New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1852976 = | 39 (1.320) | 4 (0.140) | 4/236 | NT | 10.0% | coding (2020/2241 nt) | relA | ATP:GTP 3'‑pyrophosphotransferase |
? | NC_002947 | 1853007 = | 35 (1.240) | coding (2051/2241 nt) | relA | ATP:GTP 3'‑pyrophosphotransferase |
AGGACTGCGCCTCGGTACTGCAGCTGGCGGGCAAAGAGCCAGAGCGCATGATCCAGGTGAGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGTTCGAACAAGGAAGACAACACCGCGCTGATGTCGCTGACCATCGAGATTCCAGGCCTGGACGCGCTGGGGCGCCTGCTGGGGCGGATCT > NC_002947/1852869‑1853150 | aGGACTGCGCCTCGGTACTGCAGCTGGCGGGCAAAGAGCCAGAGCGCAGTATCCAGGTGAGCTGGGGGCGGATCCCGGTGCAGACCTCCCCGGTCGACATCGACATCCGAGCATACGACTGCCCCGTACGGCCGCGCGATGTGTCGCAgg > 2:333438/1‑150 (MQ=255) gcgcCTCGGTATTTCAGCTGGCGGGCAAAGAGCCAGAGCGCATGATCCAGGTGAGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGtgctgc < 1:721067/150‑1 (MQ=255) gcgcCTCGGTACTGCAGCTGGCGGGCAAAGAGCCAGAGCGCATGATCCAGGTGAGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGtgctgc < 1:702680/150‑1 (MQ=255) cTCGGTACTGCAGCTGGCGGGCAAAGAGCCAGAGCGCATGATCCAGGTGAGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGaa > 2:202496/1‑150 (MQ=255) cTCGGTACTGCAGCTGGCGGGCAAAGAGCCAGAGCGCATGATCCAGGTGAGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGaa > 2:588558/1‑150 (MQ=255) ctgatccgcccggtgttctcttccttgttcgaacgggcgttcaccgccagcacgttgatcttctcgttcagcagcccctgcgccaaatCGCGCCCACGAGCGCCCGGGCCGGCTTCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGAt > 2:360020‑M1/89‑150 (MQ=255) cAGCTGGCGGGCAAAGGGCCAGAGCGCATGATCCAGGTGCGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATc < 1:333438/150‑1 (MQ=255) cAGCTGGCGGGCAAAGAGCCAGAGCGCATGATCCAGGTGAGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATc > 2:492309/1‑150 (MQ=255) gCTGGCGGGCAAAGAGCCAGAGCGCATGATCCAGGTGAGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCaa > 2:453113/1‑150 (MQ=255) atcagcgcggtgttgtcttccttgttcgaacgggtgttcaccgccagcacgttgatcttctcgttcagcagcacctgcgacacatCGCGCCTACGACGGCCCGTTCCTGCTGCGCGATGTGTGGCAGGTGCGGCTGAACGAGAAGATcag < 1:360020‑M1/65‑2 (MQ=255) cTGGCGGGCAAAGAGCCAGAGCGCATGATCCAGGTGAGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAAc < 1:686764/150‑1 (MQ=255) gCCAGAGCGCATGATCCAGGTGAGCGGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGaa > 1:705668/1‑150 (MQ=255) ttcgaacgggtgttcaccgccagcacgttgatcttctcgttcagcagcacctgcgacacatCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGAtgt < 2:526766‑M1/35‑1 (MQ=255) ttcgaacgggtgttcaccgccagcacgttgatcttctcgttcagcagcacctgcgacacatCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGAtgt > 1:526766‑M1/62‑96 (MQ=255) cATGATCCAGGTGAGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGTTc < 2:356406/150‑1 (MQ=255) cATGATCCAGGTGAGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGTTc < 2:347321/150‑1 (MQ=255) aTGATCCAGGTGAGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGTTCg > 1:591272/1‑150 (MQ=255) gATCCAGGTGAGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGTTCGaa < 2:591272/150‑1 (MQ=255) aGGTGAGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGTTCGAACAAgg > 2:158616/1‑150 (MQ=255) gAGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGTTCGAACAAGGAAGa < 1:158616/150‑1 (MQ=255) aGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACCCCCGTTCGAACAAGGTAGac < 2:647942/150‑1 (MQ=255) cTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCGTCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGTTCGAACAAGGAAGacaa > 1:141591/1‑150 (MQ=255) tCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGTTCGAACAAGGAAGacaac < 2:752015/140‑1 (MQ=255) tCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGTTCGAACAAGGAAGacaac > 1:752015/1‑140 (MQ=255) ctgatcttctcgttcagccgcacctgccacacatcgcgcagcaggaacgggccgtcgtaggcgcgATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGTTCGAACAAGGAAGACAACACCGCGCTGAt < 1:360020‑M2/85‑1 (MQ=255) atcttctcgttcagcagcacctgcgacacatcgcgaagccggcccgggcgctcgtgggcgcgATTTGGCGCAGGGGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACGCCCGTTCGAACAAGGAAGAGAACACCGGGCggatcag > 2:360020‑M2/63‑147 (MQ=255) cAGACCTACCCAGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCACCGTGCTGTCGGTGAACACCCGTTCGAACAAGGAAGACAACACCGCGCTGATGTCGCTg > 2:48495/1‑150 (MQ=255) gACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAAc < 1:445914/91‑1 (MQ=255) gACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAAc > 2:445914/1‑91 (MQ=255) cccGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGTTCGAACAAGGAAGac < 2:50763/121‑1 (MQ=255) cccGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGTTCGAACAAGGAAGac > 1:50763/1‑121 (MQ=255) cGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGt < 1:113855/104‑1 (MQ=255) cGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGt > 2:113855/1‑104 (MQ=255) cATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTTCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGTTCGAACAAGGAAGACAACACCGCGCTGATGTCGCTGACCATCGAGATTCCAgg > 1:789044/1‑150 (MQ=255) aTCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGTTCGAACAAGGAAGACAACACCGCGCTGATGTCGCTGACCATCGAGATTCCAGGc > 2:640442/1‑150 (MQ=255) aTCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGTTCGAACAAGGAACACAACACCGCGCTGATGTCGCTGACCATCGAGATTCCAGGc > 2:544657/1‑150 (MQ=255) gTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGTTCGAACTAGGAAGACAACACCGCGCTGATGTCGCTGACCATCGAGATTCCAGGCCTg < 2:180885/150‑1 (MQ=255) acatcgcgcagcaggcccgggcggtcgtaggcgcgATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGTTCGaa > 1:526766‑M2/36‑96 (MQ=255) acatcgcgcagcaggcccgggcggtcgtaggcgcgATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGTTCGaa < 2:526766‑M2/61‑1 (MQ=255) cTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGTTCGAACAAGGAAGACAACACCGCGCTGATGTCGCTGACCATCGAGATTCCAGGCCTGGACGCGCTggg > 2:435718/1‑150 (MQ=255) gACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGTTCGAACAAGGAAGACAACACCGCGCTGATGTCGCTGACCATCGAGATTCCAGGCCTGGACGCGCTGGGgcgc < 1:202496/150‑1 (MQ=255) cccGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGTTCGAACAAGGAAGACAACACCGCGCTGATGTCGCTGACCATCGAGATTCCAGGCCTGGACGCGCTGGGGCGCctgct > 2:173312/1‑150 (MQ=255) cGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGAGCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGTTCGAACAAGGAAGACAACACCGCGCTGATGTCGCTGACCATCGAGATTCCAGGCCTGGACGCGCTGGGGCGCCTGCTgg < 2:401291/150‑1 (MQ=255) tgctgcGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGTTCGAACAAGGAAGACAACACCGCGCTGATGTCGCTGACCATCGAGATTCCAGACCTGGACGCGCTGGGGCGCCTGCTGGGGCGGa > 2:405832/1‑150 (MQ=255) gctgcGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGTTCGAACAAGGAAGACAACACCGCGCTGATGTCGCTGACCATCGAGATTCCAGGCCTGGACGCGCTGGGGCGCCTGCTGGGGCGGAt < 1:588558/150‑1 (MQ=255) tgcGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGTTCGAACAAGGAAGACAACACCGCGCTGATGTCGCTGACCATCGAGATTCCAGGCCTGGACGCGCTGGGGCGCCTGCTGGGGCGGAtct > 2:722015/1‑150 (MQ=255) | AGGACTGCGCCTCGGTACTGCAGCTGGCGGGCAAAGAGCCAGAGCGCATGATCCAGGTGAGCTGGGGGCCGATCCCGGTGCAGACCTACCCGGTCGACATCGTCATCCGCGCCTACGACCGCCCGGGCCTGCTGCGCGATGTGTCGCAGGTGCTGCTGAACGAGAAGATCAACGTGCTGGCGGTGAACACCCGTTCGAACAAGGAAGACAACACCGCGCTGATGTCGCTGACCATCGAGATTCCAGGCCTGGACGCGCTGGGGCGCCTGCTGGGGCGGATCT > NC_002947/1852869‑1853150 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |