| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1780109 = | 70 (1.210) | 17 (0.340) | 16/224 | 2.7 | 24.3% | intergenic (+26/+80) | PP_1587/dapC | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter/N‑succinyl‑L,L‑diaminopimelate aminotransferase |
| ? | NC_002947 | 1780171 = | 46 (0.930) | intergenic (+88/+18) | PP_1587/dapC | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter/N‑succinyl‑L,L‑diaminopimelate aminotransferase | |||||
CCTGAGGGCGCAGCGGTTGGAGCTGTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAAT‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGG‑TTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAG > NC_002947/1779960‑1780257 | ggtcgtacctgtcgcgtgaagtggatggggtgaacccgggtgccgggcgcgtgcgcatggcactggttgcaccgctggccgaatgcatcgaagcggcggagcgcattcgcgccttcctgcaaaaccgctgatcaaccccttcgcgggcac > 1:956943‑M1/150‑150 (MQ=255)ccTGAGGGCGCAGCGGTTGGAGCTGTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGgcgc > 2:1283776/1‑150 (MQ=255)ccTGAGGGCGCAGCGGTTGGAGCTGTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGgcgc > 1:1287036/1‑150 (MQ=255) cTGAGGGCGCAGCGGTTGGAGCTGTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGgcgcg > 2:1444817/1‑150 (MQ=255) ggCGCAGCGGTTGGAGCTGTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACACTATCAAGGCACTTCGAGGGCGCGCCCGc > 2:1136065/1‑150 (MQ=255) acctgtcgcgtgaagtggatggggtgaacccgggtgccgggcgcgtgcgcatggcactggttgcaccgctggccgaatgcatcgaagcggcggagcgcattcgcgccttcctgcaaaaccgctgatcaaccccttcgcgggcaCGCCCGc < 2:306016‑M1/7‑1 (MQ=255) tgtcgcgtgaagtggatggggtgaacccgggtgccgggcgcgtgcgcatggcactggttgcaccgctggccgaatgcatcgaagcggcggagcgcattcgcgccttcctgcaaaaccgctgatcaaccccttcgcgggcaCGCCCGCTcc < 2:106779‑M1/10‑1 (MQ=255) gcAGCGGTTGGAGCTGTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTcc > 1:980810/1‑150 (MQ=255) gcAGCGGTTGGAGCTGTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTcc > 2:945176/1‑150 (MQ=255) gcAGCGGTTGGAGCTGTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTcc > 2:294930/1‑150 (MQ=255) tcgcgtgaagtggatggggtgaacccgggtgccggacgcgtgcgcatggcacaggttgcaccgctggccgaatgcatcgaagcggcggagcgcattcgcgccttcctgcaaaaccgctgatcaaccccttcgcgggcaCGCCCGCTCCca < 1:116804‑M1/12‑1 (MQ=255) gcgtgaagtggatggggtgaacccgggtgccgggcgcgtgcgcatggcactggttgcaccgctggccgaatgcatcgaagcggcggagcgcattcgcgccttcctgcaaaaccgctgatcaaccccttcgcgggcaCGCCCGCTCCcaca < 1:1240268‑M1/14‑1 (MQ=255) cgtgaagtggatggggtgaacccgggtgccgggcgcgtgcgcatggcactggttgcaccgctggccgaatgcatcgaagcggcggagcgcattcgcgccttcctgcaaaaccgctgatcaaccccttcgcgggcaCGCCCGCTCCCACAg > 1:1014990‑M1/136‑150 (MQ=255) agtggatggggtgaacccgggtgccgggcgcgtgcgcatggcactggttgcaccgctggccgaatgcatcgaagcggcggagcgcattcgcgccttcctgcaaaaccgctgatcaaccccttcgcgggcgCGCCCGCTCCCACAGGTAct < 1:442993‑M1/20‑1 (MQ=255) aGCTGTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTActg > 2:445383/1‑150 (MQ=255) cTGTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTActgcg < 2:609188/150‑1 (MQ=255) ggggtgaacccgggtgccgggcgcgtgcgcatggcactggttgcaccgctggccgaatgcatcgaagcggcggagcgcattcgcgccttcctgcaaaaccgctgatcaaccccttcgcgggcaCGCCCGCTCCCACAGGTActgcgctgc < 1:1233687‑M1/27‑1 (MQ=255) cTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAg < 2:317635/133‑1 (MQ=255) 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gggggATGAGGTGGTGCGGCAAATACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAAT‑CAGCGCTGTACCtgtg < 2:1189735/150‑1 (MQ=255) gcatggcactggttgcaccgctggccgaatgcatcgaagcggcggagcgcattcgcgccttcctgcaaaaccgctgatcaaccccttcgcgggcgCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAAT‑CAGCGCTGTACCTGTGGGa > 2:442993‑M1/96‑150 (MQ=255) atggcactggttgcaccgctggccgaatgcatcgaagcggcggagcgcattcgcgccttcctgcaaaaccgctgatcaaccccttcgcgggcaCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAAT‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGc < 1:1387806‑M1/57‑1 (MQ=255) gAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAAT‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCgg < 1:1238434/150‑1 (MQ=255) ggtggtGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGTGCCTATCAAGGCACTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAAT‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGc < 1:1227700/150‑1 (MQ=255) gtggtgCGGCAATTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAAGTACCGCGCTGCGCTTGAAAT‑CAGCGCTGTACCTGTGCGAGcgcgcg > 2:305340/1‑150 (MQ=255) gtgCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAAT‑CAGCGCTGTACCTGTgg < 1:754145/138‑1 (MQ=255) gtgCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAAT‑CAGCGCTGTACCTGTgg > 2:754145/1‑138 (MQ=255) ggCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAAT‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCcgc > 2:1389766/1‑150 (MQ=255) gCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAAT‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCcgcg > 2:246850/1‑150 (MQ=255) accgctggccgaatgcatcgaagcggcggagcgcattcgcgccttcctgcaaaaccgctgatcaaccccttcgcgggcaCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGaaa > 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1:37840/1‑136 (MQ=255) gTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAAT‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGG‑TTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAAt < 2:37840/136‑1 (MQ=255) gACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAAT‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGG‑TTGATCAGCGGTTTTGc < 1:60381/119‑1 (MQ=255) gACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAAT‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGG‑TTGATCAGCGGTTTTGc > 2:60381/1‑119 (MQ=255) ccTATCAAGCCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAAT‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGG‑TTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGc > 2:897962/1‑150 (MQ=255) aTCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAAT‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGG‑TTGATCAGCGGTTTTg < 2:1349499/112‑1 (MQ=255) aTCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAAT‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGG‑TTGATCAGCGGTTTTg > 1:1349499/1‑112 (MQ=255) aaGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAAT‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGG‑TTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCgg > 1:620850/1‑150 (MQ=255) aaGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAAT‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGG‑TTGATCAGCGGTTTTGACTCAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCgg > 1:14170/1‑150 (MQ=255) aGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAAT‑CAg < 2:845896/55‑1 (MQ=255) aGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAAT‑CAg > 1:845896/1‑55 (MQ=255) ggCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAAT‑CAGCGCTGTACCTGTgg > 2:408904/1‑68 (MQ=255) ggCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAAT‑CAGCGCTGTACCTGTgg < 1:408904/68‑1 (MQ=255) gCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTTAAAT‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGG‑TTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCa < 1:1136065/150‑1 (MQ=255) cccttcgcgggcaCGCCCGCTCCCACAGGTACAGCGCTGAT‑TTCAAGCGCAGCGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGG‑TTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAg < 2:1233687‑M1/137‑1 (MQ=255) ccttcgcgggcaCGCCCGCTCCCACAGGTACAGCGCTGAT‑TTCAAGCGCAGCGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGG‑TTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGc < 2:1387806‑M1/138‑1 (MQ=255) cTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAAT‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGG‑TTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCg < 2:794707/150‑1 (MQ=255) ttCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAAT‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGG‑TTGATCAGCGGTTTTg < 2:228024/102‑1 (MQ=255) ttCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAAT‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGG‑TTGATCAGCGGTTTTg > 1:228024/1‑102 (MQ=255) gcgcgcCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAAT‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGG‑TTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAAcc > 2:331183/1‑150 (MQ=255) cgcgcCCGCTCCAAAAGGTACTGCGCTGCACTTGAAAT‑CATCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGG‑TTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCCAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCa < 1:1470162/150‑1 (MQ=255) gcgcCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAAT‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTTGTTGAG‑GGGTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTAGGCCAGCGGTGCAACCAg > 1:837779/1‑150 (MQ=255) | CCTGAGGGCGCAGCGGTTGGAGCTGTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAAT‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGG‑TTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAG > NC_002947/1779960‑1780257 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |