New junction evidence | |||||||||||
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TCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCAC > NC_002947/337669‑337959 | tCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAgcgc < 2:1306302/150‑1 (MQ=255) cacaGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCc‑a < 2:400100/150‑1 (MQ=255) gctgctGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CAtt < 1:833194/150‑1 (MQ=255) 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ggAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTgtagcgccaaccttgaatgtggcgctatac < 2:807706‑M1/149‑31 (MQ=255) aaCTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGGTACacctg < 2:1230909‑M2/150‑6 (MQ=255) aaCTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACacctg < 2:90943‑M2/150‑6 (MQ=255) aCTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCTACAGGTATATCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACacctgt > 1:1427192‑M2/1‑144 (MQ=255) tGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGGTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCGGCTCCCACAGGGATAGAGCC‑A‑CCTTCAAGGTTAGCGCTACacctgtgg < 1:86666‑M2/150‑9 (MQ=255) 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tgGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGACACGCCCGCTCCCACAGGTgtagcgccaaccttgaatgtggcgctatac > 2:1179008‑M1/1‑75 (MQ=255) gAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCCCAGGCATAGCGGC‑T‑CAGTCCAGGTTGGCGCTACACCTGTGGAAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTTAGTGAGGCCTCAGCgg > 1:1380153/1‑150 (MQ=38) aGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGc < 2:952658/150‑1 (MQ=255) gtggtTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CATTCaa < 1:255814/86‑1 (MQ=255) gtggtTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CATTCaa > 2:255814/1‑86 (MQ=255) gtggtTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCt > 2:1171665/1‑150 (MQ=255) 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ccACAGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACga > 1:858355/1‑150 (MQ=255) ccACAGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACga < 2:6224/150‑1 (MQ=255) cacaGGTatagcgccacattcaaggttggcgctacacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccaca > 2:1468189‑M1/1‑7 (MQ=255) cacaGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccaca > 1:1468189‑M2/1‑35 (MQ=255) acaGGTgtagcgccaaccttgaatgtggcgatatacctgtaggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcccccacctaagcacccgcttccaggccctcgaccagt > 1:1427192‑M1/1‑6 (MQ=255) acaGGTGTAGCGCCAA‑CCTTGAATG‑TGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACgaga > 2:619322/1‑150 (MQ=25) acaGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGCGCGGGCGTTCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACgaga < 1:90943/150‑1 (MQ=255) acaGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCt > 1:519399/1‑123 (MQ=255) acaGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCt < 2:519399/123‑1 (MQ=255) acaGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGaa > 1:278595/1‑145 (MQ=255) acaGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGaa < 2:278595/145‑1 (MQ=255) acaGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACgaga < 1:1409296/150‑1 (MQ=255) acaGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACgaga < 1:342350/150‑1 (MQ=255) caGGTgtagcgccaaccttgaatgtggcgctatacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcccccacctaagcacccgcttccaggccctcgaccagtt < 2:90943‑M1/150‑146 (MQ=255) caGGTgtaccgccaaccttgaatgtggcgctatacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcccccacctaagcacccgcttccaggccctcgaccagtt < 2:1230909‑M1/150‑146 (MQ=255) caGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACgagag > 1:71155/1‑149 (MQ=255) caGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGAt > 1:70034/1‑150 (MQ=255) gTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggcgtgtccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctcca > 2:1179008‑M2/1‑30 (MQ=255) gTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggcgtgtccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctcca < 1:1179008‑M2/105‑76 (MQ=255) gTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcccccacctaagcacccgcttccaggccctcgaccagttcc > 1:807706‑M2/1‑30 (MQ=255) gTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcccccacctaagcacccgcttccaggccctcgaccagttcc < 2:807706‑M2/149‑120 (MQ=255) gTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCAc > 2:1436707/1‑150 (MQ=255) gTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCAc < 2:563920/150‑1 (MQ=255) gTATAGCGAC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctcca > 1:747925‑M2/1‑30 (MQ=255) gTATAGCGAC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctcca < 2:747925‑M2/105‑76 (MQ=255) | TCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCAC > NC_002947/337669‑337959 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |