| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | BX571857 | 980997 = | NA (NA) | 23 (0.160) | 20/118 | NT | NA | noncoding (1/27 nt) | Repeat flanking prophage phiSa4(476) | Repeat flanking prophage phiSa4(476) |
| ? | BX571857 | = 1025750 | NA (NA) | intergenic (+519/‑57) | SAS0954/SAS0955 | amidase/putative protease | |||||
Only 100 of 303 total aligned reads displayed.
GAAGAATGTGAATCAAAAGATGCGATATAGTATTAAGAAAATGTGCCTTTTATATTTAGCATTTTTTCAATAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCTTAATTACAGTGTTTTCAAGGTGTTCAGAATGTGTTGCAAGGTAAAAAAGGGCATAAAA > BX571857/980901‑981093 | acacgagtggaaaatatttaaagttaaagtgataaaaactttgatattacagcgtttttaaacgttcgtgtacgtttgagaatggccgttttaccAt > 2:1216950‑M1/96‑97 (MQ=255) cacgagtggaaaatatttaaagttaaagtgataaaaactttgatattacagcgtttttaaacgttcgtgtacgtttgagaatggccgttttaccAtt < 2:3035223‑M1/3‑1 (MQ=255) agaaTGTAAATCAAAAGATGCGATATAGTATTAAGATAATGTGACTTTTATATTTAGCATTTTTTCAATAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAAtt < 2:2048533/97‑1 (MQ=255) gaaTGTGAATCAAAAGATGCGATATAGTATTAAGAAAATGTGCCTTTTATATTTAGCATTTTCTCAATAGTAATTATATAGATTTTAAACCAAATTa > 2:1046058/1‑97 (MQ=255) acgagtggaaaatatttaaagttaaagtgataaaaactttgatattacagcgtttttaaacgttcgtgtacgtttgagaatggccgttttaccATTa < 2:2140874‑M1/4‑1 (MQ=255) aTGTGAATCAAAAGATGCGATATAGTATTAAGAAAATGTGCCTTTTATATTTAGCATTTTTTCAATAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAgg < 2:3058738/97‑1 (MQ=255) tgtgAATCAAAAGATGCGATATAGTATTAAGAAAATGTGCCTTTTATATTTAGCATTTTTTCAATAGAAATTCTATAGATTTTAAAGCGAATTAGgt > 2:2807206/1‑97 (MQ=255) tgtgAATCAAAAGATGCGATATAGTATTAAGAAAATGTGCCTTTTATATTTAGCATTTTTTCAATAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGgt < 2:1085095/97‑1 (MQ=255) agtggaaaatatttaaagttaaagtgataaaaactttgatattacagcgtttttaaacgttcgtgtacgtttgagaatggccgttttaccATTAGgt > 1:3222138‑M1/91‑97 (MQ=255) gtggaaaatatttaaagttaaagtgataaaaactttgatattacagcgtttttaaacgttcgtgtacgtttgagaatggccgttttaccATTAGgtg < 2:3402959‑M1/8‑1 (MQ=255) tcaTCAAAAGATTCGATATAGTATTAAGAAAATGTGCCTTTTATATTTAGCGTTTTTTCAATAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGtt < 2:2758753/95‑1 (MQ=255) gAATCAAAAGATGCGATATAGTATTAAGAAAATGTGCCTTTTATATTTAGCATTTTTTCAATAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGtt < 2:1880241/97‑1 (MQ=255) gaaaatatttaaagttaaagtgataaaaactttgatattacagcgtttttaaacgttcgtgtacgtttgagaatggccgttttaccATTAGGTGTTa > 1:35425‑M1/87‑97 (MQ=255) aaTCAAAAGATGCGATATAGTATTAAGAAAATGTGCCTTTTATATTTAGCATTTTTTCAATAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTa < 1:731960/97‑1 (MQ=255) aaTCAAAAGATGCGATATAGTATTAAGAAAATGTGCCTTTTATATTTAGCATTTTTTCAATAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTa > 1:1582160/1‑97 (MQ=255) atgaaaaGATGCGATATAGTATTAAGAAAATGTGCCTTTTATATTTAGCATTTTTTCGATAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTaa < 2:1726970/94‑1 (MQ=255) aTCAAAAGATGCGATATAGTATTAAGAAAATGTGCCTTTTATATTTAGCATTTTTTCAATAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTaa < 1:1525917/97‑1 (MQ=255) tCAAAAGATGCGATATAGTATTAAGAAAATGTGCCTTTTATATTTAGCATTTTTTCATTAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAAt > 2:1442345/1‑97 (MQ=255) aatatttaaagttaaagtgataaaaactttgatattacagcgtttttaaacgttcgtgtacgtttgagaatggccgttttaccATTAGGTGTTAAtg > 2:478586‑M1/84‑97 (MQ=255) aatatttaaagttaaagtgataaaaactttgatattacagcgtttttaaacgttcgtgtacgtttgagaatggccgttttaccATTAGGTGTTAAtg < 2:2091117‑M1/14‑1 (MQ=255) aatatttaaagttaaagtgataaaaactttgatattacagcgtttttaaacgttcgtgtacgtttgagaatggccgttttaccATTAGGTGTTAAtg > 1:2934609‑M1/84‑97 (MQ=255) atatttaaagttaaagtgataaaaactttgatattacagcgtttttaaacgttcgtgtacgtttgagaatggccgttttaccATTAGGTGTTAAtgt < 2:649403‑M1/15‑1 (MQ=255) atatttaaagttaaagtgataaaaactttgatattacagcgtttttaaacgttcgtgtacgtttgagaatggccgttttaccATTAGGTGTTAAtgt < 1:451490‑M1/15‑1 (MQ=255) atatttaaagttaaagtgataaaaactttgatattacagcgtttttaaacgttcgtgtacgtttgagaatggccgttttaccATTAGGTGTTAAtgt < 1:2541326‑M1/15‑1 (MQ=255) tatttaaagttaaagtgataaaaactttgatattacaacgtttttaaacgttcgtgtacgtttgagaatgaccgttttaccATTAGGTGTGAAtgtg < 1:3000306‑M1/16‑1 (MQ=255) aaaGATGCGATATAGTATTAAGAAAATGTGCCTTTTATATTTAGCATTTTTTCAATAGAAATTATATAGATTTCAAAGCAAATTAGGTGTTAAtgtg < 2:3213750/97‑1 (MQ=255) atttaaagttaaagtgataaaaactttgatattacagcgtttttaaacgttcgtgtacgtttgagaatggccgttttaccATTAGGTGTTAATgtgt > 1:1677987‑M1/81‑97 (MQ=255) tttaaagttaaagtgataaaaactttgatattacagcgtttttaaacgttcgtgtacgtttgagaatggccgttttaccATTAGGTGTTAATGTGTc < 1:2175855‑M1/18‑1 (MQ=255) tttaaagttaaagtgataaaaactttgatattacagcgtttttaaacgttcgtgtacgtttgagaatggccgttttaccATTAGGTGTTAATGTGTc < 1:1825363‑M1/18‑1 (MQ=255) aGATGCGATATAGTATTAAGAAAATGTGCCTTTTATATTTAGCATTTTTTCAATAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTc > 1:2261771/1‑97 (MQ=255) gATGCGATATAGTATTAAGAAAATGTGCCTTTTATATTTAGCATTTTTTCAATAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCa > 1:1282860/1‑97 (MQ=255) taaagttaaagtgataaaaactttgatattacagcgtttttaaacgttcgtgtacgtttgagaatggccgttttaccATTAGGTGTTAATGTGTCAt < 2:2411839‑M1/20‑1 (MQ=255) aTGCGATATAGTATTAAGAAAATGTGCCTTTTATATTTAGCATTTTTTCAATAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCAt < 1:2856069/97‑1 (MQ=255) aaagttaaagtgataaaaactttgatattacagcgtttttaaacgttcgtgtacgtttgagaatggccgttttaccATTAGGTGTTAATGTGTCATa < 2:1514685‑M1/21‑1 (MQ=255) aagttaaagtgataaaaactttgatattacagcgtttttaaacgttcgtgtacgtttgagaatggccgttttaccATTAGGTGTTAATGTGTCATaa < 1:599819‑M1/22‑1 (MQ=255) cGATATAGTATTAAGAAAATGTGCCTTTTATATTTAGCATTTTTTCAATAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAAt < 2:3279420/97‑1 (MQ=255) gttaaagtgataaaaactttgatattacagcgtttttaaacgttcgtgtacgtttgagaatggccgttttaccATTAGGTGTTAATGTGTCATAATg < 1:3069813‑M1/24‑1 (MQ=255) gttaaagtgataaaaactttgatattacagcgtttttaaacgttcgtgtacgtttgagaatggccgttttaccATTAGGTGTTAATGTGTCATAATg > 2:1156911‑M1/74‑97 (MQ=255) taaagtgataaaaactttgatattacagcgtttttaaacgttcgtgtacgtttgagaatggccgttttaccATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGAt < 1:562388‑M1/26‑1 (MQ=255) taaagtgataaaaactttgatattacagcgtttttaaacgttcgtgtacgtttgagaatggccgttttaccATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGAt < 1:1013357‑M1/26‑1 (MQ=255) gTATTAAGAAAATGTGCCTTTTATATTTAGCATTTTTTCAATAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAg > 2:707768/1‑97 (MQ=255) gTATTAAGAAAATGTGCCTTTTATATTTAGCATTTTTTCAATAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAg < 2:2579869/97‑1 (MQ=255) gTATTAAGAAAATGTGCCTTTTATATTTAGCATTTTTTCAATAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAg > 2:821828/1‑97 (MQ=255) gTATTAAGAAAATGTGCCTTTTATATTTAGCATTTTTTCAATAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAAATAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAg > 1:898926/1‑97 (MQ=255) tATTAAGAAAATGTGCCTTTTATATTTAGCATTTTTTCAATAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGa < 2:2872872/97‑1 (MQ=255) aTTAAGAAAATGTGCCTTTTATATTTAGCATTTTTTCAATAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGAt < 1:3311975/97‑1 (MQ=255) ttAAGAAAATGTGCCTTTTCTATTTAGCATTTTTTCAATAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATa < 2:3545723/97‑1 (MQ=255) ttAAGAAAATGTGCCTTTTATATTTAGCATTTTTTCAATAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATa > 1:2014106/1‑97 (MQ=255) aaGAAAATGTGCCTTTTATATTTAGCATTTTTTCAATAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAAc < 2:290792/97‑1 (MQ=255) aGAAAAAGTGCCTTTTATCTTTAGCACTTTTTCAATACAAATTAAATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACg < 2:1819223/97‑1 (MQ=38) gAAAATGTGCCTTTTATATTTAGCATTTTTTCAATAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGc < 1:2091899/97‑1 (MQ=255) aaaTGTGCCTTTTATATTTAGCATTTTTTCAATAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCt > 1:376248/1‑97 (MQ=255) aaaTGTGCCTTTTATATTTAGCATTTTTTCAATAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTCAATGTGTCATACTGATACAGATAACGCCt > 1:1179783/1‑97 (MQ=255) aaTGTGCCTTTTATATTTAGCATTTTTTCAATAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCtt > 2:540259/1‑97 (MQ=255) aTGTGCCTTTTATATTTAGCATTTTTTCAATAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCCTAATGATACAGATAACGCCTTa > 2:1918499/1‑97 (MQ=255) aTGTGCCTTTTATATTTAGCATTTTTTCAATAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCTTa > 2:3137692/1‑97 (MQ=255) aTGTGCCTTTTATATTTAGCATTTTTTCAATAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCTTa < 1:268114/97‑1 (MQ=255) ttgatattacagcgtttttaaacgttcgtgtacgtttgagaatggccgttttaccATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCTTaa > 1:281166‑M1/56‑97 (MQ=255) tgtgCCTTTTATATTTAGCATTTTTTCAATAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCTTaa < 1:2056438/97‑1 (MQ=255) gtgCCTTTTATATTTAGCATTTTTTCAATAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCTTAAt > 1:2444884/1‑97 (MQ=255) gtgCCTTTTATATTTAGCATTTTTTCAATAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCTTAAt < 2:2719960/97‑1 (MQ=255) tgCCTTTTATATTTAGCATTTTTTCAATAGAACTTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCTTAAtt > 2:410938/1‑97 (MQ=255) tgCCTTTTATATTTAGCATTTTTTCAATAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCTTAAtt > 2:3416594/1‑97 (MQ=255) gatattacagcgtttttaaacgttcgtgtacgtttgagaatggccgttttaccATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCcttattt < 2:1289218‑M1/44‑4 (MQ=255) gCCTTTTATATTTAGCATTTTTTCAATAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCTTAATTa < 2:2617112/97‑1 (MQ=255) tttATATTTAGCATTTTTTCAATAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCTTAATTACAgt < 2:782218/97‑1 (MQ=255) tttATATTTAGCATTTTTTCAATAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCTTAATTACAgt < 2:2673240/97‑1 (MQ=255) tacagcgtttttaaacgttcgtgtacgtttgagaatggccgttttaccATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCTTAATTACAgt < 2:2458975‑M1/49‑1 (MQ=255) tatTTAGCATTTTTTCAATAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCTTAATTACAGTGttt > 1:2291667/1‑97 (MQ=255) tttAGCATTTTTTCAATAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCTTAATTACAGTGTTTTc > 2:1549727/1‑97 (MQ=255) tttAGCATTTTTTCAATAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCTTAATTACAGTGTTTTc > 2:1359697/1‑97 (MQ=255) gtttttaaacgttcgtgtacgtttgagaatggccgttttaccATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCTTAATTACAGTGTTTTc > 1:644240‑M1/43‑97 (MQ=255) aGCATTTTTTCAATAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCTTAATTACAGTGTTTTCAAg < 1:2341346/97‑1 (MQ=255) aTTTTTTCAATAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCTTAATTACAGTGTTTTCAAGgtg > 1:3157349/1‑97 (MQ=255) tttttCATTATAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCTTAATTACAGTGTTTTCAAGGTGtt > 2:3166445/1‑97 (MQ=255) ttttCAATAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCTTAATTACAGTGTTTTCAAGGTGTTc > 2:1603430/1‑97 (MQ=255) aTAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCTTAATTACAGTGTTTTCAAGGTGTTCAGAAtg > 1:1413924/1‑97 (MQ=255) tAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCTTAATTACAGTGTTTTCAAGGTGTTCAGAAtgt < 1:1100999/97‑1 (MQ=255) tAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCTTAATTACAGTGTTTTCAAGGTGTTCAGAAtgt > 2:1664736/1‑97 (MQ=255) aGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCTTAATTACAGTGTTTTCAAGGTGTTCAGAAtgtg < 2:1484076/97‑1 (MQ=255) aGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCATTAATTACAGTGTTTTCAAGGAGTTCAGAAtgtg > 1:3446709/1‑97 (MQ=255) gAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCTTAATTACAGTGTTTTCAAGGTGTTCAGAATgtgt > 1:783621/1‑97 (MQ=255) gAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCTTAATTACAGTGTTTTCAAGGTGTTCAGAATgtgt < 1:3260004/97‑1 (MQ=255) aaTTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCTTAATTACAGTGTTTTCAAGGTGTTCAGAATGTGTTg > 1:953789/1‑97 (MQ=255) tgagaatggccgttttaccATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCTTAATTACAGTGTTTTCAAGGTGTTCAGAATGTGTTGCaa > 1:2134236‑M1/20‑97 (MQ=255) tatataGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCTTAATTACAGTGTTTTCAAGGTGTTCAGAATGTGTTGCaa > 1:249533/1‑97 (MQ=255) tatataGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCTTAATTACAGTGTTTTCAAGGTGTTCAGAATGTGTTGCaa < 1:3515721/97‑1 (MQ=255) tatataGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCTTAATTACAGTGTTTTCAAGGTGTTCAGAATGTGTTGCaa < 1:1921645/97‑1 (MQ=255) taGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCTTAATTACAGTGTTTTCAAGGTGTTCAGAATGTGTTGCAAGGTa > 1:1157367/1‑97 (MQ=255) aatggccgttttaccATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCTTAATTACAGTGTTTTCAAGGTGTTCAGAATGTGTTGCAAGGTa > 1:2519380‑M1/16‑97 (MQ=255) ttAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCTTAATTACAGTGTTTTCAAGGTGTTCAGAATGTGTTGCAAGGTAAAAAAg > 2:2491218/1‑97 (MQ=255) ttAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCTTAATTACAGTGTTTTCAAGGTGTTCAGAATGTGTTGCAAGGTAAAAAAg > 1:3492180/1‑97 (MQ=255) ttAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCTTAATTACAGTGTTTTCAAGGCGTTCAGAATGTGTTGCAAGGTAAAAAAg > 2:3352613/1‑97 (MQ=255) cgttttaccATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCTTAATTACAGTGTTTTCAAGGTGTTCAGAATGTGTTGCAAGGTAAAAAAg > 1:8446‑M1/10‑97 (MQ=255) aaaGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCTTAATTACAGTGTTTTCAAGGTGTTCAGAATGTGTTGCAAGGTAAAAAAgag > 2:2544571/1‑95 (MQ=255) aaGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCTTAATTACAGTGTTTTCAAGGTGTTCAGAATGTGTTGCAAGGTAAAAAAGGGc > 2:2252184/1‑97 (MQ=255) ttaccATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCTTAATTACAGTGTTTTCAAGGTGTTCCGAATGTGTTGCAAGGTAAAAAAGGGCa < 2:3116002‑M1/92‑1 (MQ=255) gCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCTTAATTACAGTGTTTTCAAGGTGTTCAGAATGTGTTGCAAGGTAAAAAAGGGCAt < 2:1688671/97‑1 (MQ=255) cAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCTTAATTACAGTGTTTTCAAGGTGTTCAGAATGTGTTGCAAGGTAAACAAGGGCATa > 2:221962/1‑97 (MQ=255) aaTTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCTTAATTACAGTGTTTTCAAGGTGTTCAGAATGTGTTGCAAGGTAAAAAAGGGCATaaa < 2:1130472/97‑1 (MQ=255) | GAAGAATGTGAATCAAAAGATGCGATATAGTATTAAGAAAATGTGCCTTTTATATTTAGCATTTTTTCAATAGAAATTATATAGATTTTAAAGCAAATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATACAGATAACGCCTTAATTACAGTGTTTTCAAGGTGTTCAGAATGTGTTGCAAGGTAAAAAAGGGCATAAAA > BX571857/980901‑981093 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |