Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 1211101 | 1212749 | 1649 | 28 [27] | [23] 28 | [mcrA]–[ycgX] | [mcrA],icdC,iraM,[ycgX] |
CGCTTCTGAATATGAGGGTTAGTAAATTAATTAAGAAAACGTTGAGTCAACCCGAGGGCTCCAGGAAACCAGTTGAGGTAGAAAGACTACAAAAAGTTTATGTCCGAGACCCGATGGTAAAAGCTTGGATTTTACAGCAAAGTAAAGGTATATGTGAAAACTGTGGTAAAAATGCTCCGTTTTATTTAAATGATGGAAACCCATATTTGGAAGTACATCATGTAATTCCCCTGTCTTCAGGTGGTGCTGATACAACAGATAACTGTGTTGCCCTTTGTCCGAATTGCCATAGAGAATTGCACTATAGTAAAAATGCAAAAGAACTAATCGAGATGCTTTACGTTAATATAAACCGATTACAGAAATAAAATTATTTATTAAAGTCACATTTAAGACGTAATACCCTACAGGGTAAAAATTTTCTCTGATCTTAACTTCTGCAAATGTTAACTGCTATTTTTATGCTAAAAATGGTTATCAAAACTCAAAAACACATGTTTA > NC_000913/1210812‑1211312 | cGCTTCTGAATATGAGGGTTAGTAAATTAATTAAGAAAACGTTGAGTCAACCCGAGGGCTCCAGGAAACCAGTTGAGGTAGAAAGACTACAAAAAGTTTATGTCCGAGACCCGATGGTAAAAGCTTGGATTTTACAGCAAAGTAAAGGTATATGTGAAAACTGTGGTAAAAATGCTCCGTTTTATTTAAATGATGGAAACCCATATTTGGAAGTACATCATGTAATTCCCCTGTCTTCAGGTGGTGCTGATACAACAGATAACTGTGTTGCCCTTTGTCCGAATTGCCa < 2:234402/289‑1 (MQ=255) gatgcAACCCGAGGGCTCCAGGAAACCAGTTGAGGTAGAAAGACTACAAAAAGTTTATGTCCGAGACCCGATGGTAAAAGCTTGGATTTTACAGCAAAGTAAAGGTATATGTGAAAACTGTGGTAAAAATGCTCCGTTTTATTTAAATGATTGAAACCCATATTTGGAAGTACATCATGTAATTCCCCTGTCTTCAGGTGGTGCTGATACAACAGATAACTGTGTTGCCCTTTGTCCGAATTGCCATAGAGAATTGCACTATAGTAAAAATGCAAAAGAACTAATCgag < 1:412702/285‑1 (MQ=255) gAGTCAACCCGAGGGCTCCAGGAAACCAGTTGAGGTAGAAAGACTACAAAAAGTTTATGTCCGAGAACCGATGGTAAAAGCTTTGATTTTACAGCAAAGTAAAGGTATATGTGAAAACTGTGGTAAAAATGCTCCGTTTTATTTAAATGATGGAAACCCATATTTGGAAGTACATCATGTAATTCCCCTGTCTTCAGGTGGTGCTGATACAACAGATAACTGTGTTGCCCTTTGTCCGAATTGCCATAGAGAATTGCACTATAGTAAAAATGCAAAAGAACTAATCgag < 2:580470/289‑1 (MQ=255) aaCCCGAGGGCTCCAGGAAACCAGTTGAGGTAGAAAGACTACAAAAAGTTTATGTCCGAGACCCGATGGTAAAAGCTTGGATTTTACAGCAAAGTAAAGGTATATGTGAAAACTGTGGTAAAAATGCTCCGTTTTATTTAAATGATGGAAACCCATATTTGGAAGTACATCATGTAATTCCCCTGTCTTCAGGTCGTGCTGATACAACAGATAACTGTGTTGCCCTTTGTCCGAATTGCCATAGAGAATTGCACTATAGTAAAAATGCAAAAGAACTAATCGAGATGCt < 2:70598/289‑1 (MQ=255) aaCACGAGGGCTCCAGGAAACCAGTTGAAGTAGAAAGACTACAAAAAGTTTATGTCCGAGACCCGATGGTAAAAGCTTGGATTTTACAGCAAAGTAAAGGTATATGTGAAAACTGTGGTAAAAATGCTCCGTTTTATTTAAATGATGGAAACCCATAGTTGGAAGTACATCATGTAATTCCCCTGTCTTCAGGTGGTGCTGATACAACAGATAACTGTGTTGCCCTTTGTCCGAATTGCCATAGAGAATTGCACTATAGTAAAAATGCAAAAGAACTAATCGAGATGCt < 1:482629/289‑1 (MQ=255) cccGAGGGCTCCAGGAAACCAGTTGAGGTAGAAAGACTACAAAAAGTTTATGTCCGAGACCCGATGGTAAAAGCTTGGATTTTACAGCAAAGTAAAGGTATATGTGAAAACTGTGGTAAAAATGCTCCGTTTTATTTAAATGATGGAAACCCATATTTGGAAGTACATCATGTAATTCCCCTGTCTTCAGGTGGTGCTGATACAACAGATAACTGTGTTGCCCTTTGTCCGAATTGCCATAGAGAATTGCACTATAGTaaaaa > 1:352191/1‑263 (MQ=255) cccGAGGGCTCCAGGAAACCAGTTGAGGTAGAAAGACTACAAAAAGTTTATGTCCGAGACCCGATGGTAAAAGCTTGGATTTTACAGCAAAGTAAAGGTATATGTGAAAACTGTGGTAAAAATGCTCCGTTTTATTTAAATGATGGAAACCCATATTTGGAAGTACATCATGTAATTCCCCTGTCTTCAGGTGGTGCTGATACAACAGATAACTGTGTTGCCCTTTGTCCGAATTGCCATAGAGAATTGCACTATAGTaaaaa < 2:352191/263‑1 (MQ=255) acaGGGATCCAGGAAACCAGTTGAGGTAGAAAGACTACAAAAAGTTTATGTCCGAGAACCGATGGTAAAAGCTTGGATTTTACAGCAAAGTAAAGGTATATGTGAAAACTGTGGTAAAAATGCTCCGTTTTATTTAAATGATGGAAACCCATATTTGGAAGTACATCATGTAATTCCCCTGTCTTCAGGTGGTGCTGATACAACAGATAACTGTGTTGCCC‑‑TGTCCGAATTGCCATAGAGAATTGCACTATAGTAAAAATGCAAAAGAACTAATCGAGATGCTTTACGt < 2:67169/287‑1 (MQ=255) gtatATGTCAGAGAACCGATTGTAAAAGCTTGTATATTACAGGAAAATGAAAGTATATGTGAAAAATGTTGTAAAAATGCTCCGTGTTATTTAAATGAAGGAAACCCATATTTGGAAGTACATCATGTAATTCCCCTGTCTTCAGGTGGTGCTGATACAACAGATAACTGTGTTGCCCTTTGTCCGAATTGCCATAGAGAATTGCACTATAGTAAAAATGCAAAAGAACTAATCGAGATGCTTTACGTTAATATAAACCGATTACAGAAATAAAATTATTTATTAAAGt < 2:412979/286‑1 (MQ=255) cAAAGTAAAGGTATATGTGAAAACTGTGGTAAAAATGCTCCGTTTTATTTAAATGATGGAAACCCATATTTGGAAGTACATCATGTAATTCCCCTGTCTTCAGGTGGTGCTGATACAACAGATAACTGTGTTGCCCTTTGTCCGAATTGCCATAGAGAATTGCACTATAGTAAAAATGCAAAAGAACTAATCga < 2:62688/194‑1 (MQ=255) cAAAGTAAAGGTATATGTGAAAACTGTGGTAAAAATGCTCCGTTTTATTTAAATGATGGAAACCCATATTTGGAAGTACATCATGTAATTCCCCTGTCTTCAGGTGGTGCTGATACAACAGATAACTGTGTTGCCCTTTGTCCGAATTGCCATAGAGAATTGCACTATAGTAAAAATGCAAAAGAACTAATCga > 1:62688/1‑194 (MQ=255) tAAAGGTATATGTGAAAACTGTGGTAAAAATGCTCCGTTTTATTTAAATGATGGAAACCCATATTTGGAAGTACATCATGTAATTCCCCTGTCTTCAGGTGGTGCTGATACAACAGATAACTGTGTTGCCCTTTGTCCGAATTGCCATAGAGAATTGCACTATAGTAAAAATGCAAAAGAACTAATCGAGATGCTTTACGTTAATATAAACCGATTACAGAAATAAAATTATTTATTAAAGt < 1:355197/242‑1 (MQ=255) tgtgAAAACTGTGGTAAAAATGCTCCGTTTTATTTAAATGATGGAAACCCATATTTGGAAGTACATCATGTAATTCCCCTGTCTTCAGGTGGTGCTGATACAACAGATAACTGTGTTGCCCTTTGTCCGAATTGCCATAGAGAATTGCACTATAGTAAAAATGCAAAAGAACTAATCgag > 1:539872/1‑180 (MQ=255) tgtgAAAACTGTGGTAAAAATGCTCCGTTTTATTTAAATGATGGAAACCCATATTTGGAAGTACATCATGTAATTCCCCTGTCTTCAGGTGGTGCTGATACAACAGATAACTGTGTTGCCCTTTGTCCGAATTGCCATAGAGAATTGCACTATAGTAAAAATGCAAAAGAACTAATCgag < 2:539872/180‑1 (MQ=255) tgtgAAAACTGTGGTAAAAATGCTCCGTTTTATTTAAATGATGGAAACCCATATTTGGAAGTACATCATGTAATTCCCCTGTCTTCAGGTGGTGCTGATACAACAGATAACTGTGTTGCACTTTGTCCGAATTGCCATAGAGAATTGCACTATAGTAAAAATGCAAAAGAACTAATCGAGATGCTTTACGTTAATATACACCGATTTCAGTACTAAAATTATTTATTAAAGTAACTTTTAAg > 2:355197/1‑242 (MQ=255) aaaCTGTGGTAAAAATGCTCCGTTTTATTTAAATGATGGAAACCCATATTTGGAAGTACATCATGTAATTCCCCTGTCTTCAGGTGGTGCTGATACAACAGATAACTGTGTTGCCCTTTGTCCGAATTGCCATAGAGAATTGCACTATAGTAAAAATGCAAAAGAACTAATCgag > 1:270230/1‑175 (MQ=255) aaaCTGTGGTAAAAATGCTCCGTTTTATTTAAATGATGGAAACCCATATTTGGAAGTACATCATGTAATTCCCCTGTCTTCAGGTGGTGCTGATACAACAGATAACTGTGTTGCCCTTTGTCCGAATTGCCATAGAGAATTGCACTATAGTAAAAATGCAAAAGAACTAATCgag < 2:270230/175‑1 (MQ=255) gtgGTAAAAATGCTCCGTTTTATTTAAATGATGGAAACCCATATTTGGAAGTACATCATGTAATTCCCCTGTCTTCAGGTGGTGCTGATACAACAGATAACTGTGTTGCCCTTTGTCCGAATTGCCATAGAGAATTGCACTATAGTAAAAATGCAAAAGAACTAATCGAGATGCTTTACg < 2:242899/180‑1 (MQ=255) gtgGTAAAAATGCTCCGTTTTATTTAAATGATGGAAACCCATATTTGGAAGTACATCATGTAATTCCCCTGTCTTCAGGTGGTGCTGATACAACAGATAACTGTGTTGCCCTTTGTCCGAATTGCCATAGAGAATTGCACTATAGTAAAAATGCAAAAGAACTAATCGAGATGCTTTACg > 1:242899/1‑180 (MQ=255) gCTCCGTTTTATTTAAATGATGGAAACCCATATTTGGAAGTACATCATGTAATTCCCCTGTCTTCAGGTGGTGCTGATACAACAGATAACTGTGTTGCCCTTTGTCCGAATTGCCATAGAGAATTGc < 2:238017/127‑1 (MQ=255) gCTCCGTTTTATTTAAATGATGGAAACCCATATTTGGAAGTACATCATGTAATTCCCCTGTCTTCAGGTGGTGCTGATACAACAGATAACTGTGTTGCCCTTTGTCCGAATTGCCATAGAGAATTGc > 1:238017/1‑127 (MQ=255) cTCCGTTTTATTTAAATGATGGAAACCCATATTTGGAAGTACATCATGTAATTCCCCTGTCTTCAGGTGGTGCTGATACAACAGATAACTGTGTTGCCCTTTGTCCGAATTGCCATAGAGAATTGCACTATAGTAAAAATGCAAAAGAACTAATCGAGATGCTTTACGTTAATATAAACCGATTACAGAAATAAAATTATTTATTAAAGTCACATTTAAg < 1:682705/220‑1 (MQ=255) cTCCGTTTTATTTAAATGATGGAAACCCATATTTGGAAGTACATCATGTAATTCCCCTGTCTTCAGGTGGTGCTGATACAACAGATAACTGTGTTGCCCTTTGTCCGAATTGCCATAGAGAATTGCACTATAGTAAAAATGCAAAAGAACTAATCGAGATGCTTTACGTTAATATAAACCGATTACAGAAATAAAATTATTTATTAAAGTCACATTTAAg > 2:682705/1‑220 (MQ=255) atgatgGAAACCCATATTTGGAAGTACATCATGTAATTCCCCTGTCTTCAGGTGGTGCTGATACAACAGATAACTGTGTTGCCCTTTGTCCGAATTGCCATAGAGaa < 2:54807/107‑1 (MQ=255) atgatgGAAACCCATATTTGGAAGTACATCATGTAATTCCCCTGTCTTCAGGTGGTGCTGATACAACAGATAACTGTGTTGCCCTTTGTCCGAATTGCCATAGAGaa > 1:54807/1‑107 (MQ=255) aCATCATGTAATTCCCCTGTCTTCAGGTGGTGCTGATACAACAGATAACTGTGTTGCCATTTGTCCGAATTGCCATAGAGAATTGCACTATAGTAAAAATGCAAAAGAACTAATCGAGATGCTTTACGTTAAGATAAACCGATTACAGAAATAAAATTATTTATTAAAGTCACATTTAAGACGTAATACCCTACAGGGTAAAAATTTTCTCTGATCTTAACTTCTGCAAATGTTAACTGCTATTTTTATGCTAAAAATGGTTATCAAAACTCAAAAACACATGTTta < 1:18550/287‑1 (MQ=255) cTGTCTTCAGGTGGTGCTGATACAACAGATAACTGTGTTGCCCTTTGTCCGAATTGCCATAGAGAATTGCACTATAGTAAAAATGCAAAAGAACTAATCgag < 2:118845/102‑1 (MQ=255) cTGTCTTCAGGTGGTGCTGATACAACAGATAACTGTGTTGCCCTTTGTCCGAATTGCCATAGAGAATTGCACTATAGTAAAAATGCAAAAGAACTAATCgag > 1:118845/1‑102 (MQ=255) | CGCTTCTGAATATGAGGGTTAGTAAATTAATTAAGAAAACGTTGAGTCAACCCGAGGGCTCCAGGAAACCAGTTGAGGTAGAAAGACTACAAAAAGTTTATGTCCGAGACCCGATGGTAAAAGCTTGGATTTTACAGCAAAGTAAAGGTATATGTGAAAACTGTGGTAAAAATGCTCCGTTTTATTTAAATGATGGAAACCCATATTTGGAAGTACATCATGTAATTCCCCTGTCTTCAGGTGGTGCTGATACAACAGATAACTGTGTTGCCCTTTGTCCGAATTGCCATAGAGAATTGCACTATAGTAAAAATGCAAAAGAACTAATCGAGATGCTTTACGTTAATATAAACCGATTACAGAAATAAAATTATTTATTAAAGTCACATTTAAGACGTAATACCCTACAGGGTAAAAATTTTCTCTGATCTTAACTTCTGCAAATGTTAACTGCTATTTTTATGCTAAAAATGGTTATCAAAACTCAAAAACACATGTTTA > NC_000913/1210812‑1211312 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |