| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | BX571857 | = 2027394 | 124 (0.700) | 3 (0.020) | 3/160 | 16.7 | 2.3% | intergenic (‑390/+122) | SAS1866/SAS1867 | putative exported protein/amidase (fragment) |
| ? | BX571857 | 2028235 = | 150 (1.010) | intergenic (‑384/+267) | SAS1867/SAS1868 | amidase (fragment)/staphylokinase precursor | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
AACGCCCAAGGTAATATTAACATAAAATGGCTACTATTGCATTATCTAATTTTATTTAATTAAAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAATTTCAAACTATTCTATAATAAATTAATTAACT > BX571857/2027298‑2027489 | aCGCCCAAGGTAATATTAACATAAAATGGCTACTATTGCATTATCTAATTTTATTTAATTAAAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAg < 1:700069/97‑1 (MQ=255) cccAAGGTAATATTAACATAAAATGGCTACTACTGCATTATCTAATTTTATTTAATTAAAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCt < 1:367839/97‑1 (MQ=255) cAAGGTAATATTAACATAAAATGGCTACTATTGCATTATCTAATTTTATTTAATTAAAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAg > 1:343049/1‑97 (MQ=255) aaGGTAATATTAACATAAAATGGCTACTATTGCATTATCTAATTTTATTTAATTAAAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGc > 2:1144763/1‑97 (MQ=255) aGGTAATATTAACATAAAATGGCTACTATTGCATTATCTAATTTTATTTAATTAAAACAAATATATAGCACAACAAAAACTAGCCCGACGGCTAGCt > 2:1470849/1‑97 (MQ=255) aGGTAATATTAACATAAAATGGCTACTATTGCATTATCTAATTTTATTTAATTAAAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCt > 2:1470722/1‑97 (MQ=255) aGGTAATATTAACATAAAATGGCTACTATTGCATTATCTAATTTTATTTAATTAAAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCt > 2:1887705/1‑97 (MQ=255) gTAATATTAACATAAAATGGCTACTATTGCATTATCTAATTTTATTTAATTAAAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAagctagctaa > 2:565128/1‑95 (MQ=255) atatTAACATAAAATGGCTACTATTGCATTATCTAATTTTATTTAATTAAAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGa < 2:2463269/97‑1 (MQ=255) tatTAACATAAAATGGCTACTATTGCATTATCTAATTTTATTTAATTAAAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGaa > 2:2451301/1‑97 (MQ=255) ttAACATAAAATGGCTACTATTGCATTATCTAATTTTATTTAATTAAAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATa > 1:2614482/1‑97 (MQ=255) aaCATAAAATGGCTACTATTGCATTATCTAATTTTATTTAATTAAAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGa > 2:2232271/1‑97 (MQ=255) cATAAAATGGCTACTATTGCATTATCTAATTTTATTTAATTAAAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATg > 1:693978/1‑97 (MQ=255) tAAAATGGCTACTATTGCATTATCTAATTTTATTTAATTAAAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGaa < 1:653926/97‑1 (MQ=255) tAAAATGGCTACTATTGCATTATCTAATTTTATTTAATTAAAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGaa < 1:1770534/97‑1 (MQ=255) aTGGCTACTATTGCATTATCTAATTTTATTTAATTAAAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAAtt > 2:1715395/1‑97 (MQ=255) ggCTACTATTGCATTATCTAATTTTATTTAATTAAAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTg > 2:2130123/1‑97 (MQ=255) ggCTACTATTGCATTATCTAATTTTATTTAATTAAAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTg < 1:2122946/97‑1 (MQ=255) ggCTACTATTGCATTATCTAATTTTATTTAATTAAAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTg > 2:1828248/1‑97 (MQ=255) gCTACTATTGCATTATCTAATTTTATTTAATTAAAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGa > 1:1421456/1‑97 (MQ=255) ctaTTGCATTATCTAATTTTATTTAATTAAAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAacac < 1:1480465/97‑1 (MQ=255) ctaTTGCATTATCTAATTTTATTTAATTAAAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAacac < 2:1295682/97‑1 (MQ=255) taTTGCATTATCTAATTTTATTTAATTAAAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAAaaca > 2:741397/1‑97 (MQ=255) aTTGCATTATCTAATTTTATTTAATTAAAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACAt > 2:748028/1‑97 (MQ=255) tGCATTATCTAATTTTATTTAATTAAAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTg > 2:1560007/1‑97 (MQ=255) tGCATTATCTAATTTTATTTAATTAAAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTg < 1:2311537/97‑1 (MQ=255) tGCATTATCTAATTTTATTTAATTAAAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTg < 1:2311459/97‑1 (MQ=255) gCATTATCTAATTTTATTTAATTAAAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGc > 1:707802/1‑97 (MQ=255) cATTATCTAATTTTATTTAATTAAAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCt < 1:970703/97‑1 (MQ=255) cATTATCTAATTTTATTTAATTAAAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCt < 2:1605642/97‑1 (MQ=255) ttATCTAATTTTATTTAATTAAAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTTCtgt < 2:1505038/97‑1 (MQ=255) tATCTAATTTTATTTAATTAAAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAGTTTGAACACATTGCtgtg < 1:1910771/97‑1 (MQ=255) tATCTAATTTTATTTAATTAAAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCtgtg < 1:2238997/97‑1 (MQ=255) tAATTTTATTTAATTAAAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTa > 1:1757719/1‑97 (MQ=255) ttttATTTAATTAAAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTaaaa > 1:1511439/1‑97 (MQ=255) ttatttaATTAAAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATg > 2:1905838/1‑97 (MQ=255) tatgtaACTAAAACAAATAGATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGa < 2:886398/97‑1 (MQ=255) ttaattaaAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATta < 1:2520897/97‑1 (MQ=255) ttaattaaAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATta > 2:566523/1‑97 (MQ=255) taattaaAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGACGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATtat > 2:923627/1‑97 (MQ=255) taattaaAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATtat < 1:852725/97‑1 (MQ=255) taattaaAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATtat > 1:239514/1‑97 (MQ=255) aattaaAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATtata < 1:1928988/97‑1 (MQ=255) attaaAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAg < 2:1860741/97‑1 (MQ=255) attaaAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAg > 1:1026281/1‑97 (MQ=255) ttaaAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGc > 1:882810/1‑97 (MQ=255) taaAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCa < 1:971721/97‑1 (MQ=255) aaaaCAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGCAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATCATAGCAt > 2:1061893/1‑97 (MQ=255) aaaaCAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCAt > 1:1534229/1‑97 (MQ=255) aaaCAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATa > 1:2260539/1‑97 (MQ=255) aaaCAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATCTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATa < 2:242461/97‑1 (MQ=255) aCAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAAt > 1:1893737/1‑97 (MQ=255) aCAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAAt > 2:1097532/1‑97 (MQ=255) cAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAAtt > 2:1116795/1‑97 (MQ=255) aaaTATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAAttt > 2:518597/1‑97 (MQ=255) aaaTATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAAttt > 1:1703799/1‑97 (MQ=255) aaaTATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAAttt > 1:1420886/1‑97 (MQ=255) aaaTATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAAttt < 1:1095441/97‑1 (MQ=255) aaaTATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAAttt < 1:2533492/97‑1 (MQ=255) aaTATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAATTTc > 2:2168327/1‑97 (MQ=255) aaTATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAATTTc > 2:134686/1‑97 (MQ=255) aaTATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAATTTc > 2:134769/1‑97 (MQ=255) aaTATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAATTTc > 1:1779848/1‑97 (MQ=255) atatatAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAATTTCa > 1:1669793/1‑97 (MQ=255) atatatAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAATTTCa > 1:1669748/1‑97 (MQ=255) tatataGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAATTTCaa > 1:1851302/1‑97 (MQ=255) aatataGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAATTTCaa < 2:2195471/96‑1 (MQ=255) tataGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAATTTCAAAc < 1:2022838/97‑1 (MQ=255) gataGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAATTTCAAAc < 1:2153936/96‑1 (MQ=255) ataGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAATTTCAAACt < 1:1510124/97‑1 (MQ=255) ataGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAATTTCAAACt > 2:1548021/1‑97 (MQ=255) ataGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAATTTCAAACt < 1:216899/97‑1 (MQ=255) taGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAATTTCAAACTa > 2:819246/1‑97 (MQ=255) taGAACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCGTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAATTTCAAACTa < 2:2078299/97‑1 (MQ=255) agaacaAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAATTTCAAACTAt < 2:1790706/94‑1 (MQ=255) aGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAATTTCAAACTAt < 2:2246052/97‑1 (MQ=255) caAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAATTTCAAACTATTCta > 1:1574701/1‑97 (MQ=255) caAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAATTTCAAACTATTCta < 2:42849/97‑1 (MQ=255) aaaaaaaaCTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAATTTCAAACTATTCtat > 2:2502880/1‑97 (MQ=255) aaaaaaaCTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAATTTCAAACTATTCtata < 1:144954/97‑1 (MQ=255) aaaaaaaCTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAATTTCAAACTATTCtata > 1:94017/1‑97 (MQ=255) aaaaaaaCTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAATTTCAAACTATTCtata > 2:2316374/1‑97 (MQ=255) aaaaaaaCTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAATTTCAAACTATTCtata > 1:93930/1‑97 (MQ=255) aaaaaCTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAATTTCAAACTATTCTataat > 2:1320155/1‑97 (MQ=255) aaaCTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAATTTCAAACTATTCTAtaataa > 1:106186/1‑97 (MQ=255) aaCTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAATTTCAAACTATTCTATAATaaa > 1:552506/1‑97 (MQ=255) aCTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAATTTCAAACTATTCTATAATCaat > 2:2578543/1‑97 (MQ=255) cTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAATTTCAAACTATTCTATAATAaatt > 1:759193/1‑97 (MQ=255) tAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAATTTCAAACTATTCTATAATAaatta > 2:2642562/1‑97 (MQ=255) tAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAATTTCAAACTATTCTATAATAaatta < 1:2010532/97‑1 (MQ=255) tAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAATTTCAAACTATTCTATAATAaatta > 1:1411232/1‑97 (MQ=255) aGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAATTTCAAACTATTCTATAATAaattaa > 1:1942308/1‑97 (MQ=255) ccGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAATTTCAAACTATTCTATAATAAattaatta > 1:1992349/1‑97 (MQ=255) cGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAATTTCAAACTATTCTATAATAAAttaattaa > 2:710902/1‑97 (MQ=255) cGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAATTTCAAACTATTCTATAATAAAttaattaa < 2:95784/97‑1 (MQ=255) gAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAATTTCAAACTATTCTATAATAAATTAATTAAc < 2:2657077/97‑1 (MQ=255) gAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAATTTCAAACTATTCTATAATAAATTAATTAAc < 1:1191658/97‑1 (MQ=255) aaGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAATTTCAAACTATTCTATAATAAATTAATTAACt < 2:2429878/97‑1 (MQ=255) aaGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAATTTCAAACTATTCTATAATAAATTAATTAACt > 1:2535326/1‑97 (MQ=255) aaGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAATTTCAAACTATTCTATAATAAATTAATTAACt > 1:2534352/1‑97 (MQ=255) | AACGCCCAAGGTAATATTAACATAAAATGGCTACTATTGCATTATCTAATTTTATTTAATTAAAACAAATATATAGCACAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAATTTCAAACTATTCTATAATAAATTAATTAACT > BX571857/2027298‑2027489 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |