| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | BX571857 | 596989 = | 159 (0.890) | 10 (0.060) +GTCTGA |
4/180 | 16.9 | 6.1% | coding (2584/2874 nt) | SAS0519 | putative surface anchored protein |
| ? | BX571857 | 2700095 = | 168 (0.940) | coding (2373/2718 nt) | SAS2516 | fibrinogen and keratin‑10 binding surface anchored protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 163 total aligned reads displayed.
AGCGATTCAGATACAGATAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCGATTCAGATACAGATA > BX571857/596893‑597085 | aGCGATTCAGATACAGATAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTAGGATa > 1:46321/1‑97 (MQ=255) gCGATTCAGATACAGATAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAg > 1:1389041/1‑97 (MQ=255) gCGATTCAGATACAGATAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACCCGGATAGCGATTCAGACTCCGATAGCGATTCAGCCTTAGACTCGGATAg > 2:2019180/1‑97 (MQ=21) aTTCAGATACAGATAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCga < 1:882903/97‑1 (MQ=255) aTTCAGATACAGATAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCga < 2:2505459/97‑1 (MQ=255) aTTCAGATACAGATAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCga < 1:2620711/97‑1 (MQ=255) ttCAGATACAGATAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCgat > 1:2344713/1‑97 (MQ=255) ttCAGATACAGATAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCgat > 1:1203232/1‑97 (MQ=255) agatacagataGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCgattca > 1:373821/1‑97 (MQ=255) atacagataGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCgattcaga < 1:769214/97‑1 (MQ=255) atacagataGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCgattcaga > 2:1187899/1‑97 (MQ=255) atacagataGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCgattcaga > 2:185224/1‑97 (MQ=255) acagataGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCgattcagatt > 1:256848/1‑97 (MQ=255) acagataGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCgattcagatt > 1:410774/1‑97 (MQ=255) cagataGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCgattcagattc > 2:1953936/1‑97 (MQ=255) cagataGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCgattcagattc > 1:575627/1‑97 (MQ=255) gataGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGattcagattcag > 1:109305/1‑97 (MQ=255) gataGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGattcagatgcag > 2:626133/1‑97 (MQ=255) ataGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGAttcagattcaga < 1:1232440/97‑1 (MQ=255) taGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGAc < 2:1075061/97‑1 (MQ=255) taGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGAc > 2:375835/1‑97 (MQ=255) aGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACa < 1:1653403/97‑1 (MQ=255) gCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAg > 1:1885538/1‑97 (MQ=255) cGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGc < 1:860422/97‑1 (MQ=255) cGATACAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGc < 2:168105/97‑1 (MQ=255) gATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCg > 1:2168210/1‑97 (MQ=255) gATGCAGACTCGGAGAGCGACTCAGACGCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCg < 2:2280310/97‑1 (MQ=255) aTTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGa < 1:2649555/97‑1 (MQ=255) ttCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGAc < 2:1508389/97‑1 (MQ=255) ttCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGAc > 1:1622299/1‑97 (MQ=255) cAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTc > 1:272395/1‑97 (MQ=255) cAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTc > 2:2035819/1‑97 (MQ=255) cgACTCGGACCGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCa < 2:1019365/96‑1 (MQ=21) cTCGGCTAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGAt < 2:823127/97‑1 (MQ=255) cTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGAt > 2:505112/1‑97 (MQ=255) cTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGAt < 2:1248514/97‑1 (MQ=255) cGGATAGCGACTCAGACTCGGCTAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGCCACGCATACCAACCCCGATTCAGACAGCGACCCAGACTc > 2:1748150/1‑97 (MQ=9) cGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTc > 1:1240744/1‑97 (MQ=255) ggATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCg < 1:2414035/97‑1 (MQ=255) ggATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCg < 1:2199019/97‑1 (MQ=255) ggATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTAAGATAGCGATTCAGACTCAGTCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCg < 1:1006/97‑1 (MQ=255) acaGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGa < 1:2251458/95‑1 (MQ=18) aTAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGa > 1:481277/1‑97 (MQ=255) tAGCGACTCAGACTCGGATCGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATCCAGCTTCAGACAGCGACCCAGATTCGGAc > 2:1399554/1‑97 (MQ=25) agagACACAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACa < 2:1351777/94‑1 (MQ=21) aGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACa > 1:1743598/1‑97 (MQ=255) aGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACa > 1:1743641/1‑97 (MQ=255) gACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCg > 2:962365/1‑97 (MQ=255) gACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCg > 2:559259/1‑97 (MQ=255) gACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCg > 1:1986552/1‑97 (MQ=255) gACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCg > 1:1986508/1‑97 (MQ=255) tcTCAGATTCGGATAGCGACGGAGACTGAGATAGTGATCCGGGATCGGAGTCGGATAGCGTGTCAGACTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGa < 1:1474428/96‑1 (MQ=12) acccAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGGGAGTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGAGTCAGAGAGCGACTCAGATTCGGACAGCGa < 2:952544/94‑1 (MQ=21) aCTCCGACTCGGATAGCGACCCAGACTCAGATAGCGACTGAGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGa < 2:1608216/97‑1 (MQ=17) aCTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGa < 1:530513/97‑1 (MQ=255) tCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGAtt > 1:1507544/1‑97 (MQ=255) tCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGAtt < 1:2259668/97‑1 (MQ=255) cAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTc > 1:322943/1‑97 (MQ=255) aggcTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGGCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCa < 2:2118676/94‑1 (MQ=255) gACTCGGATAGCGGTTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAg < 1:1154784/97‑1 (MQ=255) aCTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGa < 1:726945/97‑1 (MQ=255) cTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGAc > 2:1899655/1‑97 (MQ=255) tCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACt < 1:414684/97‑1 (MQ=255) tCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACt < 1:827479/97‑1 (MQ=255) tCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACt > 1:610935/1‑97 (MQ=255) tCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACCCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACt > 2:785834/1‑97 (MQ=255) cGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTc > 2:1155857/1‑97 (MQ=255) atagcgattcagactcagatagcgattcagactcagACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGa < 1:1705983/97‑1 (MQ=255) acagcgactgagactcagacaccgactccgactcagaCTCGGACAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGa < 2:980991/95‑1 (MQ=14) tagcgattcagactcagatagcgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGAt < 1:1101474/97‑1 (MQ=255) agcgattcagactcagatagcgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATa > 2:2614118/1‑97 (MQ=255) agcgattcagactcagatagcgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATa < 2:2221927/97‑1 (MQ=255) agcgattcagactcagatagcgattcagactcaaaCACGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATa > 2:147260/1‑97 (MQ=255) gattcagactcagatagcgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCg > 1:1062645/1‑97 (MQ=255) gattcagactcagatagcgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCg > 1:728254/1‑97 (MQ=255) cagactcagatagcgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCgactc > 2:272458/1‑97 (MQ=255) gactcagatagcgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCgactcag < 1:2080386/97‑1 (MQ=255) tcagatagcgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCgactcagact > 1:643032/1‑97 (MQ=255) agatagcgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCgactcagactca > 1:1140595/1‑97 (MQ=255) agatagcgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCgactcagactca < 1:2434630/97‑1 (MQ=255) tagcgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGaa > 2:2218124/1‑97 (MQ=255) tagcgatgcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGaa < 1:96503/97‑1 (MQ=255) taccgattcagactcagaCTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGaa < 2:1267532/94‑1 (MQ=255) agcgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGaaa > 1:2499998/1‑97 (MQ=255) cgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGt < 2:2638765/97‑1 (MQ=255) cgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGAAAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGt < 1:503016/97‑1 (MQ=255) gattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTg > 2:1511387/1‑97 (MQ=255) cagactcagactCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGc > 1:1021012/1‑97 (MQ=255) agactcagactcGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGcc < 2:1006258/97‑1 (MQ=255) gactcagacgcGGATAGCGATTCTGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCg < 2:591170/97‑1 (MQ=255) gctcagactcGGATAGCGAGTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCGa < 1:1491110/96‑1 (MQ=255) actcagactcagACAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCGa < 2:2535962/97‑1 (MQ=255) actcagactcGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCGa > 2:271074/1‑97 (MQ=255) ctcagactcGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCGaa > 2:590097/1‑96 (MQ=255) cagactcGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCGATTc > 1:2683395/1‑97 (MQ=255) cgattcGGACCGCGATTCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCGATTca < 2:916815/93‑1 (MQ=14) agactcGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCGATTca < 1:885476/97‑1 (MQ=255) attcGGACAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCGATTcaga < 2:1298936/95‑1 (MQ=255) tcGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCGATTcagata < 2:2527036/97‑1 (MQ=255) aTAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCGATTcagatacaga < 1:168604/97‑1 (MQ=255) | AGCGATTCAGATACAGATAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCGATTCAGATACAGATA > BX571857/596893‑597085 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |