New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1982470 = | 27 (0.910) | 3 (0.110) | 3/236 | NT | 10.5% | coding (379/1434 nt) | PP_1775 | metallo‑beta‑lactamase family protein |
? | NC_002947 | 1982497 = | 25 (0.880) | coding (406/1434 nt) | PP_1775 | metallo‑beta‑lactamase family protein |
TGCTGGCAGCGGGTTACCGTGGTCCTATCCTGTGCAGCGAGCCCTCGGCCCGGCTGCTGCCGCTGGTACTGGAAGACGCCTACAAGCTGAGCATCAGCAGCGAGCCTGCGCAGGTGGCGCGCTATCTCGAATTCATCCGTGACCTTATCGTGCCGCTGCCCTTCGAGCAGTGGCACACGGTGGTTGAGTACCCTGGTCTTGCCTGTCGTATTCGCCTGCAGCGTGCAGGGCATCTGCTGGGTTCCGCTTATGTCGAGTGCGATATGCAGCATGAGCAAACCAACAGCCGGTACGTGT > NC_002947/1982321‑1982617 | tgctgGCAGCGGGTTACCGTGGTCCTATCCTGTGCAGCGAGCCCTCGGCCCGGCTGCTGCCGCTGGTACTGGAAGACGCCTACAAGCTGAGCATCAGCAGCGAGCCTGCGCAGGTGGCGCGCTATCTCGAATTCATCCGTGACCTTATCg < 1:492517/150‑1 (MQ=255) tACCGTGGCCCTATCCTGTGCAGCGAGCCCTCGGCCAGGCTGCTGCCGCTGGTACTGGAAGACGCCTACAAGCTGAGCATCAGCAGCGAGCCGGCGCAGGTGGCGCGCTATCGCTATTTCATCCGTGACCTTATCGTGCCGCTGCCCTTc < 2:551882/150‑1 (MQ=255) ccGTGGTCCTATCCTGTGCAGCGAGCCCTCGGCCCGGCTGCTGCCGCTGGTACTGGAAGACGCCTACAAGCTGAGCATCAGCAGCGAGCCTGCGCAGGTGGCGCGCTATCTCGAATTCATCCGTGACCTTATCGTGCCGCTGCCCTTCGa > 2:756948/1‑150 (MQ=255) tATCCTGTGCAGCGAGCCCTCGGCCCGGCTGCTGCCGCTGGTACTGGAAGACGCCTACAAGCTGAGCATCAGCAGCGAGCCTGCGCAGGTGGCGCGCTATCTCGAATTCATCCGTGACCTTATCGTGCCGCTGCCCTTCGAGCAGTGGca > 2:65308/1‑150 (MQ=255) cTGTGCAGCGAGCCCTCGGCCCGGCTGCTGCCGCTGGTACTGGAAGACGCCTACAAGCTGAGCATCAGCAGCGAGCCTGCGCAGGTGGCGCGCTATCTCGAATTCATCCGTGACCTTATCGTGCCGCTGCCCTTCGAGCAGTGGCACACg < 1:756948/150‑1 (MQ=255) tgCAGCGAGCCCTCGGCCCGGCTGCTGCCGCTGGTACTGGAAGACGCCTACAAGCTGAGCATCAGCAGCGAGCCTGCGCAGGTGGCGCGCTATCTCGAATTCATCCGTGACCTTATCGTGCCGCTGCCCTTCGAGCAGTGGCACACggtg < 1:369240/150‑1 (MQ=255) tgCAGCGAGCCCTCGGCCCGGCTGCTGCCGCTGGTACTGGAAGACGCCTACAAGCTGAGCATCAGCAGCGAGCCTGCGCAGGTGGCGCGCTATCTCGAATTCATCCGTGACCTTATCGTGCCGCTGCCCTTCGAGCAGTGGCACACggtg < 1:724748/150‑1 (MQ=255) cGAGCCCTCGGCCCGGCTGCTGCCGCTGGTACTGGAAGACGCCTACAAGCTGAGCATCAGCAGCGAGCCTGCGCAGGTGGCGCGCTATCTCGAATTCATCCGTGACCTTATCGTGCCGCTGCCCTTCGAGCAGTGGCACACGGTGGTTGa < 2:138906/150‑1 (MQ=255) aGCCCTCGGCCCGGCTGCTGCCGCTGGTACTGGAAGACGCCTACAAGCTGAGCATCAGCAGCGAGCCTGCGCAGGTGGCGCGCTATCTCGAATTCATCCGTGACCTTATCGTGCCGCTGCCCTTCGAGCAGTGGCACACGGTGGTTGAGt > 1:224942/1‑150 (MQ=255) gctgctGCCGCTGGTACTGGAAGACGCCTACAAGCTGAGCATCAGCAGCGAGCCTGCGCAGGTGGCGCGCTATCTCGAATTCATCCGTGACCTTATCGTGCCGCTGCCCTTCGAGCAGTGGCACACGGTGGTTGAGTACCCTGGTCTTGc > 2:308465/1‑150 (MQ=255) tgcCGCTGGTACTGGAAGACGCCTACAAGCTGAGCATCAGCAGCGAGCCTGCGCAGGTGGCGCGCTATCTCGAATTCATCCGTGACCTTATCGTGCCGCTGCCCTTCGAGCAGTGGCACACGGTGGTTGAGTACCCTGGTCTTGCCTGTc < 2:297311/150‑1 (MQ=255) gcactcgacataagcggaacccagcagatgccctgcacgctgcaggcgaatacgacaggcaagaccagggtactcaaccaccgtgt > 2:767627‑M1/85‑86 (MQ=255) gcactcgacataagcggaacccagcagatgccctgcacgctgcaggcgaatacgacaggcaagaccagggtactcaaccaccgtgt < 1:767627‑M1/2‑1 (MQ=255) cAAGCTGAGCATCAGCAGCGAGCCTGCGCAGGTGGCGCGCTATCTCGAATTCATCCGTGACCTTATCGTGCCGCTGCCCTTCGAGCAGTGGCACACGGTGGTTGAGTACCCTGGTCTTGCCTGTCGTATTCGCCTGCAGCGTGCAGGGCa > 1:595099/1‑150 (MQ=255) tGAGCATCAGCAGCGAGCCTGCGCAGGTGGCGCGCTATCTCGAATTCATCCGTGACCTTATCGTGCCGCTGCCCTTCGAGCAGTGGCACACGGTGGTTGAGTACCCTGGTCTTGCCTGTCGTATTCGCCTGCAGCGTGCAGGGCATctgc < 2:701486/150‑1 (MQ=255) aGCATCAGCAGCGAGCCTGCGCAGGTGGCGCGCTATCTCGAATTCATCCGTGACCTTATCGTGCCGCTGCCCTTCGAGCAGTGGCACACGGTGGTTGAGTACCCTGGTCTTGCCTGTCGTATTCGCCTGCAGCGTGCAGGGCATctgctg < 2:457302/150‑1 (MQ=255) tGCGCAGGTGGCGCGCTATCTCGAATTCATCCGTGACCTTATCGTGCCGCTGCCCTTCGAGCAGTGGCACACGGTGGTTGAGTACCCTGGTCTTGCCTGTCGTATTCGCCTGCAGCGTGCAGGGCATCTGCTGGGTTCCGCTTATGTCGa < 2:78316/150‑1 (MQ=255) tGCGCAGGTGGCGCGCTATCTCGAATTCATCCGTGACCTTATCGTGCCGCTGCCCTTCGAGCAGTGGCACACGGTGGTTGAGTACCCTGGTCTTGCCTGTCGTATTCGCCTGCAGCGTGCAGGGCATCTGCTGGGTTCCGCTTATGTCGa > 1:525955/1‑150 (MQ=255) gcgcAGGTGGCGCGCTATCTCGAATTCATCCGTGACCTTATCGTGCCGCTGCCCTTCGAGCAGTGGCACACGGTGGTTGAGTACCCTGGTCTTGCCTGTCGTATTCGCCTGCAGCGTGCAGGGCATCTGCTGGGTTCCGCTTATGTCGAg < 2:595099/150‑1 (MQ=255) gcgcAGGTGGCGCGCTATCTCGAATTCATCCGTGACCTTATCGTGCCGCTGCCCTTCGAGCAGTGGCACACGGTGGTTGAGTACCCTGGTCTTGCCTGTCGTATTCGCCTGCAGCGTGCAGGGCATCTGCTGGGTTCCGCTTATGTCGAg < 1:308465/150‑1 (MQ=255) tGGCGCGCTATCTCGAATTCATCCGTGACCTTATCGTGCCGCTGCCCTTCGAGCAGTGGCACACGGTGGTTGAGTACCCTGGTCTTGCCTGTCGTATTCGCCTGCAGc > 1:681778/1‑108 (MQ=255) tGGCGCGCTATCTCGAATTCATCCGTGACCTTATCGTGCCGCTGCCCTTCGAGCAGTGGCACACGGTGGTTGAGTACCCTGGTCTTGCCTGTCGTATTCGCCTGCAGc < 2:681778/108‑1 (MQ=255) gacaggcaagaccagggtactcaaccaccgtGTGCCGCTGCCCTTCGAGCAGTg > 2:363201‑M1/32‑54 (MQ=255) gacaggcaagaccagggtactcaaccaccgtGTGCCGCTGCCCTTCGAGCAGTg < 1:363201‑M1/23‑1 (MQ=255) tcGAATTCATCCGTGACCTTATCGTGCCGCTGCCCTTCGAGCAGTGGCACACGGTGGTTGAGTACCCTGGTCtt > 2:376188/1‑74 (MQ=255) tcGAATTCATCCGTGACCTTATCGTGCCGCTGCCCTTCGAGCAGTGGCACACGGTGGTTGAGTACCCTGGTCtt < 1:376188/74‑1 (MQ=255) tcGAATTCATCCGTGACCTTATCGTGCCGCTGCCCTTCGAGCAGTGGCACACGGTGGTTGAGTACCCTGGTCTTGCCTGTCGTATTCGCCTGCAGCGTGCAGGGCATCTGCTGGGTTCCGCTTa > 1:756340/1‑124 (MQ=255) tcGAATTCATCCGTGACCTTATCGTGCCGCTGCCCTTCGAGCAGTGGCACACGGTGGTTGAGTACCCTGGTCTTGCCTGTCGTATTCGCCTGCAGCGTGCAGGGCATCTGCTGGGTTCCGCTTa < 2:756340/124‑1 (MQ=255) tcGAATTCATCCGTGACCTTATCGTGCCGCTGCCCTTCGAGCAGTGGCACACGGTGGTTGAGTACCCTGGTCTGCAAGGTCGGATTCGCCTGCAGCGTGCAGGGCATCTGCTGGGTTCCGCTTATGTCGAGTGCGATATGCAGCATGAGc > 1:695302/1‑150 (MQ=255) tcGAATTCATCCGTGACCTTATCGTGCCGCTACCCTTCGAGCAGTGGCACACGGTGGTTGAGTACCCTGGTCTTGCCTGTCGTATTCGCCTGCAGCGTGCAGGGCATCTGCTGGGTTCCGCTTATGTCGAGTGCGATATGCAGCATGAGc > 2:490660/1‑150 (MQ=255) aTTCATCCGTGACCTTATCGTGCCGCTGCCCTTCGAGCAGTGGCACACGGTGGTTGAGTACCCTGGTCTTGCCTGTCGTATTCGCCTGCAGCGTGCAGGGCATCTGCTGGGTTCCGCTTATGTCGAGTGCGATATGCAGCAt < 1:787434/142‑1 (MQ=255) aTTCATCCGTGACCTTATCGTGCCGCTGCCCTTCGAGCAGTGGCACACGGTGGTTGAGTACCCTGGTCTTGCCTGTCGTATTCGCCTGCAGCGTGCAGGGCATCTGCTGGGTTCCGCTTATGTCGAGTGCGATATGCAGCAt > 2:787434/1‑142 (MQ=255) tactcaaccaccgtGTGCCACTGCTCGAAGGGCAGCGGCACACGGTGGTTGAGTACCCTGGTCTTGCCTGTCGTATTCGCCTGCAGCGTGCAGGGCATCTGCTGGGTTCCGCTTATGTCGAGTGCGATATGCAGCATGAGCAAACCAACa < 2:267523‑M1/136‑1 (MQ=255) tCGTGCCGCTGCCCTTCGAGCAGTGGCACACGGTGGTTGAGTACCCTGGTCTTGCCTGTCGTATTCGCCGGCAGCGTGCAGGGCATCTGCTGGGTTCCGCTTATGTCGAGTGCGATATGCAGCATGAGCAAACCAACAGCCGGTACgtgt > 1:258125/1‑150 (MQ=255) | TGCTGGCAGCGGGTTACCGTGGTCCTATCCTGTGCAGCGAGCCCTCGGCCCGGCTGCTGCCGCTGGTACTGGAAGACGCCTACAAGCTGAGCATCAGCAGCGAGCCTGCGCAGGTGGCGCGCTATCTCGAATTCATCCGTGACCTTATCGTGCCGCTGCCCTTCGAGCAGTGGCACACGGTGGTTGAGTACCCTGGTCTTGCCTGTCGTATTCGCCTGCAGCGTGCAGGGCATCTGCTGGGTTCCGCTTATGTCGAGTGCGATATGCAGCATGAGCAAACCAACAGCCGGTACGTGT > NC_002947/1982321‑1982617 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |