New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1128401 = | 33 (1.120) | 5 (0.170) | 4/246 | NT | 12.5% | coding (1156/2856 nt) | gcvP‑I | glycine dehydrogenase |
? | NC_002947 | 1128443 = | 37 (1.250) | coding (1114/2856 nt) | gcvP‑I | glycine dehydrogenase |
AGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGCGAACATGCTGGCGATGTTGGCCAGCAGCACCTGGGCGGTGCAGATGTTGCTGGTGGCC > NC_002947/1128294‑1128579 | tctgctgcccaacatcgccagcatgttcgccgtctaccacggccctgccggtctcaagcgcattgccgagcgcacccacgccctgaccgcgatcctcgccgccggccCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAg > 1:380768‑M1/108‑150 (MQ=255) cccACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGACTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCcggcg > 2:393440/1‑150 (MQ=255) gcATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATcgcg < 1:347525/150‑1 (MQ=255) agcatgttcgccgtgtaccacggccctgccggtctcaagcgcattgccgagcccacccgcgccctgaccgcgaccctcgccgccggccTGAAGGCCCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATcgcg > 1:776997‑M1/89‑150 (MQ=255) tCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATcgcg > 2:726626/1‑147 (MQ=255) tCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATcgcg < 1:726626/147‑1 (MQ=255) gATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAg > 1:86011/1‑150 (MQ=255) gATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAg > 2:728828/1‑150 (MQ=255) cgcAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTgg < 1:355816/150‑1 (MQ=255) gATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTc < 1:393440/150‑1 (MQ=255) tGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCgg < 1:616818/150‑1 (MQ=255) tGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATg < 1:349285/150‑1 (MQ=255) ggCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCGTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATgcg > 2:607711/1‑150 (MQ=255) cTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAACCCGCTGGCGCCCACCACCGGGACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGAcc > 1:97175/1‑150 (MQ=255) ttGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCg > 1:452999/1‑150 (MQ=255) tCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCa < 1:268746/150‑1 (MQ=255) acccacgccctgaccgcgatcctcgccgccggccCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATc > 1:360876‑M1/35‑93 (MQ=255) acccacgccctgaccgcgatcctcgccgccggccCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATc < 2:360876‑M1/59‑1 (MQ=255) ggCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGc < 1:480124/150‑1 (MQ=255) ccGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATgcgc < 1:723673/114‑1 (MQ=255) ccGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATgcgc > 2:723673/1‑114 (MQ=255) ccGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACGTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGCGAACATg < 1:650261/150‑1 (MQ=255) cgcgatcctcgccgccggcctgaaggcgctgggcgtacaagtggtgggcgccagggccttcaGGCCGGCGGCGAGGGTCGCGGTCAGGGCGCGGGTGGGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGCGAACATGCt > 1:776997‑M2/63‑150 (MQ=255) tGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGCGAACATGCTgg < 2:452999/150‑1 (MQ=255) gatcctcgccgccggcctgaaggcgctgggcgtacaagtggtgggcgccagcgccttcgGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGt > 1:360876‑M2/60‑93 (MQ=255) gatcctcgccgccggcctgaaggcgctgggcgtacaagtggtgggcgccagcgccttcgGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGt < 2:360876‑M2/34‑1 (MQ=255) cagggtcagggtATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGCGAACATGCTGGCGAt > 2:21253/1‑150 (MQ=255) cagggtATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCTCTTGCACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCTTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGCGAACATGCTGGCGATGTTGGc < 2:190930/150‑1 (MQ=255) ctgaaggcgctgggcgtacaagtggtgggcgccagcgccttcgGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTAGACGGCGAACATGCTGGCGATGTTGGgcagcaga > 1:380768‑M2/44‑149 (MQ=255) aaGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGCGAACATGCTGGCGATGTTCTCcagcccaacc > 1:36896/1‑144 (MQ=255) gcgcTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGCGAACATGCTGGCGATGTTGGCCAGCAGCACCTgg > 1:411736/1‑150 (MQ=255) ggCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGAGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGCGAACATGCTg < 2:579810/121‑1 (MQ=255) ggCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGAGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGCGAACATGCTg > 1:579810/1‑121 (MQ=255) gcgcCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGCGAACATGCTGGCGATGTTGGCCAGCAGCACCTGGGCGGTg < 2:263960/150‑1 (MQ=255) gcCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGCGAACATGCTGGCGATGTTGGCCAGCAGCACCTGGGCGGTGCa > 2:103506/1‑150 (MQ=255) accacTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCCGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAGGGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACATTACGAACATGCTGGCGATGTTGGCCAGCAGGACCTGGGGGGTGCAGagg > 2:257433/1‑148 (MQ=255) accacTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGCGAACGTGCTGGCGATGTTGGCCAGCAGCACCTGGGCGGTGCAGATg > 2:544476/1‑150 (MQ=255) accacTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGCGAACATGCTGGCGATGTTGGCCAGCAGCACCTGGGCGGTGCAGATg > 2:203696/1‑150 (MQ=255) accacTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGCGAACATGCTGGCGATGTTGGCCAGCAGCACCTGGGCGGTGCAGATg > 1:452355/1‑150 (MQ=255) ttGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGt < 2:367215/89‑1 (MQ=255) ttGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGt > 1:367215/1‑89 (MQ=255) ggcgccagcgccttcaGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGCGAACATGCTGGCGATGTTGGCCAGCAGCACCTGGGCGGTGCAGATGTTGCtggtg < 2:776997‑M2/134‑1 (MQ=255) cGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGCGAACATGCTGGCGATGTTGGCCAGCAGCACCTGGGCGGTGCAGATGTTGCtggtgg > 2:332153/1‑150 (MQ=255) cGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGCGAACATGCTGGCGATGTTGGCCAGCAGCACCTGGGCGGTGCAGATGTTGCtggtgg > 2:331993/1‑150 (MQ=255) ggccAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGAGCTCGGCACTGCCCTTGCGACCAGCAGGCTTGTTGTTTACGTCGAACATTCTGGCTATTTTGGCCTGCAGCACCTGGGCGGTGCAGATGTTGCTGGTGGc < 2:290826/148‑1 (MQ=255) cccAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGAGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGCGAACATGCTGGCGATGTTGGCCAGCAGCACCTGGGCGGTGCAGATGTTGCTGGTGGcc > 1:566188/1‑150 (MQ=255) | AGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGCGAACATGCTGGCGATGTTGGCCAGCAGCACCTGGGCGGTGCAGATGTTGCTGGTGGCC > NC_002947/1128294‑1128579 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |