| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| ? | NC_007779 | = 3094936 | 193 (1.300) | coding (461/567 nt) | yggT | osmotic shock tolerance protein YggT | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 208 total aligned reads displayed.
ATCGTGCTGTTTAAAGTGGTGACCTTCCTGCCAATCATCTGGATTGCCGGTTTACTGATTCTGCTGAAAACCATCGGCCTGCTGATTTTCTGGGTCCTGCTGGTGATGGCGATTATGAGCTGGGTAAGCCAGGGGCGTAGCCCGATTGAATACGTGCTGATTCAGCTGG‑CCGATCCGCTGCTGCGCCCGATTCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTACATGGCGACGAAGTTAAAGTCGCCATTACCGCGCCGCCGGTTGACGG > NC_007779/3094707‑3095172 | gtGTTTAACGTGTTGCCTCACCGGCCAATCAACTGGATTGCCTGTTTACAGATTCTGCTGAAAACCATCGGCTTGCTGATTTTCTGGGTCCTGCTGGTGATGGCGATTATGAGCTGGGTAAGCCAGGGGCTTAGCCCGATTGAATACGTGCTGATCCAGCTGG‑CCGATCCTCTGCTGCGCCCGATTCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCg < 2:1079110/237‑1 (MQ=255) cTGTTTAAAGTGGTGACCTTCCTGCCAATCATCTGGATTGCCGGTTTACTGATTCTGCTGAAAACCATCGGCCTGCTGATTTTCTGGGTCCTGCTGGTGATGGCGATTATGAGCTGGGTAAGCCAGGGGCGTAGCCCGATTGAATACGTGCTGATTCAGCTGG‑CCGATCCGCTGCTGCGCCCGATTCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGt > 1:2050223/1‑239 (MQ=255) cTGTTTAAAGTGGTGACCTTCCTGCCAATCATCTGGATTGCCGGTTTACTGATTCTGCTGAAAACCATCGGCCTGCTGATTTTCTGGGTCCTGCTGGTGATGGCGATTATGAGCTGGGTAAGCCAGGGGCGTAGCCCGATTGAATACGTGCTGATTCAGCTGG‑CCGATCCGCTGCTGCGCCCGATTCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGt > 1:1296594/1‑239 (MQ=255) tttAAAGTGGTGACCTTCCTGCCAATCATCTGGATTGCCGGTTTACTGATTCTGCTGAAAACCATCGGCCTGCTGATTTTCTGGGTCCTGCTGGTGATGGCGATTATGAGCTGGGTAAGCCAGGGGCGTAGCCCGATTGAATACGTGCTGATTCAGCTGG‑CCGATCCGCTGCTGCGCCCGATTCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGTGGGCTTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGt > 1:1647384/1‑236 (MQ=255) 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2:307421/135‑1 (MQ=255) aTTGGCCGCCTGCTACCGGTAATGGGTGGGATGGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGGATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTTTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTACAGGGcga < 2:1252518/238‑1 (MQ=255) ttCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGTGGGGTTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTACATGGcgacg > 1:1389688/1‑239 (MQ=255) ttCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTACATGGcgac < 1:1333102/238‑1 (MQ=255) 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tgggtgggATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGGCGCAGAAGCATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCtata > 1:187039/1‑170 (MQ=255) gggtgggATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATAtgct > 2:1017344/1‑96 (MQ=255) gggtgggATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATAtgct < 1:1017344/96‑1 (MQ=255) attTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGtc > 2:1800237/1‑38 (MQ=255) tcGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTACATGGCGACGAAGTTAAAGTCGCCATTACCGCGCCGCCGGTTGACgg > 1:467356/1‑238 (MQ=255) | ATCGTGCTGTTTAAAGTGGTGACCTTCCTGCCAATCATCTGGATTGCCGGTTTACTGATTCTGCTGAAAACCATCGGCCTGCTGATTTTCTGGGTCCTGCTGGTGATGGCGATTATGAGCTGGGTAAGCCAGGGGCGTAGCCCGATTGAATACGTGCTGATTCAGCTGG‑CCGATCCGCTGCTGCGCCCGATTCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTACATGGCGACGAAGTTAAAGTCGCCATTACCGCGCCGCCGGTTGACGG > NC_007779/3094707‑3095172 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |