New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1583554 | 51 (0.680) | 4 (0.060) | 4/242 | NT | 6.6% | intergenic (+68/+50) | ttgR/PP_1388 | HTH‑type transcriptional regulator TtgR/EmrB/QacA family drug resistance transporter |
? | NC_002947 | = 1583575 | 64 (0.900) | intergenic (+89/+29) | ttgR/PP_1388 | HTH‑type transcriptional regulator TtgR/EmrB/QacA family drug resistance transporter |
GATCTGTTGGGTGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATCAGCAGCTGCCGGAACGTTTCC > NC_002947/1583409‑1583703 | gATCTGTTGGGTGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAACGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCATGc < 2:1206382/150‑1 (MQ=255) gATCTGTTGGGTGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCGGGCCGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGc > 2:31620/1‑150 (MQ=255) aTCTGTTGGGTGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCg < 1:1437120/150‑1 (MQ=255) gTCGAAAAATGGGTCGACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGcac > 1:268444/1‑150 (MQ=255) cGAAAAATGGGTCGACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACaa < 1:1330458/150‑1 (MQ=255) gAAAAATGGGTCGACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAg < 2:609506‑M2/150‑2 (MQ=255) gAAAAATGGGTCGACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAg > 1:609506‑M2/1‑149 (MQ=255) aaTGGGTCGACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAggcgg > 1:1361107‑M2/1‑145 (MQ=255) aaTGGGTCGACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAggcgg > 2:1730820‑M2/1‑145 (MQ=255) gACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCttgtgctgcgaacagccgcagggcggccat > 2:1896928‑M1/1‑116 (MQ=255) gACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCttgtgctgcgaacagccgcagggcggccat < 1:1896928‑M1/146‑31 (MQ=255) acacCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCttgtgctgcgaacagccgcagggcggccatgccct > 2:1249875‑M1/1‑115 (MQ=255) acacCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAg < 2:1736042/150‑1 (MQ=255) ccGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGa < 2:981668/150‑1 (MQ=255) gggCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCttgtgctgcgaacagccgcagggcggccatgcccttaata < 1:1249875‑M1/150‑41 (MQ=255) gATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAg > 1:1828190/1‑150 (MQ=255) ctgcGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCa > 2:13072/1‑150 (MQ=255) cTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCgg > 1:1841442/1‑99 (MQ=255) cTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCgg < 2:1841442/99‑1 (MQ=255) ttGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGcc > 2:1308301/1‑150 (MQ=255) ttGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGcc > 2:161158/1‑150 (MQ=255) tctGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGcc > 1:1449525/1‑150 (MQ=255) aaaTGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCATGTTTGGTAAGGGGGCATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCGTCAGCGGCAGCGCAATTGTCGGTCggg > 2:1006307/1‑150 (MQ=255) tGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCaa > 2:1042413/1‑150 (MQ=255) cacTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGc < 1:1042413/150‑1 (MQ=255) acTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTCGCAGCCAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGcc > 2:878885/1‑150 (MQ=255) cTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCa < 1:1308301/150‑1 (MQ=255) ttAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGcc > 1:943820/1‑150 (MQ=255) ggATTGTGCCGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAAt < 1:98303/122‑1 (MQ=255) ggATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAAt > 2:98303/1‑122 (MQ=255) ggATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCaa < 1:737258/150‑1 (MQ=255) gATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAg > 1:1529233/1‑150 (MQ=255) tgAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTa < 1:1629914/96‑1 (MQ=255) tgAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTa > 2:1629914/1‑96 (MQ=255) gAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCaa > 1:1626819/1‑129 (MQ=255) gAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCaa < 2:1626819/129‑1 (MQ=255) gAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTcc < 1:599134/150‑1 (MQ=255) gtgtTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCAc < 1:1648827/150‑1 (MQ=255) tttCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCTGACGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACcgc > 2:23864/1‑150 (MQ=255) ttCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACcgcg > 1:1429906/1‑150 (MQ=255) ccccTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGcgac < 2:1828190/150‑1 (MQ=255) cTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGc > 1:834878/1‑77 (MQ=255) cTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGc < 2:834878/77‑1 (MQ=255) cTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCgacgac > 1:72548/1‑150 (MQ=255) tttGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGc > 2:1105754/1‑88 (MQ=255) tttGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGc < 1:1105754/88‑1 (MQ=255) ttGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGCTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCg > 2:1266706/1‑150 (MQ=255) gtgtTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCa < 1:402841/150‑1 (MQ=255) tgtTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCAc > 2:1377562/1‑150 (MQ=255) ttAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCATGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTc > 2:220267/1‑150 (MQ=255) gggggTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCa > 1:1637081/1‑150 (MQ=255) ggTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATca > 2:1460383/1‑150 (MQ=255) gTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATcag > 2:345484/1‑150 (MQ=255) gTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATcag > 1:829176/1‑150 (MQ=255) tATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAggcggccatgcccttaatacccccttaacacaaaggggaaacactccctcacaatccttaacaaagtgtcatttgcgcagagccgggctcaagcgcagcatatccagccc < 1:1249875‑M2/150‑111 (MQ=255) tATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATcatc < 2:72548/150‑3 (MQ=255) aTTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATcagca < 2:829176/150‑1 (MQ=255) ttAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATcagcag > 2:1122670/1‑150 (MQ=255) aaGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATCAGCAGCt > 2:1566518/1‑150 (MQ=255) aGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAggcggccatgcccttaatacccccttaacacaaaggggaaacactccctcacaatccttaacaaagtgtcatttgcgcagagccgggctcaagcgcagcatatccagcccggtgt > 2:1249875‑M2/1‑35 (MQ=255) gggCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATCAGCAGCTGc > 2:1211402/1‑150 (MQ=255) gCANGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATCAGCAGCTGCCg > 2:1197933/1‑150 (MQ=255) aTGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAggcggccatgcccttaatacccccttaacacaaaggggaaacactccctcacaatccttaacaaagtgtcatttgcgcagagccgggctcaagcgcagcatatccagcccggtgtc < 1:1896928‑M2/146‑117 (MQ=255) aTGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAggcggccatgcccttaatacccccttaacacaaaggggaaacactccctcacaatccttaacaaagtgtcatttgcgcagagccgggctcaagcgcagcatatccagcccggtgtc > 2:1896928‑M2/1‑30 (MQ=255) aTGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCAAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATCAGCAGCTGCCGGa > 1:1517438/1‑150 (MQ=255) tGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATCAGCAGCTGCCGGaa < 2:1637081/150‑1 (MQ=255) ccgccttgtgctgcgaacagccgcagggcggccatgcccttaatacccccttaacacaaaggggaaacactccctcacaatccttaacaaagtgtcatttgcgcagagccgggctcaagcgcagcatatccagcccggtgtcgacccatt > 1:1361107‑M1/1‑5 (MQ=255) ccgccttgtgctgcgaacagccgcagggcggccatgcccttaatacccccttaacacaaaggggaaacactccctcacaatccttaacaaagtgtcatttgcgcagagccgggctcaagcgcagcatatccagcccggtgtcgacccatt > 2:1730820‑M1/1‑5 (MQ=255) cgccCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATCAGCAGCTGCCGGAACGtt < 2:85694/150‑1 (MQ=255) cgccCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCAACGCCACGACCGCACTCCCCATCAGCAGCTGCCGGAACGtt > 1:100717/1‑150 (MQ=255) cgccCCGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCTAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATCAGCAGCTGCCGGAACGtt > 1:627354/1‑150 (MQ=255) gccCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATCAGCAGCTGCCGGAACGttt > 1:1406076/1‑150 (MQ=255) gccCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGACAAGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATCAGCAGCTGCCGGAACGttt > 1:601833/1‑150 (MQ=255) cccTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATCAGCAGCTGCCGGAACGTTTc < 1:26597/150‑1 (MQ=255) cttgtgctgcgaacagccgcagggcggccatgcccttaatacccccttaacacaaaggggaaacactccctcacaatccttaacaaagtgtcatttgcgcagagccgggctcaagcgcagcatatccagcccggtgtcgacccatttttc < 2:609506‑M1/150‑150 (MQ=255) cttgtgctgcgaacagccgcagggcggccatgcccttaatacccccttaacacaaaggggaaacactccctcacaatccttaacaaagtgtcatttgcgcagagccgggctcaagcgcagcatatccagcccggtgtcgacccatttttc > 1:609506‑M1/1‑1 (MQ=255) ccTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATCAGCAGCTGCCGGAACGTTTcc < 1:345484/150‑1 (MQ=255) | GATCTGTTGGGTGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATCAGCAGCTGCCGGAACGTTTCC > NC_002947/1583409‑1583703 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |