New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 6119391 | 35 (1.180) | 4 (0.140) | 4/242 | NT | 10.7% | intergenic (‑308/+91) | PP_5368/PP_5370 | MFS transporter/oxidoreductase‑like protein |
? | NC_002947 | = 6119409 | 32 (1.100) | intergenic (‑326/+73) | PP_5368/PP_5370 | MFS transporter/oxidoreductase‑like protein |
CAGCCCTCAATGACAAAAATCACTTCGTCATAGAGCACCGTCCAGGCCACTTCAGCACCTTCCCAGCGGGCAAAGCCGATACCCAGGTTGGGCGACACCTCATTACTGACAGCACGCGCTACCGAGGCGCCGCCAGGCGGCCCGCCCCGGTGGACAAAGTCCAGGTTCCGGTGGTCGACCAGACGCACCGGGCCTTTTCCGCTGAGTGTGCGGGTCATACTTCGCTCCTACTGTTGAACGCGGCCCAGCGGATCCGGGCCCGCACCCCCATACCCAAGAA > NC_002947/6119268‑6119547 | cAGCCCTCAATGACAAAAATCACTTCGTCATAGAGCACCGTCCAGGCCACTTCAGCACCTTCCCAGCGGGCAAAGCCGATACCCAGGTTGGGCGACACCTCATTACTGACAGCACGCGCTACCGAGGCGCCGCCAGGCGGCCCGCCCCgg < 2:463197/150‑1 (MQ=255) gCCCTCAATGACAAAAATCACTTCGTCATAGAGCACCGTCCAGGCCACTTCAGCACCTTCCCAGCGGGCAAAGCCGATACCCAGGTTGGGCGACACCTCATTACTGACAGCACGCGCTACCGAGGCGCCGCCAGGCGGCCCGCCCCGGTg > 1:528825/1‑150 (MQ=255) cTCAATGACAAAAATCACTTCGTCATAGAGCACCGTCCAGGCCACTTCAGCACCTTCCCAGCGGGCAAAGCCGATACCCAGGTTGGGCGACACCTCATTACTGACAGCACGCGCTACCGAGGCGCCGCCAGGCGGCCCGCCCCGGTGGAc > 1:475427/1‑150 (MQ=255) aCAAAAATCACTTCGTCATAGAGCACCGTCCAGGCCACTTCAGCACCTTCCCAGCGGGCAAAGCCGATACCCAGGTTGGGCGACACCTCATTACTGACAGCACGCGCTACCGAGGCGCCGCCAGGCGGCCCGCCCCGGTGGACAAAGTcc < 2:375088/150‑1 (MQ=255) tCACTTCGTCATAGAGCACCGTCCAGGCCACTTCAGCACCTTCCCAGCGGGCAAAGCCGATACCCAGGTTGGGCGACACCTCATTACTGACAGCACGCGCTACCGAGGCGCCGCCAGGCGGCCCGCCCCGGTGGACAAAGTCCAGGTTcc > 1:88669/1‑150 (MQ=255) cTTCGTCATAGAGCACCGTCCAGGCCACTTCAGCACCTTCCCAGCGGGCAAAGCCGATACCCAGGTTGGGCGACACCTCATTACTGACAGCACGCGCTACCGAGGCGCCGCCAGGCGGCCCGCCCCGGTGGACAAAGTCCAGGTTCCggt < 2:475427/150‑1 (MQ=255) ttCGTCATAGAGCACCGTCCAGGCCACTTCAGCACCTTCCCAGCGGGCAAAGCCGATACCCAGGTTGGGCGACACCTCATTACTGACAGCACGCGCTACCGAGGCGCCGCCAGGCGGCCCGCCCCGGTGGACAAAGTCCAGGTTCCggtg > 1:671975/1‑150 (MQ=255) gTCATAGAGCACCGTCCAGGCCACTTCAGCACCTTCCCAGCGGGCAAAGCCGATACCCAGGTTGGGCGACACCTCATTACTGACAGCACGCGCTACCGAGGCGCCGCCAGGCGGCCCGCCCCGGTGGACAACGTCCAGGTTCCGGTGGTc < 1:281305/150‑1 (MQ=255) aTAGAGCACCGTCCAGGCCACTTCAGCACCTTCCCAGCGGGCAAAGCCGATACCCAGGTTGGGCGACACCTCATTACTGACAGCACGCGCTACCGAGGCGCCGCCAGGCGGCCCGCCCCGGTGGACAAAGTCCAGGTTCCGGTGGTCGAc > 2:774527/1‑150 (MQ=255) aTAGAGCACCGTCCAGGCCACTTCAGCACCTTCCCAGCGGGCAAAGCCGATACCCAGGTTGGGCGACACCTCATTACTGACAGCACGCGCTACCGAGGCGCCGCCAGGCGGCCCGCCCCGGTGGACAAAGTCCAGGTTCCGGTGGTCGAc > 1:173473/1‑150 (MQ=255) aTAGAGCACCGTCCAGGCCACTTCAGCACCTTCCCAGCGGGCAAAGCCGATACCCAGGTTGGGCGACACCTCATTACTGACAGCACGCGCTACCGAGGCGCCGCCAGGCGGCCCGCCCCGGTGGACAAAGTCCAGGTTCCGGTGGTCGAc < 2:199441/150‑1 (MQ=255) aTAGAGCACCGTCCAGGCCACTTCAGCACCTTCCCAGCGGGCAAAGCCGATACCCAGGTTGGGCGACACCTCATTACTGACAGCACGCGCTACCGAGGCGCCGCCAGGCGGCCCGCCCCGGTGGACAAAGTCCAGGTTCCGGTGGTCGAc < 1:712387/150‑1 (MQ=255) cACCGTCCAGGCCACTTCAGCACCTTCCCAGCGGGCAAAGCCGATACCCAGGTTGGGCGACACCTCATTACTGACAGCACGCGCTACCGAGGCGCCGCCAGGCGGCCCGCCCCGGTGGACAAAGTCCAGGTTCCGGTGGTCGACCAGACg > 1:30640/1‑150 (MQ=255) cACCGTCCAGGCCACTTCAGCACCTTCCCAGCGGGCAAAGCCGATACCCAGGTTGGGCGACACCTCATTACTGACAGCACGCGCTACCGAGGCGCCGCCAGGCGGCCCGCCCCGGTGGACAAAGTCCAGGTTCCGGTGGTCGACCAGACg > 2:126838/1‑150 (MQ=255) aGGCCACTTCAGCACCTTCCCAGCGGGCAAAGCCGATACCCAGGTTGGGCGACACCTCATTACTGACAGCACGCGCTACCGAGGCGCCGCCAGGCGGCCCGCCCCGGTGGACAAAGTCCAGGTTCCGGTGGTCGACCAGACGCACCGGGc > 1:109497/1‑150 (MQ=255) aGGCCACTTCAGCACCTTCCCAGCGGGCAAAGCCGATACCCAGGTTGGGCGACACCTCATTACTGACAGCACGCGCTACCGAGGCGCCGCCAGGCGGCCCGCCCCGGTGGACAAAGTCCAGGTTCCGGTGGTCGACCAGACGCACCGGGc > 1:449136/1‑150 (MQ=255) cTTCAGCACCTTCCCAGCGGGCAAAGCCGATCACCCGGTTGGGCGACACCTCATTACTGACAGCACGCGCTACCGAGGCGCCGCCAGGCGGCCCGCCCCGGTGGACAAAGTCCAGGTTCCGGTGGTCGACCAGACGCACCGGGCCTTTTc < 2:528825/150‑1 (MQ=255) aGCGGGCAAAGCCGATACCCAGGTTGGGCGACACCTCATTACTGACAGCACGCGCTACCGAGGCGCCGCCAGGCGGCCCGCCCCGGTGGACAAAGTCCAGGTTCCGGTGGTCGACCAGACGCACCGGGCCTTTTCCGCt < 1:495281/139‑1 (MQ=255) aGCGGGCAAAGCCGATACCCAGGTTGGGCGACACCTCATTACTGACAGCACGCGCTACCGAGGCGCCGCCAGGCGGCCCGCCCCGGTGGACAAAGTCCAGGTTCCGGTGGTCGACCAGACGCACCGGGCCTTTTCCGCt > 2:495281/1‑139 (MQ=255) gCAAAGCCGATACCCAGGTTGGGCGACACCTCATTACTGACAGCACGCGCTACCGAGGCGCCGCCAGGCGGCCCGCCCCGGTGGACAAAGTCCAGGTTCCGGTGGTCGACCAGACGCACCGGGCCTTTTCCGCTGAGTGTGCGGGTCATa < 1:630695/150‑1 (MQ=255) gATACCCAGGTTGGGCGACACCTCATTACTGACAGCACGCGCTACCGAGGCGCCGCCAGGCGGCCCGCCCCGGTGGACAAAGTCCAGGTTCCGGTGGTCGACCAGACGCACCGGGCCTTTTCCGCTGAGTGTGCGGGTCATACTTCGCTc < 2:671975/150‑1 (MQ=255) ccAGGTTGGGCGACACCTCATTACTGACAGCACGCGCTACCGAGGCGCCGCCAGGCGGCCCGCCCCGGTGGACAAAGTCCAGGTTCCGGTGGTCGACCAGACGCACCGGGCCTTTTCCGCTGAGTGTGCGGGTCATACTTCGCTCCTACt > 1:286982/1‑150 (MQ=255) ggTTGGGCGACACCTCATTACTGACAGCACGCGCTACCGAGGCGCCGCCAGGCGGCCCGCCCCGGTGGACAAAGTCCAGGTTCCGGTGGTCGACCAGACGCACCGGGCCTTTTCCGCTGAGTGTGCGGGTCATACTTCGCTCCTACTGtt < 2:286982/150‑1 (MQ=255) ttGGGCGACACCTCATTACTGACAGCACGCGCTACCGAGGCGCCGCCAGGCGGCCCGCCCCGGTGGACAAAGTCCAGGTTCCGGTGGTCGACCAGACACACCGGGCCTTTTCCGCTGAGTGTGCGGGTCATACTTCGCTCCTACTGTTGa > 1:552602/1‑150 (MQ=255) gCGACACCTCATTACTGACAGCACGCGCTACCGAGGCGCCGCCAGGCGGCCCGCCCCGGTGGACAAAGTCCAGGTTCCGGTGGTCGACCAGACGCACCGGGCCTTTTCCGCTGAGTGTGCGGGTCATACTTCGCTCCTAc < 1:701134/140‑1 (MQ=255) gCGACACCTCATTACTGACAGCACGCGCTACCGAGGCGCCGCCAGGCGGCCCGCCCCGGTGGACAAAGTCCAGGTTCCGGTGGTCGACCAGACGCACCGGGCCTTTTCCGCTGAGTGTGCGGGTCATACTTCGCTCCTAc > 2:701134/1‑140 (MQ=255) accacCTCATTACTGACAGCACGCGCGACCGAGGCGCCGCCAGGCGGCCCGCCCCGGTGGACAAAGTCCAGGTTCCGGTGGTCGACCAGACGCACCGGGCCTTTTCCGCTGAGTGTGCGGGTCATACTTCGCTCCTACTGTTGAACGCgg < 2:173473/148‑1 (MQ=255) tCATTACTGACAGCACGCGCTACCGAGGCGCCGCCAGGCGGCCCGCCCCGGTGGACAAAGTCCAGGTTCCGGTGGTCGACCAGACGCACCGGGCCTTTTCCGCTGAGTGTGCGGGTCATACTTCGCTCCTACt > 1:480345/1‑133 (MQ=255) tCATTACTGACAGCACGCGCTACCGAGGCGCCGCCAGGCGGCCCGCCCCGGTGGACAAAGTCCAGGTTCCGGTGGTCGACCAGACGCACCGGGCCTTTTCCGCTGAGTGTGCGGGTCATACTTCGCTCCTACt < 2:480345/133‑1 (MQ=255) tCATTACTGACAGCACGCGCTACCGAGGCGCCGCCAGGCGGCCCGCCCCGGTGGACAAAGTCCAGGTTCCGGTGGTCGACCAGACGCACCGGGCCTTTTCCGCTGAGTGTGCGGGTCATACTTCGCTCCTACTGTTGAACGCGGCCCAGc > 2:293169/1‑150 (MQ=255) tGACAGCACGCGCTACCGAGGCGCCGCCAGGCGGCCCGCCCCGGTGGACAAAGTCCAGGTTCCGGTGGTCGACCAGACGCACCGGGCCTTTTCCGCTGAGTGTGCGGGTCATACTTCGCTCCTACTGTTGAACGCGGCCCAGCGGATCCg > 1:102666/1‑150 (MQ=255) cgcTACCGAGGCGCCGCCAGGCGGCCcggtagcgcgtgctgtcagtactgaggtgtcgcccaacctgggtatcggctttgcccgctgggaaggtgctgaagtg < 2:793165‑M2/103‑78 (MQ=255) cgcTACCGAGGCGCCGCCAGGCGGCCcggtagcgcgtgctgtcagtaatgaggtgtcgcccaacctgggtatcggctttgcccgctgggaaggtgctgaagtg > 1:793165‑M2/1‑26 (MQ=255) aCCGAGGCGCCGCCAGGCGGCCcggtagcgcgtgctgtcagtaatgaggtgtcgcccaacctgg > 1:264809‑M2/1‑22 (MQ=255) aCCGAGGCGCCGCCAGGCGGCCcggtagcgcgtgctgtcagtaatgaggtgtcgcccaacctgg < 2:264809‑M2/64‑43 (MQ=255) cgccAGGCGGCCCGCCCCGGTGGACAAAGTCCAGGTTCCGGTGGTCGACCAGACGCACCGGGCCTTTTCCGCTGAGTGTGCGGGTCATACTTCGCTCCTACTGTTGAACGCGGCCCAGCGGATCCGGGCCCGCACCCCCATACCCAAGaa < 2:449136/150‑1 (MQ=255) ccgcccCGGTGGACAAAGTCCAGGTTCCGGTGGTCGACCAGACGCACCGGGCCTTTTCCGCTGAGTGTGCGGGTCATACTTCGCTCCTACTGTTGAAcgcg > 1:139628/1‑101 (MQ=255) ccgcccCGGTGGACAAAGTCCAGGTTCCGGTGGTCGACCAGACGCACCGGGCCTTTTCCGCTGAGTGTGCGGGTCATACTTCGCTCCTACTGTTGAAcgcg < 2:139628/101‑1 (MQ=255) | CAGCCCTCAATGACAAAAATCACTTCGTCATAGAGCACCGTCCAGGCCACTTCAGCACCTTCCCAGCGGGCAAAGCCGATACCCAGGTTGGGCGACACCTCATTACTGACAGCACGCGCTACCGAGGCGCCGCCAGGCGGCCCGCCCCGGTGGACAAAGTCCAGGTTCCGGTGGTCGACCAGACGCACCGGGCCTTTTCCGCTGAGTGTGCGGGTCATACTTCGCTCCTACTGTTGAACGCGGCCCAGCGGATCCGGGCCCGCACCCCCATACCCAAGAA > NC_002947/6119268‑6119547 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |