| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_007779 | 3,750,591 | Δ1,199 bp | 100% | Y75_RS18600 | Y75_RS18600 | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_007779 | 3750591 | 3751789–3750592 | 2–1199 | 204 [0] | [0] 205 | Y75_RS18600 | Y75_RS18600 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | = 3750590 | 0 (0.000) | 190 (1.180) | 93/416 | NT | 100% | intergenic (‑104/‑33) | tnaA/Y75_RS18600 | tryptophanase/IS5‑like element IS5 family transposase |
| ? | NC_007779 | 3751790 = | 0 (0.000) | intergenic (+151/+116) | Y75_RS18600/tnaC | IS5‑like element IS5 family transposase/tryptophanase leader peptide | |||||
Only 100 of 204 total aligned reads displayed.
ATCTTCGCTATCCAGCAGGAACGGGTTCATACCGGATTTAATAATTGCCTCTTCACGATAAGCGCGAGTGGTACGTTTTACTGGCTCAATAACACGAATGCGGAACGGTTCAGGGAGATGTTTAAAGTTTTCCATTACATAATCCTTCATTTATTTTAATTACAGTGATCCCTGTGAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCGACAGTGAATTCAGCAGTAAGCGCCGTCAGACCAGAAAAGAGATTTTCTTGTCCCGCATGGAGCAGATTCTGCCATGGCAAAACATGGTGGAAGTCATCGAGCCGTTTTACCCCAAGGCTGGTAATGGCCGGCGACCTTATCCG > NC_007779/3750352‑3750826 | aTCTTCGCTATCCAGCAGGAACGGGTTCATACCGGATTTAATAATTGCCTCTTCACGATAAGCGCGAGTGGTACGTTTTACTGGCTCAATAACACGAATGCGGAACGGTTCAGGGAGATGTTTAAAGTTTTCCATTACATAATCCTTCATTTATTTTAATTACAGTGATCCCTGTGAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAA < 1:481412‑M1/239‑1 (MQ=255) cTTCGCTATCCAGCAGGAACGGGTTCATACCGGATTTAATAATTGCCTCTTCACGATAAGCGCGAGTGGTACGTTTTACTGGCTCAATAACACGAATGCGGAACGGTTCAGGGAGATGTTTAAAGTTTTCCATTACATAATCCTTCATTTATTTTAATTACAGTGATCACTGTGAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAa > 1:1050374‑M1/1‑237 (MQ=255) cGCTATCCAGCAGGAACGGGTTCATACCGGATTTAATAATTGCCTCTTCACGATAAGCGCGAGTGGTACGTTTTACTGGCTCAATAACACGAATGCGGAACGGTTCAGGGAGATGTTTAAAGTTTTCCATTACATAATCCTTCATTTATTTTAATTACAGTGATCCCTGTGAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaa < 2:543616‑M1/239‑6 (MQ=255) cGCTATCCAGCAGGAACGGGTTCATACCGGATTTAATAATTGCCTCTTCACGATAAGCGCGAGTGGTACGTTTTACTGGCTCAATAACACGAATGCGGAACGGTTCAGGGAGATGTTTAAAGTTTTCCATTACATAATCCTTCATTTATTTTAATTACAGTGATCCCTGTGAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaa < 1:73247‑M1/239‑6 (MQ=255) gtaTCCAGCAGGAACGGGTTCATACCGGATTTAATAATTGCCTCTTCACGATAAGCGCGAGTGGTACGTTTTACTGGCTCAATAACACGAATGCGGAACGGTTCAGGGAGATGTTTAAAGTTTTCCATTACATAATCCTTCATTTATTTTAATTACAGTGATCCCTGTGAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagt < 2:1814054‑M1/238‑8 (MQ=255) cagcagGAACGGGTTCATACCGGATTTAATAATTGCCTCTTCACGATAAGCGCGAGTGGTACGTTTTACTGGCTCAATAACACGAATGCGGAACGGTTCAGGGAGATGTTTAAAGTTTTCCATTACATAATCCTTCATTTATTTTAATTACAGTGATCCCTGTGAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaata < 1:504300‑M1/239‑13 (MQ=255) agcagGAACGGGTTCATACCGGATTTAATAATTGCCTCTTCACGATAAGCGCGAGTGGTACGTTTTACTGGCTCAATAACACGAATGCGGAACGGTTCAGGGAGATGTTTAAAGTTTTCCATTACATAATCCTTCATTTATTTTAATTACAGTGATCCCTGTGAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataa > 2:426820‑M1/1‑226 (MQ=255) cagGAACGGGTTCATACCGGATTTAATAATTGCCTCTTCACGATAAGCGCGAGTGGTACGTTTTACTGGCTCAATAACACGAATGCGGAACGGTTCAGGGAGATGTTTAAAGTTTTCCATTACATAATCCTTCATTTATTTTAATTACAGTGATCCCTGTGAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaac > 2:1698886‑M1/1‑224 (MQ=255) cagGAACGGGTTCATACCGGATTTAATAATTGCCTCTTCACGATAAGCGCGAGTGGTACGTTTTACTGGCTCAATAACACGAATGCGGAACGGTTCAGGGAGATGTTTAAAGTTTTCCATTACATAATCCTTCATTTATTTTAATTACAGTGATCCCTGTGAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaac > 2:1170939‑M1/1‑224 (MQ=255) agGAACGGGTTCATACCGGATTTAATAATTGCCTCTTCACGATAAGCGCGAGTGGTACGTTTTACTGGCTCAATAACACGAATGCGGAACGGTTCAGGGAGATGTTTAAAGTTTTCCATTACATAATCCTTCATTTATTTTAATTACAGTGATCCCTGTGAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaac < 2:1591494‑M1/238‑16 (MQ=255) agGAACGGGTTCATACCGGATTTAATAATTGCCTCTTCACGATAAGCGCGAGTGGTACGTTTTACTGGCTCAATAACACGAATGCGGAACGGTTCAGGGAGATGTTTAAAGTTTTCCATTACATAATCCTTCATTTATTTTAATTACAGTGATCCCTGTGAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaac < 1:1273534‑M1/238‑16 (MQ=255) agGAACGGGTTCATACCGGATTTAATAATTGCCTCTTCACGATAAGCGCGAGTGGTACGTTTTACTGGCTCAATAACACGAATGCGGAACGGTTCAGGGAGATGTTTAAAGTTTTCCATTACATAATCCTTCATTTATTTTAATTACAGTGATCCCTGTGAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaac < 2:21374‑M1/238‑16 (MQ=255) agGAACGGGTTCATACCGGATTTAATAATTGCCTCTTCACGATAAGCGCGAGTGGTACGTTTTACTGGCTCAATAACACGAATGCGGAACGGTTCAGGGAGATGTTTAAAGTTTTCCATTACATAATCCTTCATTTATTTTAATTACAGTGATCCCTGTGAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaac < 1:1837189‑M1/238‑16 (MQ=255) gAACGGGTTCATACCGGATTTAATAATTGCCTCTTCACGATAAGCGCGAGTGGTACGTTTTACTGGCTCAATAACACGAATGCGGAACGGTTCAGGGAGATGTTTAAAGTTTTCCATTACATAATCCTTCATTTATTTTAATTACAGTGATCCCTGTGAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgag > 1:1689493‑M1/1‑221 (MQ=255) ttAATAATTGCCTCTTCACGATAAGCGCGAGTGGTACGTTTTACTGGCTCAATAACACGAATGCGGAACGGTTCAGGGAGATGTTTAAAGTTTTCCATTACATAATCCTTCATTTATTTTAATTACAGTGATCCCTGTGAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaagg < 1:567930‑M1/239‑38 (MQ=255) taataaTTGCCTCTTCACGATAAGCGCGAGTGGTACGTTTTACTGGCTCAATAACACGAATGCGGAACGGTTCAGGGAGATGTTTAAAGTTTTCCATTACATAATCCTTCATTTATTTTAATTACAGTGATCCCTGTGAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggc < 1:1822194‑M1/239‑39 (MQ=255) aataatTGCCTCTTCACGATAAGCGCGAGTGGTACGTTTTACTGGCTCAATAACACGAATGCGGAACGGTTCAGGGAGATGTTTAAAGTTTTCCATTACATAATCCTTCATTTATTTTAATTACAGTGATCCCTGTGAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggca > 2:749145‑M1/1‑200 (MQ=255) ttGCCTCTTCACGATAAGCGCGAGTGGTACGTTTTACTGGCTCAATAACACGAATGCGGAACGGTTCAGGGAGATGTTTAAAGTTTTCCATTACATAATCCTTCATTTATTTTAATTACAGTGATCCCTGTGAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaatt > 1:1237430‑M1/1‑195 (MQ=255) ttGCCTCTTCACGATAAGCGCGAGTGGTACGTTTTACTGGCTCAATAACACGAATGCGGAACGGTTCAGGGAGATGTTTAAAGTTTTCCATTACATAATCCTTCATTTATTTTAATTACAGTGATCCCTGTGAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaatt < 1:1513121‑M1/239‑45 (MQ=255) tGCCTCTTCACGATAAGCGCGAGTGGTACGTTTTACTGGCTCAATAACACGAATGCGGAACGGTTCAGGGAGATGTTTAAAGTTTTCCATTACATAATCCTTCATTTATTTTAATTACAGTGATCCCTGTGAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaatta > 1:1607466‑M1/1‑194 (MQ=255) gCCTCTTCACGATAAGCGCGAGTGGTACGTTTTACTGGCTCAATAACACTAATGCGGAACGGTTCAGGGAGATGTTTAAAGTTTTCCATTACATAATCCTTCATTTATTTTAATTACAGTGATCCCTGTGAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaagg < 1:983918‑M1/230‑38 (MQ=255) tctTCACGATAAGCGCGAGTGGTACGTTTTACTGGCTCAATAACACGAATGCGGAACGGTTCAGGGAGATGTTTAAAGTTTTCCATTACATAATCCTTCATTTATTTTAATTACAGTGATCCCTGTGAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagat > 2:1266522‑M1/1‑190 (MQ=255) tctTCACGATAAGCGCGAGTGGTACGTTTTACTGGCTCAATAACACGAATGCGGAACGGTTCAGGGAGATGTTTAAAGTTTTCCATTACATAATCCTTCATTTATTTTAATTACAGTGATCCCTGTGAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaa > 2:387004‑M1/1‑190 (MQ=255) ttCACGATAAGCGCGAGTGGTACGTTTTACTGGCTCAATAACACGAATGCGGAACGGTTCAGGGAGATGTTTAAAGTTTTCCATTACATAATCCTTCATTTATTTTAATTACAGTGATCCCTGTGAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatat < 2:1237430‑M1/239‑52 (MQ=255) aCGTTTTACTGGCTCAATAACACGAATGCGGAACGGTTCAGGGAGATGTTTAAAGTTTTCCATTACATAATCCTTCATTTATTTTAATTACAGTGATCCCTGTGAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacatt > 2:367846‑M1/1‑167 (MQ=255) cTGGCTCAATAACACGAATGCGGAACGGTTCAGGGAGATGTTTAAAGTTTTCCATTACATAATCCTTCATTTATTTTAATTACAGTGATCCCTGTGAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaa > 2:1458231‑M1/1‑159 (MQ=255) aTGCGGAACGGTTCAGGGAGATGTTTAAAGTTTTCCATTACATAATCCTTCATTTATTTTAATTACAGTGATCCCTGTGAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtg < 1:312082‑M1/239‑98 (MQ=255) aTGCGGAACGGTTCAGGGAGATGTTTAAAGTTTTCCATTACATAATCCTTCATTTATTTTAATTACAGTGATCCCTGTGAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagca > 2:740547‑M1/1‑142 (MQ=255) tGTTTAAAGTTTTCCATTACATAATCCTTCATTTATTTTAATTACAGTGATCCCTGTGAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatc > 2:141773‑M1/1‑121 (MQ=255) tGTTTAAAGTTTTCCATTACATAATCCTTCATTTATTTTAATTACAGTGATCCCTGTGAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatc > 2:669851‑M1/1‑121 (MQ=255) tGTTTAAAGTTTTCCATTACATAATCCTTCATTTATTTTAATTACAGTGATCCCTGTGAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatc > 2:636732‑M1/1‑121 (MQ=255) tCCTTCATTTATTTTAATTACAGTGATCCCTGTGAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaa > 2:625088‑M1/1‑97 (MQ=255) tCCTTCATTTATTTTAATTACAGTGATCCCTGTGAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaa < 1:625088‑M1/131‑35 (MQ=255) cATTTATTTTAATTACAGTGCTCCCTGTGAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaccaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgaca > 2:1851858‑M1/1‑92 (MQ=255) cATTTATTTTAATTACAGTGATCCCTGTGAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtca > 2:1276634‑M1/1‑92 (MQ=255) cATTTATTTTAATTACAGTGATCCCTGTGAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgaca < 1:1851858‑M1/227‑136 (MQ=255) ttAATTACAGTGATCCCTGTGAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaa < 1:103443‑M1/239‑156 (MQ=255) aTTACAGTGATCCCTGTGAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaagg < 2:642255‑M1/118‑38 (MQ=255) gATCCCTGTGAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccatttttt < 1:1458231‑M1/237‑165 (MQ=255) aTCCCTGTGAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaaggtcggtgatcgacaattttgttgtacatattgaaccattttgagg > 2:1378119‑M1/1‑72 (MQ=255) aTCCCTGTGAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgagg > 2:164391‑M1/1‑72 (MQ=255) tCCCTGTGAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgaggt < 1:1243714‑M1/238‑168 (MQ=255) tgtgAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagata > 1:131570‑M1/1‑67 (MQ=255) gtgAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgaggtcacaca > 1:1189991‑M1/1‑66 (MQ=255) gAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgaggtcacacat < 1:1780784‑M1/238‑175 (MQ=255) atTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgaggtcacacatatatg > 2:129300‑M1/1‑60 (MQ=255) atTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaat > 2:112531‑M1/1‑60 (MQ=255) ttACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgaggtcacacatatatgt < 2:1787061‑M1/239‑181 (MQ=255) tACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgaggtcacacatatatgta > 1:365716‑M1/1‑58 (MQ=255) tACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggca > 2:1402905‑M1/1‑58 (MQ=255) tACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggca < 1:1402905‑M1/97‑40 (MQ=255) aCATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgaggtcacacatatatgtaa > 1:1214689‑M1/1‑57 (MQ=255) cATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgaggtcacacatatatgtaag < 1:370609‑M1/239‑184 (MQ=255) aTCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgaggtcacacatatatgtaaga > 2:1025955‑M1/1‑55 (MQ=255) tCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgaggtcacacatatatgtaagat < 1:1378119‑M1/239‑186 (MQ=255) cTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgaggtcacacatatatgtaagata > 1:868046‑M1/1‑53 (MQ=255) cTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttga < 1:637106‑M1/217‑165 (MQ=255) cTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatatt > 2:573350‑M1/1‑53 (MQ=255) cTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaaggg > 2:92093‑M1/1‑53 (MQ=255) cTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaaggg < 1:92093‑M1/176‑124 (MQ=255) cTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtg < 1:404988‑M1/150‑98 (MQ=255) cTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacat > 2:1360145‑M1/1‑53 (MQ=255) tGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgaggtcacacatatatgtaagatat < 2:812151‑M1/239‑188 (MQ=255) gCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgaggtca < 1:1350050‑M1/220‑170 (MQ=255) aTTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgaggtcacacatatatgtaagatattcataatgc > 1:883603‑M1/1‑42 (MQ=255) aTTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgaggtcacacatatatgtaagatattcataatgc > 1:838274‑M1/1‑42 (MQ=255) aTTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgaggtcacacatatatgtaagatattcataatgc > 1:1281166‑M1/1‑42 (MQ=255) aTTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtt > 2:1039044‑M1/1‑42 (MQ=255) ttCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgaggt > 2:721965‑M1/1‑37 (MQ=255) ttCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgaggt < 1:721965‑M1/204‑168 (MQ=255) atatatatGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgaggtca > 2:249000‑M1/1‑29 (MQ=255) atatatatGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgaggtca < 1:249000‑M1/198‑170 (MQ=255) atatGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgaggtcacacatatatgtaagatattcataatgcacttatcctcgcaagaca < 1:709911‑M1/239‑215 (MQ=255) atatGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgaggtcacacatatatgtaagatattcataatgcacttatcctcgcaagaca < 1:141773‑M1/239‑215 (MQ=255) atatGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgaggtcacacatatatgtaagatattcataatgcacttatcctcgcaagaca < 1:433757‑M1/239‑215 (MQ=255) tGCAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgaggt < 2:1325195‑M1/189‑168 (MQ=255) cAAGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgaggtcacacatatatgtaagatattcataatgcacttatcctcgcaagacacgag > 2:320940‑M1/1‑20 (MQ=255) acgcaCCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctatggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgaggtcacacatatatgtaagatattcata > 2:1136595‑M1/3‑19 (MQ=255) aaGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgatccattttgaggtca < 1:1110844‑M1/188‑170 (MQ=255) aaGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgaggtcacacatatatgtaagatattcataatgcacttatcctcgcaagacacgaggc < 2:872000‑M1/239‑221 (MQ=255) aaGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgaggtcacacatatatgtaagatattcataatgcacttatcctcgcaagacacgaggc < 1:1196364‑M1/239‑221 (MQ=255) aaGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgaggtcacacatatatgtaagatattcataatgcacttatcctcgcaagacacgagg < 1:320940‑M1/238‑220 (MQ=255) aaGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgaggtcacacatatatgtaagatattcataatgcacttatcctcgcaagacacgagg < 1:669851‑M1/238‑220 (MQ=255) aaGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgaggtcacacatatatgtaagatattcata < 1:1136595‑M1/211‑193 (MQ=255) aaGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgaggtc > 2:892079‑M1/1‑19 (MQ=255) aGCTCCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgaggtcacacatatatgtaagatattcataatgcacttatcctcgcaagacacgaggct > 2:1741681‑M1/1‑18 (MQ=255) aGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgaggtcacacatatatgtaagatattcataatgcacttatcctcgcaagacacgaggct > 1:15231‑M1/1‑18 (MQ=255) aGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgaggtcacacatatatgtaagatattcataatgcacttatcctcgcaagacacgaggct > 1:1387545‑M1/1‑18 (MQ=255) aGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtt > 1:1679907‑M1/1‑18 (MQ=255) aGCACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtt < 2:1679907‑M1/104‑87 (MQ=255) cACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgaggtcacacatatatgtaagatattcataatgcacttatcctcgcaagacacgaggct > 2:1521242‑M1/1‑16 (MQ=255) cACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgaggtcacacatatatgt < 1:1636021‑M1/196‑181 (MQ=255) cACCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgaggtcacacatatatgt > 2:1636021‑M1/1‑16 (MQ=255) aCCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgaggtcacacatatatgtaagatattcataatgcacttatcctcgcaagacacgaggcta < 2:1071108‑M1/237‑223 (MQ=255) aCCATCATTTACTAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgaggtcacacatatatgtaagatattcataatgcacttatcctcgcaagacacgaggcta < 2:838274‑M1/237‑223 (MQ=255) tAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgaggtcacacatatatgtaagatattcataatgcacttatcctcgcaagacacgaggctacattattacactca > 2:449220‑M1/1‑3 (MQ=255) tAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgaggtcacacatatatgtaagatattcataatgcacttatcctcgcaagacacgaggctacattattacactca < 1:164391‑M1/239‑237 (MQ=255) tAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgaggtcacacatatatgtaagatattcataatgcacttatcctcgcaagacacgaggcta > 1:741178‑M1/1‑3 (MQ=255) tAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgaggtcacacatatatgtaagatattcataatgcacttatcct > 2:661359‑M1/1‑3 (MQ=255) tAAaacaagtaaataaacgagagatgacctttgcaaaaggcaaaattaagatatagcaaacaaatagatcacattgaatctaatcggtttggctctggtgatggctacagaagggcaaatcaagggcggtgatcgacaattttgttgtcaatattgaaccattttgaggtcacacatatatgtaagatattcataatgcacttatcct < 1:661359‑M1/208‑206 (MQ=255) | ATCTTCGCTATCCAGCAGGAACGGGTTCATACCGGATTTAATAATTGCCTCTTCACGATAAGCGCGAGTGGTACGTTTTACTGGCTCAATAACACGAATGCGGAACGGTTCAGGGAGATGTTTAAAGTTTTCCATTACATAATCCTTCATTTATTTTAATTACAGTGATCCCTGTGAATATTACATCTGCTATACCGATTAATTCGCCAGATATATATGCAAGCACCATCATTTACTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCGACAGTGAATTCAGCAGTAAGCGCCGTCAGACCAGAAAAGAGATTTTCTTGTCCCGCATGGAGCAGATTCTGCCATGGCAAAACATGGTGGAAGTCATCGAGCCGTTTTACCCCAAGGCTGGTAATGGCCGGCGACCTTATCCG > NC_007779/3750352‑3750826 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |