| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 911026 = | 43 (1.460) | 4 (0.140) | 4/238 | NT | 9.3% | coding (1531/2853 nt) | fruB | PTS fructose transporter subunit EI/HPr/IIA |
| ? | NC_002947 | 911059 = | 36 (1.260) | coding (1564/2853 nt) | fruB | PTS fructose transporter subunit EI/HPr/IIA | |||||
ACCCGGCCCTGACCGATGATGTCGAACAGCGCCTGGCCCAGGGCGAAAGCGCTGCGGCCGCGTGGATGGCCGTGATCGAAGCTGCGGCCCGTCAGCAAGAGGCGTTGCACGATGCGCTGCTCGCCGAGCGCGC‑CGCCGACCTGCGCGATATTGGCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTTGTGTGGTGTGCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAG > NC_002947/910913‑911208 | aCCCGGCCCTGACCGATGATGTCGAACAGCGCCTGGCCCAGGGCGAAAGCGCTGCGGCCGCGTGGATGGCCGTGATCGAAGCTGCGGCCCGTCAGCAAGAGGCGTTGCACGATGCGCTGCTCGCCGAGCGCGC‑CGCCGACCTGCGCGata < 1:397676/150‑1 (MQ=255) ccTGACCGATGATGTCGAACAGCGCCTGGCCCAGGGCGAAAGCGCTGCGGCCGCGTGGATGGCCGTGATCGAAGCTGCGGCCCGTCAGCAAGAGGCGTTGCACGATGCGCTGCTCGCCGAGCGCGC‑CGCCGACCTGCGCGATATTGgccg > 1:392674/1‑150 (MQ=255) ccTGACCGATGATGTCGAACAGCGCCTGGCCCAGGGCGAAAGCGCTGCGGCCGCGTGGATGGCCGTGATCGAAGCTGCGGCCCGTCAGCAAGAGGCGTTGCACGATGCGCTGCTCGCCGAGCGCGC‑CGCCGACCTGCGCGATATTGgccg > 2:39013/1‑150 (MQ=255) cTGACCGATGATGTCGAACAGCGCCTGGCCCAGGGCGAAAGCGCTGCGGCCGCGTGGATGGCCGTGATCGAAGCTGCGGCCCGTCAGCAAGAGGCGTTGCACGATGCGCTGCTCGCCGAGCGCGC‑CGCCGACCTGCGCGATATTGgccgc > 2:408110/1‑150 (MQ=255) aCCGATGATGTCGAACAGCGCCTGGCCCAGGGCGAAAGCGCTGCGGCCGCGTGGATGGCCGTGATCGAAGCTGCGGCCCGTCAGCAAGAGGCGTTGCACGATGCGCTGCTCGCCGAGCGCGC‑CGCCGACCTGCGCGATATTGGCcgccgc < 1:92656/150‑1 (MQ=255) gTCGAACAGCGCCTGGCCCAGGGCGAAAGCGCTGCGGCCGCGTGGATGGCCGTGATCGAAGCTGCGGCCCGTCAGCAAGAGGCGTTGCACGATGCGCTGCTCGCCGAGCGCGC‑CGCCGACCTGCGCGATATTGGCCGCCGCGTGCTGgcg > 2:536047/1‑150 (MQ=255) gTCGAACAGCGACTGGCCCAGGGCGAAAGCGCTGCGGCCGCATGGATGGCCGTGATCGAAGCTGCGGACCGTCAGCAAGAGGCGTTGCACGATGCGCTGCTCGCCGAGCGCGC‑CGCCGACCTGCGCGATATTAGCCGCCGCGTGCTGgcg > 2:96626/1‑150 (MQ=255) gcCTGGCCCAGGGCGAAAGCGCTGCGGCCGCGTGGATGGCCGTGATCGAAGCTGCGGCCCGTCAGCAAGAGGCGTTGCACGATGCGCTGCTCGCCGAGCGCGC‑CGCCGACCTGCGCGat > 2:460151/1‑119 (MQ=255) gcCTGGCCCAGGGCGAAAGCGCTGCGGCCGCGTGGATGGCCGTGATCGAAGCTGCGGCCCGTCAGCAAGAGGCGTTGCACGATGCGCTGCTCGCCGAGCGCGC‑CGCCGACCTGCGCGat < 1:460151/119‑1 (MQ=255) gcCTGGCCCAGGGCGAAAGCGCTGCGGCCGCGTGGATGGCCGTGATCGAAGCTGCGGCCCGTCAGCAAGAGGCGTTGCACGATGCGCTGCTCGCCGAGCGCGC‑CGCCGACCTGCGCGATATTGGCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTtgtgtg < 2:631346/150‑1 (MQ=255) tcatcaccagcacatagggttgctcgggttcaacctgcgcctgcacaccacacaactgcgccagcacgcggcggccaatatcgcgctgctcgccgagcgcgccgccgacctgcgcGATAtt > 1:317253‑M2/116‑121 (MQ=255) tcatcaccagcacatagggttgctcgggttcaacctgcgcctgcacaccacacaactgcgccagcacgcggcggccaatatcgcgctgctcgccgagcgcgccgccgacctgcgcGATAtt < 2:317253‑M2/6‑1 (MQ=255) cTGGCCCAGGGCGAAAGCGCTGCGGCCGCGTGGATGGCCGTGATCGAAGCTGCGGCCCGTCAGCAAGAGGCGTTGCACGATGCGCTGCTCGCCGAGCGCGC‑CGCCGACCTGCGCAATATTGGCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTTgtgtggt < 1:63259/150‑1 (MQ=255) ggCCCAGGGCGAAAGCGCTGCGGCCGCGTGGATGGCCGTGATCGAAGCTGCGGCCCGTCAGCAAGAGGCGTTGCACGATGCGCTGCTCGCCGAGCGCGC‑CGCCGACCTGCGCGATATTGGCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTTgtgtggtgt < 1:39013/150‑1 (MQ=255) ccAGGGCGAAAGCGCTGCGGCCGCGTGGATGGCCGTGATCGAAGCTGCGGCCCGTCAGCAAGAGGCGTTGCACGATGCGCTGCTCGCCGAGCGCGC‑CGCCGACCTGCGCGATATTGGCCGCCGCGTGCTGGCGCCGTTGTGTGGTGTGCa > 1:213452/1‑150 (MQ=255) ccAGGGCGAAAGCGCTGCGGCCGCGTGGATGGCCGTGATCGAAGCTGCGGCCCGTCAGCAAGAGGCGTTGCACGATGCGCTGCTCGCCGAGCGCGC‑CGCCGACCTGCGCGATATTGGCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTTGTGTGGTGTGCa > 2:525343/1‑150 (MQ=255) ccAGGGCGAAAGCGCTGCGGCCGCGTGGATGGCCGTGATCGAAGCTGCGGCCCGTCAGCAAGAGGCGTTGCACGATGCGCTGCTCGCCGAGCGCGC‑CGCCGACCTGCGCGATATTGGCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTTGTGTGGTGTGCa > 2:405530/1‑150 (MQ=255) aGGGCGAAAGCGCTGCGGCCGCGTGGATGGCCGTGATCGAAGCTGCGGCCCGTCAGCAAGAGGCGTTGCACGATGCGCTGCTCGCCGAGCGCGC‑CGCCGACCTGCGCGATATTGGCCGCCGCGTGCTGGCGTAGTTGTGTGGTGTGCAgg > 2:415024/1‑150 (MQ=255) aGGGCGAAAGCGCTGCGGCCGCGTGGATGGCCGTGATCGAAGCTGCGGCCCGTCAGCAAGAGGCGTTGCACGATGCGCTGCTCGCCGAGCGCGC‑CGCCGACCTGCGCGATATTGGCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTTGTGTGGTGTGCAgg < 1:405530/150‑1 (MQ=255) gAAAGCGCTGCGGCCGCGTGGATGGCCGTGATCGAAGCTGCGGCCCGTCAGCAAGAGGCGTTGCACGATGCGCTGCTCGCCGAGCGCGC‑CGCCGACCTGCGCGATATTGGCCGCCGCGTGCTGGCGTAGTTGTGTGGTGTGCAGGCGCAg < 1:415024/150‑1 (MQ=255) gAAAGCGCTGCGGCCGCGTGGATGGCCGTGATCGAAGCTGCGGCCCGTCAGCAAGAGGCGTTGCACGATGCGCTGCTCGCCGAGCGCGC‑CGCCGACCTGCGCGATATTGGCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTTGTGTGGTGTGCAGGCGCAg < 2:105594/150‑1 (MQ=255) gcTGCGGCCGCGTGGATGGCCGTGATCGAAGCTGCGGCCCGTCAGCAAGAGGCGTTGCACGATGCGCTGCTCGCCGAGCGCGC‑CGCCGACCTGCGCGATATTGGCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTTgtgtggt > 1:125601/1‑132 (MQ=255) gcTGCGGCCGCGTGGATGGCCGTGATCGAAGCTGCGGCCCGTCAGCAAGAGGCGTTGCACGATGCGCTGCTCGCCGAGCGCGC‑CGCCGACCTGCGCGATATTGGCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTTgtgtggt < 2:125601/132‑1 (MQ=255) ccgCGGCCGCGTGGATGGCCGTGATCGAAGCTGCGTCCCGTCAGCAAGAGGCGTTGCACGATGCGCTGCTCGCCGAGCGTCC‑TGCCGACCTGCGCGATATTGGCCGCCGCGTGTTGCCGCAGTTGTGTTGTGTGCAGGCGCAGGTTGAAc < 1:525343/148‑1 (MQ=255) gTGATCGAAGCTGCGGCCCGTCAGCAAGAGGCGTTGCACGATGCGCTGCTCGCCGAGCGCGC‑CGCCGACCTGCGCGATATTGGCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTTGTGTGGTGTGCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTg > 2:384653/1‑150 (MQ=255) gTGATCGAAGCTGCGGCCCGTCAGCAAGAGGCGTTGCACGATGCGCTGCTCGCCGAGCGCGC‑CGCCGACCTGCGCGATATTGGCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTTGTGTGGTATGCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTg < 1:239778/150‑1 (MQ=255) tCGAAGCTGCGGCCCGTCAGCAAGAGGCGTTGCACGATGCGCTGCTCGCCGAGCGCGC‑CGCCGACCTGCGCGATATTGGCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTtgtgtg > 1:520752/1‑105 (MQ=255) tCGAAGCTGCGGCCCGTCAGCAAGAGGCGTTGCACGATGCGCTGCTCGCCGAGCGCGC‑CGCCGACCTGCGCGATATTGGCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTtgtgtg < 2:520752/105‑1 (MQ=255) gAAGCTGCGGCCCGTCAGCAAGAGGCGTTGCACGATGCGCTGCTCGCCGAGCGCGC‑CGCCGACCTGCGCGATATTGGCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTTGTGTGGTGTGCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGtgatg > 2:120648/1‑150 (MQ=255) gAAGCTGCGGCCCGTCAGCAAGAGGCGTTGCACGATGCGCTGCTCGCCGAGCGCGC‑CGCCGACCTGCGCGATATTGGCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTTGTGTGGTGTGCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGtgatg > 1:752219/1‑150 (MQ=255) ccGTCAGCAAGAGGCGTTGCACGATGCGCTGCTCGCCGAGCGCGC‑CGCCGACCTGCGCGATATTGGCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTTgtgtggt < 2:344422/94‑1 (MQ=255) ccGTCAGCAAGAGGCGTTGCACGATGCGCTGCTCGCCGAGCGCGC‑CGCCGACCTGCGCGATATTGGCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTTgtgtggt > 1:344422/1‑94 (MQ=255) gTCAGCAAGAGGCGTTGCACGATGCGCTGCTCGCCGAGCGCGC‑CGCCGACCTGCGCGATATTGGCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTTGTGTGGTGTGCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTc > 2:121365/1‑150 (MQ=255) tCAGCAAGAGGCGTTGCACGATGCGCTGCTCGCCGAGCGCGC‑CGCCGACATACGCGATATTGGCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTTGTGTGGTGTGCAGTCTGAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTcc > 1:743455/1‑150 (MQ=255) aGCAAGAGGCGTTGCACGATGCGCTGCTCGCCGAGCGCGC‑CGCCGACCTGCGCGATATTGGCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTTGTGTGGTGTGCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGACTTCGGtaatc < 2:213452/150‑5 (MQ=255) gagTTGCACGATGCGCTGTTCGCTGAGCGCGC‑CGCCGACCTTCGCGATTTTGGCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTTGCGTGGTGTGCAGGCGAAGGGTCAAACCAAGCAACGCTATGTGCTGTTGATGACCGAAGTCGATCCAGCTGATGTc < 2:112752/148‑1 (MQ=255) gCACGATGCGCTGCTCGCCGAGCGCGC‑CGCCGACCTGCGCGATATTGGCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTTGTGTGGTGTGCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTcgcccg > 1:47494/1‑150 (MQ=255) cACGATGCGCTGCTCGCCGAGCGCGC‑CGCCGACCTGCGCGATATTGGCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTTGTGTGGTGTGCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTcgcccgc > 2:345509/1‑150 (MQ=255) aatatcGCGCAGGTCGGCG‑GCGCGCTCGGCGAGCAGCGCGATATTGGCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTTGTGTGGTGTGCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGtgatga > 1:317253‑M1/7‑121 (MQ=255) aatatcGCGCAGGTCGGCG‑GCGCGCTCGGCGAGCAGCGCGATATTGGCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTTGTGTGGTGTGCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGtgatga < 2:317253‑M1/115‑1 (MQ=255) tGCGCTGCTCGCCGAGCGCGC‑CGCCGACCTGCGCGATATTGGCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTTGTGTGGTGTGCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGa < 1:345509/150‑1 (MQ=255) tGCGCTGCTCGCCGAGCGCGC‑CGCCGACCTGCGCGATATTGGCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTTGTGTGGTGTGCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGa < 2:752219/150‑1 (MQ=255) gcaggtcggcggcgcgctcggcgagcagcgcGATATTGGCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTTGTGTGGTGTGCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAAc > 2:434285‑M2/32‑95 (MQ=255) gcaggtcggcggcgcgctcggcgagcagcgcGATATTGGCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTTGTGTGGTGTGCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAAc < 1:434285‑M2/64‑1 (MQ=255) cgcgc‑CGCCGACCTGCGCGATATTGGCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTTGTGTGGTGTGCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGcc > 1:71618/1‑150 (MQ=255) tGCGCGATATTGGCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTTGTGTGGTGTGCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCg > 2:280899/1‑150 (MQ=255) gcgcGATATTGGCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTTGTGTGGTGTGCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGc < 2:47494‑M2/146‑1 (MQ=255) gATATTGGCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTTGTGTGGTGTGCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCt > 1:683702/1‑113 (MQ=255) gATATTGGCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTTGTGTGGTGTGCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCt < 2:683702/113‑1 (MQ=255) gATATTGGCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTTGTGTGGTGTGCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAg > 2:584096/1‑150 (MQ=255) | ACCCGGCCCTGACCGATGATGTCGAACAGCGCCTGGCCCAGGGCGAAAGCGCTGCGGCCGCGTGGATGGCCGTGATCGAAGCTGCGGCCCGTCAGCAAGAGGCGTTGCACGATGCGCTGCTCGCCGAGCGCGC‑CGCCGACCTGCGCGATATTGGCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTTGTGTGGTGTGCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAG > NC_002947/910913‑911208 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |