| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 2295841 | 47 (0.630) | 11 (0.180) | 6/206 | NT | 21.8% | intergenic (+44/+89) | PP_5496/PP_2023 | hypothetical protein/glutathione S‑transferase family protein |
| ? | NC_002947 | = 2295878 | 41 (0.680) | intergenic (+81/+52) | PP_5496/PP_2023 | hypothetical protein/glutathione S‑transferase family protein | |||||
GTCGTACTGCCAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/2295672‑2295841‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgtgggagcgggcatgcccgcgaa‑G‑CGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAAGGACCTCACACAAGCCAGATCAGTGGTGGTGCTTGCCACTCAGGGCCGCATGGAAATTGGCGCTCTGGCGCAGGTACTGCTCGG < NC_002947/2295878‑2295733 GTCGTACTGCCAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCCAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCCAGCACCACCACTGATCCGGCTTGTGTCAGGTCCTTGTG > 2:127818/1‑150GTCGTACTGCCAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTG < 2:1871603/150‑1 TCGTACTGCCAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCTAATTTCCATGCTGCCCTGAGTGGCAAACAACACCACTGATCTGGTTTGTGTGAGGTCCTTGTGG < 1:521641/150‑1 TCGTACTGCCAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGG < 1:849938/150‑1 GTACTGCCAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGA < 1:1682734/150‑1 TACTGCCAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAG > 1:689334/1‑150 TGCCAGCGCCTGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGG < 2:1021584/150‑1 TGCCAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGG > 2:1174678/1‑150 CCAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGC > 2:1571041/1‑150 CCAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGC > 1:7725/1‑150 CCAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCAAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGC > 1:1616420/1‑150 CAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCA > 1:1305803/1‑150 AGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCAa > 1:1850948/1‑149 CGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGC < 2:134203/150‑1 ATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCG > 1:1546239/1‑150 CCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAA < 1:1543147/150‑1 CCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAA > 2:128641/1‑150 ACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGG < 1:1145786/99‑1 ACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGG > 2:1145786/1‑99 ACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCCCCCCCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCAGCGAA‑G‑TGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCAGAGCCGGTGcca < 1:441320/150‑4 CCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACA‑CCGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTC > 2:823553/1‑150 AGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCTCGAA‑G‑CGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGG < 2:689334/150‑1 AGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAA‑G‑CGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGG < 1:1103052/150‑1 GCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAA‑CACCGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGG < 1:823553/150‑1 CAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCG < 2:254834/82‑1 CAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCG > 1:254834/1‑82 CAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAA‑G‑CGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTC < 1:855725/124‑1 CAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAA‑G‑CGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTC > 2:855725/1‑124 ATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAA‑G‑CGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTC > 1:1345344/1‑105 ATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAA‑G‑CGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTC < 2:1345344/105‑1 TGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGA < 1:1866438/74‑1 TGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGA > 2:1866438/1‑74 CTGATTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAA‑G‑CGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGG < 1:782086/113‑1 CTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAA‑G‑CGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGG > 2:782086/1‑113 TGNGAGCGGGCATGCCCGCGAA‑G‑CGGGCACCGCGGTGGATNGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAAGGACCTCACACAAGCCAGATCAGTGGTGGTGCTTGCCACTCAGGGCCGCATGGAAATTGGCGCTCT > 1:1174678/1‑150 TGGGAGCGGGCATGCCCGCGAA‑G‑CGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAAGGACCTCACACAAGCCAGATCAGTGGTGGTGCTTGCCACTCAGGGCCGCATGGAAATTGGCGCTCT < 1:260107/150‑1 GGGAGCGGGCATCCCCGCGAA‑G‑CGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCGCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAAGGACCTCACACAAGCCAGATCAGTGGTGGTGCTTGCCACTCAGGGCCGCATGGAAATTGGCGCTCTG < 1:52525/150‑1 GGGCATGCCCGCGAA‑G‑CGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAAGGACCTCACACAAGCCAGATCAGTGGTGGTGCTTGCCACTCAGGGCCGCATGGAAATTGGCGCTCTGGCGCAG > 2:886195/1‑150 GCATGCCCGCGAA‑G‑CGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAAGGACCTCACACAAGCCAGATCAGTGGTGGTGCTTGCCACTCAGGGCCGCATGGAAATTGGCGCTCTGGCGCAGGT > 2:1675094/1‑150 CATGCCCGCGAA‑G‑CGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAAGGACCTCACACAAGCCAGATCAGTGGTGGTGCTTGCCACTCAGGGCCGCATGGAAATTGGCGCTCTGGCGCAGGTA < 2:1076976/150‑1 ATGCCCGCGAA‑G‑CGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAAGGACCTCACACAAGCCAGATCAGTGGTGGTGCTTGCCACTCAGGGCCGCATGGAAATTGGCGCTCTGGCGCAGGTAC < 2:268549/150‑1 TGCCCGCGAA‑G‑CGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAAGGACCTCACACAAGCCAGATCAGTGGTGGTGCTTGCCACTCAGGGCCGCATGGAAATTGGCGCTCTGGCGCAGGTACT > 2:1546239/1‑150 CCGCGAA‑G‑CGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCGCACACAACCCAGATCAGCGGTGGTACTTGCCACTCAGGGCCGCATGGAAATTGGCGCTCTGGCGCGGGTACTGCc > 2:721870/1‑149 CCGCGAA‑G‑CGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAAGGACCTCACACAAGCCAGATCAGTGGTGGTGCTTGCCACTCAGGGCCGCATGGAAATTGGCGCTCTGGCGCAGGTACTGCT < 1:26818/150‑1 CCGCGAA‑G‑CGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAAGGACCTCACACAAGCCAGATCAGTGGTGGTGCTTGCCACTCAGGGCCGCATGGAAATTGGCGCTCTGGCGCAGGTACTGCT > 1:301786/1‑150 CCGCGAA‑G‑CGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAAGGACCTCACACAAGCCAGATCAGTGGTGGTGCTTGCCACTCAGGGCCGCATGGAAATTGGCGCTCTGGCGCAGGTACTGCT > 1:685716/1‑150 CGAA‑G‑CGGGCCCCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAAGGACCTCACACAAGCCAGATCAGTGGTGGTGCTTGCCACTCAGGGCCGCATGGAAATTGGCGCTCTGGCGCAGGTACTGCTCGG < 1:1423845/150‑1 GTCGTACTGCCAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/2295672‑2295841‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgtgggagcgggcatgcccgcgaa‑G‑CGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAAGGACCTCACACAAGCCAGATCAGTGGTGGTGCTTGCCACTCAGGGCCGCATGGAAATTGGCGCTCTGGCGCAGGTACTGCTCGG < NC_002947/2295878‑2295733 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |