New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | BX571857 | = 1827674 | 228 (1.030) | 3 (0.020) | 3/140 | NT | 1.6% | coding (4984/6561 nt) | SAS1682 | putative surface anchored protein |
? | BX571857 | 1828188 = | 192 (1.070) | coding (4470/6561 nt) | SAS1682 | putative surface anchored protein | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 325 total aligned reads displayed.
TATCAATAGCAACATCTCTTTCATCTTGAGTAGTATCCAACGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCAATTGCCTTGATTGTTTGATTTCTAACATCAGTAACAGCAGCATCTTGATTTGTATTTTC > BX571857/1827578‑1827770 | tATCAATAGCAACATCTCTTTCATCTTGAGTAGTATCCAACGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGC > 2:3476397‑M1/1‑97 (MQ=255) aTCAATAGCAACATCTCTTTCATCTTGAGTAGTATCCAACGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCa > 1:1285528/1‑97 (MQ=255) aTCAATAGCAACATCTCTTTCATCTTGAGTAGTATCCAACGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCa < 1:3242388/97‑1 (MQ=255) aTCAATAGCAACATCTCTTTCATCTTGAGTAGTATCCAACGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCa > 1:1430122/1‑97 (MQ=255) tCAATAGCAACATCTCTTTCATCTTGAGTAGTATCCAACGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAg < 2:391274/97‑1 (MQ=255) cAATAGCAACATCTCTTTCATCTTGAGTAGTATCCAACGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGc > 1:3575512/1‑97 (MQ=255) aaTAGCAACATCTCTTTCATCTTGAGTAGTATCCAACGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCt > 1:468772/1‑97 (MQ=255) aaTAGCAACATCTCTTTCATCTTGAGTAGTATCCAACGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCt > 1:361279/1‑97 (MQ=255) aaTAGCAACATCTCTTTCATCTTGAGTAGTATCCAACGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCt > 1:2020129/1‑97 (MQ=255) gCAACATCTCTTTCATCTTGAGTAGTATCCAACGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGtt > 2:884694/1‑97 (MQ=255) gCAACATCTCTTTCATCTTGAGTAGTATCCAACGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGtt > 1:829324/1‑97 (MQ=255) cATCTCTTTCATCTTGAGTAGTATCCAACGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACg < 1:1876876/97‑1 (MQ=255) aTCTCTTTCATCTTGAGTAGTATCCAACGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTAGCAAGCGCAGCTCGTTTACGt < 2:2471897/97‑1 (MQ=255) tctcTTTCATCTTGAGTAGTATCCAACGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTc > 1:2720229/1‑97 (MQ=255) ctctTTCATCTTGAGTAGTATCCAACGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCt > 1:1409142/1‑97 (MQ=255) tctTTCATCTTGAGTAGTATCCAACGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCtt > 2:2780563/1‑97 (MQ=255) ctTTCATCTTGAGTAGTATCCAACGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTa < 1:1963710/97‑1 (MQ=255) tttCATCTTGAGTAGTATCCAACGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTAc < 2:2047330/97‑1 (MQ=255) tttCATCTTGAGTAGTATCCAACGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTAc < 1:2519108/97‑1 (MQ=255) tCATCTTGAGTAGTATCCAACGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACtt < 2:3216512/97‑1 (MQ=255) cATCTTGAGTAGTATCCAACGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACttt > 1:2974147/1‑97 (MQ=255) cATCTTGAGTAGTATCCAACGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACttt > 2:1284659/1‑97 (MQ=255) cATCTTGAGTAGTATCCAACGTAGTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCCATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACttt > 2:1507226/1‑97 (MQ=255) aTCTTGAGTAGTATCCAACGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTa > 2:50788/1‑97 (MQ=255) tGAGTAGTATCCAACGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGtt > 2:48906/1‑97 (MQ=255) gAGTAGTATCCAACGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGttt < 1:658675/97‑1 (MQ=255) agtagtATCCAACGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGtttt > 1:1364018/1‑97 (MQ=255) gtagtaTCCAACGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTa < 2:449608/97‑1 (MQ=255) agtaTCCAACGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTAtt > 1:773805/1‑97 (MQ=255) agtaTCCAACGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTAtt < 1:1587723/97‑1 (MQ=255) gtaTCCAACGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTCTTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTAttt < 1:1665368/97‑1 (MQ=255) aTCCAACGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGc > 1:1134834/1‑97 (MQ=255) ccAACGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTc < 1:1696987/97‑1 (MQ=255) cAACGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCGATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCa < 1:3115697/97‑1 (MQ=255) cAACGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCa < 1:3285852/97‑1 (MQ=255) aCGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCAAt < 1:2678540/97‑1 (MQ=255) aCGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCAAt < 1:1737266/97‑1 (MQ=255) gTATTTCGGTTTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCAATTg < 1:2202212/97‑1 (MQ=255) gTATTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCAATTg < 1:2402215/97‑1 (MQ=255) gTATTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCAATTg > 2:1639665/1‑97 (MQ=255) tCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCAATTGCCTTg < 2:1957442/97‑1 (MQ=255) tCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCAATTGCCTTg > 1:3654570/1‑97 (MQ=255) aTTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCAATTGCCTTGATTg < 1:67182/97‑1 (MQ=255) ttGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCAATTGCCTTGATTGt > 1:871092/1‑97 (MQ=255) ttGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGAAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCAATTGCCTTGATTGt > 2:2834594/1‑97 (MQ=255) cATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCAATTGCCTTGATTGTTTg < 2:2224791/97‑1 (MQ=255) tCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTTCTCAATTGCCTTGATTGTTTGAt > 2:2521950/1‑97 (MQ=255) tCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCAATTGCCTTGATTGTTTGAt < 1:2947147/97‑1 (MQ=255) cGAGTTGTTTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCAATTGCCTTGATTGTTTGAtt < 1:2841287/97‑1 (MQ=255) cGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCAATTGCCTTGATTgtttgttt > 2:1171371/1‑97 (MQ=255) gAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCAATTGCCTTGATTGTTTGAttt > 1:3355059/1‑97 (MQ=255) gTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCAATTGCCTTGATTGTTTGATTTCt > 2:1993657/1‑97 (MQ=255) gTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCAATTGCCTTGATTGTTTGATTTCt < 1:2090458/97‑1 (MQ=255) tGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCAATTGCCTTGATTGTTTGATTTCTaa > 1:105616/1‑97 (MQ=255) ttttATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCAATTGCCTTGATTGTTTGATTTCTAACATc < 1:442138/97‑1 (MQ=255) ttttATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCAATTGCCTTGATTGTTTGATTTCTAACATc < 2:3315413/97‑1 (MQ=255) tttCTTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTCTCTTTGCTCAATTGCCTTGATTGTTTGATTTCTAACATCa > 2:2670205/1‑97 (MQ=255) tttATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCAATTGCCTTGATTGTTTGATTTCTACCATCa > 2:808408/1‑97 (MQ=255) tttATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCAATTGCCTTGATTGTTTGATTTCTAACATCa > 2:1098497/1‑97 (MQ=255) tttATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCAATTGCCTTGATTGTTTGATTTCTAACATCa > 2:3578341/1‑97 (MQ=255) tttATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCAATTGCCTTGATTGTTTGATTTCTAACATCa < 2:745101/97‑1 (MQ=255) ttattaTTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCAATTGCCTTGATTGTTTGATTTCTAACATCAg < 1:503280/97‑1 (MQ=255) attTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCAATTGCCTTGATTGTTTGATTTCTAACATCAGTAAca > 1:1450241/1‑97 (MQ=255) attTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCAATTGCCTTGATTGTTTGATTTCTAACATCAGTAAca > 2:557116/1‑97 (MQ=255) tttCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCAATTGCCTTGATTGTTTGATTTCTAACATCAGTAAcagc < 2:2951360/97‑1 (MQ=255) tttCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCAATTGCCTTGATTGTTTGATTTCTAACATCAGTAAcagc < 2:2092390/97‑1 (MQ=255) cttcAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCAATTGCCTTGATTGTTTGATTTCTAACATCAGTAACagcagc < 2:2288882/97‑1 (MQ=255) cAATGCTATCAAGCGCttgacttgttgtatcatcaacttgttgatttgttctattattcgtaatatctgtcatggcttgatttacaaattcattgat < 1:1495660‑M1/97‑82 (MQ=255) cAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCAATTGCCTTGATTGTTTGCTTTCTAACCTCAGTAACAGCAGCATc > 2:703519/1‑97 (MQ=255) cAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCAATTGCCTTGATTGTTTGATTTCTAACATCAGTAACAGCAGCATc < 2:3151124/97‑1 (MQ=255) aaTGCTATCAAGCGCttgacttgttgtatcatcaacttgttgatttgttctattattcgtaatatctgtcatggcttgatttacaaattcattgatt > 2:2164999‑M1/1‑15 (MQ=255) aaTGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCAATTGCCTTGATTGTTTGATTTCTAACATCAGTAACAGCAGCATCt > 2:1803112/1‑97 (MQ=255) aTGCTATCAAGCGCttgacttgttgtatcatcaacttgttgatttgttctattattcgtaatatctgtcatggcttgatttacaaattcattgattt < 2:3376125‑M1/97‑84 (MQ=255) gCTATCAAGCGCttgacttgttgtatcatcaacttgttgatttgttctattattcgtaatatctgtcatggcttgatttacaaattcattgatttta > 1:1511941‑M1/1‑12 (MQ=255) gCTATCAAGCGCttgacttgttgtatcatcaacttgttgatttgttctattattcgtaatatctgtcatggcttgatttacaaattcattgatttta < 2:2633744‑M1/97‑86 (MQ=255) gCTATCAAGCGCttgacttgttgtatcatcaacttgttgatttgttctattattcgtaatatctgtcatggcttgatttacaaattcattgatttta > 2:1710447‑M1/1‑12 (MQ=255) gCTATCAAGCGCttgacttgttgtatcatcaacttgttgatttgttctattattcgtaatatctgtcatggcttgatttacaaattcattgatttta < 2:290337‑M1/97‑86 (MQ=255) gCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCGCAATTGCCTTGATTGTTTGATTTCTAACATCAGTAACAGCAGCATCTTGa < 1:2371536/97‑1 (MQ=255) cTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCAATTGCCTTGATTGTTTGATTTCTAACATCAGTAACAGCAGCATCTTGAt > 1:928820/1‑97 (MQ=255) cTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCAATTGCCTTGATTGTTTGATTTCTAACATCAGTAACAGCAGCATCTTGAt > 1:1062650/1‑97 (MQ=255) cTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCAATTGCCTTGATTGTTTGATTTCTAACATCAGTAACAGCAGCATCTTGAt > 1:1189246/1‑97 (MQ=255) tATCAAGCGCttgacttgttgtatcatcaacttgatgatttgttctattattcgtaataactgtcatggcttgatttacaaattcatcgattttatc > 2:1917623‑M1/1‑10 (MQ=255) aTCAAGCGCttgacttgttgtatcatcaacttgttgatttgttctattattcgtaatatctgtcatggcttgatttacaaattcattgattttatct > 2:1325239‑M1/1‑9 (MQ=255) tCAAGCGCttgacttgttgtatcatcaacttgttgatttgttctattattcgtaatatctgtcatggcttgatttacaaattcattgattttatcta > 1:3370957‑M1/1‑8 (MQ=255) cAAGCGCttgacttgttgtatcatcaacttgttgatttgttctattattcgtaatatctgtcatggcttgatttacaaattcattgattttatctag > 2:3405576‑M1/1‑7 (MQ=255) cAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCAATTGCCTTGATTGTTTGATTTCTAACATCAGTAACAGCAGCATCTTGATTTGt < 1:611019/97‑1 (MQ=255) aaGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCAATTGCCTTGATTGTTTGATTTCTAACATCAGTAACAGCAGCATCTTGATTTGTa > 2:3546748/1‑97 (MQ=255) aaGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCAATTGCCTTGATTGTTTGATTTCTAACATCAGTAACAGCAGCATCTTGATTTGTa > 2:2740225/1‑97 (MQ=255) aaGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACCTTAGGTTTTATTTGCTCAATTGCCTTGATTGTTTGATTTCTAACATCAGTAACAGCAGCATCTTGATTGGTa > 1:493834/1‑97 (MQ=255) aGCGCttggcttgttgtatcatcaacttgttgatttgttctattattcgtaatatctgtcatggcttgatttacaaattcattgattttatctagtg < 1:1085646‑M1/97‑93 (MQ=255) aGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCAATTGCCTTGATTGTTTGATTTCTAACATCAGTAACAGCAGCATCTTGATTTGTAt < 2:3132132/97‑1 (MQ=255) gcgcttgacttgttgtatcatcaacttgttgatttgttctattattcgtaatatctgtcatggcttgatttacaaattcattgattttatctagtgc < 1:3353082‑M1/97‑94 (MQ=255) cgcttgacttgttgtatcatcaacttgttgatttgttctattattcgtaatatctgtcatggcttgatttacaaattcattgattttatctagtgct > 2:1567775‑M1/1‑3 (MQ=255) cgcttgacttgttgtatcatcaacttgttgatttgttctattattcgtaatatctgtcatggcttgatttacaaattcattgattttatctagtgct < 1:3490100‑M1/97‑95 (MQ=255) cgcAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCAATTGCCTTGATTGTTTGATTTCTAACATCAGTAACAGCAGCATCTTGATTCGTAttt > 2:2558221/1‑97 (MQ=255) gcttgtcttgttgtatcatcaccttgttgatttgttctattattcgtaatatctgtcatggcttgatttacaaattcattgattttatctagtgcta < 2:36868‑M1/97‑96 (MQ=255) gcttgacttgttgtatcatcaacttgttgatttgttctattattcgtaatatgtgtcatggcttgatttacaaattcattgattttatctagtgcta > 1:2663852‑M1/1‑2 (MQ=255) gcttgacttgttgtatcatcaacttgttgatttgttctattattcgtaatatctgtcatggcttgatttacaaattcattgattttatctagtgcta > 2:1265185‑M1/1‑2 (MQ=255) gcAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCAATTGCCTTGATTGTTTGATTTCTAACATCAGTAACAGCAGCATCTTGATTTGTAtttt > 2:2410983/1‑97 (MQ=255) cAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCAATTGCCTTGATTGTTTGATTTCTAACATCAGTAACAGCAGCATCTTGATTTGTATTTTc < 2:3081856/97‑1 (MQ=255) | TATCAATAGCAACATCTCTTTCATCTTGAGTAGTATCCAACGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCAATTGCCTTGATTGTTTGATTTCTAACATCAGTAACAGCAGCATCTTGATTTGTATTTTC > BX571857/1827578‑1827770 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |