New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 675401 = | 43 (1.460) | 3 (0.110) | 3/224 | NT | 7.2% | coding (301/696 nt) | PP_0577 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 675451 = | 38 (1.410) | coding (251/696 nt) | PP_0577 | hypothetical protein |
TTTTCCAGGCGCATATCGGCGCTCACCAGCAAGTCGCCAGGGCCTGCGCGAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAGCACTGGCGTCGAAGGTGGTGGCCGCCTGGGCGGGGGCCGGTGGTAACGGGCGGCTGCTGGCCACATACGGGTTGCTGCCCTGGCAGCCAGCCAGG > NC_002947/675307‑675600 | ttttCCCGCCACATATCGGCGGCGACGATCAAGTCGCGAGGGCCTGCGCGAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTgcgc < 2:568685/150‑1 (MQ=255) tttCCAGGCGCATATCGGCGCTCACCAGCAAGTCGCCAGGGCCTGCGCGAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGcc > 2:112399/1‑150 (MQ=255) aGGCGCATATCGGCGCTCACCAGCAAGTCGCCAGGGCCTGCGCGAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGccagctc > 1:584363/1‑150 (MQ=255) aGGCGCATATCGGCGCTCACCAGCAAGTCGCCAGGGCCTGCGCGAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGCCAACTGGCCGTTGCGccagcgc > 2:750343/1‑148 (MQ=255) gcgcATATCGGCGCTCACCAGCAAGTCGCCAGGGCCTGCGCGAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTgcgc < 2:614160/142‑1 (MQ=255) gcgcATATCGGCGCTCACCAGCAAGTCGCCAGGGCCTGCGCGAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTgcgc > 1:614160/1‑142 (MQ=255) gcATATCGGCGCTCACCAGCAAGTCGCCAGGGCCTGCGCGAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGccagctccagc > 1:322301/1‑150 (MQ=255) gcATATCGGCGCTCACCAGCAAGTCGCCAGGGCCTGCGCGAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAAATGGCCGTTGCGccagctccagc > 1:39536/1‑150 (MQ=255) tCGGCGCTCACCAGCAAGTCGCCAGGGCCTGCGCGAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCgg < 1:159452/150‑1 (MQ=255) GCGCTCACCAGCAAGTCGCCAGGGCCTGCGCGAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAg < 1:383502‑M1/150‑1 (MQ=255) CGCTCACCAGCAAGTCGCCAGGGCCTGCGCGAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGt > 2:657459‑M1/1‑150 (MQ=255) ctcgaccagcatggcctgcgcccctctcgcgcaggccctggcgacttgctggtgagcgcACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGc > 1:466147‑M2/60‑150 (MQ=255) CTCACCAGCAAGTCGCCAGGGCCTGCGCGAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGc > 1:248604‑M1/1‑150 (MQ=255) tcgaccagcatggcctgcgcccctctcgcgcaggccctggcgacttgctggtgagcgcACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGcc > 1:396211‑M2/59‑150 (MQ=255) ccAGCAAGTCGCCAGGGCCTGCGCGAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCAt > 1:514821/1‑150 (MQ=255) catggcctgcgcccctctcgcgcaggccctggcgacttgctggtgagcgcACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATGATCa < 2:396211‑M2/100‑1 (MQ=255) aaGTCGCCAGGGCCTGCGCGAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCa < 2:198349/150‑1 (MQ=255) aaGTCGCCAGGGCCTGCGCGAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCa < 2:584363/150‑1 (MQ=255) tCGCCAGGGCCTGCGCGAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGa > 1:114688/1‑150 (MQ=255) ccAGGGCCTGCGCGAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCg < 2:322301/150‑1 (MQ=255) cagacccTGCGCTAAAGGGGCTCAGGCCATGTTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCATCTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCgg < 2:310222/145‑1 (MQ=255) cAGGGCCTGCGCGAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCgg > 1:352326/1‑150 (MQ=255) tGCGCGAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAAATGGCTGTTTCACCAGGGCCAGCTTCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAgg > 1:776322/1‑150 (MQ=255) gagGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAGCa > 1:408354/1‑150 (MQ=255) gggCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAGCACTg > 1:11985/1‑150 (MQ=255) tGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAGCACTGGCGTCGAAggtg < 2:514821/150‑1 (MQ=255) gCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCgg < 1:155953/120‑1 (MQ=255) gCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCgg > 2:155953/1‑120 (MQ=255) tggtggAGCTCTCTGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCAGCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAGCACTGGCGTCGAAGgtggtg < 2:246766/150‑1 (MQ=255) tGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAGCACTGGCGTCGAAg < 2:274372/144‑1 (MQ=255) tGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAGCACTGGCGTCGAAg > 1:274372/1‑144 (MQ=255) tGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCAGTTGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAGCACTGGCGTCGAAGgtggtg > 1:336730/1‑150 (MQ=255) tCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAGCACTGGCGTCGAAGGTGGTGgcc < 2:352326/150‑1 (MQ=255) gcgcACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAGCACTGGCGTCGAAggtg > 2:33480‑M2/5‑140 (MQ=255) gcgcACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAGCACTGGCGTCGAAggtg < 1:33480‑M2/136‑1 (MQ=255) gcACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAGCACTGGCGTCGAAGGTGGTGGCCGCCTgg < 2:11985‑M2/148‑1 (MQ=255) cGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACg > 2:642305/1‑100 (MQ=255) cGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACg < 1:642305/100‑1 (MQ=255) cTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAGCACTGGCGTCGAAGGTGGTGGCCGCCTGGGCgggg > 1:405076/1‑150 (MQ=255) tGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTGGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAGCACTGGCGTCGAAGGTGGTGGCCGCCTGGGCggggg > 2:232642/1‑150 (MQ=255) gACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAGCACTGGCGTCGAAGGTGGTGGCCGCCTGGGCGGGGGc < 1:232642/150‑1 (MQ=255) ccGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAGCACTGGCGTCGAAGGTGGTGGCCGCCTGGGCGGGGGcc > 2:71554/2‑150 (MQ=255) ggCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAg < 1:174879/95‑1 (MQ=255) ggCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAg > 2:174879/1‑95 (MQ=255) tCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAGCACTTGCGTCGAAGGTGGTGGCCGCCGGGGCGGGGGCCggtggt > 1:638397/1‑150 (MQ=255) GGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAAt < 1:687064‑M1/83‑1 (MQ=255) GGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAAt > 2:687064‑M1/1‑83 (MQ=255) GCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGGGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAGCACTGGCGTCGAAGGTCGTGGCGGCCTGGGCGGGGGCCGGGGGTAAc < 1:440822‑M1/150‑1 (MQ=255) ccagttgcccagcggcactgtcgatgccgacccggcgcaactggccgTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAGCACTGGCGTCGAAGGTGGTGGCCGCCTGGGCGGGGGCCGGTGGTAACg > 1:176814‑M2/48‑150 (MQ=255) GCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGTGCGGGCGCAGGGTAAGCACTGGCGTCGAAGGTGGTGGCCGCCTGGGCGGGGGCCGGTGGTAACGggcggc > 2:364552‑M1/1‑150 (MQ=255) cccagcggcactgtcgatgccgacccggcgcaactggccgTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAGCACt > 2:594490‑M2/41‑99 (MQ=255) cccagcggcactgtcgatgccgacccggcgcaactggccgTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAGCACt < 1:594490‑M2/59‑1 (MQ=255) gggTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAGCACTGGCGTCGAAGGTGGTGGCCGCCTGGGCGGGGGCCGGTGGTAACGGGCGGctgctg < 1:643786/150‑1 (MQ=255) aCAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAGCACTGGCGTCGAAGGTGGTGGCCGCCTGGGCGGGGGCCGGTGGTAACGGGCGGCTGCTGGCCACATACggg > 2:41479/1‑150 (MQ=255) cTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAGCACTGGCGTCGAAGGTGGTGGCCGCCTGGGCGGGGGCCGGTGGTAACGGGCGGCTGCTGGCCACATACGGGTTGCTGccc < 2:405076/150‑1 (MQ=255) aactggccgTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAGCACTGGCGTCGAAGGTGGTGGCCGCCTGGGCGGGGGCCGGTGGTAACGGGCGGCTGCTGGCCACATACGGGTTGCTGCCCTGGcag < 2:466147‑M2/141‑1 (MQ=255) tggccgTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAGCACTGGCGTCGAAggtg > 1:728466‑M2/7‑78 (MQ=255) tggccgTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAGCACTGGCGTCGAAggtg < 2:728466‑M2/72‑1 (MQ=255) ttGCGCCAGCTCCCGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAGCACTGGCGTCGAAGGTGGTGGCCGCCTGGGCGGGGGCCGGTGGTAACGGGCGGCTGCTGGCCATATACGGGTTGCTGCCCTGGCAGCCAGCCAgg < 1:104750/150‑1 (MQ=255) | TTTTCCAGGCGCATATCGGCGCTCACCAGCAAGTCGCCAGGGCCTGCGCGAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAGCACTGGCGTCGAAGGTGGTGGCCGCCTGGGCGGGGGCCGGTGGTAACGGGCGGCTGCTGGCCACATACGGGTTGCTGCCCTGGCAGCCAGCCAGG > NC_002947/675307‑675600 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |