| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | BX571857 | = 1827674 | 228 (1.030) | 3 (0.020) | 3/140 | NT | 1.6% | coding (4984/6561 nt) | SAS1682 | putative surface anchored protein |
| ? | BX571857 | 1828188 = | 192 (1.070) | coding (4470/6561 nt) | SAS1682 | putative surface anchored protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 285 total aligned reads displayed.
TTCTTGCTTTTTAGCCTCATATTGTTGCTTTACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGCTTGATTTACAAATTCATTGATTTTATCTAGTGCTACT > BX571857/1828092‑1828284 | cTTGCTTTTTAGCCTCATATTGTTGCTTTACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTg < 1:1083224/97‑1 (MQ=255) ttGCTTTTTAGCCTCATATTGTTGCTTTACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGa < 2:2733244/97‑1 (MQ=255) ttGCTTTTTAGCCTCATATTGTTGCTTTACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGa > 2:348624/1‑97 (MQ=255) tGCTTTTTAGCCTCATATTGTTGCTTTACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGAc > 2:410848/1‑97 (MQ=255) gCTTTTTAGCCTCATATTGTTGCTTTACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACt > 1:2888962/1‑97 (MQ=255) cTTTTTAGCCTCATATTGTTGCTTTACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACtt < 2:2469671/97‑1 (MQ=255) cTTTTTAGCCTCATATTGTTGCTTTACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACtt > 1:2132327/1‑97 (MQ=255) gCCTCATATTGTTGCTTTACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTat > 1:728841/1‑97 (MQ=255) tCATATTGTTGCTTTACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTatcat < 2:151645/97‑1 (MQ=255) cATATTGTTGCTTTACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTatcatc < 1:2938607/97‑1 (MQ=255) atatTGTTGCTTTACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTAtcatca > 1:272995/1‑97 (MQ=255) atTGTTGCTTTACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAAc < 2:3525344/97‑1 (MQ=255) ttgttgCTTTACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACt > 1:2272215/1‑97 (MQ=255) ttgttgCTTTACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACt > 2:2333023/1‑97 (MQ=255) ttgttgCTTTACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACt > 1:1020670/1‑97 (MQ=255) gttgCTTTACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACttg < 1:60469/97‑1 (MQ=255) gttgCTTTACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACttg > 2:2979196/1‑97 (MQ=255) ttgCTTTACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACttgt < 2:466/97‑1 (MQ=255) tgCTTTACTGCCTCTCTCGCAGCTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTTCTTCAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACttgtt < 2:2666556/97‑1 (MQ=255) tgCTTTACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACttgtt < 2:317491/97‑1 (MQ=255) tgCTTTACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACttgtt > 1:2168328/1‑97 (MQ=255) gCTTTACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACttgttg > 1:844009/1‑97 (MQ=255) cTTTACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCACGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACGTGTTGa < 1:3483343/97‑1 (MQ=255) cTTTACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGa < 1:965393/97‑1 (MQ=255) tttACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGAt > 1:3017068/1‑97 (MQ=255) ttattatccaacgtatttcgtattgcatcgagttgatttttattattttcttcaatgctatcaagcgcTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGAt < 2:225024‑M2/29‑1 (MQ=255) ttcTGCATCTCTGGCAGCTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTTCTTCTGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGAttt < 2:105616/95‑1 (MQ=255) tACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTACAGCAATGCTATCTAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGAttt < 1:2573892/97‑1 (MQ=255) tACTGCATCACTAGCAGCTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGCTGTATCATCCACTTGTTGAtgt > 2:2880560/1‑95 (MQ=255) cTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGt < 1:3356057/97‑1 (MQ=255) gCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTc > 1:2542792/1‑97 (MQ=255) cATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCt > 2:2898433/1‑97 (MQ=255) cATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCt > 2:1948391/1‑97 (MQ=255) aTCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCta > 1:543442/1‑97 (MQ=255) tctcTAGCAGCTGCTCTAACATTATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCATCTTGTTGATTTGTTCtat < 1:3617550/97‑1 (MQ=255) tctcTAGCAGCTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCtat > 2:1676311/1‑97 (MQ=255) tctAGCAGCTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCtatta < 2:238362/97‑1 (MQ=255) gcagcTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCCACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCg > 1:1204788/1‑97 (MQ=255) gcagcTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCg < 1:70190/97‑1 (MQ=255) gcagcTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCg > 1:3452545/1‑97 (MQ=255) gcagcTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCg > 2:2800053/1‑97 (MQ=255) cagcTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGt < 2:2406185/97‑1 (MQ=255) cagcTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGt < 2:2153495/97‑1 (MQ=255) cagcTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGt < 1:238814/97‑1 (MQ=255) cagcTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGt > 2:2418627/1‑97 (MQ=255) gctgctCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTaa < 2:1592562/97‑1 (MQ=255) tgctCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAata > 2:3400555/1‑97 (MQ=255) tgctCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAata < 2:1285527/97‑1 (MQ=255) ctctAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATc > 2:1244192/1‑97 (MQ=255) tctAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCt > 1:306729/1‑97 (MQ=255) tctAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCt < 1:3160886/97‑1 (MQ=255) ctAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTg > 2:885594/1‑97 (MQ=255) ctAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTg > 2:327786/1‑97 (MQ=255) tAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGt < 1:153994/97‑1 (MQ=255) aaTATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATg > 1:2489249/1‑97 (MQ=255) tatGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGc > 1:1733320/1‑97 (MQ=255) tatGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGc > 2:2527006/1‑97 (MQ=255) tatGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGc > 1:2840453/1‑97 (MQ=255) tatGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGc > 1:1458406/1‑97 (MQ=255) tatGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGc < 2:336567/97‑1 (MQ=255) tGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGCtt < 2:6577/97‑1 (MQ=255) tGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGCtt > 1:1243770/1‑97 (MQ=255) tGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGCtt > 2:2183453/1‑97 (MQ=255) gTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGCTTg < 2:3040019/97‑1 (MQ=255) tCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGCTTGAt > 2:437205/1‑97 (MQ=255) cAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGCTTGAtt < 2:689816/97‑1 (MQ=255) gcgcTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGCTTGATTTAc > 1:1963022/1‑97 (MQ=255) cgcTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGCTTGATTTACa < 2:644925/97‑1 (MQ=255) cgcTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGCTTGATTTACa > 1:514321/1‑97 (MQ=255) gcTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGCTTGATTTACaa > 1:1008528/1‑97 (MQ=255) gcTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGCTTGATTTACaa < 2:552664/97‑1 (MQ=255) tactaAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGCTTGATTTACAAAt > 1:2741883/1‑97 (MQ=255) aaaGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGCTTGATTTACAAATTCAt > 1:3219096/1‑97 (MQ=255) aaGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGCTTGATTTACAAATTCAtt > 1:3340404/1‑97 (MQ=255) aGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGCTTGATTTACAAATTCATTg < 1:2422277/97‑1 (MQ=255) gCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGCTTGATTTACAAATTCATTGa > 2:392979/1‑97 (MQ=255) gCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGCTTGATTTACAAATTCATTGa > 1:753533/1‑97 (MQ=255) gCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGCTTGATTTACAAATTCATTGa < 2:775628/97‑1 (MQ=255) caatgctatcaagcgcTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGCTTGATTTACAAATTCATTGAt > 1:1131183‑M2/17‑97 (MQ=255) tgctatcaagcgcTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGCTTGATTTACAAATTCATTGAtttt > 1:338384‑M2/14‑97 (MQ=255) gctatcaagcgcTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGCTTGATTTACAAATTCATTGATTTTa < 2:2633744‑M2/85‑1 (MQ=255) gctatcaagcgcTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGCTTGATTTACAAATTCATTGATTTTa < 1:1497178‑M2/85‑1 (MQ=255) gctatcaagcgcTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGCTTGATTTACAAATTCATTGATTTTa > 2:1999733‑M2/13‑97 (MQ=255) gctatcaagcgcTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGCTTGATTTACAAATTCATTGATTTTa > 1:1445966‑M2/13‑97 (MQ=255) gctatcaagcgcTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGCTTGATTTACAAATTCATTGATTTTa > 2:1710447‑M2/13‑97 (MQ=255) ctatcaagcgcTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGCTTGATTTACAAATTCATTGATTTTAt > 1:398794‑M2/12‑97 (MQ=255) tatcaagcgcTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGCTTGATTTACAAATTCATTGATTTTATc < 1:3260752‑M2/87‑1 (MQ=255) tatcaagcgcTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGATGATTTGTTCTATTATTCGTAATAACTGTCATGGCTTGATTTACAAATTCATCGATTTTATc > 2:1917623‑M2/11‑97 (MQ=255) caagcgcTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGCTTGATTTACAAATTCATTGATTTTATCTAg < 2:2768650‑M2/90‑1 (MQ=255) aggggcTTGACTTGGTGGGTCATGAGCTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATAGCTGTCATGGCTTGATTTACAAATTCATTGATTTTATCTAGt < 2:147701‑M2/91‑1 (MQ=255) aagcgcTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGCTTGATTTACAAATTCATTGATTTTATCTAGt < 2:1313559‑M2/91‑1 (MQ=255) gcgcTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGCTTGATTTACAAATTCATTGATTTTATCTAGTGc > 1:1913094‑M2/5‑97 (MQ=255) gcgcTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGCTTGATTTACAAATTCATTGATTTTATCTAGTGc > 2:512879‑M2/5‑97 (MQ=255) gcgcTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGCTTGATTTACAAATTCATTGATTTTATCTAGTGc > 1:180065‑M2/5‑97 (MQ=255) cgcTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGCTTGATTTACAAATTCATTGATTTTATCTAGTGCt > 2:489812‑M2/4‑97 (MQ=255) cgcTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGCTTGATTTACAAATTCATTGATTTTATCTAGTGCt > 2:1567775‑M2/4‑97 (MQ=255) gcTTGTCTTGTTGTATCATCACCTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGCTTGATTTACAAATTCATTGATTTTATCTAGTGCTa < 2:36868‑M2/95‑1 (MQ=255) gcTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATGTGTCATGGCTTGATTTACAAATTCATTGATTTTATCTAGTGCTa > 1:2663852‑M2/3‑97 (MQ=255) gcTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGCTTGATTTACAAATTCATTGATTTTATCTAGTGCTa > 2:2048717‑M2/3‑97 (MQ=255) ttGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGCTTGATTTACAAATTCATTGATTTTATCTAGTGCTACt < 2:3619688/97‑1 (MQ=255) | TTCTTGCTTTTTAGCCTCATATTGTTGCTTTACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGCTTGATTTACAAATTCATTGATTTTATCTAGTGCTACT > BX571857/1828092‑1828284 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |