New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1128401 = | 33 (1.120) | 5 (0.170) | 4/246 | NT | 12.5% | coding (1156/2856 nt) | gcvP‑I | glycine dehydrogenase |
? | NC_002947 | 1128443 = | 37 (1.250) | coding (1114/2856 nt) | gcvP‑I | glycine dehydrogenase |
GACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGCGAACATGCTGGCGATGTTGGC > NC_002947/1128264‑1128542 | gACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGgc > 2:616818/1‑150 (MQ=255) caccagcaacatctgcaccgcccaggtgctgctggccaacatcgccagcatgttcgccgtgtaccacggccctgccggtctcaagcgcattgccgagcgcacccacgccctgaccgcgatcctcgccgccggccTGAAGGCGCTGGCGcc < 2:776997‑M1/16‑1 (MQ=255) gAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACtt < 2:721313/150‑1 (MQ=255) tGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGc > 2:39720/1‑150 (MQ=255) tGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGc > 2:480124/1‑150 (MQ=255) gTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGccc > 1:263960/1‑150 (MQ=255) tCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTg > 1:510119/1‑126 (MQ=255) tCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTg < 2:510119/126‑1 (MQ=255) gTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAgcgc > 1:290826/1‑150 (MQ=255) tctgctgcccaacatcgccagcatgttcgccgtctaccacggccctgccggtctcaagcgcattgccgagcgcacccacgccctgaccgcgatcctcgccgccggccCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAg > 1:380768‑M1/108‑150 (MQ=255) gCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACtt < 2:345203/125‑1 (MQ=255) gCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACtt > 1:345203/1‑125 (MQ=255) cccACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGACTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCcggcg > 2:393440/1‑150 (MQ=255) gcATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATcgcg < 1:347525/150‑1 (MQ=255) agcatgttcgccgtgtaccacggccctgccggtctcaagcgcattgccgagcccacccgcgccctgaccgcgaccctcgccgccggccTGAAGGCCCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATcgcg > 1:776997‑M1/89‑150 (MQ=255) tCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATcgcg > 2:726626/1‑147 (MQ=255) tCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATcgcg < 1:726626/147‑1 (MQ=255) gATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAg > 1:86011/1‑150 (MQ=255) gATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAg > 2:728828/1‑150 (MQ=255) cgcAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTgg < 1:355816/150‑1 (MQ=255) gATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTc < 1:393440/150‑1 (MQ=255) tGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCgg < 1:616818/150‑1 (MQ=255) tGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATg < 1:349285/150‑1 (MQ=255) ggCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCGTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATgcg > 2:607711/1‑150 (MQ=255) cTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAACCCGCTGGCGCCCACCACCGGGACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGAcc > 1:97175/1‑150 (MQ=255) ttGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCg > 1:452999/1‑150 (MQ=255) tCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCa < 1:268746/150‑1 (MQ=255) acccacgccctgaccgcgatcctcgccgccggccCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATc < 2:360876‑M1/59‑1 (MQ=255) acccacgccctgaccgcgatcctcgccgccggccCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATc > 1:360876‑M1/35‑93 (MQ=255) ggCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGc < 1:480124/150‑1 (MQ=255) aGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAgc > 2:366958/1‑61 (MQ=255) aGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAgc < 1:366958/61‑1 (MQ=255) ccGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATgcgc > 2:723673/1‑114 (MQ=255) ccGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATgcgc < 1:723673/114‑1 (MQ=255) ccGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACGTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGCGAACATg < 1:650261/150‑1 (MQ=255) tGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGCGAACATGCTgg < 2:452999/150‑1 (MQ=255) cagggtcagggtATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGCGAACATGCTGGCGAt > 2:21253/1‑150 (MQ=255) cagggtATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCTCTTGCACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCTTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGCGAACATGCTGGCGATGTTGGc < 2:190930/150‑1 (MQ=255) | GACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGCGAACATGCTGGCGATGTTGGC > NC_002947/1128264‑1128542 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |