| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | BX571857 | = 2600867 | 273 (1.280) | 5 (0.030) | 5/150 | NT | 2.1% | coding (1691/1740 nt) | SAS2425 | thiamine pyrophosphate enzyme |
| ? | BX571857 | 2600900 = | 233 (1.260) | coding (1658/1740 nt) | SAS2425 | thiamine pyrophosphate enzyme | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 345 total aligned reads displayed.
ATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAG > BX571857/2600771‑2600963 | ttACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGatctaaatc > 1:168286/1‑97 (MQ=255) tACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATCACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGatctaaatct > 2:152789/1‑97 (MQ=255) aCCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGatctaaatcta > 1:2400914/1‑97 (MQ=255) aCCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGatctaaatcta < 2:916066/97‑1 (MQ=255) cGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGAtctaaatctaaa > 2:3211605/1‑97 (MQ=255) cGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGAtctaaatctaaa > 2:1173249/1‑97 (MQ=255) gTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATctaaatctaaat < 2:1344071/97‑1 (MQ=255) cttttATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATg > 2:2010554/2‑97 (MQ=255) tttATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCt > 1:3366141/1‑97 (MQ=255) ttATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCtt < 2:2694151/97‑1 (MQ=255) taGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATc < 1:2669503/97‑1 (MQ=255) ttcaattcaaTTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTc < 2:2910092/97‑1 (MQ=255) ttcaattcaaTTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTc < 2:161381/97‑1 (MQ=255) ttcaattcaaTTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTc > 1:1718747/1‑97 (MQ=255) ttcaattcaaTTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTc < 1:1789077/97‑1 (MQ=255) tcaattcaatTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCa > 2:2423510/1‑97 (MQ=255) aattcaattGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGt < 1:1088937/97‑1 (MQ=255) attcaattGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTa < 1:2217207/97‑1 (MQ=255) attcaattGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTa < 2:1144506/97‑1 (MQ=255) tcaattGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAAt < 2:1218543/97‑1 (MQ=255) caattGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGCTCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAAtt > 1:3160341/1‑97 (MQ=255) caattGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAAtt > 2:873005/1‑97 (MQ=255) caattGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAAtt < 1:835923/97‑1 (MQ=255) caattGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAAtt < 1:3209293/97‑1 (MQ=255) caattGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAAtt > 1:214682/1‑97 (MQ=255) caattGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAAtt > 2:1521860/1‑97 (MQ=255) attGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGa < 1:2959832/97‑1 (MQ=255) ttGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGAt < 2:597217/97‑1 (MQ=255) gtgATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCCGTAATTGATCt > 2:295040/1‑97 (MQ=255) tgATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTa < 2:647285/97‑1 (MQ=255) aTAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTaaa > 1:21247/1‑97 (MQ=255) tAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTCATTGCTCTAAAt > 1:1313883/1‑97 (MQ=255) aCCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTTTCTTCAGTAATTGATCTAAATGc > 2:3249187/1‑97 (MQ=255) cTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGccc < 1:3060629/97‑1 (MQ=255) tttAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCa > 1:1453854/1‑97 (MQ=255) tAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACt > 2:1872078/1‑97 (MQ=255) aaaTCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACtt < 1:2277342/97‑1 (MQ=255) aTCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACTTAc < 1:188006/97‑1 (MQ=255) aTCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACTTAc > 1:844918/1‑97 (MQ=255) aTCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACTTAc < 2:3359840/97‑1 (MQ=255) tCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACTTAcc > 2:1386143/1‑97 (MQ=255) aGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACTTACCAt < 2:3470944/97‑1 (MQ=255) gTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACTTACCATa < 2:3519943/97‑1 (MQ=255) ttATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATgcccacttaccataaccaagcgcttcttcatttacaattttacctgg > 1:2072011‑M1/1‑50 (MQ=255) ttATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACTTACCATaa > 1:379987/1‑97 (MQ=255) tataAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACTTACCATAAc < 1:2316290/97‑1 (MQ=255) ataAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACTTACCATAAcc < 2:3030744/97‑1 (MQ=255) ataAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACTTACCATAAcc < 1:1964454/97‑1 (MQ=255) ataAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACTTACCATAAcc > 1:2542621/1‑97 (MQ=255) taAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCa < 2:75059/97‑1 (MQ=255) taAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCa > 2:1555397/1‑97 (MQ=255) aGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAg > 1:3028978/1‑97 (MQ=255) aaCGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAgcgc > 2:1704342/1‑97 (MQ=255) cGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGctt > 2:2354980/1‑97 (MQ=255) gTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCTACTTACCATAACCAAGCGcttc > 1:347848/1‑97 (MQ=255) gTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGcttc < 2:102997/97‑1 (MQ=255) ttGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCttcttc > 1:671968/1‑97 (MQ=255) ttGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCttcttc > 2:1195741/1‑97 (MQ=255) ttGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCttcttc < 1:125829/97‑1 (MQ=255) ttGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCttcttc > 1:3536309/1‑97 (MQ=255) ttGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCttcttc > 2:3565019/1‑97 (MQ=255) tgcCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCAttt > 1:1631587/1‑97 (MQ=255) tgcCACGGAGATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCAttt < 1:89601/97‑1 (MQ=255) aCTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCGTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACaa < 2:1797457/97‑1 (MQ=255) cTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAAt > 2:1288505/1‑97 (MQ=255) tGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAAtt > 2:513325/1‑97 (MQ=255) gAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATgcccacttaccataaccaagcgcttcttcatttacaattttacctggtaatggcgcagcattaggatcaaca > 1:2506960‑M1/1‑25 (MQ=255) gAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAAttt > 2:1666258/1‑97 (MQ=255) gAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAAttt > 2:226437/1‑97 (MQ=255) aaTTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTa < 2:1426113/97‑1 (MQ=255) ttGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTAcc > 2:1923815/1‑97 (MQ=255) tggtggAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCGAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCt < 1:3070342/97‑1 (MQ=255) tggtggAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCt > 1:149446/1‑97 (MQ=255) ggtggAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTg > 1:2741054/1‑97 (MQ=255) gtggAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTgg < 2:2450554/97‑1 (MQ=255) tggAATTTGATCTAACTgcccacttaccataaccaagcgcttcttcatttacaattttacctggtaatggcgcagcattaggatcaacatatacatc < 2:465924‑M1/97‑81 (MQ=255) tggAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGt < 2:3147808/97‑1 (MQ=255) ggAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTa < 2:2536255/97‑1 (MQ=255) ggAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTa > 1:2832059/1‑97 (MQ=255) gAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTaa > 2:2601762/1‑97 (MQ=255) aaTTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAAt < 1:484042/97‑1 (MQ=255) aTTTGATCTAAATgcccacttaccataaccaagcgcttcttcatttacaattttacctggtaatggcgcagcattaggatcaacatatacatctaca < 1:1007303‑M1/97‑85 (MQ=255) tGATCTAAATgcccacttaccataaccaagcgcttcttcatttacaattttacctggtaatggcgcagcattaggatcaacatatacatctacaatc > 1:3276767‑M1/1‑10 (MQ=255) tGATCTAAATgcccacttaccataaccaagcgcttcttcatttacaattttacctggtaatggcgcagcattaggatcaacatatacatctacaatc > 1:2260474‑M1/1‑10 (MQ=255) tGATCTAAATgcccacttaccataaccaagcgcttcttcatttacaattttacctggtaatggcgcagcattaggatcaacatatacatctacaatc < 1:543659‑M1/97‑88 (MQ=255) aTCTAGATgcccacttaccataaccaagcgcttcttcatttacaattttacctgttaatggcgcagcattaggatcaacatatacatctacaatcgt < 2:796365‑M1/97‑90 (MQ=255) tCTAAATgcccacttaccataaccaagcgcttcttcatttacaattttacctggtaatggcgcagcattaggatcaacatatacatctacaatcgtt < 1:2862760‑M1/97‑91 (MQ=255) tCTAAATgcccacttaccataaccaagcgcttcttcatttacaattttacctggtaatggcgcagcattaggatcaacatatacatctacaatcgtt > 1:62182‑M1/1‑7 (MQ=255) tCTAAATgcccacttaccataaccaagcgcttcttcatttacaattttacctggtaatggcgcagcattaggatcaacatatacatctacaatcgtt > 1:1588073‑M1/1‑7 (MQ=255) ctaaatctaaatGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCgcagc < 2:2644883/97‑1 (MQ=255) cTAAATgcccacttaccataaccaagcgcttcttcatttacaattttacctggtaatggcgcagcattaggatcaacatatacatctacaatcgttg < 1:2025168‑M1/97‑92 (MQ=255) tAAATgcccacttaccataaccaagcgcttcttcatttacaattttacctggtaatggcgcagcattaggatcaacatatacatctacaatcgttgg < 1:990500‑M1/97‑93 (MQ=255) tAAATgcccacttaccataaccaagcgcttcttcatttacaattttacctgataatggcgcagcattaggatcaacatatacatctacaatcgttgg < 2:2755979‑M1/97‑93 (MQ=255) aatctaaatGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCAtt < 2:2975169/97‑1 (MQ=255) aaTgcccacttaccataaccaagcgcttcttcatttacaattttacctggtaatggcgcagcattaggatcaacatatacatctacaatcgttggta > 1:1187786‑M1/1‑3 (MQ=255) aaTgcccacttaccataaccaagcgcttcttcatttacaattttacctggtaatggcgcagcattaggatcaacatatacatctacaatcgttggta < 2:2025359‑M1/97‑95 (MQ=255) aTgcccacttaccataaccaagcgcttcttcatttacaattttacctggtaatggcgcagcattaggatcaacatatacatctacaatcgttggtac < 2:213339‑M1/97‑96 (MQ=255) tgcccacttaccataaccaagcgcttcttcatttacaattttacctggtaatggcgcagcattaggatcaacatatacatctacaatcgttggtaca > 2:363461‑M1/1‑1 (MQ=255) tgcccacttaccataaccaagcgcttcttcatttacaattttacctggtaatggcgcagcattaggatcaacatatacatctacaatcgttggtaca < 1:747233‑M1/97‑97 (MQ=255) tgcccacttaccataaccaagcgcttcttcatttacaattttacctggtaatggcgcagcattaggatcaacagatacagctacaatcgttggtaca < 2:1098465‑M1/97‑97 (MQ=255) | ATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAG > BX571857/2600771‑2600963 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |