New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1875184 | 38 (1.290) | 4 (0.140) | 4/236 | NT | 10.1% | coding (401/567 nt) | PP_1680 | alpha‑ribazole‑5'‑phosphate phosphatase |
? | NC_002947 | = 1875198 | 35 (1.240) | coding (415/567 nt) | PP_1680 | alpha‑ribazole‑5'‑phosphate phosphatase |
GATCATGGAGCACCAGGCCGATGCACTGGGCCGTTTCTGGGCCGACCCTTACGCCTTCACACCGCCCAATGGCGAGCCGGTCGAGGCGTTTGCCGAACGGGTGCTGGCGGCTGTCGAGCGTTTGCGCCTTCAGCATGCCGGCAAGCGCGTGCTGCTGGTGACCCATGGCGGCGTGATGCGGCTGTTACTGGCCCGTGCCCGTGGCTTGCCCAGGGAGCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAG > NC_002947/1875050‑1875341 | gATCATGGAGCACCAGGCCGATGCACTGGGCCGTTTCTGGGCCGACCCTTACGCCTTCACACCGCCCAATGGCGAGCCGGTCGAGGCGTTTGCCGAACGGGTGCTGGCGGCTGTCGAGCGTTTGCGCCTTCAGCATGCCGGCAAGCGCGt > 1:449076‑M2/1‑149 (MQ=255) tGGAGCACCAGGCCGATGCACTGGGCCGTTTCTGGGCCGACCCTTACGCCTTCACACCGCCCAATGGCGAGCCGGTCGAGGCGTTTGCCGAACGGGTGCTGGCGGCTGTCGAGCGTTTGCGCCTTCAGCATGCCGGCAAGCGCGtgctgc > 2:267800/1‑150 (MQ=255) ggAGCACCAGGCCGATGCACTGGGCCGTTTCTGGGCCGACCCTTACGCCTTCACACCGCCCAATGGCGAGCCGGTCGAGGCGTTTGCCGAACGGGTGCTGGCGGCTGTCGAGCGTTTGCGCCTTCAGCATGCCGGCAAGCGCGTgctgct > 1:225830/1‑150 (MQ=255) gCACCAGGCCGATGCACTGGGCCGTTTCTGGGCCGACCCTTACGCCTTCACGCCGCCCAATGGCGAGCCGGTCGAGGCGTTTGCCGAACGGGTGCTGGCGGCTGTCGCGCGTTTGCGCCTTCAGCATGCCGGCAATCGCGTGCTGCTGGt < 2:446406/150‑1 (MQ=255) cAGGCGGATGCACTGGGCCGTTTCTGGGCCGACCCTTACGCCTTCACACCGCCCAATGGCGAGCCGGTCGAGGCGTTTGCCGAACGGGTGCTGGCGGCTGTCGAGCGTTTGCGCCTTCAGCATGCCGGCAAGCGCGTGCTGCTGGTGAcc < 2:14883/150‑1 (MQ=255) cAGGCCGATGCACTGGGCCGTTTCTGGGCCGACCCTTACGCCTTCACACCGCCCAATGGCGAGCCGGTCGAGGCGTTTGCCGAACGGGTGCTGGCGGCTGTCGAGCGTTTGCGCCTTCAGCATGCCGGCAAGCGCGTGCTGCTGGTGAcc > 1:251657/1‑150 (MQ=255) aCTGGGCCGTTTCTGGGCCGACCCTTACGCCTTCACACCGCCCAATGGCGAGCCGGTCGAGGCGTTTGCCGAACGGGTGCTGGCGGCTGTCGAGCGTTTGCGCCTTCAGCATGCCGGCAAGCGCGTGCTGCTGGTGACCCATGGCGGCGt < 2:251657/150‑1 (MQ=255) ccgggCGGTTTCTGAGCCGACCCTTGCGCGGTCACACCGCCCCATGGCGGGCCGGTCGCGGCGTTTGCCGAACGGCGTCTGGCGGCTGTCGAGCGTTTGCGCCTTCCGCATGCCGGTAAGCGCGTGCTGCTGGGGAGCCATGGCGGCGTg < 2:270696/148‑1 (MQ=255) cttttCTGGGCCGACCCTTACGCCTTCACACCGCCCAATGGCGAGCCGGTCGAGGCGTTTGCCGAACGGGTGCTGGCGGCTGTCGAGCGTTTGCGCCCAGATCTTGCCGGCAAGCGCGTGCTGCTGGTGACCCATGGCGGCGTGATGCgg < 1:743432/148‑1 (MQ=255) cGTTTCTGGGCCGACCCTTACGCCTTCACACCGCCCAATGGCGAGCCGGTCGAGCCGTTTGCCGAACGGGTGCTGGCGGCTGTCGAGCGTTTGTGCCTTCAGCATGCCGGCAAGCGGGTGCTGCTGGTGACCCATGTCGGCGTGATGCgg > 2:81715/1‑150 (MQ=255) ttCTGGGCCGACCCTTACGCCTTCACACCGCCCAATGGCGAGCCGGTCGAGGCGTTTGCCGAACGGGTGCTGGCGGCTGTCGAGCGTTTGCGCCTTCAGCATGCCGGCAAGCGCGTGCTGCTGGTGACCCATGGCGGCGTGATTCGGcag > 2:743432/1‑148 (MQ=255) aCCCTTACGCCTTCACACCGCCCAATGGCGAGCCGGTCGAGGCGTTTGCCGAACGGGTGCTGGCGGCTGTCGAGCGTTTGCGCCTTCAGCATGCCGGCAAGCGCGTGCTGCTGGTGACCCATGGCGGCGTGATGCGGCTGTTACTGgccc > 1:533924/1‑150 (MQ=255) ttACGCCTTCACACCGCCCAATGGCGAGCCGGTCGAGGCGTTTGCCGAACGGGTGCTGGCGGCTGTCGAGCGTTTGCGCCTTCAGCATGCCGGCAAGCGCGTGCTGATGCTGACTAATGGCGGCGTGATGCGGCTGTTACTGgcccgtgc > 2:786371/1‑150 (MQ=255) aCGCCTTCACACCGCCCAATGGCGAGCCGGTCGAGGCGTTTGCCGAACGGGTGCTGGCGGCTGACGAGCGTTTGCGCCTTCAGCATGCCGGCAAGCGCGTGCTGCTGGTGACCCATGGCGGCGTGATGCGGCTGTTACTGgcccgtgccc > 2:139201/1‑150 (MQ=255) cGCCTTCACACCGCCCAATGGCGAGCCGGTCGAGGCGTTTGCCGAACGGGTGCTGGCGGCTGTCGAGCGTTTGCGCCTTCAGCATGCCGGCAAGCGCGTGCTGCTGGTGACCCATGGCGGCGTGATGCGGCTGTTACTGgcccgtgcccg > 1:501203/1‑150 (MQ=255) cccTGCACACTGCCTAATTGCGCGCAGGTCGAGGCGTTTGCCGTTCGGGTGCTGGCGGCTGTCGAGCGTTTGCGCCTTCAGCATGCCGGCAAGCGCGTGCTGCTGGTGACCCATGGCGGCGTGATGCGGCTGTTACTGgcccgtgcccgt < 2:329841/149‑1 (MQ=255) ttCACACCGCCCAATGGCGAGCCGGTCGAGGCGTTTGCCGAACGGGTGCTGGCGGCTGTCGAGCGTTTGCGCCTTCAGCATGCCGGCAAGCGCGTGCTGCTGGTGACCCATGGCGGCGTGATGCGGCTGTTACTGGCCCGTGCCCGTGGc > 1:125314/1‑150 (MQ=255) acacCGCCCAATGGCGAGCCGGTCGAGGCGTTTGCCGAACGGGTGCTGGCGGCTGTCGAGCGTTTGCGCCTTCAGCATGCCGGCAAGCGCGTGCTGCTGGTGACCCATGGCGACTTGTTGCGGCTGTTACTGGCCCGTGCCCGTGGCTTg > 2:585206/1‑150 (MQ=255) cGCCCAATGGCGAGCCGGTCGAGGCGTTTGCCGAACGGGTGCTGGCGGCTGTCGAGCGTTTGCGCCTTCAGCATGCCGGCAAGCGCGTGCTGCTGGTGACCCATGGCGGCGTGATGCGGCTGTTACTGGCCCGTGCCCGTGGCTTGCCCa < 2:501203/150‑1 (MQ=255) gCCCAATGGCGAGCCGGTCGAGGCGTTTGCCGAACGGGTGCTGGCGGCTGTCGAGCGTTTGCGCCTTCAGCATGCCGGCAAGCGCGTGCTGCTGGTGACCCATGGCGGCGTGATGCGGCt > 2:94427/1‑120 (MQ=255) gCCCAATGGCGAGCCGGTCGAGGCGTTTGCCGAACGGGTGCTGGCGGCTGTCGAGCGTTTGCGCCTTCAGCATGCCGGCAAGCGCGTGCTGCTGGTGACCCATGGCGGCGTGATGCGGCt < 1:94427/120‑1 (MQ=255) cccAATGGCGAGCCGGTCGAGGCGTTTGCCGAACGGGTGCTGGCGGCTGTCGAGCGTTTGCGCCTTCAGCATGCCGGCAAGCGCGTGCTGCTGGTGACCCATGGCGGCGTGATGCGGCTGTTACTGGCCCGTGCCCGTGGCTTGCCCAgg < 1:711205/150‑1 (MQ=255) ggCGTTTGCCGAACGGGTGCTGGCGGCTGTCGAGCGTTTGCGCCTTCAGCATGCCGGCAAGCGCGTGCTGCTGGTGACCCATGGCGGCGTGATGCGGCTGTTa < 2:664999/103‑1 (MQ=255) ggCGTTTGCCGAACGGGTGCTGGCGGCTGTCGAGCGTTTGCGCCTTCAGCATGCCGGCAAGCGCGTGCTGCTGGTGACCCATGGCGGCGTGATGCGGCTGTTa > 1:664999/1‑103 (MQ=255) gTGCTGGCGGCTGTCGAGCGTTTGCGCCTTCAGCATGCCGGCAAGCGCGTGCTGCTGGTGACCCATGGCGGCGt > 2:530997/1‑74 (MQ=255) gTGCTGGCGGCTGTCGAGCGTTTGCGCCTTCAGCATGCCGGCAAGCGCGTGCTGCTGGTGACCCATGGCGGCGt < 1:530997/74‑1 (MQ=255) gTGCTGGCGGCTGTCGAGCGTTTGCGCCTTCAGCATGCCGGCAAGCGCGTGCTGCTGGTGACCCATGGCGGCGTGATGCGGCTGTTACTGGCCCGTGCCCGTGGCTTGCCCAGGGAGCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTTGGCCATGGcgcg > 1:749563/1‑150 (MQ=255) tGCTGGCGGCTGTCGAGCGTTTGCGCCTTCAGCATGCCGGCAAGCGCGTGCTGCTGGTGACCCATGGCGGCGTGATGCGGCTGTTACTGGCCCGTGCCCGTGGCTTGCCCAGGGAGCAGTTGCTGCGGGTCGAGGTTGGCCATGGCGCGt > 2:192963/1‑150 (MQ=255) gcggcTGTCGAGCGTTTGCGCCTTCAGCATGCCGGCAAGCGCGTGCTGCTGGGGACCCATGGCGGCGTGATGCGGCTGTTACTAGCCCGTGCCCGTGGCTTGCCCAGGGAGCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATg < 1:81715/150‑1 (MQ=255) gAGCGTTTGCGCCTTCAGCATGCCGGCAAGCGCGTGCTGCTGGTGACCCATGGCGGCGTGATGCGGCTGTTACTGGCCCGTGCCCGTGGCTTGCCCAGGGAGCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTTGGCCATg > 1:766120/1‑130 (MQ=255) gAGCGTTTGCGCCTTCAGCATGCCGGCAAGCGCGTGCTGCTGGTGACCCATGGCGGCGTGATGCGGCTGTTACTGGCCCGTGCCCGTGGCTTGCCCAGGGAGCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTTGGCCATg < 2:766120/130‑1 (MQ=255) gCGTTTGCGCCTTCAGCATGCCGGCAAGCGCGTGCTGCTGGTGACCCATGGCGGCGTGATGCGGCTGTTACTGgccc > 1:694386/1‑77 (MQ=255) gCGTTTGCGCCTTCAGCATGCCGGCAAGCGCGTGCTGCTGGTGACCCATGGCGGCGTGATGCGGCTGTTACTGgccc < 2:694386/77‑1 (MQ=255) tttGCGCCTTCAGCATGCCGGCAAGCGCGTGCTGCTGGTGACCCATGGCGGCGTGATGCGGCTGTTACTGGCCCGTGCCCGTGGCTTGCCCAGGGAGCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCggg < 1:192963/150‑1 (MQ=255) gcCTTCAGCATGCCGGCAAGCGCGtgctgaaggcgcaaacgctcgacagccgccagcacccgttcggcaaacgcctcgaccggctcgccattgggcggt > 2:380200‑M2/1‑24 (MQ=255) gcCTTCAGCATGCCGGCAAGCGCGtgctgaaggcgcaaacgctcgacagccgccagcacccgttcggcaaacgcctcgaccggctcgccattgggcggt < 1:380200‑M2/99‑76 (MQ=255) ccTTCAGCATGCCGGCAAGCGCGTGCTGCTGGTGACCCATGGCGGCGTGATGCGGCTGTTACTGGCCCGTGCCCGTGGCTTGCCCAGGGAGCAGTTGCTGCAGGTCGAGGGTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGa > 1:528673/1‑150 (MQ=255) cTTCAGCATGCCGGCAAGCGCGTGCTGCTGGTGACCCATGGCGGCGTGATGCGGCTGTTACTGGCCCGTGCCCGTGGGTTGCCCAGGGAGCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGAt < 2:225830/150‑1 (MQ=255) ttCAGCATGCCGGCAAGCGCGtgctgaaggcgcaaacgctcgacagccgccagcacccgttcggcaaacgcctcgaccggctcgccattgggcggtgt < 2:322934‑M2/98‑78 (MQ=255) ttCAGCATGCCGGCAAGCGCGtgctgaaggcgcaaacgctcgacagccgccagcacccgttcggcaaacgcctcgaccggctcgccattgggcggtgt > 1:322934‑M2/1‑21 (MQ=255) aTGCCGGCAAGCGCGTGCTGCTGGTGACCCATGGCGGCGTGATGCGGCTGTTACTGGCCCGTGCCCGTGGCTTGCCCAGGGAGCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAAc < 2:533924/150‑1 (MQ=255) gCCGGCAAGCGCGTGCTGCTGGTGACCCATGGCGGCGTGATGCGGCTGTTACTGGCCCGTGCCCGTGGCTTGCCCAGGGAGCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGTAACTg < 2:523233/150‑1 (MQ=255) aaGCGCGTGCTGCTGGTGACCCATGGCGGCGTGATGCGGCTGTTACTGGCCCGTGCCCGTGGCTTGCCCAGGGAGCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAg < 1:267800/150‑1 (MQ=255) | GATCATGGAGCACCAGGCCGATGCACTGGGCCGTTTCTGGGCCGACCCTTACGCCTTCACACCGCCCAATGGCGAGCCGGTCGAGGCGTTTGCCGAACGGGTGCTGGCGGCTGTCGAGCGTTTGCGCCTTCAGCATGCCGGCAAGCGCGTGCTGCTGGTGACCCATGGCGGCGTGATGCGGCTGTTACTGGCCCGTGCCCGTGGCTTGCCCAGGGAGCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAG > NC_002947/1875050‑1875341 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |