New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 713081 = | 99 (1.330) | 6 (0.080) | 5/242 | NT | 6.0% | coding (67/531 nt) | lspA | lipoprotein signal peptidase |
? | NC_002947 | 713119 = | 93 (1.310) | coding (105/531 nt) | lspA | lipoprotein signal peptidase |
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
CTGGCACTTCCGCGCCGACGTCGGCAGCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACG > NC_002947/712932‑713228 | cTGGCACTTCCGCGCCGACGTCGGCAGCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGa < 1:256896/150‑1 (MQ=255) tGGCACTTCCGCGCCGACGTCGGCAGCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGAGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAg > 1:347964/1‑150 (MQ=255) gCACTTCCGCGCCGACGTCGGCAGCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCt > 1:1456529/1‑150 (MQ=255) atcagggcgaacaaccagcgctgccaacccgctccgtcagccaggaagctgaacgcggcaccggtgttgtaagccagggtccagctgaagtagtcaggaatgaccacgatctgctggtacatggtcagggcgttgttgaagtacAGCTTg > 1:1208057‑M1/145‑150 (MQ=255) atcagggcgaacaaccagcgctgccaacccgctccgtcagccaggaagctgaacgcggcaccggtgttgtaagccagggtccagctgaagtagtcaggaatgaccacgatctgctggtacatggtcagggcgttgttgaagtacAGCTTg > 2:1297388‑M1/145‑150 (MQ=255) aCTTCCGCGCCGACGTCGGCAGCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTg > 1:673266/1‑150 (MQ=255) aCTTCCGCGCCGACGTCGGCAGCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGAAGTTGTGCGGTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGCGCTTg > 1:959623/1‑150 (MQ=255) ttCCGCGCCGACGTCGGCAGCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGct > 1:504328/1‑150 (MQ=255) ccccccccGACATCAGCAGCAATCGGAAGAACACGATTATCTGCGTCCGTTGTGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGctg < 2:959623/144‑1 (MQ=255) gcgcCGACGTCGGCAGCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGctggtc < 2:1207153/150‑1 (MQ=255) cGACGGCGGCAGCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGctggtcctgg < 1:574182/150‑1 (MQ=255) ggCAGCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGa < 2:673266/150‑1 (MQ=255) gCAGCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGctg < 2:1872211/135‑1 (MQ=255) gCAGCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGctg > 1:1872211/1‑135 (MQ=255) gCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAg < 1:319583/150‑1 (MQ=255) gCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAg < 2:811891/150‑1 (MQ=255) gCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAg < 1:1798629/150‑1 (MQ=255) gCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAg < 1:1688273/150‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) cTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGt < 2:860495/82‑1 (MQ=255) cTTGCATGGCTGTACCGGATCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTc > 1:543762/1‑150 (MQ=255) aTGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCtt > 2:1246836/1‑150 (MQ=255) tggctgtggctgAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTc < 2:1724557/150‑1 (MQ=255) ggctgtggctgAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGGTCAGCTTcc > 1:292480/1‑150 (MQ=255) ttgaagtacAGCTTGGTGG‑CCTGGTCGATGACCAGGACCAGCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGt > 2:1904439‑M1/10‑132 (MQ=255) ttgaagtacAGCTTGGTGG‑CCTGGTCGATGACCAGGACCAGCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGt < 1:1904439‑M1/123‑1 (MQ=255) ctgtggctgAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTg < 1:735031/150‑1 (MQ=255) gtggctgAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGc < 1:1827937/150‑1 (MQ=255) gctgAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGa < 2:533062/150‑1 (MQ=255) gctgAGCGAGCTGGTTCTGGAGATCGACCATG‑CGACCGAGCTGAACTTCCACAACGCCCTCACCATGTACCAGCAGATCGTGGACATGCCTGACTACTTCAGCTGCACCCTGGCTTACAGCACCGGTGCCGCGTCCAGCTTCCTGGCTgg > 2:1245684/1‑149 (MQ=255) tgAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGa < 2:1080445/91‑1 (MQ=255) tgAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGa > 1:1080445/1‑91 (MQ=255) tgAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACg > 1:1404852/1‑150 (MQ=255) | CTGGCACTTCCGCGCCGACGTCGGCAGCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACG > NC_002947/712932‑713228 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |