| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | BX571857 | 596995 = | 161 (0.900) | 13 (0.070) +G |
5/190 | 16.6 | 7.6% | coding (2590/2874 nt) | SAS0519 | putative surface anchored protein |
| ? | BX571857 | 2700102 = | 158 (0.890) | coding (2366/2718 nt) | SAS2516 | fibrinogen and keratin‑10 binding surface anchored protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
TCAGATACAGATAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCGATTCAGATACAGATAGCGATT > BX571857/596899‑597091 | agatacagataGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCgattca > 1:373821/1‑97 (MQ=255) gatacagataGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCgattcag < 2:1754645/97‑1 (MQ=255) atacagataGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCgattcaga > 2:185224/1‑97 (MQ=255) atacagataGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCgattcaga < 1:769214/97‑1 (MQ=255) atacagataGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCgattcaga > 2:1187899/1‑97 (MQ=255) acacagataGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCgattcaga < 2:1043604/95‑1 (MQ=255) tacagataGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCgattcagat < 2:706351/97‑1 (MQ=255) acagataGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCgattcagatt > 1:256848/1‑97 (MQ=255) acagataGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCgattcagatt > 1:410774/1‑97 (MQ=255) cagataGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCgattcagattc > 1:575627/1‑97 (MQ=255) gataGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGattcagatgcag > 2:626133/1‑97 (MQ=255) ataGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGAttcagattcaga < 1:1232440/97‑1 (MQ=255) ggCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACa < 2:407439/96‑1 (MQ=255) aGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACa < 1:1653403/97‑1 (MQ=255) gCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAg > 1:1188998/1‑97 (MQ=255) gCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAg > 1:1885538/1‑97 (MQ=255) cGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGc < 1:860422/97‑1 (MQ=255) cGATACAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGc < 2:168105/97‑1 (MQ=255) gATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCg > 1:2168210/1‑97 (MQ=255) gATGCAGACTCGGAGAGCGACTCAGACGCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCg < 2:2280310/97‑1 (MQ=255) aTTCAGACTCAGATAGCGACACAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGa < 1:2631700/97‑1 (MQ=255) ttCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGAc > 1:1622299/1‑97 (MQ=255) ttCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGAc < 2:1508389/97‑1 (MQ=255) tCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACt > 1:411908/1‑97 (MQ=255) cAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTc > 1:272395/1‑97 (MQ=255) cAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTc > 2:2035819/1‑97 (MQ=255) cgACTCGGACCGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCa < 2:1019365/96‑1 (MQ=21) aCTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGa < 2:1471898/97‑1 (MQ=255) cTCGGCTAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGAt < 2:823127/97‑1 (MQ=255) cTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGAt > 2:505112/1‑97 (MQ=255) ggATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCg < 1:994/97‑1 (MQ=255) ggATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCg < 1:476173/97‑1 (MQ=255) ggATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCg < 1:2414035/97‑1 (MQ=255) ggATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCg < 1:2199019/97‑1 (MQ=255) ggATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTAAGATAGCGATTCAGACTCAGTCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCg < 1:1006/97‑1 (MQ=255) acaGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGa < 1:2251458/95‑1 (MQ=18) aTAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGa > 1:1673244/1‑97 (MQ=255) aGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACa > 1:1743641/1‑97 (MQ=255) aGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACa > 1:1743598/1‑97 (MQ=255) gCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAg > 2:1325765/1‑97 (MQ=255) gACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCg > 1:1986552/1‑97 (MQ=255) gACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCg > 1:1986508/1‑97 (MQ=255) gACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCg > 2:962365/1‑97 (MQ=255) gACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCg > 2:559259/1‑97 (MQ=255) aCTCCGACTCGGATAGCGACCCAGACTCAGATAGCGACTGAGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGa < 2:1608216/97‑1 (MQ=17) aCTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGa < 1:530513/97‑1 (MQ=255) tCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGAtt > 1:1507544/1‑97 (MQ=255) tCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGAtt < 1:2259668/97‑1 (MQ=255) aggcTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGGCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCa < 2:2118676/94‑1 (MQ=255) gACTCGGATAGCGGTTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAg < 1:1154784/97‑1 (MQ=255) aCTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGa < 1:726945/97‑1 (MQ=255) tCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACt > 1:610935/1‑97 (MQ=255) tCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACt < 1:827479/97‑1 (MQ=255) tCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACt > 1:884411/1‑97 (MQ=255) atagcgattcagactcagatagcgattcagactcagACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGa < 1:1705983/97‑1 (MQ=255) acagcgactgagactcagacaccgactccgactcagaCTCGGACAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGa < 2:980991/95‑1 (MQ=14) tagcgattcagactcagatagcgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGAt < 1:1101474/97‑1 (MQ=255) agcgattcagactcagatagcgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATa > 2:2614118/1‑97 (MQ=255) agcgattcagactcagatagcgattcagactcaaaCACGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATa > 2:147260/1‑97 (MQ=255) gattcagactcagatagcgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCg > 1:1062645/1‑97 (MQ=255) gattcagactcagatagcgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCg > 1:728254/1‑97 (MQ=255) gattcagactcagatagcgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCg > 2:2531795/1‑97 (MQ=255) gattcagactcagatagcgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCg > 1:316692/1‑97 (MQ=255) gattcagactcagatagcgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCg > 2:2640125/1‑97 (MQ=255) cagactcagatagcgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCgactc > 2:272458/1‑97 (MQ=255) agacgcagacagcgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCgactca < 2:94905/97‑1 (MQ=255) gactcagatagcgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCgactcag < 1:2080386/97‑1 (MQ=255) actcagatagcgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCgactcaga > 1:2680793/1‑97 (MQ=255) tcagatagcgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCgactcagact > 1:643032/1‑97 (MQ=255) tcagatagcgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCgactcagact > 2:1145331/1‑97 (MQ=255) cagatagcgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCgactcagactc > 2:2628094/1‑97 (MQ=255) agatagcgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCgactcagactca > 1:1140595/1‑97 (MQ=255) tagcgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGaa > 2:2218124/1‑97 (MQ=255) agcgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGaaa > 1:2499998/1‑97 (MQ=255) agcgattcagactcagaCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGaaa > 2:1922768/1‑97 (MQ=255) taccgactcagactcGGACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGAt < 2:1514925/93‑1 (MQ=14) cagactcagactCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGc > 1:1021012/1‑97 (MQ=255) cagactcagactCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGc > 2:1231943/1‑97 (MQ=255) actcagactcGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCGa > 2:2415492/1‑97 (MQ=255) actcagactcGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCGa > 2:1257933/1‑97 (MQ=255) ctcagactcGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCGaa > 2:590097/1‑96 (MQ=255) ctcagactcGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCGAt > 1:1095169/1‑97 (MQ=255) tcagactcGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCGAtt > 1:487465/1‑97 (MQ=255) cagactcGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCGATTc > 1:2455970/1‑97 (MQ=255) cgattcGGACCGCGATTCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCGATTca < 2:916815/93‑1 (MQ=14) attcGGACAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCGATTcaga < 2:1298936/95‑1 (MQ=255) agtcGGAGAGCGAATAAGATTCAGACAACGGCGCCTAGTCTGAAAGCGTGTGAGACTCCGATCGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCGATTcaga < 1:1323097/95‑1 (MQ=12) ccGGACAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCGATTcagata < 2:28665/96‑1 (MQ=255) ggATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCGATTcagataca > 1:148946/1‑97 (MQ=255) gCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCGATTCAGATACAGATAg > 1:1530271/1‑97 (MQ=255) gCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCGATTCAGATACAGATAg > 1:922121/1‑97 (MQ=255) cGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCGATTCAGATACAGATAGc < 1:500651/97‑1 (MQ=255) cGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCGATTCAGATACAGATAGc < 1:2532210/97‑1 (MQ=255) cGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCGATTCAGATACAGATAGc < 2:223128/97‑1 (MQ=255) gattcagattcaGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCGATTCAGATACAGATAGCg < 1:1316154/97‑1 (MQ=255) gattcagattcaGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCGATTCAGATACAGATAGCg < 2:1990091/97‑1 (MQ=255) ttcagcctcagaCAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCGATTCAGATACAGATAGCGAt < 2:204710/97‑1 (MQ=18) ttcagattcagaCAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCGATTCAGATACAGATAGCGAt < 1:2287071/97‑1 (MQ=255) ctcagattcagaCAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCGATTCAGATACAGATAGCGAt < 1:958246/96‑1 (MQ=255) tcagactcagaTAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCAGATTCAGATACAGATAGCGAtt > 2:1394253/1‑97 (MQ=14) | TCAGATACAGATAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAAAGTGATGCCGATTCAGATACAGATAGCGATT > BX571857/596899‑597091 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |