| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_007779 | = 3094784 | 215 (1.390) | 4 (0.030) | 3/368 | NT | 2.0% | coding (309/567 nt) | yggT | osmotic shock tolerance protein YggT |
| ? | NC_007779 | = 3094936 | 193 (1.300) | coding (461/567 nt) | yggT | osmotic shock tolerance protein YggT | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 235 total aligned reads displayed.
ATGCAGTGGGCTCATTGTGATTTTTACAACCCCTTCTCACAGTTTGTAGTGAAGGTAACGCAGCCAATTATCGGGCCACTGCGCCGCGTTATTCCGGCAATGGGGCCAATTGACAGCGCCTCGCTGCTGGTTGCCTATATTCTCAGTTTTATCAAAGCCATCGTGCTGTTTAAAGTGGTGACCTTCCTGCCAATCATCTGGATTGCCGGTTTACTGATTCTGCTGAAAACCATCGGCCTGCTGATTTTCTGGGTCCTGCTG‑GTGATGGCGATTATGAGCTGGGTAAGCCAGGGGCGTAGCCCGATTGAATACGTGCTGATTCAGCTGGCCGATCCGCTGCTGCGCCCGATTCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGT‑GGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCA > NC_007779/3094548‑3095021 | aTGCAGTGGGCTCATTGTGATTTTTACAACCCCTTCTCACAGTTTGTAGTGAAGGTAACGCAGCCAATTATCGGGCCACTGCGCCGCGTTATTCCGGCAATGGGGCCAATTGACAGCGCCTCGCTGCTGGTTGCCTATATTCTCAGTTTTATCAAAGCCATCGTGCTGTTTAAAGTGGTGACCTTCCTGCCAATCATCTGGATTGCCGGTTTACTGATTCTGCTGAAAACCATCGGcc < 1:1026143/238‑1 (MQ=255)aTGCAGTGGGCTCATTGTGATTTTTACAACCCCTTCTCACAGTTTGTAGTGAAGGTAACGCAGCCAATTATCGGGCCACTGCGCCGCGTTATTCCGGCAATGGGGCCAATTGACAGCGCCTCGCTGCTGGTTGCCTATATTCTCAGTTTTATCAAAGCCATCGTGCTGTTTAAAGTGGTGACCTTCCTGCCAATCATCTGGATTGCCGGTTTACTGATTCTGCTGAAAACCATCGGcc < 1:1525849/238‑1 (MQ=255) aGTGGGCTCATTGTGATTTTTACAACCCCTTCTCACAGTTTGTAGTGAAGGTAACGCAGCCAATTATCGGGCCACTGCGCCGCGTTATTACGGCAATGGGGCCAATTGACAGCGCCTCGCTGCTGGTTGCCTATATTCTCAGTTTTATCAAAGCCATCGTGCTGTTTAACGTGGTGACCTTCCTGCCAATCATCCGGATTGCCGGTTTACTGATTCTGCGGAAACCCATCGGCctgctg > 2:842677/1‑239 (MQ=255) tGGGCTCATTGTGATTTTTACAACCCCTTCTCACAGTTTGTAGTGAAGGTAACGCAGCCAATTATCGGGCCACTGCGCCGCGTTATTCCGGCAATGGGGCCAATTGACAGCGCCTCGCTGCTGGTTGCCTATATTCTCAGTTTTATCAACGCCATCGTGCTGTTTAAAGTGGTGACCTTCCTGCCAATCATCTGGATTGCCGGTTTACTGATTCTGCTGAAACCCATCGGCCTGCTGAt > 2:1050354/1‑239 (MQ=255) tGGGCTCATTGTGATTTTTACAACCCCTTCTCACAGTTTGTAGTGAAGGTAACGCAGCCAATTATCGGGCCACTGCGCCGCGTTATTCCGGCAATGGGGCCAATTGACAGCGCCTCGCTGCTGGTTGCCTATATTCTCAGTTTTATCAAAGCCATCGTGCTGTTTAAAGTGGTGACCTTCCTGCCAATCATCTGGATTGCCGGTTTACTGATTCTGCTGAAAACCATCGGCCTGCTGAt > 1:1988557/1‑239 (MQ=255) agggCCCAGTGTGATTTTTACAACCCCTTCTCACAGTATGTGGGGAAGGTAACGCAGCCAATTCTCGCGCCACCACGCCGCGTTATTCAGGCAATGGGGCCAATGTCCAGCGCCTCGCTGCTGGTGTCATCTATTCGCAGTTTTATCAAAACCTTCGTCCTGTTAAAACTGGTTCCCTTGCTGCCAATCATCTGGATTGCGGGTTTACTGATTCTTCTGAAAACCATCTACctgaccat > 2:1550897/2‑234 (MQ=255) ttGTGATTTTTACAACCCCTTCTCACAGTTTGTAGTGAAGGTAACGCAGCCAATTATCGGGCCACTGCGCCGCGTTATTCCGGCAATGGGGCCAATTGACAGCGCCTCGCTGCTGGTTGCCTATATTCTCAGTTTTATCAAAGCCATCGTGCTGTTTAAAGTGGTGACCTTCCTGCCAATCATCTGGATTGCCGGTTTACTGATTCTGCTGAAAACCATCGGCCTGCTGATTTTCTggg < 1:300546/239‑1 (MQ=255) aTTTTTACAACCCCTTCTCACAGTTTGTAGTGAAGGTAACGCAGCCAATTATCGGGCCACTGCGCCGCGTTATTCCGGCAATGGGGCCAATTGACAGCGCCTCGCTGCTGGTTGCCTATATTCTCAGTTTTATCAAAGCCATCGTGCTGTTTAAAGTGGTGACCTTCCTGCCAATCATCTGGATTGCCGGTTTGCTGATTCTGCTGAAAACCATCGGCCTGCTGATTTTCTGGGTCct > 2:926430/1‑238 (MQ=255) ccccTTCTCACAGTTTGTAGTGAAGGTAACGCACCCAATTATCGGGCCACTGCGCCGCGTTATTCCGGCAATGGGGCCAATTGACAGCGCCTCGCTGCTGGTTGCCTATATTCTCAGTTTTATCAAAGCCATCGTGCTGTTTAAAGTGGTGACCTTCCTGCCAATCATCTGGATTGCCGGTTTACTGATTCTGCTGAAAACCATCGGCCTGCTGATTTTCTGGGTCCTGCTG‑GTGATgg < 1:1100738/239‑1 (MQ=255) tctctcATTTTGTAGTGAAGGGAACGCAGCCAATTATCGGGCCACTGCGCCGCGTTATTCCGGCAATGGGGCCAATTGACAGCGCCTCGCTGCTGGTTGCCTATATTCTCAGTTTTATCAAAGCCATCGTGCTGTTTAAAGTGGTGACCTTCCTGCCAATCATCTGGATTGCCGGTTTACTGATTCTGCTGAAAACCATCGGCCTGCTGATTTTCTGGGTCCTGCTG‑GTGATGGCGAtt < 2:1988557/239‑1 (MQ=255) tctcACAGTTTGTAGTGAAGGTAACGCAGCCAATTATCGGGCCACTGCGCCGCGTTATTCCGGCAATGGGGCCAATTGACAGCGCCTCGCTGCTGGTTGCCTATATTCTCAGTTTTATCAAAGCCATCGTGCTGTTTAAAGTGGTGACCTTCCTGCCAATCATCTGGATTGCCGGTTTACTGATTCTGCTGAAAACCATCGGCCTGCTGATTTTCTGGGTCCTGCTG‑GTGATGGCGAtt > 1:1366069/1‑239 (MQ=255) tctcACAGTTTGTAGTGAAGGTAACGCAGCCAATTATCGGGCCACTGCGCCGCGTTATTCCGGCAATGGGGCCAATTGACAGCGCCTCGCTGCTGGTTGCCTATATTCTCAGTTTTATCAAAGCCATCGTGCTGTTTAAAGTGGTGACCTTCCTGCCAATCATCTGGATTGCCGGTTTACTGATTCTGCTGAAAACCATCGGCCTGCTGATTTTCTGGGTCCTGCTG‑GTGATGGCGAtt > 2:1741389/1‑239 (MQ=255) gTTTGTAGTGAAGGTAACGCAGCCAATTATCGGGCCACTGCGCCGCGTTATTCCGGCAAAGGGGCCAATTGACAGCGCCTCGCTGCTGGTTGCCTATATTCTCAGTTTTATCAAAGCCATCGTGCTGTTTAAAGTGGTGACCTTCCTGCCAATCATCTGGATTGCCGGTTTACTGATTCTGCTGAAAACCATCGGCCTGCTGATTTTCTGGGTCCTGCTG‑GTGATGGCGATTATGa > 1:1302683/1‑236 (MQ=255) 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aGTGGTGACCTTCCTGCCAATCATCTGGATTGCCGGTTTACTGATTCTGCTGAAAACCATCGGCCTGCTGATTTTCTGGGTCCTGCTG‑GTGATGGCGATTATGAGCTGGGTAAGCCAGGGGCGTAGCCCGATTGAATACGTGCTGATTCAGCTGGCCGATCCGCTGCTGCGCCCGATTCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGT‑GGgat > 2:1136933/1‑207 (MQ=255) aGTGGTGACCTTCCTGCCAATCATCTGGATTGCCGGTTTACTGATTCTGCTGAAAACCATCGGCCTGCTGATTTTCTGGGTCCTGCTG‑GTGATGGCGATTATGAGCTGGGTAAGCCAGGGGCGTAGCCCGATTGAATACGTGCTGATTCAGCTGGCCGATCCGCTGCTGCGCCCGATTCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGT‑GGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTctgct > 1:1746032/1‑237 (MQ=255) ggtgACCTTCCTGCCAATCATCTGGATTGCCGGTTTACTGATTCTGCTGAAAACCATCGGCCTGCTGATTTTCTGGGTCCTGCTG‑GTGATGGCGATTATGAGCTGGGTAAGCCAGGGGCGTAGCCCGATTGAATACGTGCTGATTCAGCTGGCCGATCCGCTGCTGCGCCCGATTCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGT‑GGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTctgctgct < 1:1466813/237‑1 (MQ=255) 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2:312642/179‑1 (MQ=255) ctgAAAACCATCGGCCTGCTGATTTTCTGGGTCCTGCTG‑GTGATGGCGATTATGAGCTGGGTAAGCCAGGGGCGTAGCCCGATTGAATACGTGCTGATTCAGCTGGCCGATCCGCTGCTGCGCCCGATTCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGT‑GGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTctg > 1:1065856/1‑186 (MQ=255) ctgAAAACCATCGGCCTGCTGATTTTCTGGGTCCTGCTG‑GTGATGGCGATTATGAGCTGGGTAAGCCAGGGGCGTAGCCCGATTGAATACGTGCTGATTCAGCTGGCCGATCCGCTGCTGCGCCCGATTCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGT‑GGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGaaa > 1:410023/1‑239 (MQ=255) aaCCATCGGCCTGCTGATTTTCTGGGTCCTGCTG‑GTGATGGCGATTATGAGCTGGGTAAGCCAGGGGCGTAGCCCGATTGAATACGTGCTGATTCAGCTGGCCGATCCGCTGCTGCGCCCGATTCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGT‑GGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAAc > 2:1840142/1‑228 (MQ=255) tCGGCCTGCTGATTTTCTGGGTCCTGCTG‑GTGATGGCGATTATGAGCTGGGTAAGCCAGGGGCGTAGCCCGATTGAATACGTGCTGATTCAGCTGGCCGATCCGCTGCTGCGCCTGATTCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGT‑GGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATgg > 1:1574127/1‑198 (MQ=255) 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1:1727033/1‑216 (MQ=255) ccTGCTGATTTTCTGGGTCCTGCTG‑GTGATGGCGATTATGAGCTGGGTAAGCCAGGGGCGTAGCCCGATTGAATACGTGCTGATTCAGCTGGCCGATCCGCTGCTGCGCCCGATTCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGT‑GGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCa < 1:1812476/238‑1 (MQ=255) | ATGCAGTGGGCTCATTGTGATTTTTACAACCCCTTCTCACAGTTTGTAGTGAAGGTAACGCAGCCAATTATCGGGCCACTGCGCCGCGTTATTCCGGCAATGGGGCCAATTGACAGCGCCTCGCTGCTGGTTGCCTATATTCTCAGTTTTATCAAAGCCATCGTGCTGTTTAAAGTGGTGACCTTCCTGCCAATCATCTGGATTGCCGGTTTACTGATTCTGCTGAAAACCATCGGCCTGCTGATTTTCTGGGTCCTGCTG‑GTGATGGCGATTATGAGCTGGGTAAGCCAGGGGCGTAGCCCGATTGAATACGTGCTGATTCAGCTGGCCGATCCGCTGCTGCGCCCGATTCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGT‑GGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCA > NC_007779/3094548‑3095021 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |