New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5744325 | 36 (1.220) | 4 (0.140) | 4/238 | NT | 11.0% | coding (1596/2451 nt) | glgP | glycogen phosphorylase |
? | NC_002947 | = 5744356 | 30 (1.050) | coding (1565/2451 nt) | glgP | glycogen phosphorylase |
GCCAGGTTCGTTGCGTATGGCCTGGTACAGTGCAACGGTGTGCATCAGGTTGAGCAACTGGCGCTTGTATTCGTGAATACGTTTAACCTGAACGTCGAATAGCGCCTCGGGGTTGACCGTGACGCCGATGCGATCCTGAATGATGCTGGCCAGGGCGCGCTTGCTGTGCAGCCGCTGGGCAGCGAACTGTTTGCGGAACCCGGGTTTGTCGGCGAACGGCACCAGGCCCGCCAGAAGCGTCTGCGGGTCGTCCTTGAGTTCCGGCCCAAGCGCCTCGACCAGCATGTCGGTCAG > NC_002947/5744178‑5744471 | gCCAGGTTCGTTGCGTATGGCCTGGTACAGTGCAACGGTGTGCATCAGGTTGAGCAACTGGCGCTTGTATTCGTGAATACGTTTAACCTGAACGTCGAATAGCGCCTCGGGGTTGACCGTGACGCCGATGCGATCCTGAATGATGCTGGc > 2:15455/1‑150 (MQ=255) ccAGGTTCGTTGCGTATGGCCTGGTACAGTGCAACGGTGTGCATCAGGTTGAGCAACTGGCGCTTGTATTCGTGAATACGTTTAACCTGAACGTCGAATAGCGCCTCGGGGTTGACCGTGACGCCGATGCGATCCTGAATGATGCTGGcc > 1:597974/1‑150 (MQ=255) ttGCGTATGGCCTGGTACAGTGCAACGGTGTGCATCAGGTTGAGCAACTGGCGCTTGTATTCGTGAATACGTTTAACCTGAACGTCGAATAGCGCCTCGGGGTTGACCGTGACGCCGATGCGATCCTGAATGATGCTGcccagcggctgc > 2:403450‑M1/1‑138 (MQ=255) cGTATGGCCTGGTACAGTGCAACGGTGTGCATCAGGTTGAGCAACTGGCGCTTGTATTCGTGAATACGTTTAACCTGAACGTCGAATAGCGCCTCGGGGTTGACCGTGACGCCGATGCGATCCTGAATGATGCTGGCCAGGGCGCGCTTg < 1:742051/150‑1 (MQ=255) gTATGGCCTGGTACAGTGCAACGGTGTGCATCAGGTTGAGCAACTGGCGCTTGTATTCGTGAATACGTTTAACCTGAACGTCGAATAGCGCCTCGGGGTTGACCGTGACGCCGATGCGATCCTGAATGATGCTGGCCAGGGCGCGCTTGc > 1:260542/1‑150 (MQ=255) gCCTGGTACAGTGCAACGGTGTGCATCAGGTTGAGCAACTGGCGCTTGTATTCGTGAATACGTTTAACCTGAACGTCGAATAGCGCCTCGGGGTTGACCGTGACGCCGATGCGATCCTGAATGATGCTGGCCAGGGCGCGCTTGCTGTGc > 2:93921/1‑150 (MQ=255) ccTGGTACAGTGCAACGGTGTGCATCAGGTTGAGCAACTGGCGCTTGTATTCGTGAATACGTTTAACCTGAACGTCGAATAGCGCCTCGGGGTTGACCGTGACGCCGATGCGATCCTGAATGATGCTGGCCAGGGCGCGCTTGCTGTGCa > 2:388286/1‑150 (MQ=255) ccTGGTACAGTGCAACGGTGTGCATCAGGTTGAGCAACTGGCGCTTGTATTCGTGAATACGTTTAACCTGAACGTCGAATAGCGCCTCGGGGTTGACCGTGACGCCGATGCGATCCTGAATGATGCTGGCCAGGGCGCGCTTGCTGTGCa < 1:93921/150‑1 (MQ=255) cGGTGTGCATCAGGTTGAGCAACTGGCGCTTGTATTCGTGAATACGTTTAACCTGAACGTCGAATAGCGCCTCGGGGTTGACCGTGACGCCGATGCGATCCTGAATGATGCTGcccagcggctgcacagcaagcgcgccctggccagcat < 1:403450‑M1/150‑38 (MQ=255) gtgtGCATCAGGTTGAGCAACTGGCGCTTGTATTCGTGAATACGTTTAACCTGAACGTCGAATAGCGCCTCGGGGTTGACCGTGACGCCGATGCGATCCTGAATGATGCTGGCCAGGGCGCGCTTGCt > 2:333635/1‑128 (MQ=255) gtgtGCATCAGGTTGAGCAACTGGCGCTTGTATTCGTGAATACGTTTAACCTGAACGTCGAATAGCGCCTCGGGGTTGACCGTGACGCCGATGCGATCCTGAATGATGCTGGCCAGGGCGCGCTTGCt < 1:333635/128‑1 (MQ=255) aTCAGGTTGAGCAACTGGCGCTTGTATTCGTGAATACGTTTAACCTGAACGTCGAATAGCGCCTCGGGGTTGACCGTGACGCCGATGCGATCCTGAATGATGCTGGCCAGGGCGCGCTTGCTGTGCAGCCGCTGGGCAGCGAACTGTTTg > 1:757924/1‑150 (MQ=255) tCAGGTTGAGCAACTGGCGCTTGTATTCGTGAATACGTTTAACCTGAACGTCGAATAGCGCCTCGGGGTTGACCGTGACGCCGATGCGATCCTGAATGATGCTGGCCAGGGCGCGCTTGCTGTGCAGCCGCTGGGCAGCGAACTGTTTGc > 1:656254/1‑150 (MQ=255) cAGGTTGAGCAACTGGCGCTTGTATTCGTGAATAAGTTTAACCTGAACGTCGAATAGCGCCTCGGGGTTGACCGTGACGCCGATGCGATCCTGAATGATGCTGGCCAGGGCGCGCTTGCTGTGCAGCCGTTGGGCAGCGAACTGTTTGCg < 2:281375/150‑1 (MQ=255) gTTGAGCAACTGGCGCTTGTATTCGTGAATACGTTTAACCTGAACGTCGAATAGCGCCTCGGGGTTGACCGTGACGCCGATGCGATCCTGAATGATGCTGGCCAGGGCGCGCTTGCTGTGCAGCCGCTGGGCAGCGAACTGTTTGCGGaa > 1:154532/1‑150 (MQ=255) ttGAGCAACTGGCGCTTGTATTCGTGAATACGTTTAACCTGAACGTCGAATAGCGCCTCGGGGTTGACCGTGACGCCGATGCGATCCTGAATGATGCTGGCCAGGGCGCGCTTGCTGTGCAGCCGCTGGGCAGCGAACTGTTTGCGGAAc < 2:689055/150‑1 (MQ=255) gCAACTGGCGCTTGTATTCGTGAATACGTTTAACCTGAACGTCGAATAGCGCCTCGGGGTTGACCGTGACGCCGATGCGATCCTGAATGATGCTGGCCAGGGCGCGCTTGCTGTGCAGCCGCTGGGCAGCGAACTGTTTGCGGAACCCgg < 1:15455/150‑1 (MQ=255) cTTGTATTCGTGAATACGTTTAACCTGAACGTCGAATAGCGCCTCGGGGTTGACCGTGACGCCGATGCGATCCTGAATGATGCTGGCCAGGGCGCGCTTGCTGTGCAGCCGCTGGGCAGCGAACTGTTTGCGGAACCCGGGTTTGTCGGc > 2:203831/1‑150 (MQ=255) ttGTATTCGTGAATACGTTTAACCTGAACGTCGAATAGCGCCTCGGGGTTGACCGTGACGCCGATGCGATCCTGAATGATGCTGGCCAGGGCGCGCTTGCtgtg < 2:554439/104‑1 (MQ=255) ttGTATTCGTGAATACGTTTAACCTGAACGTCGAATAGCGCCTCGGGGTTGACCGTGACGCCGATGCGATCCTGAATGATGCTGGCCAGGGCGCGCTTGCtgtg > 1:554439/1‑104 (MQ=255) ttGTATTCGTGAATACGTTTAACCTGAACGTCGAATAGCGCCTCGGGGTTGACCGTGACGCCGATGCGATCCTGAATGATGCTGGCCAGGGCGCGCTTGCTGTGCAGCCGCTGGGCAGCGAACTGTTTGCGGAACCCGGGTTTGTCGGCg > 1:336427/1‑150 (MQ=255) tATTCGTGAATACGTTTAACCTGAACGTCGAATAGCGCCTCGGGGTTGACCGTGACGCCGATGCGATCCTGAATGATGCTGGCCAGGGCGCGCTTGCTGTGCAGCCGCTGGGCAGCGAACTGTTTGCGGAACCCGGGTTTGTCGGCGAAc < 1:754103/150‑1 (MQ=255) tACGTTTAACCTGAACGTCGAATAGCGCCTCGGGGTTGACCGTGACGCCGATGCGATCCTGAATGATGCTGGCCAGGGCGCGCTTGCtgt > 2:542850/1‑90 (MQ=255) tACGTTTAACCTGAACGTCGAATAGCGCCTCGGGGTTGACCGTCACGCCGATGCGATCCTGAATGATGCTGGCCAGGGCGCGCTTGCtgt < 1:542850/90‑1 (MQ=255) aCCTGAACGTCGAATAGCGCCTCGGGGTTGACCGTGACGCCGATGCGATCCTGAATGATGCTGcccagcggctgcacagcaagcgcgccctggccagcatcattcagg < 1:458387‑M1/108‑46 (MQ=255) aCCTGAACGTCGAATAGCGCCTCGGGGTTGACCGTGACGCCGATGCGATCCTGAATGATGCTGcccagcggctgcacagcaagcgcgccctggccagcatcattcagg > 2:458387‑M1/1‑63 (MQ=255) ccTGAACGTCGAATAGCGCCTCGGGGTTGACCGTGACGCCGATGCGATCCTGAATGATGCTGGCCAGGGCGCGCTTGCTGTGCAGCCGCTGGGCAGCGAACTGTTTGCGGAACCCGGGTTTGTCGGCGAACGGCACCAGGCCCGCCAGaa < 1:531177/150‑1 (MQ=255) ccTGAACGTCGAATAGCGCCTCGGGGTTGACCGTGACGCCGATGCGATCCTGAATGATGCTGGCCAGGGCGCGCTTGCTGTGCAGCCGCTGGGCAGCGAACTGTTTGCGGAACCCGGGTTTGTCGGCGAACGGCACCAGGCCCGCCAGaa < 2:165885/150‑1 (MQ=255) ccTGAACGTCGAATAGCGCCTCGGGGTTGACCGTGACGCCGATGCGATCCTGAATGATGCTGGCCAGGGCGCGCTTGCTGTGCAGCCGCTGGGCAGCGAACTGTTTGCGGAACCCGGGTTTGTCGGCGAACGGCACCAGGCCCGCCAGaa < 2:656254/150‑1 (MQ=255) tCGAATAGCGCCTCGGGGTTGACCGTGACGCCGATGCGATCCTGAATGATGCTGGCCAGGGCGCGCTTGCTGTGCAGCCGCTGGGCAGCGAACTGTTTGCGGAACCCGGGTTTGTCGGCGAACGGCACCAGGCCCGCCAGAAGCGTCTGc < 2:260542/150‑1 (MQ=255) aaTAGCGCCTCGGGGTTGACCGTGACGCCGATGCGATCCTGAATGATGCTGGCCAGGGCGCGCTTGCTGTGCAGCCGCTGGGCAGCGAACTGTTTGCGGAACCCGGGTTTGTCGGCGAACGGCACCAGGCCCGCCAGAAGCGTCTGCggg < 1:203831/150‑1 (MQ=255) aaTAGCGCCTCGGGGTTGACCGTGACGCCGATGCGATCCTGAATGATGCTGGCCAGGGCGCGCTTGCTGTGCAGCCGCTGGGCAGCGAACTGTTTGCGGAACCCGGGTTTGTCGGCGAACGGCACCAGGCCCGCCAGAAGCGTCTGCggg > 1:22894/1‑150 (MQ=255) cTCGGGGTTGACCGTGACGCCGATGCGATCCTGAATGATGCTGGCCAGGGCGCGCTTGCTGTGCAGCCGCTGGGCAGCGAACTGTTTGCGGAACCCGGGTTTGTCGGCGAACGGCACCAGGCCCGCCAAAAGCGTCTCCGGCTCGTCCtt > 2:125268/1‑150 (MQ=255) cGGGGTTGACCGTGACGCCGATGCGATCCTGAATGATGCTGGCCAGGGCGCGCTTGCTGTGCAGCCGCTGGGCAGCGAACTGTTTGCGGAACCCGGGTTTGTCGGCGAACGGCACCAGGCCCGCCAGAAGCGTCTGCGGGTCGTCCTTGa < 1:200590/150‑1 (MQ=255) aCCGTGACGCCGATGCGATCCTGAATGATGCTGGCCAGGGCGCGCTTGCTGTGCAGCCGCTGGGCAGCGAACTGTTTGCAGAACCCGGGTTTGTCGGCGAACGGCACCAGGCCCGCCAGAAGCGTCTGCGGGTCGTCCTTGAGTTCCGGc < 2:757924/150‑1 (MQ=255) ccGTGACGCCGATGCGATCCTGAATGATGCTGGCCAGGGCGCGCTTGCTGTGCAGCCGCTGGGCAGCGAACTGTTAACCCAATACGGGTTTGGCGGCGAACGGCCCCAAGACCGCAAGAAGCAACTGCGGGGCGTTCTTTAGTTCCGGcc > 1:536186/1‑150 (MQ=255) gACGCCGATGCGATCCTGAATGATGCTGGCCAGGGCGCGCTTGCTGTGCAGCCGCTGGGCAGCGAACTGTTTGCGGAACCCGGGTTTGTCGGCGAACGGCACCAGGCCCGCCAGAAGCGTCTGCGGGTCGTCCTTGAGTTCCGGCCCAAg > 1:6086/1‑150 (MQ=255) tCCTGAATGATGCTGGCCAGGGCGCGCTTGCTGTGCAGCCGCTGGGCAGCGAACTGTTTGCGGAACCCGGGTTTGTCGGCGAACGGCACCAGGCCCGCCAGAAGCGTCTGCGGGTCGTCCTTGAGTTCCGGCCCAAGCGCCTCGACCAGc < 2:22894/150‑1 (MQ=255) ccTGAATGATGCTGGCCAGGGCGCGCTTGCTGTGCAGCCGCTGGGcagcatcattcaggatcgcatcggcgtcacggtcaaccccgaggcgctattcgacgttcaggt > 2:458387‑M2/1‑45 (MQ=255) ccTGAATGATGCTGGCCAGGGCGCGCTTGCTGTGCAGCCGCTGGGcagcatcattcaggatcgcatcggcgtcacggtcaaccccgaggcgctattcgacgttcaggt < 1:458387‑M2/108‑64 (MQ=255) cTGAATGATGCTGGCCAGGGCGCGCTTGCTGTGCAGCCGCTGGGCAGCGAACTGTTTGCGGAACCCGGGTTTGTCGGCGAACGGCACCAGGCCCGCCAGAAGCGTCTGCGGGTCGTCCTTGAGTTCCGGCCCAAGCGCCTCGACCAGCAt < 2:154532/150‑1 (MQ=255) tGAATGATGCTGGCCAGGGCGCGCTTGCTGTGCAGCCGCTGGGCAGCGAACTGTTTGCGGAACCCGGGTTTGTCGGCGAACGGCACCAGGCCCGCCAGAAGCGTCTGCGGGTCGTCCTTGAGTTCCGGCCCAAGCGCCTCGACCAGCATg > 1:745127/1‑150 (MQ=255) tGAATGATGCTGGCCAGGGCGCGCTTGCTGTGCAGCCGCTGGGCAGCGAACTGTTTGCGGAACCCGGGTTTGTCGGCGAACGGCACCAGGCCCGCCAGAAGCGTCTGCGGGTCGTCCTTGAGTTCCGGCCCAAGCGCCTCGACCAGCATg > 2:703175/1‑150 (MQ=255) atgatgCTGGCCAGGGCGCGCTTGCTGTGCAGCCGCTGGGCAGCGAACTGTTTGCGGAACCCGGGTTTGTCGGCGAACGGCACCAGGCCCGCCAGAAGCGTCTGCGGGTCGTCCTTGAGTTCCGGCCCAAGCGCCTCGACCAGCATGTCg < 2:336427/150‑1 (MQ=255) atgCTGGCCAGGGCGCGCTTGCTGTGCAGCCGCTGGGcagcatcattcaggatcgcatcggcgtcacggtcaaccccgaggcgctattcgacgttcaggttaaacgtattcacgaatacaagcgccagttgctcaacctgatgcacaccg < 1:403450‑M2/150‑114 (MQ=255) gCTGGCCAGGGCGCGCTTGCTGTGCAGCCGCTGGGCAGCGAACTGTTTGCGGAACCCGGGTTTGTCGGCGAACGGCACCAGGCCCGCCAGAAGCGTCTGCGGGTCGTCCTTGAGTTCCGGCCCAAGCGCCTCGACCAGCATGTCGGTCAg > 1:422056/1‑150 (MQ=255) | GCCAGGTTCGTTGCGTATGGCCTGGTACAGTGCAACGGTGTGCATCAGGTTGAGCAACTGGCGCTTGTATTCGTGAATACGTTTAACCTGAACGTCGAATAGCGCCTCGGGGTTGACCGTGACGCCGATGCGATCCTGAATGATGCTGGCCAGGGCGCGCTTGCTGTGCAGCCGCTGGGCAGCGAACTGTTTGCGGAACCCGGGTTTGTCGGCGAACGGCACCAGGCCCGCCAGAAGCGTCTGCGGGTCGTCCTTGAGTTCCGGCCCAAGCGCCTCGACCAGCATGTCGGTCAG > NC_002947/5744178‑5744471 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |