| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | BX571857 | = 2600867 | 273 (1.280) | 5 (0.030) | 5/150 | NT | 2.1% | coding (1691/1740 nt) | SAS2425 | thiamine pyrophosphate enzyme |
| ? | BX571857 | 2600900 = | 233 (1.260) | coding (1658/1740 nt) | SAS2425 | thiamine pyrophosphate enzyme | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GAAATAGAAATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > BX571857/2600762‑2600867‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttgatctaaatGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAGGATCAACATATACATCTACAATCGTTGGTACA > BX571857/2600900‑2600995 GAAATAGAAATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATACGACACGTTTTGCTGCCACTGACATTGGTGGAATTT > 2:256918/1‑97GAAATAGAAATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTT < 1:1647858/97‑1GAAATAGAAATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTT > 2:3416225/1‑97GAAATAGAAATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTT < 1:720588/97‑1GAAATAGAAATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTT > 1:83010/1‑97GAAATAGAAATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTT > 1:868111/1‑97GAAATAGAAATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTT < 1:2696273/97‑1GAAATAGAAATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTT > 1:1955056/1‑97GAAATAGAAATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTT < 1:892242/97‑1GAAATAGAAATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTT > 2:1447128/1‑97GAAATAGAAATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTT < 1:3226214/97‑1GAAATAGAAATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTT < 1:326361/97‑1GAAATAGAAATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTT < 1:937026/97‑1GAAATAGAAATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTT < 1:3418810/97‑1 AAATAGAAATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTG > 1:3211024/1‑97 AAATAGAAATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTG < 1:249422/97‑1 AATAGAAATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGA < 2:266146/97‑1 AATAGAAATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGA < 2:321967/97‑1 AATAGAAATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGA > 1:1586407/1‑97 ATAGAAATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGAT < 1:377474/97‑1 ATAGAAATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGAT < 2:388867/97‑1 ATAGAAATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGAT > 2:286036/1‑97 TAGAAATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATC < 1:2291488/97‑1 TAGAAATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATC > 1:481131/1‑97 TAGAAATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATC > 2:2105379/1‑97 AGAAATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCT > 1:2250035/1‑97 AGAAATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCT > 2:420678/1‑97 AGAAATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCT > 1:659322/1‑97 GAAATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTA > 2:3160619/1‑97 GAAATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTA > 2:1205162/1‑97 GAAATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTA < 2:633846/97‑1 GAAATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTA < 2:1426370/97‑1 GAAATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTA > 1:2995313/1‑97 GAAATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTA < 1:2760257/97‑1 GAAATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTA > 1:2573455/1‑97 GAAATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTA < 1:2349903/97‑1 GAAATTACCGGTTTTATAGTGCAATTCAGTTGGGATAACCTTTAAATCAGTTATAGGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTA < 2:29764/97‑1 AAATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAA > 1:700281/1‑97 AATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAA < 1:931112/97‑1 AATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAA < 2:3320484/97‑1 AATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAA < 2:3154830/97‑1 AATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAA > 1:2923223/1‑97 ATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAAT < 1:3247449/97‑1 ATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAAT > 1:1862635/1‑97 ATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAAT > 1:103935/1‑97 GTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTT < 2:1562451/97‑1 TTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGG > 1:2072011/1‑97 CTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAG < 2:1626850/97‑1 GAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAGGATCAACA > 1:2506960/1‑97 TGGAATTTGATCTAACTGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAGGATCAACATATACATC < 2:465924/97‑1 GGAATTTGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAGGATCAACATATACATCT > 2:137743/1‑97 ATTTGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAGGATCAACATATACATCTACA < 1:1007303/97‑1 TTGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAGGATCAACATATACATCTACAAT < 2:357988/97‑1 TTGATCTAAATGCACACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAGGATCAACATATACATCTACAAT < 2:2980660/97‑1 TGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAGGATCAACATATACATCTACAATC < 1:543659/97‑1 TGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAGGATCAACATATACATCTACAATC < 2:2469780/97‑1 TGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAGGATCAACATATACATCTACAATC > 1:2260474/1‑97 TGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAGGATCAACATATACATCTACAATC > 1:3276767/1‑97 TGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAGGATCAACATATACATCTACAATC < 1:375117/97‑1 GATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAGGATCAACATATACATCTACAATCG < 1:3046500/97‑1 GATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAGGATCAACATATACATCTACAATCG > 1:2144324/1‑97 ATCTAGATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGTTAATGGCGCAGCATTAGGATCAACATATACATCTACAATCGT < 2:796365/97‑1 ATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAGGATCAACATATACATCTACAATCGT < 2:892960/97‑1 TCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAGGATCAACATATACATCTACAATCGTT < 1:2862760/97‑1 TCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAGGATCAACATATACATCTACAATCGTT > 1:1588073/1‑97 TCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAGGATCAACATATACATCTACAATCGTT > 1:62182/1‑97 CTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAGGATCAACATATACATCTACAATCGTTG < 1:2025168/97‑1 TAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAGGATCAACATATACATCTACAATCGTTGG > 2:2667049/1‑97 TAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAGGATCAACATATACATCTACAATCGTTGG > 1:10109/1‑97 TAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAGGATCAACATATACATCTACAATCGTTGG > 1:1427466/1‑97 TAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAGGATCAACATATACATCTACAATCGTTGG < 1:990500/97‑1 TAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGATAATGGCGCAGCATTAGGATCAACATATACATCTACAATCGTTGG < 2:2755979/97‑1 AATGCCCACTTACCATAACCACGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAGGATCAACATATACATCTACAATCGTTGGTA < 2:3438474/97‑1 AATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAGGATCAACATATACATCTACAATCGTTGGTA > 1:1187786/1‑97 AATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAGGATCAACATATACATCTACAATCGTTGGTA < 1:223613/97‑1 AATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAGGATCAACATATACATCTACAATCGTTGGTA < 1:3141704/97‑1 AATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAGGATCAACATATACATCTACAATCGTTGGTA > 2:106988/1‑97 AATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAGGATCAACATATACATCTACAATCGTTGGTA < 2:1148205/97‑1 AATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAGGATCAACATATACATCTACAATCGTTGGTA < 2:2025359/97‑1 ATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAGGATCAACATATACATCTACAATCGTTGGTAC < 2:1802288/97‑1 ATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAGGATCAACATATACATCTACAATCGTTGGTAC > 1:1545077/1‑97 ATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAGGATCAACATATACATCTACAATCGTTGGTAC < 2:213339/97‑1 TGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAGGATCAACATATACATCTACAATCGTTGGTACA > 2:3199054/1‑97 TGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAGGATCAACATATACATCTACAATCGTTGGTACA < 1:747233/97‑1 TGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAGGATCAACATATACATCTACAATCGTTGGTACA > 1:517131/1‑97 TGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAGGATCAACATATACATCTACAATCGTTGGTACA > 2:362529/1‑97 TGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAGGATCAACATATACATCTACAATCGTTGGTACA > 2:363461/1‑97 TGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAGGATCAACATATACATCTACAATCGTTGGTACA > 2:1201006/1‑97 TGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAGGATCAACATATACATCTACAATCGTTGGTACA < 1:1599746/97‑1 TGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAGGATCAACAGATACAGCTACAATCGTTGGTACA < 2:1098465/97‑1 GAAATAGAAATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > BX571857/2600762‑2600867‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttgatctaaatGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAGGATCAACATATACATCTACAATCGTTGGTACA > BX571857/2600900‑2600995 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |