New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1852976 = | 39 (1.320) | 4 (0.140) | 4/236 | NT | 10.0% | coding (2020/2241 nt) | relA | ATP:GTP 3'‑pyrophosphotransferase |
? | NC_002947 | 1853007 = | 35 (1.240) | coding (2051/2241 nt) | relA | ATP:GTP 3'‑pyrophosphotransferase |
GGTTACATCACCCAGGGCCGGGGCGTGAGCATTCATCGCCAGGACTGCGCCTCGGTACTGCAGCTGGCGGGCAAAGAGCCAGAGCGCATGATCCAGGTGAGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGTTCGAACAAGGAAGACAACACCGCGCTGATGTCGCTGACCATCGAGATTCCAGGCCTG > NC_002947/1852829‑1853119 | ggTTACATCACCCAGGGCCGGGGCGTGAGCATTCATCGCCAGGACTGCGCCTCGGTACTGCAGCTGGCGGGCAAAGAGCCAGAGCGCATGATCCAGGTGAGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCcgc > 1:401291/1‑150 (MQ=255) ttACATCACCCAGGGCCGGGGCGTGAGCATTCATCGCCAGGACTGCGCCTCGGTACTGCAGCTGGCGGGCAAAGAGCCAGAGCGCATGATCCAGGTGAGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCgcgc < 2:717358/150‑1 (MQ=255) aTCACCCAGGGCCGGGGCGTGAGCATTCATCGCCAGGACTGCGCCTCGGTACTGCAGCTGGCGGGCAAAGAGCCAGAGCGCATGATCCAGGTGAGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTAc > 1:239451/1‑150 (MQ=255) cACCCAGGGCCGGGGCGTGAGCATTCATCGCCAGGACTGCGCCTCGGTACTGCAGCTGGCGGGCAAAGAGCCAGAGCGCATGATCCAGGTGAGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGa < 2:239451/150‑1 (MQ=255) cccAGGGCCGGGGCGTGAGCATTCATCGCCAGGACTGCGCCTCGGTACTGCAGCTGGCGGGCAAAGAGCCAGAGCGCATGATCCAGGTGAGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGAcc > 2:702680/1‑150 (MQ=255) gggCCGGGGCGTGAGCATTCATCGCCAGGACTGCGCCTCGGTACTGCAGCTGGCGGGCAAAGAGCCAGAGCGCATGATCCAGGTGAGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGccc > 1:356406/1‑150 (MQ=255) gCGTGAGCATTCATCGCCAGGACTGCGCCTCGGTACTGCAGCTGGCGGGCAAAGAGCCAGAGCGCATGATCCAGGTGAGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGcc < 2:239404/131‑1 (MQ=255) gCGTGAGCATTCATCGCCAGGACTGCGCCTCGGTACTGCAGCTGGCGGGCAAAGAGCCAGAGCGCATGATCCAGGTGAGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGcc > 1:239404/1‑131 (MQ=255) tCGCCAGGACTGCGCCTCGGTACTGCAGCTGGCGGGCAAAGAGCCAGAGCGCATGATCCAGGTGAGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATcc < 1:304338/113‑1 (MQ=255) tCGCCAGGACTGCGCCTCGGTACTGCAGCTGGCGGGCAAAGAGCCAGAGCGCATGATCCAGGTGAGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATcc > 2:304338/1‑113 (MQ=255) aGGACTGCGCCTCGGTACTGCAGCTGGCGGGCAAAGAGCCAGAGCGCAGTATCCAGGTGAGCTGGGGGCGGATCCCGGTGCAGACCTCCCCGGTCGACATCGACATCCGAGCATACGACTGCCCCGTACGGCCGCGCGATGTGTCGCAgg > 2:333438/1‑150 (MQ=255) gcgcCTCGGTATTTCAGCTGGCGGGCAAAGAGCCAGAGCGCATGATCCAGGTGAGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGtgctgc < 1:721067/150‑1 (MQ=255) gcgcCTCGGTACTGCAGCTGGCGGGCAAAGAGCCAGAGCGCATGATCCAGGTGAGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGtgctgc < 1:702680/150‑1 (MQ=255) cTCGGTACTGCAGCTGGCGGGCAAAGAGCCAGAGCGCATGATCCAGGTGAGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGaa > 2:588558/1‑150 (MQ=255) cTCGGTACTGCAGCTGGCGGGCAAAGAGCCAGAGCGCATGATCCAGGTGAGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGaa > 2:202496/1‑150 (MQ=255) ctgatccgcccggtgttctcttccttgttcgaacgggcgttcaccgccagcacgttgatcttctcgttcagcagcccctgcgccaaatCGCGCCCACGAGCGCCCGGGCCGGCTTCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGAt > 2:360020‑M1/89‑150 (MQ=255) cAGCTGGCGGGCAAAGGGCCAGAGCGCATGATCCAGGTGCGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATc < 1:333438/150‑1 (MQ=255) cAGCTGGCGGGCAAAGAGCCAGAGCGCATGATCCAGGTGAGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATc > 2:492309/1‑150 (MQ=255) gCTGGCGGGCAAAGAGCCAGAGCGCATGATCCAGGTGAGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCaa > 2:453113/1‑150 (MQ=255) atcagcgcggtgttgtcttccttgttcgaacgggtgttcaccgccagcacgttgatcttctcgttcagcagcacctgcgacacatCGCGCCTACGACGGCCCGTTCCTGCTGCGCGATGTGTGGCAGGTGCGGCTGAACGAGAAGATcag < 1:360020‑M1/65‑2 (MQ=255) cTGGCGGGCAAAGAGCCAGAGCGCATGATCCAGGTGAGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAAc < 1:686764/150‑1 (MQ=255) gCCAGAGCGCATGATCCAGGTGAGCGGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGaa > 1:705668/1‑150 (MQ=255) cAGAGCGCATGATCCAGGTGAGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCctgc > 2:286646/1‑93 (MQ=255) cAGAGCGCATGATCCAGGTGAGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCctgc < 1:286646/93‑1 (MQ=255) ttcgaacgggtgttcaccgccagcacgttgatcttctcgttcagcagcacctgcgacacatCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGAtgt < 2:526766‑M1/35‑1 (MQ=255) ttcgaacgggtgttcaccgccagcacgttgatcttctcgttcagcagcacctgcgacacatCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGAtgt > 1:526766‑M1/62‑96 (MQ=255) cATGATCCAGGTGAGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGTTc < 2:347321/150‑1 (MQ=255) cATGATCCAGGTGAGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGTTc < 2:356406/150‑1 (MQ=255) aTGATCCAGGTGAGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGTTCg > 1:591272/1‑150 (MQ=255) gATCCAGGTGAGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGTTCGaa < 2:591272/150‑1 (MQ=255) aGGTGAGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGTTCGAACAAgg > 2:158616/1‑150 (MQ=255) gAGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGTTCGAACAAGGAAGa < 1:158616/150‑1 (MQ=255) aGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACCCCCGTTCGAACAAGGTAGac < 2:647942/150‑1 (MQ=255) cTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCGTCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGTTCGAACAAGGAAGacaa > 1:141591/1‑150 (MQ=255) tCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGTTCGAACAAGGAAGacaac < 2:752015/140‑1 (MQ=255) tCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGTTCGAACAAGGAAGacaac > 1:752015/1‑140 (MQ=255) cAGACCTACCCAGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCACCGTGCTGTCGGTGAACACCCGTTCGAACAAGGAAGACAACACCGCGCTGATGTCGCTg > 2:48495/1‑150 (MQ=255) gACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAAc > 2:445914/1‑91 (MQ=255) gACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAAc < 1:445914/91‑1 (MQ=255) cccGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGTTCGAACAAGGAAGac < 2:50763/121‑1 (MQ=255) cccGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGTTCGAACAAGGAAGac > 1:50763/1‑121 (MQ=255) cGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGt > 2:113855/1‑104 (MQ=255) cGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGt < 1:113855/104‑1 (MQ=255) cATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTTCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGTTCGAACAAGGAAGACAACACCGCGCTGATGTCGCTGACCATCGAGATTCCAgg > 1:789044/1‑150 (MQ=255) aTCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGTTCGAACAAGGAAGACAACACCGCGCTGATGTCGCTGACCATCGAGATTCCAGGc > 2:640442/1‑150 (MQ=255) aTCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGTTCGAACAAGGAACACAACACCGCGCTGATGTCGCTGACCATCGAGATTCCAGGc > 2:544657/1‑150 (MQ=255) gTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGTTCGAACTAGGAAGACAACACCGCGCTGATGTCGCTGACCATCGAGATTCCAGGCCTg < 2:180885/150‑1 (MQ=255) | GGTTACATCACCCAGGGCCGGGGCGTGAGCATTCATCGCCAGGACTGCGCCTCGGTACTGCAGCTGGCGGGCAAAGAGCCAGAGCGCATGATCCAGGTGAGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGTTCGAACAAGGAAGACAACACCGCGCTGATGTCGCTGACCATCGAGATTCCAGGCCTG > NC_002947/1852829‑1853119 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |