGGCTCTGGTGATGGCTACAGAAGGGCAAATCAAGGGCGGTGATCGACAATTTTGTTGTCAATATTGAACCATTTTGAGGTCACACATATATGTAAGATAT < 2:812151/239‑1 GCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAAACAAGTAAATAAACGAGAGATGACCTTTGCAAAAGGCAAAATTAAGATATAGCAAACAAATAGATCACATTGAATCTAATCGGTTTGGCTCTGGTGATGGCTACAGAAGGGCAAATCAAGGGCGGTGATCGACAATTTTGTTGTCAATATTGAACCATTTTGAGGTCA < 1:1350050/220‑1 ATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAAACAAGTAAATAAACGAGAGATGACCTTTGCAAAAGGCAAAATTAAGATATAGCAAACAAATAGATCACATTGAATCTAATCGGTTTGGCTCTGGTGATGGCTACAGAAGGGCAAATCAAGGGCGGTGATCGACAATTTTGTTGTCAATATTGAACCATTTTGAGGTCACACATATATGTAAGATATTCATAATGC > 1:883603/1‑238 ATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAAACAAGTAAATAAACGAGAGATGACCTTTGCAAAAGGCAAAATTAAGATATAGCAAACAAATAGATCACATTGAATCTAATCGGTTTGGCTCTGGTGATGGCTACAGAAGGGCAAATCAAGGGCGGTGATCGACAATTTTGTTGTCAATATTGAACCATTTTGAGGTCACACATATATGTAAGATATTCATAATGC > 1:838274/1‑238 ATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAAACAAGTAAATAAACGAGAGATGACCTTTGCAAAAGGCAAAATTAAGATATAGCAAACAAATAGATCACATTGAATCTAATCGGTTTGGCTCTGGTGATGGCTACAGAAGGGCAAATCAAGGGCGGTGATCGACAATTTTGTTGTCAATATTGAACCATTTTGAGGTCACACATATATGTAAGATATTCATAATGC > 1:1281166/1‑238 ATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAAACAAGTAAATAAACGAGAGATGACCTTTGCAAAAGGCAAAATTAAGATATAGCAAACAAATAGATCACATTGAATCTAATCGGTT > 2:1039044/1‑128 TTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAAACAAGTAAATAAACGAGAGATGACCTTTGCAAAAGGCAAAATTAAGATATAGCAAACAAATAGATCACATTGAATCTAATCGGTTTGGCTCTGGTGATGGCTACAGAAGGGCAAATCAAGGGCGGTGATCGACAATTTTGTTGTCAATATTGAACCATTTTGAGGT > 2:721965/1‑204 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acGCACCATCATTTACTAAAACAAGTAAATAAACGAGAGATGACCTTTGCAAAAGGCAAAATTAAGATATAGCAAACAAATAGATCACATTGAATCTAATCGGTTTGGCTATGGTGATGGCTACAGAAGGGCAAATCAAGGGCGGTGATCGACAATTTTGTTGTCAATATTGAACCATTTTGAGGTCACACATATATGTAAGATATTCATA > 2:1136595/3‑211 AAGCACCATCATTTACTAAAACAAGTAAATAAACGAGAGATGACCTTTGCAAAAGGCAAAATTAAGATATAGCAAACAAATAGATCACATTGAATCTAATCGGTTTGGCTCTGGTGATGGCTACAGAAGGGCAAATCAAGGGCGGTGATCGACAATTTTGTTGTCAATATTGATCCATTTTGAGGTCA < 1:1110844/188‑1 AAGCACCATCATTTACTAAAACAAGTAAATAAACGAGAGATGACCTTTGCAAAAGGCAAAATTAAGATATAGCAAACAAATAGATCACATTGAATCTAATCGGTTTGGCTCTGGTGATGGCTACAGAAGGGCAAATCAAGGGCGGTGATCGACAATTTTGTTGTCAATATTGAACCATTTTGAGGTCACACATATATGTAAGATATTCATAATGCACTTATCCTCGCAAGACACGAGGC < 2:872000/239‑1 AAGCACCATCATTTACTAAAACAAGTAAATAAACGAGAGATGACCTTTGCAAAAGGCAAAATTAAGATATAGCAAACAAATAGATCACATTGAATCTAATCGGTTTGGCTCTGGTGATGGCTACAGAAGGGCAAATCAAGGGCGGTGATCGACAATTTTGTTGTCAATATTGAACCATTTTGAGGTCACACATATATGTAAGATATTCATAATGCACTTATCCTCGCAAGACACGAGGC < 1:1196364/239‑1 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1:741178/1‑225 TAAAACAAGTAAATAAACGAGAGATGACCTTTGCAAAAGGCAAAATTAAGATATAGCAAACAAATAGATCACATTGAATCTAATCGGTTTGGCTCTGGTGATGGCTACAGAAGGGCAAATCAAGGGCGGTGATCGACAATTTTGTTGTCAATATTGAACCATTTTGAGGTCACACATATATGTAAGATATTCATAATGCACTTATCCT > 2:661359/1‑208 TAAAACAAGTAAATAAACGAGAGATGACCTTTGCAAAAGGCAAAATTAAGATATAGCAAACAAATAGATCACATTGAATCTAATCGGTTTGGCTCTGGTGATGGCTACAGAAGGGCAAATCAAGGGCGGTGATCGACAATTTTGTTGTCAATATTGAACCATTTTGAGGTCACACATATATGTAAGATATTCATAATGCACTTATCCT < 1:661359/208‑1 ATCTTCGCTATCCAGCAGGAACGGGTTCATACCGGATTTAATAATTGCCTCTTCACGATAAGCGCGAGTGGTACGTTTTACTGGCTCAATAACACGAATGCGGAACGGTTCAGGGAGATGTTTAAAGTTTTCCATTACATAATCCTTCATTTATTTTAATTACAGTGATCCCTGTGAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/3750352‑3750590 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |