| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | BX571857 | = 596982 | 169 (0.950) | 20 (0.110) | 8/192 | 14.9 | 10.6% | coding (2577/2874 nt) | SAS0519 | putative surface anchored protein |
| ? | BX571857 | = 2700094 | 167 (0.940) | coding (2374/2718 nt) | SAS2516 | fibrinogen and keratin‑10 binding surface anchored protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 173 total aligned reads displayed.
TTCAGACAGCGATTCAGATACAGATAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCGATTCA > BX571857/596886‑597075 | ttcagaCAGCGATTCAGATACAGATAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATtcagactcagac > 1:691602/1‑97 (MQ=255) tcagaCAGCGATTCAGATACAGATAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTcagactcagact > 1:2314154/1‑97 (MQ=255) tcagaCAGCGATTCAGATACAGATAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTcagactcagact < 2:1679790/97‑1 (MQ=255) tcagaCAGCGATTCAGATACAGATAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTcagactcagact < 1:2177223/97‑1 (MQ=255) tcagaCAGCGATTCAGATACAGATAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTcagactcagact < 1:1995681/97‑1 (MQ=255) cagaCAGCGATTCAGATACAGATAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCagactcagactc > 2:2118921/1‑97 (MQ=255) cagaCAGCGATTCAGATACAGATAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCagactcagactc < 2:1949645/97‑1 (MQ=255) aCAGCGATTCAGATACAGATAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGa < 1:596865/97‑1 (MQ=255) aCAGCGATTCAGATACAGATAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGa < 2:715209/97‑1 (MQ=255) aCAGCGATTCAGATACAGATAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGa < 1:871874/97‑1 (MQ=255) cAGCGATTCAGATACAGATAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATGGCGATTCAGACTCAGACTCGGAt < 1:2206321/97‑1 (MQ=255) cAGCGATTCAGATACAGATAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACGCAGACTCGGAt > 1:791445/1‑97 (MQ=255) aGCGATTCAGATACAGATAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTAGGATa > 1:46321/1‑97 (MQ=255) gCGATTCAGATACAGATAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAg > 1:1503762/1‑97 (MQ=255) gCGATTCAGATACAGATAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAg > 1:1389041/1‑97 (MQ=255) gATTCAGATACAGATAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCg > 2:1988672/1‑97 (MQ=255) gATTCAGATACAGATAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCg < 2:594554/97‑1 (MQ=255) aTTCAGATACAGATAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCga < 1:2620711/97‑1 (MQ=255) aTTCAGATACAGATAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCga < 2:2505459/97‑1 (MQ=255) ttCAGATACAGATAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCgat > 1:1203232/1‑97 (MQ=255) tCAGATACAGATAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCgatt > 1:738548/1‑97 (MQ=255) agatacagataGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCgattca > 1:373821/1‑97 (MQ=255) atacagataGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCgattcaga > 2:185224/1‑97 (MQ=255) acacagataGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCgattcaga < 2:1043604/95‑1 (MQ=255) cagataGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCgattcagattc > 1:575627/1‑97 (MQ=255) gataGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGattcagattcag > 1:109305/1‑97 (MQ=255) gataGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGattcagatgcag > 2:626133/1‑97 (MQ=255) ataGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGAttcagattcaga < 1:1232440/97‑1 (MQ=255) taGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGAc < 2:1075061/97‑1 (MQ=255) taGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGAc > 2:375835/1‑97 (MQ=255) ggCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACa < 2:407439/96‑1 (MQ=255) cGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGc < 1:860422/97‑1 (MQ=255) gATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCg > 1:2168210/1‑97 (MQ=255) gATGCAGACTCGGAGAGCGACTCAGACGCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCg < 2:2280310/97‑1 (MQ=255) aTTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGa < 1:2649555/97‑1 (MQ=255) ttCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGAc < 2:1508389/97‑1 (MQ=255) tCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACt > 1:411908/1‑97 (MQ=255) cAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTc > 1:272395/1‑97 (MQ=255) cAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTc > 2:2035819/1‑97 (MQ=255) aCTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGa < 2:1471898/97‑1 (MQ=255) cTCGGCTAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGAt < 2:823127/97‑1 (MQ=255) cTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGAt < 2:1248514/97‑1 (MQ=255) cGGATAGCGACTCAGACTCGGCTAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGCCACGCATACCAACCCCGATTCAGACAGCGACCCAGACTc > 2:1748150/1‑97 (MQ=9) cGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTc > 1:1240744/1‑97 (MQ=255) cGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTc > 1:2367864/1‑97 (MQ=255) ggATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCg < 1:476173/97‑1 (MQ=255) ggATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTAAGATAGCGATTCAGACTCAGTCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCg < 1:1006/97‑1 (MQ=255) acaGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGa < 1:2251458/95‑1 (MQ=18) aTAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGa > 1:1673244/1‑97 (MQ=255) agagACACAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACa < 2:1351777/94‑1 (MQ=21) aGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACa > 1:1743598/1‑97 (MQ=255) aGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACa > 2:898880/1‑97 (MQ=255) gACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCg > 1:1986508/1‑97 (MQ=255) gACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCg > 2:559259/1‑97 (MQ=255) gACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCg > 2:962365/1‑97 (MQ=255) aCTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGa < 1:530513/97‑1 (MQ=255) tCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGAtt < 1:1632407/97‑1 (MQ=255) tCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGAtt > 1:1507544/1‑97 (MQ=255) cAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTc < 1:626812/97‑1 (MQ=255) aGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCa < 2:204870/97‑1 (MQ=255) gACTCGGATAGCGGTTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAg < 1:1154784/97‑1 (MQ=255) gACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGATTCAGATACAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAg < 1:398070/97‑1 (MQ=17) aCTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGa < 1:726945/97‑1 (MQ=255) tCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACt > 1:884411/1‑97 (MQ=255) cGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTc > 2:1155857/1‑97 (MQ=255) atagcgattcagactcagatagcgattcagactcagACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGa < 1:1705983/97‑1 (MQ=255) acagcgactgagactcagacaccgactccgactcagaCTCGGACAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGa < 2:980991/95‑1 (MQ=14) tagcgattcagactcagatagcgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGAt < 1:1101474/97‑1 (MQ=255) agcgattcagactcagatagcgattcagactcaaaCACGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATa > 2:147260/1‑97 (MQ=255) agcgattcagaatcagatagcgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATa < 1:2535648/97‑1 (MQ=255) gattcagactcagatagcgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCg < 1:1962994/97‑1 (MQ=255) gattcagactcagatagcgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCg > 1:316692/1‑97 (MQ=255) ttcagactcagatagcgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCgac < 1:2257387/97‑1 (MQ=255) agacgcagacagcgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCgactca < 2:94905/97‑1 (MQ=255) gactcagatagcgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCgactcag < 1:2080386/97‑1 (MQ=255) actcagatagcgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCgactcaga > 1:2680793/1‑97 (MQ=255) tcagatagcgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCgactcagact > 1:643032/1‑97 (MQ=255) cagatagcgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCgactcagactc > 2:2628094/1‑97 (MQ=255) agatagcgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCgactcagactca < 1:2434630/97‑1 (MQ=255) tagcgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGaa > 1:777256/1‑97 (MQ=255) tagcgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGaa > 2:2218124/1‑97 (MQ=255) tagcgatgcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGaa < 1:96503/97‑1 (MQ=255) taccgattcagactcagaCTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGaa < 2:1267532/94‑1 (MQ=255) agcgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGaaa > 2:1922768/1‑97 (MQ=255) cgattcagactgcgaCTGACATAGCAACTCAGATTCAGTCAGCAATTCAGATTCGGTCTGCGCTTCAGACTCATACAGCGACTCAGACTCAGAAAGt < 1:1807434/97‑1 (MQ=9) cgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGGTAGCGACTCAGACTCAGAAAGt < 1:1121566/97‑1 (MQ=255) cgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGt < 2:2638765/97‑1 (MQ=255) taccgactcagactcGGACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGAt < 2:1514925/93‑1 (MQ=14) cagactcagactCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGc > 1:1021012/1‑97 (MQ=255) cagactcagactCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGc > 2:1231943/1‑97 (MQ=255) agactcagactcGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGcc < 2:1006258/97‑1 (MQ=255) gactcagactcGGAGAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCg < 2:1647599/97‑1 (MQ=255) gctcagactcGGATAGCGAGTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCGa < 1:1491110/96‑1 (MQ=255) actcagactcagACAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCGa < 2:2535962/97‑1 (MQ=255) actcagactcGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCGa > 2:271074/1‑97 (MQ=255) actcagactcGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCGa > 2:2415492/1‑97 (MQ=255) ctcagactcGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCGaa > 2:590097/1‑96 (MQ=255) tcagactcGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCGAtt > 1:487465/1‑97 (MQ=255) cagactcGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCGATTc > 1:2455970/1‑97 (MQ=255) agactcGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCGATTca < 1:885476/97‑1 (MQ=255) | TTCAGACAGCGATTCAGATACAGATAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCGATTCA > BX571857/596886‑597075 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |