| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | BX571857 | 980997 = | NA (NA) | 17 (0.160) | 14/120 | NT | NA | noncoding (1/27 nt) | Repeat flanking prophage phiSa4(476) | Repeat flanking prophage phiSa4(476) |
| ? | BX571857 | = 1025750 | NA (NA) | intergenic (+519/‑57) | SAS0954/SAS0955 | amidase/putative protease | |||||
Only 100 of 182 total aligned reads displayed.
CAAACACGAGTGGAAAATATTTAAAGTTAAAGTGATAAAAACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGATTTTATTGAATGGAGTGGACATTAGTGGATATTGGTAAAAAACATGTAATTCCTAAAAGTCAGTA > BX571857/1025653‑1025847 | cAAACACGAGTGGAAAATATTTAAAGTTAAAGTGATAAAAACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTAcc < 1:1349049/98‑1 (MQ=255) aaaCACGAGTGGAAAATATTTAAAGTTAATGTGATTAATACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCa > 2:767773‑M2/1‑97 (MQ=255) aaaCACGAGTGGAAAATATTTAAAGTTAAAGTGATAAAAACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCa < 1:2144292‑M2/98‑2 (MQ=255) aaCACGAGTGGAAAATATTTAAAGTTAAAGTGATAAAAACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCat < 2:276052‑M2/98‑3 (MQ=255) acGAGTGGAAAATATTTAAAGTTAAAGTGATAAAAACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCattag > 2:137862‑M2/1‑93 (MQ=255) acGAGTGGAAAATATTTAAAGTTAAAGTGATAAAAACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCattag > 2:1116710‑M2/1‑93 (MQ=255) gAGTGGAAAATATTTAAAGTTAAAGTGATAAAAACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCattaggt > 1:2152583‑M2/1‑91 (MQ=255) gTGGAAAATATTTAAAGTTAAAGTGATAAAAACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCattaggtgt > 1:1527726‑M2/1‑89 (MQ=255) tGGAAAATATTTACAGTTAAAGTGATAAAAACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCattaggtgtt < 2:2467061‑M2/98‑11 (MQ=255) ggAAAATATTTAAAGTTAAAGTGATAAACACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCattaggtgtaa < 2:184532‑M2/98‑12 (MQ=255) ggAAAATATTTAAAGTTAAAGTGATAAAAACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCattaggtgtta > 2:886410‑M2/1‑87 (MQ=255) ggAAAATATTTAAAGTTAAAGTGATAAAAACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCattaggtgtta > 2:16369‑M2/1‑87 (MQ=255) ggAAAATATTTAAAGTTAAAGTGATAAAAACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCattaggtgtta < 1:1394378‑M2/98‑12 (MQ=255) aaaaTATTTAAAGTTAAAGTGATAAAAACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCattaggtgttaat > 1:451311‑M2/1‑85 (MQ=255) aaaTATTTAAAGTTAAAGTGATAAAAACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCattaggtgttaatg > 2:2170646‑M2/1‑84 (MQ=255) aaTATTTAAAGTTAAAGTGATAAAAACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCattaggtgttaatgt < 1:296339‑M2/98‑16 (MQ=255) aaTATTTAAAGTTAAAGTGATAAAAACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCattaggtgttaatgt < 2:2168760‑M2/98‑16 (MQ=255) aaTATTTAAAGTTAAAGTGATAAAAACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCattaggtgttaatgt < 2:1606085‑M2/98‑16 (MQ=255) atatTTAAAGTTAAAGTGATAAAAACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCattaggtgttaatgtg < 2:2042754‑M2/98‑17 (MQ=255) tatTTAAAGTTAAAGTGATAAAAACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCattaggtgttaatgtgt < 1:1225430‑M2/98‑18 (MQ=255) tttAAAGTTAAAGTGATAAAAACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCattaggtgttaatgtgtca > 2:331211‑M2/1‑79 (MQ=255) ttaaagttaaagTGATAAAAACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCattaggtgttaatgtgtcat > 1:2536119‑M2/1‑78 (MQ=255) ttaaagttaaagTGATAAAAACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCattaggtgttaatgtgtcat < 1:175525‑M2/98‑21 (MQ=255) taaagttaaagtGATAAAAACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCattaggtgttaatgtgtcata > 1:1439276‑M2/1‑77 (MQ=255) aaagttaaagtGATAAAAACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCattaggtgttaatgtgtcataa < 1:640768‑M2/98‑23 (MQ=255) agttaaagtGATAAAAACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCattaggtgttaatgtgtcataatg > 1:2158635‑M2/1‑74 (MQ=255) gttaaagtGATAAAAACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCattaggtgttaatgtgtcataatga < 1:456945‑M2/98‑26 (MQ=255) gttaaagtGATAAAAACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCattaggtgttaatgggtcataatga < 1:583718‑M2/98‑26 (MQ=255) ttaaagtGATAAAAACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCattaggtgttaatgtgtcataatgat < 1:53640‑M2/98‑27 (MQ=255) ttaaagtGATAAAAACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCattaggtgttaatgtgtcataatgat < 1:1647350‑M2/98‑27 (MQ=255) ttaaagtGATAAAAACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCattaggtgttaatgtgtcataatgat < 2:378268‑M2/98‑27 (MQ=255) ttaaagtGATAAAAACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGATTTACCattaggtgttattgtgtcataaggaa < 1:649012‑M2/98‑27 (MQ=255) taaagtGATGAAAACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCattaggtgttaatgtgtcataatgata > 1:406667‑M2/1‑71 (MQ=255) taaagtGATAAAAACTTCGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGATTGAGAATGGCCGTTTTACCcgtaggtgttcatgggtcataatgaca < 2:633026‑M2/98‑28 (MQ=255) aaagtGATAAAAACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATaa < 2:2233306/98‑1 (MQ=255) aaagtGATAAAAACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATaa < 1:2566642/98‑1 (MQ=255) aagtGATAAAAACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAg > 2:782945/1‑98 (MQ=255) ggtgATAAGATCTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCattaggtgttaatgtgtcataatgatacag > 2:2129097‑M2/2‑68 (MQ=255) gtGATAAAAACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTg < 1:593241/98‑1 (MQ=255) tGATAAAAACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGa < 1:1308500/98‑1 (MQ=255) tGATAAAAACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGa > 2:2603074/1‑98 (MQ=255) gATAAAAACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGAt < 1:913259/98‑1 (MQ=255) aTAAAAACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCattaggtgttaatgtgtcataatgatacagataa < 1:354367‑M2/98‑35 (MQ=255) aTAAAAACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCattaggtgttaatgtgtcataatgatacagataa < 1:631292‑M2/98‑35 (MQ=255) aTAAAAACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGAtt < 2:1944489/98‑1 (MQ=255) tAAAAACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCATTCGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGAttt > 2:234989/1‑98 (MQ=255) tAAAAACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGATCGTGTACGTCTGAGAATGGCCGTTTTACCATTAGGTGTTACTGTGTCATAATGATAAGTGActt > 1:902200/1‑98 (MQ=255) aaaaaCTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCattaggtgttaatgtgtcataatgatacagataacg < 1:229962‑M2/98‑37 (MQ=255) aaaCTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATCATGATAAGTGATGTTAt > 1:1462194/1‑98 (MQ=255) aaaCTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGATTTTAt < 2:1988567/98‑1 (MQ=255) cTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGATTTTATTGa > 1:2424128/1‑98 (MQ=255) tttGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGATTTTATTGaa > 1:77227/1‑98 (MQ=255) ttGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGATTTTATTGAAt > 1:1829400/1‑98 (MQ=255) ttACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGATTTTATTGAATGGAGTg > 1:1719305/1‑98 (MQ=255) tACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGATTTTATTGAATGGAGTgg < 1:98264/98‑1 (MQ=255) cAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGATTTTATTGAATGGAGTGGAc < 2:2391098/98‑1 (MQ=255) aGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCattaggtgttaatgtgtcataatgatacagataacgccttaattacagtgttt > 2:1734184‑M2/1‑45 (MQ=255) aGCGCTTTTACACGCTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCATCAGGTGTTACCGCGACCTCATGCCAAGTGATGTTACTGCACGGAGTGGCCa > 2:226672/1‑98 (MQ=255) cGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGATTTTATTGAATGGAGTGGACAtt < 1:873279/98‑1 (MQ=255) cGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGATTTTATTGAATGGAGTGGACAtt > 2:1145964/1‑98 (MQ=255) cGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGATTTTATTGAATGGAGTGGACAtt > 1:1346577/1‑98 (MQ=255) gTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGATTTTATTGAATGGAGTGGACATTa > 1:1855834/1‑98 (MQ=255) ttttAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCattaggtgttaatgtgtcataatgatacagataacgccttaattacagtgttttcaag > 1:514951‑M2/1‑40 (MQ=255) tttAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGATTTTATTGAATGGAGTGGACATTAGTg > 2:71648/1‑98 (MQ=255) ttAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGATTTTATTGAATGGAGTGGACATTAGTgg < 2:737530/98‑1 (MQ=255) aCGTTCGTGTACGTTTGAGAAAGGCAGTTTTACCATGAGGTGTTAAAGTGTTACAATGATAAGCAATTTTATTTAATGGAGAGGAGATATGTggcaaa > 2:2586710/1‑94 (MQ=255) gTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGATTTTATTGAATGGAGTGGACATTAGTGGATATTg < 2:611846/98‑1 (MQ=255) gTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGATTTTATTGAATGGAGTGGACATTAGTGGATATTg < 1:1018950/98‑1 (MQ=255) tCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGATTTTATTGAATGGAGTGGACATTAGTGGATATTGGt > 1:1456865/1‑98 (MQ=255) tCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGAGAAGTGATTTCATTGCCTGGAGTGGACATTAGCGGATATTgtg > 2:1189235/1‑96 (MQ=38) cGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGATTTTATTGAATGGAGTGGACATTAGTGGATATTGGTa < 1:201475/98‑1 (MQ=255) gtACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGATTTTATTGAATGGAGTGGACATTAGTGGATATTGGTaaaa > 1:2211186/1‑98 (MQ=255) gtACGTTTGAGAATGGCCGTATTACCATCAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGATTTTATTGAATGGAGTGGGCATTAGTGGATATTGGTaaaa > 2:50989/1‑98 (MQ=255) tACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGATTTTATTGAATGGAGTGGACATTAGTGGATATTGGTaaaaa < 1:2021398/98‑1 (MQ=255) tACGTTTGAGAAGGGCCGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGATTTTATTGAATGGAGTGGACATTAGTGGATATTGGTaaaaa < 2:1105082/98‑1 (MQ=255) cGTTTGGGAATGGCCGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGATTTTATTGAATGGAGTGGACATTAGTGGATATTGGTAAAAAAc < 2:1087975/98‑1 (MQ=255) gTTTGAGAATGGCCGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGAAAAGTGATTTTATTGAATGGCGTGGACATTAGTGGATATTGGTAAAAAACa > 1:1628437/1‑98 (MQ=255) ttGAGAATGGCCGTTTTACCattaggtgttaatgtgtcataatgatacagataacgccttaattacagtgttttcaaggtgttcagaatgtgttgcaa > 1:2219435‑M2/1‑20 (MQ=255) ttGAGAATGGCCGTTTTACCattaggtgttaatgtgtcataatgatacagataacgccttaattacagtgttttcaaggtgttcagaatgtgttgcaa < 2:843647‑M2/98‑79 (MQ=255) tGAGAATGGCCGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGATTTTATTGAATGGAGTGGACATTAGTGGATATTGGTAAAAAACATGt < 2:427988/98‑1 (MQ=255) tGAGAATGGCCGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGATTTTATTGAATGGAGTGGACATTAGTGGATATTGGTAAAAAACATGt < 2:427811/98‑1 (MQ=255) gaATGGCCGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGATTTTATTGAATGGAGTGGACATTAGTGGATATTGGTAAAAAACATGTAAt > 2:85251/1‑98 (MQ=255) gaATGGCCGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGATTTTATTGAATGGAGTGGACATTAGTGGATATCGGTAAAAAACATGCAAt > 1:1495356/1‑98 (MQ=255) gaATGGCCGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGAGAAGTGATTTTATTGAATGGAGTGGACATTAGTGGATATTGGTAAAAAACATGTAAt > 1:7408/1‑98 (MQ=255) gaATGGCCGTTTGACCAGTAGGTTTTAATGTGTCATAATGATAAGTGATTGTATTGAATGGAGGGGACATGAGTGGATATGGGTAAAAAACATGTact < 2:1955707/98‑3 (MQ=255) aaTGGCCGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGATTTTATTGAATGGAGTAGACATTAGTGGATATTGGTAAAAAACATGTAAtt < 1:1495050/98‑1 (MQ=255) aTGGCCGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGATTTTATTGAATGGAGTGGACATTAGTGGATATTGGTAAAAAACATGTAATTc < 1:1235590/98‑1 (MQ=255) aTGGCCGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGATTTTATTGAATGGAGTGGACATTAGTGGATATTGGTAAAAAACATGTAATTc > 2:2435719/1‑98 (MQ=255) aTGGCCGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGATTTTATTGAATGGAGTGGACATTAGTGGATATTGGTAAAAAACATGTAATTc < 2:2365716/98‑1 (MQ=255) aTGGCCGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGATTTTATTGAATGGAGTGGACATTAGTGGATATTGGTAAAAAACATGTAATTc > 1:88363/1‑98 (MQ=255) ccGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGATTTTATTGAATGGAGTGGACATTAGTGGATATTGGTAAAAAACATGTAATTCCTaa > 2:40377/1‑98 (MQ=255) cGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGATTTTATTGAATGGAGTGGACATTAGTGGATATTGGTAAAAAACATGTAATTCCTaaa > 2:2558357/1‑98 (MQ=255) gTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGATTTTATTGAATGGAGTGGACATTAGTGGATATTGGTAAAAAACATGTAATTCCTaaaa < 1:1978834/98‑1 (MQ=255) gTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGATTTTATTGAATGGAGTGGACATTAGTGGATATTGGTAAAAAACATGTAATTCCTaaaa < 1:1540528/98‑1 (MQ=255) ttttACCattaggtgttcatgtgtcataatgatacagataacgccttaattacagtgttttcaaggtgttcagaatgtgttgcaaggtaaaaaagggc > 2:1765264‑M2/1‑7 (MQ=255) tttACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGATTTCATTGAATGGAGCGGACACTAGCGGCTATTGGTAAAAAACATGTACTTCCCaaacgc > 1:1611369/1‑95 (MQ=37) ttACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGATTTTATTGAATGGAGTGGACATTAGTGGATATTGGTAAAAAACATGTAATTCCTAAAAGTc < 1:950039/98‑1 (MQ=255) tACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGATTTTATTGAATGGAGTGGACATTAGTGGATATTGGTAAAAAACATGTAATTCCTAAAAGTCa > 1:2056400/1‑98 (MQ=255) tACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGATTTTATTGAATGGAGTGGACATTAGTGGATATTGGTAAAAAACATGTAATTCCTAAAAGTCa < 2:211399/98‑1 (MQ=255) cATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGATTTTATTGAATGGAGTGGACATTAGTGGATATTGGTAAAAAACATGTAATTCCTAAAAGTCAGTa < 1:1001348/98‑1 (MQ=255) | CAAACACGAGTGGAAAATATTTAAAGTTAAAGTGATAAAAACTTTGATATTACAGCGTTTTTAAACGTTCGTGTACGTTTGAGAATGGCCGTTTTACCATTAGGTGTTAATGTGTCATAATGATAAGTGATTTTATTGAATGGAGTGGACATTAGTGGATATTGGTAAAAAACATGTAATTCCTAAAAGTCAGTA > BX571857/1025653‑1025847 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |