| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 2771960 | 165 (1.090) | 4 (0.030) | 4/548 | NT | 2.4% | intergenic (+345/+42) | yfjT/yfjU | CP4‑57 prophage; putative periplasmic protein/CP4‑57 prophage; conserved protein;Phage or Prophage Related |
| ? | NC_000913 | = 2771971 | 168 (1.140) | intergenic (+356/+31) | yfjT/yfjU | CP4‑57 prophage; putative periplasmic protein/CP4‑57 prophage; conserved protein;Phage or Prophage Related | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 187 total aligned reads displayed.
GGGTTTCTTTTTTCTCCTTAATCTCCAGAGGTAGGCCACGTACTTTCGAACGATGAGCGCAGTGGTCAGTTTTTTTCAGATATATTTATCTTTTTTTGGCTGTAAGCTCCGCTGTGAGCGCAGGCTGTGTTAAAACTCCTGATCACTTTTTGGTCTAAGCGATGGTTTCATATGATCAACCATTCTTGATAAACCCATGAGACGGACTAACTTTTTCATTAAAATTAAAAAGATATGAATGAATACTGCGGATATCAACATGGCCAATCACATTCAAGGACAAGGCAGGCATCAGGTGACATTGCTCCCTGATGCACTCGATGATTTTGTCACTGAAGATATCTGAAATAAGTTTAATCAGTTCATCACGGGTCGGTGGCATATCGAGATAATTAATTATTGTCGGTTCGTTGCCGTTGTTATGAAGCATCTCCAGCGTGTTGCGTGAGGTGCCACAGGCCGGGTTGTGATAGATGGTAATGTTGCTCATATCAGTATCTAATTACAAAGTGACAGAGAGCCGCCACGCCAGCGCGGCCAGAGTGACAAACAGCACCGGCACAGTCATGACAATGCCGGTACGGAAGTAATA > NC_000913/2771665‑2772256 | cgatctCTTTTTTCTCCTTAATCTCCAGAGGTAGGCCACGTACTTTCGAACGATGAGCGCAGTGGTCAGTTTTTTTCAGATATATTTATCTTTTTTTGGCTGTAAGCTCCGCTGTGAGCGCAGGCTGTGTTAAAACTCCTGATCACTTTTTGGTCTAAGCGATGGTTTCATATGATCAACCATTCTTGATAAACCCATGAGACGGACTAACTTTTTCATTAAAATTAAAAAGATATGAATGAATACTGCGGATATCAACATGGCCAATCACATTCAAGGACAAGGCAGGCATCAGGTGAc < 1:347878/295‑1 (MQ=255) 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tCAGGgagcaatgtcacctgatgcctgccttgtccttgaatgttattggccatgttgatatccgcagtattcattcatatctttttaattttaatgaaaaagttagtccgtctcatgggtttatcaagaatggttgatcatatgaaaccatcgcttagaccaaaaagtgatcaggagttttaacacagcctgcgctcacagcggagcttacagccaaaaaaagataaatatatctgaaaaaaactgaccactgcgctcatcgttcgaaagtacgtggcctacctct < 2:1014877‑M1/286‑282 (MQ=255) catgTGACATTGCTCCCTGATGCACTCGATGATTTTGTCACTGAAGATATCTGAAATAAGTTTAATCAGTTCATCACGGGTCGGTGGCATATCGAGATAATTAATTATTGTCGGTTCGTTGCCGTTGTTATGAAGCATCTCCAGCGTGTTGCGTGAGGTGCCACAGGCCGGGTTGTGATAGATGATAATGTTGCTCATATCAGTATCTAATTACAAAGTGACAGAGAGCCGCCACGCCAGCGCGGCCAGAGTGACAAACAGCACCGGCACAGTCATGACAATGCCGGTACGGAAGTAata < 1:873174/297‑1 (MQ=255) aGGgatcaatgtcacctgatgcctgtcttgtccttgaatgtgattggccttgttgatatccgcagtattcattcatatctttttaattttaatgaaaaagttagtccgtctcatgggtttatcaagaatggttgatcatatgaaaccatcgcttagaccaaaaagtgatcagtagttttaacacagcctgcgctcacagcggagcttacagccaaaaaaagataaatatatctgaaaaaaactgaccactgcgctcatcgttcgaaagtacgtggcctacctctgg < 2:1172625‑M1/286‑284 (MQ=255) | GGGTTTCTTTTTTCTCCTTAATCTCCAGAGGTAGGCCACGTACTTTCGAACGATGAGCGCAGTGGTCAGTTTTTTTCAGATATATTTATCTTTTTTTGGCTGTAAGCTCCGCTGTGAGCGCAGGCTGTGTTAAAACTCCTGATCACTTTTTGGTCTAAGCGATGGTTTCATATGATCAACCATTCTTGATAAACCCATGAGACGGACTAACTTTTTCATTAAAATTAAAAAGATATGAATGAATACTGCGGATATCAACATGGCCAATCACATTCAAGGACAAGGCAGGCATCAGGTGACATTGCTCCCTGATGCACTCGATGATTTTGTCACTGAAGATATCTGAAATAAGTTTAATCAGTTCATCACGGGTCGGTGGCATATCGAGATAATTAATTATTGTCGGTTCGTTGCCGTTGTTATGAAGCATCTCCAGCGTGTTGCGTGAGGTGCCACAGGCCGGGTTGTGATAGATGGTAATGTTGCTCATATCAGTATCTAATTACAAAGTGACAGAGAGCCGCCACGCCAGCGCGGCCAGAGTGACAAACAGCACCGGCACAGTCATGACAATGCCGGTACGGAAGTAATA > NC_000913/2771665‑2772256 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |