New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 138938 | 55 (1.860) | 8 (0.270) | 8/246 | NT | 12.6% | coding (1566/1782 nt) | kinB | alginate biosynthesis sensor protein KinB |
? | NC_002947 | = 138962 | 56 (1.900) | coding (1542/1782 nt) | kinB | alginate biosynthesis sensor protein KinB |
GCTGCACAATTTCCTTGCACAGCGCGAGCCCCAGCCCAGCGCCGCCTTTCTTGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGCGGCGGGTCCAGTTCCTTGATCAACT > NC_002947/138796‑139086 | gCTGCACAATTTCCTTGCACAGCGCGAGCCCCAGCCCAGCGCCGCCTTTCTTGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCAt < 2:292964/150‑1 (MQ=255) cacaATTTCCTTGCACAGCGCGAGCCCCAGCCCAGCGCCGCCTTTCTTGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGcca > 1:141490/1‑149 (MQ=255) aaTTTCCTTGCACAGCGCGAGCCCCAGCCCAGCGCCGCCTTTCTTGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTcctgcatgccagac < 1:550134‑M1/150‑15 (MQ=255) aaTTTCCTTGCACAGCGCGAGCCCCAGCCCAGCGCCGCCTTTCTTGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTcctgcatgccagac > 2:221408‑M1/1‑136 (MQ=255) aTTTCCTTGCACAGCGCGAGCCCCAGCCCAGCGCCGCCTTTCTTGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTg < 1:326776/150‑1 (MQ=255) cTTGCACAGCGCGAGCCCCAGCCCAGCGCCGCCTTTCTTGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTtctgcatgccagacggcatg < 2:141490‑M1/150‑21 (MQ=255) gCACAGCGCGAGCCCCAGCCCAGCGCCGCCTTTCTTGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGAAGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAg > 2:378824/1‑150 (MQ=255) cccagcccagCGCCGCCTTTCTTGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGcgcccg > 1:42374/1‑150 (MQ=255) ccagcccagcGCCGCCTTTCTTGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGcgcccgc > 2:756338/1‑150 (MQ=255) gcccagcGCCGCCTTTCTTGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTCCTGCATGCCAGAC‑GGCATGCAGAacgggt > 1:150752‑M2/1‑134 (MQ=255) gcccagcGCCGCCTTTCTTGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTCCTGCATGCC‑AGACGGCATGCAGAacgggt < 2:150752‑M2/140‑7 (MQ=255) agcGCCGCCTTTCTTGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGc < 1:155400/150‑1 (MQ=255) gcgcCGCCTTTCTTGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTCCTGCATGCCAGAC‑GGCATGCAGAacgggtgatcatcagcgtcga > 1:221408‑M2/1‑129 (MQ=255) ccgccTTTCTTGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCGATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTa > 1:697145/1‑150 (MQ=255) cgccTTTCTTGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTAt > 1:570419/1‑150 (MQ=255) ccTTTCTTGCGACCCACCTGCACGAAAGGCTCGACGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTGGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATgg < 2:283817/150‑1 (MQ=255) ttGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATg > 1:79701/1‑150 (MQ=255) ttGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATg < 1:756338/150‑1 (MQ=255) ttGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATg > 1:657463/1‑150 (MQ=255) gCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGc < 2:79701/150‑1 (MQ=255) acctacctGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGtt < 2:570419/150‑1 (MQ=255) ctacctGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTtgt < 1:463349/150‑1 (MQ=255) ctacctGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTtgt < 2:657463/150‑1 (MQ=255) acctGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGa < 1:168429/139‑1 (MQ=255) acctGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGa > 2:168429/1‑139 (MQ=255) tGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTgcagc > 1:784654/1‑150 (MQ=255) gCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTgcagca > 2:179244/1‑150 (MQ=255) gCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTgcagca < 2:732587/150‑1 (MQ=255) gCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCa < 1:673602/150‑1 (MQ=255) tCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCa < 1:40479/148‑1 (MQ=255) tCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCa > 2:40479/1‑148 (MQ=255) gAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCAc > 1:72662/1‑150 (MQ=255) gcgcgcTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTc < 1:158621/150‑1 (MQ=255) gcgcTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCa > 1:494091/1‑138 (MQ=255) gcgcTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCa < 2:494091/138‑1 (MQ=255) gcTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTCGCATGCAGGCGGAGGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAAc > 1:494685/1‑150 (MQ=255) ttgCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGc < 2:784654/150‑1 (MQ=255) cATAGGAAGTGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGt > 2:617937/1‑150 (MQ=255) cATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCgg > 2:377100/1‑134 (MQ=255) cATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCgg < 1:377100/134‑1 (MQ=255) aTAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTcctgcatgccagacggcatgcagaacggg < 1:301219‑M1/75‑30 (MQ=255) aTAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTcctgcatgccagacggcatgcagaacggg > 2:301219‑M1/1‑46 (MQ=255) aTAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTc < 2:416264/150‑1 (MQ=255) aGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCgg < 2:72662/150‑1 (MQ=255) gAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTgcagca > 1:239751/1‑112 (MQ=255) gAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTgcagca < 2:239751/112‑1 (MQ=255) gAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGcc < 2:177027/150‑1 (MQ=255) tGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGa < 2:665854/150‑1 (MQ=255) ccTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATg > 2:655337/1‑55 (MQ=255) ctctCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCCTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATAcg > 1:298087/1‑150 (MQ=255) ttGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAgc > 2:304285/1‑150 (MQ=255) tCGACGCTGATGATCACCCGTtctgcatgccgtctggcatgcaggacgggtgatcatcagcgtcgaggacaacggagagggcatttcctatgggcaacaagcgcgcatcttcgagcctttcgtgcaggtaggtcgcaagaaaggcggcgc > 1:221408‑M1/1‑21 (MQ=255) tCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCg > 1:469722/1‑66 (MQ=255) tCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCg < 2:469722/66‑1 (MQ=255) tCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGCGGCggg < 2:163170/150‑1 (MQ=255) gACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGCGGCGGGTc < 1:617937/150‑1 (MQ=255) gCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACTCGGTAGCGGCGGGTCCAg > 2:255074/1‑150 (MQ=255) atgatCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGCGGCGGGTCCAGTTcc < 2:298087/150‑1 (MQ=255) tCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATAc < 2:127809/123‑1 (MQ=255) tCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATAc > 1:127809/1‑123 (MQ=255) tCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGCGGCGGGTCCAGTTCCTTGa < 1:304285/150‑1 (MQ=255) cACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGGGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGCGGCGGGTCCAGTTCCTTGAt < 1:179244/150‑1 (MQ=255) aCCCGTtctgcatgccgtctggcatgcaggacgggtgatcatcagcgtcgaggacaacggagagggcatttcctatgggcaacaagcgcgcatcttcgagcctttcgtgcaggtaggtcgcaagaaaggcggcgctgggc < 2:150752‑M1/140‑135 (MQ=255) aCCCGTtctgcatgccgtctggcatgcaggacgggtgatcatcagcgtcgaggacaacggagagggcatttcctatgggcaacaagcgcgcatcttcgagcctttcgtgcaggtaggtcgcaagaaaggcggcgctgggc > 1:150752‑M1/1‑6 (MQ=255) aCCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCg < 2:638644/92‑1 (MQ=255) aCCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCg > 1:638644/1‑92 (MQ=255) cccGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGacgggtgatcatcagcgtcgaggacaacggagagggcatttcctat > 2:301219‑M2/1‑29 (MQ=255) cccGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGacgggtgatcatcagcgtcgaggacaacggagagggcatttcctat < 1:301219‑M2/75‑47 (MQ=255) cccGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGCGGCGGGTCCAGTTCCTTGATCa > 1:748184/1‑150 (MQ=255) gTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGCGGCGGGACCGGGTCCTTGATCAACt > 2:618210/1‑150 (MQ=255) | GCTGCACAATTTCCTTGCACAGCGCGAGCCCCAGCCCAGCGCCGCCTTTCTTGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCC‑GTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGCGGCGGGTCCAGTTCCTTGATCAACT > NC_002947/138796‑139086 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |